MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris KW2

Total Repeats: 935

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022369	TTGCTG	2	12	419	430	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	544393403
2	NC_022369	TTGAAG	2	12	1628	1639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	544393404
3	NC_022369	TGAAAG	2	12	1931	1942	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	544393404
4	NC_022369	ATGTTG	2	12	4415	4426	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	544393405
5	NC_022369	TCAAAA	2	12	7004	7015	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	544393406
6	NC_022369	AAAATG	2	12	7155	7166	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	544393406
7	NC_022369	AAGCCA	2	12	10232	10243	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	544393408
8	NC_022369	AAAGAT	2	12	11231	11242	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	544393409
9	NC_022369	TAAAAA	2	12	12748	12759	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	544393411
10	NC_022369	TTGACA	2	12	17406	17417	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	544393414
11	NC_022369	AAATCA	2	12	20779	20790	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	544393418
12	NC_022369	GTAAAA	2	12	23649	23660	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	544393421
13	NC_022369	GTCGGA	2	12	24210	24221	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	544393421
14	NC_022369	GCGTGA	2	12	24752	24763	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	544393421
15	NC_022369	ATGCAA	2	12	25384	25395	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	544393421
16	NC_022369	TTTTAA	2	12	35620	35631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	544393429
17	NC_022369	TATATT	2	12	35786	35797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	544393429
18	NC_022369	TGTTTG	2	12	37785	37796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	544393433
19	NC_022369	GATAAT	2	12	39383	39394	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	544393434
20	NC_022369	TCAGAG	2	12	39602	39613	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	544393434
21	NC_022369	AAGGAA	2	12	39661	39672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	544393434
22	NC_022369	TTCACC	2	12	46410	46421	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	544393440
23	NC_022369	AGGAGC	2	12	47598	47609	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	544393440
24	NC_022369	AGCTGC	2	12	47610	47621	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	544393440
25	NC_022369	CTTCAA	2	12	50682	50693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	544393443
26	NC_022369	TATAAA	2	12	51582	51593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	544393444
27	NC_022369	GGTCAG	2	12	53637	53648	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	544393447
28	NC_022369	TTGCTT	2	12	55592	55603	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	544393449
29	NC_022369	TTGTTT	2	12	55901	55912	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	544393449
30	NC_022369	TCCAAG	2	12	59317	59328	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	544393452
31	NC_022369	ACAAGA	2	12	61486	61497	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	544393453
32	NC_022369	TAGGCT	2	12	61615	61626	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	544393454
33	NC_022369	CTTTAT	2	12	63032	63043	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	544393455
34	NC_022369	AAGTTC	2	12	69923	69934	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	544393463
35	NC_022369	CATTTG	2	12	72129	72140	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	544393466
36	NC_022369	AAGCAA	2	12	72234	72245	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	544393466
37	NC_022369	GGGAAT	2	12	73270	73281	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	544393467
38	NC_022369	TTTTCG	2	12	76360	76371	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	544393470
39	NC_022369	AAAACC	2	12	78008	78019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	544393472
40	NC_022369	TGGACG	2	12	78499	78510	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	544393472
41	NC_022369	TGGGAC	2	12	80714	80725	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	544393476
42	NC_022369	CAGTTG	2	12	81576	81587	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	544393477
43	NC_022369	AGCTGA	2	12	84971	84982	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	544393479
44	NC_022369	TTTATC	2	12	87762	87773	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	544393482
45	NC_022369	TATGGG	2	12	98491	98502	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	544393491
46	NC_022369	AAGAAC	2	12	107737	107748	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	544393501
47	NC_022369	TTCATA	2	12	116348	116359	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	544393509
48	NC_022369	ATTGCT	2	12	118375	118386	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	544393511
49	NC_022369	TCATAA	2	12	121856	121867	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	544393518
50	NC_022369	CAAAAG	2	12	122392	122403	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	544393519
51	NC_022369	ATTAAT	2	12	130098	130109	50 %	50 %	0 %	0 %	544393526
52	NC_022369	TATAAT	2	12	130533	130544	50 %	50 %	0 %	0 %	544393526
53	NC_022369	TAACTT	2	12	137094	137105	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	544393527
54	NC_022369	ACCTGG	2	12	138048	138059	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	544393529
55	NC_022369	ATAATT	2	12	146461	146472	50 %	50 %	0 %	0 %	544393537
56	NC_022369	TTGCTT	2	12	152812	152823	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	544393544
57	NC_022369	GCTTAT	2	12	154804	154815	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	544393546
58	NC_022369	GTAAAG	2	12	158713	158724	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	544393548
59	NC_022369	GAATAC	2	12	161530	161541	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	544393554
60	NC_022369	ATGAAA	2	12	161658	161669	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	544393554
61	NC_022369	TTTGAA	2	12	161981	161992	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	544393554
62	NC_022369	TTCAGC	2	12	166304	166315	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	544393559
63	NC_022369	ATTGGG	2	12	167305	167316	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	544393559
64	NC_022369	AAATAG	2	12	169639	169650	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	544393561
65	NC_022369	AATCGA	2	12	170094	170105	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	544393562
66	NC_022369	TACCAT	2	12	173992	174003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	544393566
67	NC_022369	ATGTTT	2	12	174043	174054	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	544393566
68	NC_022369	CGAAGT	2	12	177296	177307	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	544393569
69	NC_022369	ATGTTG	2	12	178139	178150	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	544393570
70	NC_022369	AGAAGT	2	12	179237	179248	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	544393571
71	NC_022369	GACTTT	2	12	179312	179323	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	544393571
72	NC_022369	TCCAGA	2	12	182478	182489	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	544393575
73	NC_022369	CGAAAA	2	12	184795	184806	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	544393578
74	NC_022369	CTGAAT	2	12	185431	185442	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	544393579
75	NC_022369	AAAAGC	2	12	185843	185854	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	544393579
76	NC_022369	AAAAAC	2	12	188188	188199	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	544393581
77	NC_022369	TTGCTT	2	12	190852	190863	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	544393584
78	NC_022369	TTATAC	2	12	199206	199217	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	544393592
79	NC_022369	AAATAA	2	12	203739	203750	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	544393595
80	NC_022369	ATTATG	2	12	203951	203962	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	544393595
81	NC_022369	TGAAAA	2	12	209268	209279	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	544393599
82	NC_022369	AAAATC	2	12	213940	213951	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	544393604
83	NC_022369	ACGTAA	2	12	226678	226689	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	544393621
84	NC_022369	CGTAAA	2	12	226703	226714	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	544393621
85	NC_022369	CCAGCC	2	12	229549	229560	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	544393624
86	NC_022369	TATTAC	2	12	234631	234642	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	544393631
87	NC_022369	ATGGTT	2	12	235471	235482	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	544393631
88	NC_022369	TTGGCT	2	12	236455	236466	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	544393632
89	NC_022369	AAGCTC	2	12	240654	240665	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	544393636
90	NC_022369	TGATTG	2	12	243506	243517	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	544393637
91	NC_022369	GTCATT	2	12	245611	245622	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	544393639
92	NC_022369	TAACGA	2	12	252168	252179	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	544393644
93	NC_022369	TGGCAT	2	12	253078	253089	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	544393646
94	NC_022369	TTTGAT	2	12	254718	254729	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	544393648
95	NC_022369	TTTAAC	2	12	257845	257856	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	544393652
96	NC_022369	TTGGTT	2	12	259134	259145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	544393653
97	NC_022369	CAAAAT	2	12	260430	260441	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	544393653
98	NC_022369	TTTCCA	2	12	264916	264927	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	544393658
99	NC_022369	TCTGTA	2	12	265525	265536	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	544393658
100	NC_022369	TGGTGC	2	12	272404	272415	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	544393664
101	NC_022369	GGCTCA	2	12	272519	272530	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	544393664
102	NC_022369	AAAAAC	2	12	277861	277872	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	544393669
103	NC_022369	GTCTTG	2	12	278005	278016	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	544393669
104	NC_022369	CTTGGT	2	12	280225	280236	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	544393670
105	NC_022369	TCTTTT	2	12	282987	282998	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	544393674
106	NC_022369	ATTTTT	2	12	292809	292820	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	544393686
107	NC_022369	CCAACA	2	12	299889	299900	50 %	0 %	0 %	50 %	544393692
108	NC_022369	AACATC	2	12	301703	301714	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	544393694
109	NC_022369	AGGGAT	2	12	303669	303680	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	544393696
110	NC_022369	TTGCTG	2	12	313847	313858	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	544393706
111	NC_022369	TAATTA	2	12	314448	314459	50 %	50 %	0 %	0 %	544393706
112	NC_022369	GATTTT	3	18	318248	318265	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	544393710
113	NC_022369	TTGCTT	2	12	319349	319360	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	544393712
114	NC_022369	ATGATT	2	12	320482	320493	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	544393712
115	NC_022369	GAAAAT	2	12	320590	320601	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	544393712
116	NC_022369	GAAAAA	2	12	321400	321411	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	544393713
117	NC_022369	AAAAAG	2	12	325757	325768	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	544393717
118	NC_022369	TTTTTG	2	12	326796	326807	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	544393719
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232	NC_022369	AAGAAA	2	12	584183	584194	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	544393956
233	NC_022369	TTGAAG	2	12	589883	589894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	544393961
234	NC_022369	CGTTTT	2	12	593509	593520	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	544393964
235	NC_022369	GCCAAG	2	12	593899	593910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	544393965
236	NC_022369	TTCATT	2	12	599868	599879	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	544393969
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238	NC_022369	CGTTTG	2	12	604524	604535	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	544393972
239	NC_022369	TTGGAC	2	12	605416	605427	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	544393972
240	NC_022369	ACTTGC	2	12	606855	606866	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	544393973
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341	NC_022369	TATACT	2	12	824530	824541	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	544394162
342	NC_022369	TAAATG	2	12	825320	825331	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	544394163
343	NC_022369	ATTTTT	2	12	826321	826332	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	544394164
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345	NC_022369	TGGTCC	2	12	829083	829094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544394166
346	NC_022369	ATTGCC	2	12	829473	829484	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	544394166
347	NC_022369	AGTGGA	2	12	834279	834290	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	544394171
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352	NC_022369	TTGGTT	2	12	839691	839702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	544394180
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444	NC_022369	AAAAGC	2	12	1087311	1087322	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	544394418
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446	NC_022369	TCCAGA	2	12	1090430	1090441	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	544394419
447	NC_022369	GTTTTT	2	12	1090739	1090750	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	544394420
448	NC_022369	ACAAGC	2	12	1092094	1092105	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	544394422
449	NC_022369	TTGAAA	2	12	1095074	1095085	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	544394424
450	NC_022369	CATCGA	2	12	1103545	1103556	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	544394431
451	NC_022369	CAAGTT	2	12	1103575	1103586	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	544394431
452	NC_022369	AAGTAC	2	12	1103600	1103611	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	544394431
453	NC_022369	AACTGA	2	12	1104395	1104406	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	544394432
454	NC_022369	GCTGGT	2	12	1110325	1110336	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	544394437
455	NC_022369	TGCCAT	2	12	1110546	1110557	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	544394437
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457	NC_022369	CCAGAA	2	12	1124960	1124971	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	544394452
458	NC_022369	AGTATC	2	12	1125154	1125165	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	544394452
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