MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris KW2

Total Repeats: 1975

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022369	AAAGT	2	10	3938	3947	60 %	20 %	20 %	0 %	544393405
2	NC_022369	GTCTT	2	10	4633	4642	0 %	60 %	20 %	20 %	544393405
3	NC_022369	AAGCA	2	10	10177	10186	60 %	0 %	20 %	20 %	544393408
4	NC_022369	AGCTA	2	10	10538	10547	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_022369	AAATG	2	10	11880	11889	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022369	ATGGT	2	10	12732	12741	20 %	40 %	40 %	0 %	544393411
7	NC_022369	GCATG	2	10	14924	14933	20 %	20 %	40 %	20 %	544393413
8	NC_022369	ATTTT	2	10	15754	15763	20 %	80 %	0 %	0 %	544393414
9	NC_022369	AAATG	2	10	16046	16055	60 %	20 %	20 %	0 %	544393414
10	NC_022369	TGCGA	2	10	17063	17072	20 %	20 %	40 %	20 %	544393414
11	NC_022369	TGATT	2	10	19775	19784	20 %	60 %	20 %	0 %	544393417
12	NC_022369	TGGTA	2	10	25070	25079	20 %	40 %	40 %	0 %	544393421
13	NC_022369	CTTAA	2	10	26129	26138	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_022369	AAGTC	2	10	26270	26279	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_022369	TGGCT	2	10	27068	27077	0 %	40 %	40 %	20 %	544393422
16	NC_022369	ATTTT	2	10	27163	27172	20 %	80 %	0 %	0 %	544393422
17	NC_022369	AGAGA	2	10	28081	28090	60 %	0 %	40 %	0 %	544393422
18	NC_022369	CAAAA	2	10	28429	28438	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_022369	TATAA	2	10	35962	35971	60 %	40 %	0 %	0 %	544393429
20	NC_022369	TTTAA	2	10	37149	37158	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022369	TGGAT	2	10	37374	37383	20 %	40 %	40 %	0 %	544393432
22	NC_022369	AAAAG	2	10	37839	37848	80 %	0 %	20 %	0 %	544393433
23	NC_022369	TCAAA	2	10	38007	38016	60 %	20 %	0 %	20 %	544393433
24	NC_022369	GTGAG	2	10	39583	39592	20 %	20 %	60 %	0 %	544393434
25	NC_022369	AGTAA	2	10	40152	40161	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022369	AATTA	2	10	40865	40874	60 %	40 %	0 %	0 %	544393435
27	NC_022369	ATTAT	2	10	41138	41147	40 %	60 %	0 %	0 %	544393435
28	NC_022369	CGAAA	2	10	42420	42429	60 %	0 %	20 %	20 %	544393437
29	NC_022369	AATCA	2	10	45199	45208	60 %	20 %	0 %	20 %	544393439
30	NC_022369	TTTAA	2	10	45794	45803	40 %	60 %	0 %	0 %	544393439
31	NC_022369	GCTTG	2	10	48892	48901	0 %	40 %	40 %	20 %	544393442
32	NC_022369	TCCAT	2	10	49243	49252	20 %	40 %	0 %	40 %	544393442
33	NC_022369	AAAAT	2	10	53154	53163	80 %	20 %	0 %	0 %	544393446
34	NC_022369	AGTTT	2	10	54354	54363	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022369	ATTAA	2	10	55130	55139	60 %	40 %	0 %	0 %	544393448
36	NC_022369	GTCTT	2	10	55401	55410	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_022369	CAAAT	2	10	57835	57844	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_022369	CAAGC	2	10	60164	60173	40 %	0 %	20 %	40 %	544393452
39	NC_022369	CCATT	2	10	62405	62414	20 %	40 %	0 %	40 %	544393454
40	NC_022369	TACTA	2	10	63278	63287	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_022369	ACAAG	2	10	63628	63637	60 %	0 %	20 %	20 %	544393456
42	NC_022369	TCCAA	2	10	63784	63793	40 %	20 %	0 %	40 %	544393456
43	NC_022369	TGAGT	2	10	66135	66144	20 %	40 %	40 %	0 %	544393458
44	NC_022369	TGAAA	2	10	66651	66660	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022369	AATTT	2	10	68070	68079	40 %	60 %	0 %	0 %	544393461
46	NC_022369	GTAAA	2	10	70695	70704	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022369	TTATT	2	10	71689	71698	20 %	80 %	0 %	0 %	544393466
48	NC_022369	TCTTT	2	10	72875	72884	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_022369	TTGCT	2	10	73176	73185	0 %	60 %	20 %	20 %	544393467
50	NC_022369	TGAGT	2	10	74551	74560	20 %	40 %	40 %	0 %	544393468
51	NC_022369	GCAGA	2	10	75166	75175	40 %	0 %	40 %	20 %	544393469
52	NC_022369	AAGCT	2	10	77893	77902	40 %	20 %	20 %	20 %	544393472
53	NC_022369	TGGAT	2	10	78888	78897	20 %	40 %	40 %	0 %	544393473
54	NC_022369	ATAAA	2	10	81277	81286	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022369	CAAGA	2	10	82274	82283	60 %	0 %	20 %	20 %	544393478
56	NC_022369	ATAGA	2	10	83145	83154	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022369	AAAGA	2	10	86765	86774	80 %	0 %	20 %	0 %	544393481
58	NC_022369	AGAGT	2	10	87175	87184	40 %	20 %	40 %	0 %	544393482
59	NC_022369	TGGTT	2	10	87848	87857	0 %	60 %	40 %	0 %	544393482
60	NC_022369	TATGA	2	10	90460	90469	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022369	TCGTA	2	10	90915	90924	20 %	40 %	20 %	20 %	544393485
62	NC_022369	TTATA	2	10	91679	91688	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022369	GATTT	2	10	94767	94776	20 %	60 %	20 %	0 %	544393488
64	NC_022369	TCAAA	2	10	97198	97207	60 %	20 %	0 %	20 %	544393491
65	NC_022369	TCGCA	2	10	100827	100836	20 %	20 %	20 %	40 %	544393495
66	NC_022369	TATTC	2	10	101661	101670	20 %	60 %	0 %	20 %	544393496
67	NC_022369	TTTTA	2	10	103835	103844	20 %	80 %	0 %	0 %	544393498
68	NC_022369	AATAA	2	10	104776	104785	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022369	AAATG	2	10	105092	105101	60 %	20 %	20 %	0 %	544393499
70	NC_022369	ATTTT	2	10	105931	105940	20 %	80 %	0 %	0 %	544393500
71	NC_022369	ATTTG	2	10	109816	109825	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022369	GCTCC	2	10	110118	110127	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
73	NC_022369	TAAAA	2	10	110191	110200	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022369	TGGAT	2	10	110320	110329	20 %	40 %	40 %	0 %	544393503
75	NC_022369	GAAGG	2	10	110399	110408	40 %	0 %	60 %	0 %	544393503
76	NC_022369	AATTA	2	10	111301	111310	60 %	40 %	0 %	0 %	544393503
77	NC_022369	ATTTT	2	10	112207	112216	20 %	80 %	0 %	0 %	544393504
78	NC_022369	TTTTC	2	10	113511	113520	0 %	80 %	0 %	20 %	544393505
79	NC_022369	CCAAA	2	10	114056	114065	60 %	0 %	0 %	40 %	544393505
80	NC_022369	TGGCT	2	10	115018	115027	0 %	40 %	40 %	20 %	544393507
81	NC_022369	TCAAA	2	10	115596	115605	60 %	20 %	0 %	20 %	544393508
82	NC_022369	TTTTA	2	10	115869	115878	20 %	80 %	0 %	0 %	544393508
83	NC_022369	TTTTA	2	10	116199	116208	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022369	CAGGT	2	10	118070	118079	20 %	20 %	40 %	20 %	544393511
85	NC_022369	GTTTG	2	10	118131	118140	0 %	60 %	40 %	0 %	544393511
86	NC_022369	TTATT	2	10	119588	119597	20 %	80 %	0 %	0 %	544393514
87	NC_022369	TTTAC	2	10	120108	120117	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_022369	TTGTT	2	10	121055	121064	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022369	TAAAA	2	10	121435	121444	80 %	20 %	0 %	0 %	544393517
90	NC_022369	TTAAC	2	10	129139	129148	40 %	40 %	0 %	20 %	544393526
91	NC_022369	AAACA	2	10	129895	129904	80 %	0 %	0 %	20 %	544393526
92	NC_022369	GAAAT	2	10	130651	130660	60 %	20 %	20 %	0 %	544393526
93	NC_022369	TTCAC	2	10	133021	133030	20 %	40 %	0 %	40 %	544393526
94	NC_022369	TTCAC	2	10	133306	133315	20 %	40 %	0 %	40 %	544393526
95	NC_022369	TTCAC	2	10	133591	133600	20 %	40 %	0 %	40 %	544393526
96	NC_022369	TTCAC	2	10	133876	133885	20 %	40 %	0 %	40 %	544393526
97	NC_022369	AAGAA	2	10	134944	134953	80 %	0 %	20 %	0 %	544393526
98	NC_022369	AAAAC	2	10	135385	135394	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_022369	TGTTT	2	10	135418	135427	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022369	AATAT	2	10	136658	136667	60 %	40 %	0 %	0 %	544393527
101	NC_022369	AAAGA	2	10	136795	136804	80 %	0 %	20 %	0 %	544393527
102	NC_022369	GAAAA	2	10	137482	137491	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022369	CTTCC	2	10	137622	137631	0 %	40 %	0 %	60 %	544393528
104	NC_022369	TAATT	2	10	137824	137833	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022369	ATGGA	2	10	139324	139333	40 %	20 %	40 %	0 %	544393530
106	NC_022369	TACAG	2	10	139659	139668	40 %	20 %	20 %	20 %	544393530
107	NC_022369	TTTTA	2	10	141888	141897	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022369	ATTTT	2	10	145571	145580	20 %	80 %	0 %	0 %	544393536
109	NC_022369	TAATT	2	10	150069	150078	40 %	60 %	0 %	0 %	544393541
110	NC_022369	TACAA	2	10	151011	151020	60 %	20 %	0 %	20 %	544393542
111	NC_022369	TTTTA	2	10	151771	151780	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022369	TGATT	2	10	153389	153398	20 %	60 %	20 %	0 %	544393544
113	NC_022369	GATTG	2	10	155400	155409	20 %	40 %	40 %	0 %	544393546
114	NC_022369	TAAAA	2	10	157404	157413	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022369	AGCCA	2	10	157504	157513	40 %	0 %	20 %	40 %	544393548
116	NC_022369	TTGGC	2	10	158399	158408	0 %	40 %	40 %	20 %	544393548
117	NC_022369	AAAGT	2	10	159275	159284	60 %	20 %	20 %	0 %	544393550
118	NC_022369	AATTT	2	10	159434	159443	40 %	60 %	0 %	0 %	544393550
119	NC_022369	ATTTA	2	10	162741	162750	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022369	CCAAA	2	10	164538	164547	60 %	0 %	0 %	40 %	544393556
121	NC_022369	GTAAA	2	10	166735	166744	60 %	20 %	20 %	0 %	544393559
122	NC_022369	AAATT	2	10	167889	167898	60 %	40 %	0 %	0 %	544393560
123	NC_022369	TAAAT	2	10	169682	169691	60 %	40 %	0 %	0 %	544393562
124	NC_022369	TCCTT	2	10	175076	175085	0 %	60 %	0 %	40 %	544393568
125	NC_022369	AAAAT	2	10	175091	175100	80 %	20 %	0 %	0 %	544393568
126	NC_022369	AACTA	2	10	175129	175138	60 %	20 %	0 %	20 %	544393568
127	NC_022369	AAAAG	2	10	175630	175639	80 %	0 %	20 %	0 %	544393568
128	NC_022369	GAAAG	2	10	178008	178017	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022369	TAAAA	2	10	180724	180733	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022369	TTCAA	2	10	183658	183667	40 %	40 %	0 %	20 %	544393577
131	NC_022369	GCAAA	2	10	186818	186827	60 %	0 %	20 %	20 %	544393580
132	NC_022369	ACAAA	2	10	187184	187193	80 %	0 %	0 %	20 %	544393580
133	NC_022369	ATTTA	2	10	189066	189075	40 %	60 %	0 %	0 %	544393582
134	NC_022369	TAATT	2	10	190712	190721	40 %	60 %	0 %	0 %	544393584
135	NC_022369	CAATT	2	10	190807	190816	40 %	40 %	0 %	20 %	544393584
136	NC_022369	TCTTA	2	10	191284	191293	20 %	60 %	0 %	20 %	544393584
137	NC_022369	GATTG	2	10	193772	193781	20 %	40 %	40 %	0 %	544393586
138	NC_022369	TGAAA	2	10	197086	197095	60 %	20 %	20 %	0 %	544393590
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