MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli PMV-1 pHUSEC411like plasmid

Total Repeats: 120

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022371	CA	3	6	567	572	50 %	0 %	0 %	50 %	544579033
2	NC_022371	CA	3	6	2623	2628	50 %	0 %	0 %	50 %	544579035
3	NC_022371	AT	3	6	3979	3984	50 %	50 %	0 %	0 %	544579038
4	NC_022371	TG	3	6	8002	8007	0 %	50 %	50 %	0 %	544579042
5	NC_022371	GA	3	6	8609	8614	50 %	0 %	50 %	0 %	544579042
6	NC_022371	GC	3	6	8835	8840	0 %	0 %	50 %	50 %	544579042
7	NC_022371	CA	3	6	8844	8849	50 %	0 %	0 %	50 %	544579042
8	NC_022371	GC	3	6	9213	9218	0 %	0 %	50 %	50 %	544579043
9	NC_022371	AC	3	6	10286	10291	50 %	0 %	0 %	50 %	544579045
10	NC_022371	TG	3	6	10481	10486	0 %	50 %	50 %	0 %	544579045
11	NC_022371	CA	3	6	11791	11796	50 %	0 %	0 %	50 %	544579047
12	NC_022371	TG	3	6	12054	12059	0 %	50 %	50 %	0 %	544579048
13	NC_022371	AC	3	6	14188	14193	50 %	0 %	0 %	50 %	544579050
14	NC_022371	GC	3	6	14548	14553	0 %	0 %	50 %	50 %	544579051
15	NC_022371	GT	3	6	15330	15335	0 %	50 %	50 %	0 %	544579052
16	NC_022371	AG	3	6	16485	16490	50 %	0 %	50 %	0 %	544579053
17	NC_022371	CG	3	6	17159	17164	0 %	0 %	50 %	50 %	544579054
18	NC_022371	TG	3	6	17714	17719	0 %	50 %	50 %	0 %	544579054
19	NC_022371	TG	3	6	18436	18441	0 %	50 %	50 %	0 %	544579054
20	NC_022371	AC	3	6	18470	18475	50 %	0 %	0 %	50 %	544579054
21	NC_022371	TC	3	6	18802	18807	0 %	50 %	0 %	50 %	544579055
22	NC_022371	TG	3	6	20227	20232	0 %	50 %	50 %	0 %	544579057
23	NC_022371	CG	3	6	22754	22759	0 %	0 %	50 %	50 %	544579060
24	NC_022371	CA	3	6	24552	24557	50 %	0 %	0 %	50 %	544579064
25	NC_022371	GC	3	6	25524	25529	0 %	0 %	50 %	50 %	544579065
26	NC_022371	TC	3	6	26443	26448	0 %	50 %	0 %	50 %	544579066
27	NC_022371	TG	3	6	27641	27646	0 %	50 %	50 %	0 %	544579068
28	NC_022371	CA	3	6	27650	27655	50 %	0 %	0 %	50 %	544579068
29	NC_022371	AT	3	6	27955	27960	50 %	50 %	0 %	0 %	544579068
30	NC_022371	GT	3	6	28470	28475	0 %	50 %	50 %	0 %	544579068
31	NC_022371	AT	3	6	28941	28946	50 %	50 %	0 %	0 %	544579068
32	NC_022371	GC	4	8	29080	29087	0 %	0 %	50 %	50 %	544579068
33	NC_022371	TG	3	6	29576	29581	0 %	50 %	50 %	0 %	544579068
34	NC_022371	AT	3	6	29845	29850	50 %	50 %	0 %	0 %	544579068
35	NC_022371	AT	3	6	30041	30046	50 %	50 %	0 %	0 %	544579069
36	NC_022371	GC	3	6	37022	37027	0 %	0 %	50 %	50 %	544579077
37	NC_022371	GT	3	6	37253	37258	0 %	50 %	50 %	0 %	544579077
38	NC_022371	GT	3	6	38776	38781	0 %	50 %	50 %	0 %	544579078
39	NC_022371	GC	3	6	40495	40500	0 %	0 %	50 %	50 %	544579080
40	NC_022371	GC	3	6	41029	41034	0 %	0 %	50 %	50 %	544579081
41	NC_022371	GC	3	6	41176	41181	0 %	0 %	50 %	50 %	544579081
42	NC_022371	GT	3	6	43544	43549	0 %	50 %	50 %	0 %	544579085
43	NC_022371	GT	3	6	45085	45090	0 %	50 %	50 %	0 %	544579087
44	NC_022371	GC	4	8	45177	45184	0 %	0 %	50 %	50 %	544579087
45	NC_022371	GC	3	6	45361	45366	0 %	0 %	50 %	50 %	544579087
46	NC_022371	CG	3	6	45632	45637	0 %	0 %	50 %	50 %	544579087
47	NC_022371	CT	3	6	46714	46719	0 %	50 %	0 %	50 %	544579089
48	NC_022371	GA	3	6	47965	47970	50 %	0 %	50 %	0 %	544579089
49	NC_022371	GA	3	6	48442	48447	50 %	0 %	50 %	0 %	544579089
50	NC_022371	CA	3	6	49278	49283	50 %	0 %	0 %	50 %	544579090
51	NC_022371	TG	3	6	49583	49588	0 %	50 %	50 %	0 %	544579090
52	NC_022371	CA	3	6	49773	49778	50 %	0 %	0 %	50 %	544579090
53	NC_022371	CA	3	6	50349	50354	50 %	0 %	0 %	50 %	544579091
54	NC_022371	GA	3	6	50689	50694	50 %	0 %	50 %	0 %	544579091
55	NC_022371	GT	3	6	51017	51022	0 %	50 %	50 %	0 %	544579091
56	NC_022371	GT	3	6	51257	51262	0 %	50 %	50 %	0 %	544579091
57	NC_022371	AT	3	6	52868	52873	50 %	50 %	0 %	0 %	544579093
58	NC_022371	AG	4	8	53522	53529	50 %	0 %	50 %	0 %	544579094
59	NC_022371	AT	4	8	53555	53562	50 %	50 %	0 %	0 %	544579094
60	NC_022371	GC	3	6	54639	54644	0 %	0 %	50 %	50 %	544579097
61	NC_022371	TG	3	6	54879	54884	0 %	50 %	50 %	0 %	544579098
62	NC_022371	AG	3	6	54985	54990	50 %	0 %	50 %	0 %	544579098
63	NC_022371	GC	3	6	55015	55020	0 %	0 %	50 %	50 %	544579098
64	NC_022371	AT	3	6	56397	56402	50 %	50 %	0 %	0 %	544579100
65	NC_022371	CT	3	6	56893	56898	0 %	50 %	0 %	50 %	544579100
66	NC_022371	AT	3	6	56934	56939	50 %	50 %	0 %	0 %	544579100
67	NC_022371	AT	3	6	57411	57416	50 %	50 %	0 %	0 %	544579100
68	NC_022371	TA	3	6	57485	57490	50 %	50 %	0 %	0 %	544579100
69	NC_022371	GA	3	6	60345	60350	50 %	0 %	50 %	0 %	544579102
70	NC_022371	CA	3	6	61272	61277	50 %	0 %	0 %	50 %	544579103
71	NC_022371	CA	3	6	61365	61370	50 %	0 %	0 %	50 %	544579103
72	NC_022371	TG	3	6	62158	62163	0 %	50 %	50 %	0 %	544579104
73	NC_022371	GA	3	6	62452	62457	50 %	0 %	50 %	0 %	544579104
74	NC_022371	GT	3	6	62613	62618	0 %	50 %	50 %	0 %	544579104
75	NC_022371	TC	3	6	63256	63261	0 %	50 %	0 %	50 %	544579105
76	NC_022371	TG	3	6	63536	63541	0 %	50 %	50 %	0 %	544579106
77	NC_022371	CT	3	6	64562	64567	0 %	50 %	0 %	50 %	544579106
78	NC_022371	CA	4	8	64714	64721	50 %	0 %	0 %	50 %	544579106
79	NC_022371	GT	3	6	65623	65628	0 %	50 %	50 %	0 %	544579106
80	NC_022371	TG	3	6	65636	65641	0 %	50 %	50 %	0 %	544579106
81	NC_022371	TC	3	6	67633	67638	0 %	50 %	0 %	50 %	544579108
82	NC_022371	GC	3	6	68209	68214	0 %	0 %	50 %	50 %	544579109
83	NC_022371	GA	3	6	68492	68497	50 %	0 %	50 %	0 %	544579110
84	NC_022371	GC	3	6	68693	68698	0 %	0 %	50 %	50 %	544579110
85	NC_022371	CT	3	6	69780	69785	0 %	50 %	0 %	50 %	544579112
86	NC_022371	TG	3	6	69909	69914	0 %	50 %	50 %	0 %	544579112
87	NC_022371	GC	3	6	71328	71333	0 %	0 %	50 %	50 %	544579113
88	NC_022371	CA	3	6	71805	71810	50 %	0 %	0 %	50 %	544579113
89	NC_022371	CG	3	6	72338	72343	0 %	0 %	50 %	50 %	544579114
90	NC_022371	GC	3	6	72782	72787	0 %	0 %	50 %	50 %	544579115
91	NC_022371	AG	3	6	73033	73038	50 %	0 %	50 %	0 %	544579116
92	NC_022371	TC	3	6	73681	73686	0 %	50 %	0 %	50 %	544579116
93	NC_022371	GT	3	6	73901	73906	0 %	50 %	50 %	0 %	544579116
94	NC_022371	TG	3	6	74459	74464	0 %	50 %	50 %	0 %	544579116
95	NC_022371	GT	3	6	75242	75247	0 %	50 %	50 %	0 %	544579116
96	NC_022371	TC	3	6	77878	77883	0 %	50 %	0 %	50 %	544579118
97	NC_022371	TC	3	6	77995	78000	0 %	50 %	0 %	50 %	544579118
98	NC_022371	GT	3	6	78552	78557	0 %	50 %	50 %	0 %	544579119
99	NC_022371	TC	3	6	80721	80726	0 %	50 %	0 %	50 %	544579121
100	NC_022371	TG	3	6	81504	81509	0 %	50 %	50 %	0 %	544579122
101	NC_022371	CA	3	6	82840	82845	50 %	0 %	0 %	50 %	544579123
102	NC_022371	TG	3	6	84717	84722	0 %	50 %	50 %	0 %	544579125
103	NC_022371	CA	3	6	85817	85822	50 %	0 %	0 %	50 %	544579127
104	NC_022371	GA	3	6	86452	86457	50 %	0 %	50 %	0 %	544579127
105	NC_022371	AG	3	6	87516	87521	50 %	0 %	50 %	0 %	544579128
106	NC_022371	GC	3	6	87562	87567	0 %	0 %	50 %	50 %	544579128
107	NC_022371	CA	3	6	87657	87662	50 %	0 %	0 %	50 %	544579128
108	NC_022371	GC	3	6	87678	87683	0 %	0 %	50 %	50 %	544579128
109	NC_022371	GC	3	6	89632	89637	0 %	0 %	50 %	50 %	544579130
110	NC_022371	GA	4	8	89816	89823	50 %	0 %	50 %	0 %	544579130
111	NC_022371	GA	3	6	90344	90349	50 %	0 %	50 %	0 %	544579131
112	NC_022371	AG	3	6	90589	90594	50 %	0 %	50 %	0 %	544579131
113	NC_022371	TG	3	6	92067	92072	0 %	50 %	50 %	0 %	544579132
114	NC_022371	CT	3	6	92517	92522	0 %	50 %	0 %	50 %	544579133
115	NC_022371	TG	3	6	92967	92972	0 %	50 %	50 %	0 %	544579133
116	NC_022371	AC	3	6	94033	94038	50 %	0 %	0 %	50 %	544579134
117	NC_022371	GC	3	6	94657	94662	0 %	0 %	50 %	50 %	544579135
118	NC_022371	CG	3	6	95101	95106	0 %	0 %	50 %	50 %	544579135
119	NC_022371	AC	3	6	95411	95416	50 %	0 %	0 %	50 %	544579135
120	NC_022371	AG	3	6	96479	96484	50 %	0 %	50 %	0 %	544579136

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.