MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli PMV-1 main chromosome

Total Repeats: 142

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022370	GAAAAT	2	12	10792	10803	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022370	AAGGGA	2	12	86897	86908	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022370	GTAGTG	2	12	205305	205316	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022370	TGTTGA	2	12	263554	263565	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022370	CTTTTC	2	12	279545	279556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_022370	TTTTCT	2	12	329042	329053	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_022370	CTATTT	2	12	330079	330090	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_022370	GTCACT	2	12	333581	333592	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_022370	AATTTC	2	12	336807	336818	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_022370	TGTCTG	2	12	346735	346746	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_022370	TGAGGT	2	12	346928	346939	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022370	TTTATT	2	12	363912	363923	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022370	AACAAT	2	12	410474	410485	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_022370	TATTGA	2	12	413320	413331	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022370	TTTTCA	2	12	475578	475589	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_022370	CAGGCG	2	12	494422	494433	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_022370	TTTCTG	2	12	520784	520795	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_022370	GTTTTC	2	12	557804	557815	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_022370	GACAGA	2	12	592698	592709	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_022370	AATATG	2	12	602239	602250	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022370	TGCAAA	2	12	633048	633059	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_022370	CATGAG	2	12	674982	674993	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_022370	GCCAGG	2	12	697914	697925	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_022370	ATTTTT	2	12	728155	728166	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022370	TTTACC	2	12	739067	739078	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_022370	TTTTCT	2	12	794429	794440	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_022370	ACGGCA	2	12	930129	930140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_022370	GGCATG	2	12	930187	930198	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_022370	AATGAT	2	12	930272	930283	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022370	TAACCG	2	12	930502	930513	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_022370	CTGGAA	2	12	978220	978231	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_022370	AAAGAT	2	12	1001013	1001024	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022370	TAAGGA	2	12	1036903	1036914	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022370	ATAATG	2	12	1038318	1038329	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022370	TGGTAA	2	12	1062109	1062120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022370	TGTTAA	2	12	1070553	1070564	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022370	GAATAA	2	12	1140001	1140012	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022370	CAAACC	2	12	1141181	1141192	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_022370	CAAAAA	2	12	1175725	1175736	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_022370	TCTGCT	2	12	1253688	1253699	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_022370	GACAGA	2	12	1285134	1285145	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_022370	GACGCT	2	12	1288018	1288029	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_022370	AAAATG	2	12	1296262	1296273	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022370	AGGGGG	2	12	1308183	1308194	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022370	CTTATT	2	12	1377946	1377957	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_022370	CTGATC	2	12	1395475	1395486	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_022370	GGAAAA	2	12	1413773	1413784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022370	GACAGA	2	12	1434700	1434711	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_022370	AAAGTT	2	12	1446803	1446814	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022370	TATAAC	2	12	1496031	1496042	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_022370	TAAATT	2	12	1541949	1541960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022370	GTTAAT	2	12	1606911	1606922	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022370	AAAAAC	2	12	1633279	1633290	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_022370	CGTTGT	2	12	1634667	1634678	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_022370	ACCGTT	2	12	1640851	1640862	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_022370	TGGTTA	2	12	1649680	1649691	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022370	CAAAAA	2	12	1694026	1694037	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_022370	ATACTT	2	12	1779810	1779821	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_022370	AAAATA	2	12	1793460	1793471	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022370	TGTTTT	2	12	1794093	1794104	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022370	AAGACT	2	12	1794353	1794364	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_022370	ACAGCG	2	12	1904038	1904049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_022370	TATTAC	2	12	1907073	1907084	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_022370	TTTCTT	2	12	1919530	1919541	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_022370	TCAACG	2	12	1937146	1937157	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_022370	AATTCA	2	12	2013315	2013326	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_022370	ATATTT	2	12	2015302	2015313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022370	TCTTAT	2	12	2027122	2027133	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_022370	GTGTAT	2	12	2041439	2041450	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022370	ATTTTT	2	12	2112542	2112553	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022370	CTGATA	2	12	2176037	2176048	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_022370	GAAAAC	2	12	2203376	2203387	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_022370	TTTTGT	2	12	2263401	2263412	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022370	TCTTCC	2	12	2406807	2406818	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_022370	TAAATG	2	12	2541964	2541975	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022370	TGTCAC	2	12	2555598	2555609	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_022370	AGCGGA	2	12	2558734	2558745	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_022370	AGAAAA	2	12	2565877	2565888	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022370	CTGATG	2	12	2659194	2659205	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_022370	GTTATG	2	12	2677039	2677050	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022370	TCGATA	2	12	2687664	2687675	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_022370	CAAGTG	2	12	2694007	2694018	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_022370	TCCTTC	2	12	2789721	2789732	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_022370	TGAGCG	2	12	2824195	2824206	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_022370	TGGACA	2	12	2834205	2834216	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_022370	CGGCAG	2	12	2848214	2848225	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_022370	ATATAG	2	12	2981649	2981660	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022370	TGATAT	2	12	3019508	3019519	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022370	TGACGC	2	12	3070815	3070826	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_022370	AATGAT	2	12	3098731	3098742	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022370	GGTTTT	2	12	3114708	3114719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022370	ACAAGA	2	12	3119038	3119049	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_022370	TTTGTT	2	12	3143862	3143873	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022370	ATCGCG	2	12	3262055	3262066	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_022370	GTAAGG	2	12	3276730	3276741	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022370	ACTGAG	2	12	3300839	3300850	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_022370	TTTTCG	2	12	3373952	3373963	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_022370	ATTTAA	2	12	3387156	3387167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022370	ATAAAA	2	12	3439036	3439047	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022370	ATTTAA	2	12	3449776	3449787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022370	AGTTGT	2	12	3481073	3481084	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022370	CTTTTT	2	12	3485750	3485761	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_022370	AATGAT	2	12	3486585	3486596	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022370	TCTCCC	2	12	3508436	3508447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_022370	GTAACC	2	12	3534202	3534213	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_022370	TTTTAT	2	12	3543982	3543993	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022370	AAGCGA	2	12	3549380	3549391	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_022370	CTTTCT	2	12	3573247	3573258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_022370	ACAGAA	2	12	3596776	3596787	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_022370	AGCGTT	2	12	3678563	3678574	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_022370	TTTATA	2	12	3695152	3695163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022370	AATTTA	2	12	3801178	3801189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022370	TGATAA	2	12	3827988	3827999	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022370	AAGATA	2	12	3898796	3898807	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022370	AGATGC	2	12	3914265	3914276	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_022370	TGAAAA	2	12	3938152	3938163	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022370	GCCAGC	2	12	3977531	3977542	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
118	NC_022370	CTGAAG	2	12	3979984	3979995	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_022370	GGCTTC	2	12	3989316	3989327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_022370	CTCTGG	2	12	4130629	4130640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_022370	CTTTTT	2	12	4203930	4203941	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_022370	TCCAGT	2	12	4281484	4281495	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_022370	AAATGG	2	12	4338247	4338258	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022370	GCTTTG	2	12	4364761	4364772	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_022370	CCATGC	2	12	4365300	4365311	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
126	NC_022370	TTTGTT	2	12	4365912	4365923	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022370	GGGAGT	2	12	4367675	4367686	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022370	ATAAAA	2	12	4379454	4379465	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022370	ATTTTT	2	12	4474633	4474644	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022370	TCATTT	2	12	4501357	4501368	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_022370	TAACCA	2	12	4520831	4520842	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_022370	GAAAAA	2	12	4580335	4580346	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022370	ATTTAT	2	12	4610837	4610848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022370	GTCTTT	2	12	4619646	4619657	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_022370	AATATC	2	12	4651715	4651726	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_022370	CTGATA	2	12	4687362	4687373	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_022370	TTTTTA	2	12	4737616	4737627	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022370	TTTAAT	2	12	4769475	4769486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022370	CAGCCT	2	12	4809111	4809122	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
140	NC_022370	AACAGG	2	12	4874100	4874111	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_022370	TTATCA	2	12	4948608	4948619	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_022370	GTAAAA	2	12	4973588	4973599	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.