MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Escherichia coli PMV-1 pHUSEC411like plasmid

Total Repeats: 163

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022371	TA	3	6	63	68	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022371	CA	3	6	567	572	50 %	0 %	0 %	50 %	544579033
3	NC_022371	AT	3	6	1408	1413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022371	CG	3	6	1561	1566	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_022371	CA	3	6	1624	1629	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_022371	CA	3	6	2623	2628	50 %	0 %	0 %	50 %	544579035
7	NC_022371	TG	4	8	2646	2653	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022371	CA	3	6	3663	3668	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_022371	AT	3	6	3979	3984	50 %	50 %	0 %	0 %	544579038
10	NC_022371	AT	3	6	4512	4517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022371	TC	3	6	4518	4523	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_022371	TG	3	6	8002	8007	0 %	50 %	50 %	0 %	544579042
13	NC_022371	GA	3	6	8609	8614	50 %	0 %	50 %	0 %	544579042
14	NC_022371	GC	3	6	8835	8840	0 %	0 %	50 %	50 %	544579042
15	NC_022371	CA	3	6	8844	8849	50 %	0 %	0 %	50 %	544579042
16	NC_022371	GC	3	6	9213	9218	0 %	0 %	50 %	50 %	544579043
17	NC_022371	CA	3	6	9697	9702	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_022371	GT	3	6	9746	9751	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022371	GT	3	6	9877	9882	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022371	AC	3	6	10286	10291	50 %	0 %	0 %	50 %	544579045
21	NC_022371	TG	3	6	10481	10486	0 %	50 %	50 %	0 %	544579045
22	NC_022371	CA	3	6	11791	11796	50 %	0 %	0 %	50 %	544579047
23	NC_022371	TG	3	6	12054	12059	0 %	50 %	50 %	0 %	544579048
24	NC_022371	GC	3	6	12379	12384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_022371	GA	3	6	12460	12465	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022371	AC	3	6	14188	14193	50 %	0 %	0 %	50 %	544579050
27	NC_022371	GC	3	6	14548	14553	0 %	0 %	50 %	50 %	544579051
28	NC_022371	CG	3	6	14953	14958	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_022371	GT	3	6	15330	15335	0 %	50 %	50 %	0 %	544579052
30	NC_022371	AG	3	6	16485	16490	50 %	0 %	50 %	0 %	544579053
31	NC_022371	CG	3	6	16499	16504	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_022371	CG	3	6	17159	17164	0 %	0 %	50 %	50 %	544579054
33	NC_022371	TG	3	6	17714	17719	0 %	50 %	50 %	0 %	544579054
34	NC_022371	TG	3	6	18436	18441	0 %	50 %	50 %	0 %	544579054
35	NC_022371	AC	3	6	18470	18475	50 %	0 %	0 %	50 %	544579054
36	NC_022371	TC	3	6	18802	18807	0 %	50 %	0 %	50 %	544579055
37	NC_022371	TG	3	6	20227	20232	0 %	50 %	50 %	0 %	544579057
38	NC_022371	GT	3	6	21650	21655	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022371	GA	3	6	21776	21781	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022371	CG	3	6	22754	22759	0 %	0 %	50 %	50 %	544579060
41	NC_022371	CA	3	6	24552	24557	50 %	0 %	0 %	50 %	544579064
42	NC_022371	GT	3	6	25043	25048	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022371	GA	3	6	25172	25177	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022371	GC	3	6	25524	25529	0 %	0 %	50 %	50 %	544579065
45	NC_022371	TC	3	6	26443	26448	0 %	50 %	0 %	50 %	544579066
46	NC_022371	TC	3	6	26662	26667	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_022371	TG	3	6	27641	27646	0 %	50 %	50 %	0 %	544579068
48	NC_022371	CA	3	6	27650	27655	50 %	0 %	0 %	50 %	544579068
49	NC_022371	AT	3	6	27955	27960	50 %	50 %	0 %	0 %	544579068
50	NC_022371	GT	3	6	28470	28475	0 %	50 %	50 %	0 %	544579068
51	NC_022371	AT	3	6	28941	28946	50 %	50 %	0 %	0 %	544579068
52	NC_022371	GC	4	8	29080	29087	0 %	0 %	50 %	50 %	544579068
53	NC_022371	TG	3	6	29576	29581	0 %	50 %	50 %	0 %	544579068
54	NC_022371	AT	3	6	29845	29850	50 %	50 %	0 %	0 %	544579068
55	NC_022371	AT	3	6	30041	30046	50 %	50 %	0 %	0 %	544579069
56	NC_022371	TG	3	6	30875	30880	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022371	TG	3	6	34585	34590	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022371	GT	4	8	34713	34720	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022371	GC	3	6	37022	37027	0 %	0 %	50 %	50 %	544579077
60	NC_022371	GT	3	6	37253	37258	0 %	50 %	50 %	0 %	544579077
61	NC_022371	GA	4	8	38242	38249	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022371	GT	3	6	38776	38781	0 %	50 %	50 %	0 %	544579078
63	NC_022371	GC	3	6	40495	40500	0 %	0 %	50 %	50 %	544579080
64	NC_022371	GC	3	6	41029	41034	0 %	0 %	50 %	50 %	544579081
65	NC_022371	GC	3	6	41176	41181	0 %	0 %	50 %	50 %	544579081
66	NC_022371	TG	3	6	42816	42821	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022371	GT	3	6	43544	43549	0 %	50 %	50 %	0 %	544579085
68	NC_022371	GT	3	6	45085	45090	0 %	50 %	50 %	0 %	544579087
69	NC_022371	GC	4	8	45177	45184	0 %	0 %	50 %	50 %	544579087
70	NC_022371	GC	3	6	45361	45366	0 %	0 %	50 %	50 %	544579087
71	NC_022371	CG	3	6	45632	45637	0 %	0 %	50 %	50 %	544579087
72	NC_022371	CT	3	6	46714	46719	0 %	50 %	0 %	50 %	544579089
73	NC_022371	GA	3	6	47965	47970	50 %	0 %	50 %	0 %	544579089
74	NC_022371	GA	3	6	48442	48447	50 %	0 %	50 %	0 %	544579089
75	NC_022371	CA	3	6	49278	49283	50 %	0 %	0 %	50 %	544579090
76	NC_022371	TG	3	6	49583	49588	0 %	50 %	50 %	0 %	544579090
77	NC_022371	CA	3	6	49773	49778	50 %	0 %	0 %	50 %	544579090
78	NC_022371	CA	3	6	50349	50354	50 %	0 %	0 %	50 %	544579091
79	NC_022371	GA	3	6	50689	50694	50 %	0 %	50 %	0 %	544579091
80	NC_022371	GT	3	6	51017	51022	0 %	50 %	50 %	0 %	544579091
81	NC_022371	GT	3	6	51257	51262	0 %	50 %	50 %	0 %	544579091
82	NC_022371	GA	3	6	51530	51535	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022371	AT	3	6	52172	52177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022371	GA	3	6	52237	52242	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022371	GT	3	6	52416	52421	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022371	AT	3	6	52868	52873	50 %	50 %	0 %	0 %	544579093
87	NC_022371	AG	4	8	53522	53529	50 %	0 %	50 %	0 %	544579094
88	NC_022371	AT	4	8	53555	53562	50 %	50 %	0 %	0 %	544579094
89	NC_022371	GT	3	6	53635	53640	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022371	GC	3	6	54639	54644	0 %	0 %	50 %	50 %	544579097
91	NC_022371	TG	3	6	54879	54884	0 %	50 %	50 %	0 %	544579098
92	NC_022371	AG	3	6	54985	54990	50 %	0 %	50 %	0 %	544579098
93	NC_022371	GC	3	6	55015	55020	0 %	0 %	50 %	50 %	544579098
94	NC_022371	TG	3	6	55741	55746	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022371	TG	3	6	56040	56045	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022371	AT	3	6	56397	56402	50 %	50 %	0 %	0 %	544579100
97	NC_022371	CT	3	6	56893	56898	0 %	50 %	0 %	50 %	544579100
98	NC_022371	AT	3	6	56934	56939	50 %	50 %	0 %	0 %	544579100
99	NC_022371	AT	3	6	57411	57416	50 %	50 %	0 %	0 %	544579100
100	NC_022371	TA	3	6	57485	57490	50 %	50 %	0 %	0 %	544579100
101	NC_022371	GT	3	6	57913	57918	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022371	AT	3	6	58822	58827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022371	GA	3	6	60345	60350	50 %	0 %	50 %	0 %	544579102
104	NC_022371	CA	3	6	61272	61277	50 %	0 %	0 %	50 %	544579103
105	NC_022371	CA	3	6	61365	61370	50 %	0 %	0 %	50 %	544579103
106	NC_022371	TG	3	6	62158	62163	0 %	50 %	50 %	0 %	544579104
107	NC_022371	GA	3	6	62452	62457	50 %	0 %	50 %	0 %	544579104
108	NC_022371	GT	3	6	62613	62618	0 %	50 %	50 %	0 %	544579104
109	NC_022371	TC	3	6	63256	63261	0 %	50 %	0 %	50 %	544579105
110	NC_022371	TG	3	6	63536	63541	0 %	50 %	50 %	0 %	544579106
111	NC_022371	CT	3	6	64562	64567	0 %	50 %	0 %	50 %	544579106
112	NC_022371	CA	4	8	64714	64721	50 %	0 %	0 %	50 %	544579106
113	NC_022371	GT	3	6	65623	65628	0 %	50 %	50 %	0 %	544579106
114	NC_022371	TG	3	6	65636	65641	0 %	50 %	50 %	0 %	544579106
115	NC_022371	TG	3	6	66640	66645	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022371	TG	3	6	66802	66807	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022371	GT	3	6	67322	67327	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022371	TC	3	6	67633	67638	0 %	50 %	0 %	50 %	544579108
119	NC_022371	TG	3	6	67809	67814	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022371	GC	3	6	68209	68214	0 %	0 %	50 %	50 %	544579109
121	NC_022371	GA	3	6	68492	68497	50 %	0 %	50 %	0 %	544579110
122	NC_022371	GC	3	6	68693	68698	0 %	0 %	50 %	50 %	544579110
123	NC_022371	CT	3	6	69780	69785	0 %	50 %	0 %	50 %	544579112
124	NC_022371	TG	3	6	69909	69914	0 %	50 %	50 %	0 %	544579112
125	NC_022371	GC	3	6	71328	71333	0 %	0 %	50 %	50 %	544579113
126	NC_022371	CA	3	6	71805	71810	50 %	0 %	0 %	50 %	544579113
127	NC_022371	CG	3	6	72338	72343	0 %	0 %	50 %	50 %	544579114
128	NC_022371	GC	3	6	72782	72787	0 %	0 %	50 %	50 %	544579115
129	NC_022371	AG	3	6	73033	73038	50 %	0 %	50 %	0 %	544579116
130	NC_022371	TC	3	6	73681	73686	0 %	50 %	0 %	50 %	544579116
131	NC_022371	GT	3	6	73901	73906	0 %	50 %	50 %	0 %	544579116
132	NC_022371	TG	3	6	74459	74464	0 %	50 %	50 %	0 %	544579116
133	NC_022371	GT	3	6	75242	75247	0 %	50 %	50 %	0 %	544579116
134	NC_022371	TC	3	6	77878	77883	0 %	50 %	0 %	50 %	544579118
135	NC_022371	TC	3	6	77995	78000	0 %	50 %	0 %	50 %	544579118
136	NC_022371	GT	3	6	78552	78557	0 %	50 %	50 %	0 %	544579119
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139	NC_022371	AG	3	6	82042	82047	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022371	GT	3	6	82091	82096	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022371	CA	3	6	82840	82845	50 %	0 %	0 %	50 %	544579123
142	NC_022371	TG	3	6	84717	84722	0 %	50 %	50 %	0 %	544579125
143	NC_022371	CA	3	6	85817	85822	50 %	0 %	0 %	50 %	544579127
144	NC_022371	GA	3	6	86452	86457	50 %	0 %	50 %	0 %	544579127
145	NC_022371	AG	3	6	87516	87521	50 %	0 %	50 %	0 %	544579128
146	NC_022371	GC	3	6	87562	87567	0 %	0 %	50 %	50 %	544579128
147	NC_022371	CA	3	6	87657	87662	50 %	0 %	0 %	50 %	544579128
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.