MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris KW2

Total Repeats: 462

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022369	AGCTA	2	10	10538	10547	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_022369	AAATG	2	10	11880	11889	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022369	CTTAA	2	10	26129	26138	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_022369	AAGTC	2	10	26270	26279	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_022369	CAAAA	2	10	28429	28438	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_022369	TTTAA	2	10	37149	37158	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022369	AGTAA	2	10	40152	40161	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022369	AGTTT	2	10	54354	54363	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022369	GTCTT	2	10	55401	55410	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_022369	CAAAT	2	10	57835	57844	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_022369	TACTA	2	10	63278	63287	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_022369	TGAAA	2	10	66651	66660	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022369	GTAAA	2	10	70695	70704	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022369	TCTTT	2	10	72875	72884	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_022369	ATAAA	2	10	81277	81286	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022369	ATAGA	2	10	83145	83154	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022369	TATGA	2	10	90460	90469	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022369	TTATA	2	10	91679	91688	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022369	AATAA	2	10	104776	104785	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022369	ATTTG	2	10	109816	109825	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022369	GCTCC	2	10	110118	110127	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
22	NC_022369	TAAAA	2	10	110191	110200	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022369	TTTTA	2	10	116199	116208	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022369	TTTAC	2	10	120108	120117	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_022369	TTGTT	2	10	121055	121064	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022369	AAAAC	2	10	135385	135394	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_022369	TGTTT	2	10	135418	135427	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022369	GAAAA	2	10	137482	137491	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022369	TAATT	2	10	137824	137833	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022369	TTTTA	2	10	141888	141897	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022369	TTTTA	2	10	151771	151780	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022369	TAAAA	2	10	157404	157413	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022369	ATTTA	2	10	162741	162750	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022369	GAAAG	2	10	178008	178017	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022369	TAAAA	2	10	180724	180733	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022369	AGTTT	2	10	211663	211672	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022369	TGACT	2	10	223618	223627	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_022369	TAAAA	2	10	224407	224416	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022369	AAAAT	2	10	227677	227686	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022369	TGAAT	2	10	227779	227788	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022369	TTTTA	2	10	231476	231485	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022369	TTGAT	2	10	238443	238452	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022369	GCTAT	2	10	240511	240520	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_022369	TATTT	2	10	241849	241858	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022369	ATAGA	2	10	258180	258189	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022369	CAAAG	2	10	263358	263367	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_022369	AAATA	2	10	277677	277686	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022369	AAAAG	2	10	281441	281450	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022369	GCAAG	2	10	285773	285782	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_022369	AAATA	2	10	291578	291587	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022369	AATGA	2	10	293170	293179	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022369	AAAGA	2	10	296453	296462	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022369	TGAAT	2	10	300456	300465	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022369	AAATA	2	10	309901	309910	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022369	AAAAT	2	10	321859	321868	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022369	TTTTG	2	10	328811	328820	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022369	TAAAA	2	10	336030	336039	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022369	TAAAT	2	10	346908	346917	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022369	CGCTT	2	10	351123	351132	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
60	NC_022369	CTTTC	2	10	361242	361251	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_022369	ATTAA	2	10	365675	365684	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022369	TATAA	2	10	367414	367423	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022369	ATTTT	2	10	373232	373241	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022369	CTTTG	2	10	376612	376621	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_022369	TAAAA	2	10	383709	383718	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022369	TTATA	2	10	397538	397547	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022369	AAATC	2	10	408498	408507	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_022369	AAAAG	2	10	425869	425878	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022369	CTTAT	2	10	425962	425971	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_022369	CAAAC	2	10	447075	447084	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
71	NC_022369	CTATT	2	10	452923	452932	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_022369	CTAAT	2	10	458530	458539	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_022369	TATAG	2	10	459003	459012	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022369	CTATT	2	10	460759	460768	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_022369	AAAAT	2	10	461149	461158	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022369	TAATT	2	10	461162	461171	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022369	ATTTG	2	10	461278	461287	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022369	ATTTT	2	10	476095	476104	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022369	TTTTG	2	10	479269	479278	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022369	AGGAT	2	10	481925	481934	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022369	AAATG	2	10	496673	496682	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022369	AGATA	2	10	499765	499774	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022369	AGGAG	2	10	500763	500772	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022369	TCGTG	2	10	501173	501182	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
85	NC_022369	AGGGA	2	10	504681	504690	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022369	TGTAG	2	10	505158	505167	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022369	ATTTT	2	10	506445	506454	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022369	TTATG	2	10	512373	512382	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022369	TAAAA	2	10	514744	514753	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022369	ACAAA	2	10	522957	522966	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_022369	TTATT	2	10	525743	525752	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022369	AGAAA	2	10	527860	527869	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022369	AAAAC	2	10	535273	535282	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_022369	TGAAA	2	10	535851	535860	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022369	ATTGA	2	10	536019	536028	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022369	AATTT	2	10	538999	539008	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022369	ATTAT	2	10	544441	544450	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022369	AATTC	2	10	549791	549800	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_022369	AAAAT	2	10	556011	556020	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022369	GCTTA	2	10	567339	567348	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_022369	ATTAT	2	10	571902	571911	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022369	ATATA	2	10	572740	572749	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022369	TTATG	2	10	578094	578103	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022369	ATATT	2	10	582952	582961	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022369	AATTA	2	10	588965	588974	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022369	AAAGG	2	10	588980	588989	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022369	CTCTT	2	10	591152	591161	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
108	NC_022369	AAATA	2	10	595357	595366	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022369	AAAAT	2	10	599104	599113	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022369	TAAAC	2	10	601238	601247	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_022369	TAAAT	2	10	615071	615080	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022369	ATAAA	2	10	618376	618385	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022369	TGTTA	2	10	618423	618432	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022369	AATAA	2	10	623512	623521	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022369	TAATT	2	10	624371	624380	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022369	GATAT	2	10	624463	624472	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022369	TGATT	2	10	624520	624529	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022369	TATAA	2	10	643046	643055	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022369	TTATT	2	10	645140	645149	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022369	TGAAA	2	10	645180	645189	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022369	TAAAA	2	10	651570	651579	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022369	TATAT	2	10	663900	663909	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022369	AAATT	2	10	669459	669468	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022369	AGCGG	2	10	675840	675849	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
125	NC_022369	TTAAA	2	10	683659	683668	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022369	TCCAT	2	10	685748	685757	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
127	NC_022369	CCTTC	2	10	692999	693008	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
128	NC_022369	ATTAA	2	10	693012	693021	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022369	ATTTT	2	10	693076	693085	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022369	AATAT	2	10	694557	694566	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022369	TTGTC	2	10	694579	694588	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_022369	TTAGA	2	10	699344	699353	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022369	AAAGG	2	10	699746	699755	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022369	GAACT	2	10	705442	705451	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_022369	AAACT	2	10	707841	707850	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_022369	TGAAA	2	10	723285	723294	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022369	ATATA	2	10	726237	726246	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022369	AAAAG	2	10	730374	730383	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022369	TTGTT	2	10	731083	731092	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022369	TAAAA	2	10	747155	747164	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022369	TATTT	2	10	773027	773036	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022369	TTATG	2	10	782245	782254	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022369	AAATT	2	10	784682	784691	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022369	GAAAA	2	10	790873	790882	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022369	TAATT	2	10	797456	797465	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022369	ATGAA	2	10	797492	797501	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022369	TAAAT	2	10	802356	802365	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_022369	AGTTA	2	10	802726	802735	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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430	NC_022369	CACGA	2	10	2320650	2320659	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
431	NC_022369	CTCTC	2	10	2321058	2321067	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
432	NC_022369	CATTT	2	10	2327510	2327519	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
433	NC_022369	CAATC	2	10	2328694	2328703	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
434	NC_022369	TCTAT	2	10	2328709	2328718	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
435	NC_022369	TCTAT	2	10	2331524	2331533	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
436	NC_022369	CTAAA	2	10	2331571	2331580	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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438	NC_022369	TAAAA	2	10	2365053	2365062	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
439	NC_022369	TTTTA	2	10	2368716	2368725	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
440	NC_022369	CTTAT	2	10	2377549	2377558	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
441	NC_022369	TTATT	2	10	2379403	2379412	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
442	NC_022369	ATTTT	2	10	2380337	2380346	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
443	NC_022369	TAAAT	2	10	2380358	2380367	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
444	NC_022369	TAAAA	2	10	2389242	2389251	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
445	NC_022369	TTTTA	2	10	2390388	2390397	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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447	NC_022369	TAAAA	2	10	2395650	2395659	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
448	NC_022369	TAAAA	2	10	2397157	2397166	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
449	NC_022369	TTATG	2	10	2397256	2397265	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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453	NC_022369	TAAAT	2	10	2403062	2403071	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_022369	TTAAG	2	10	2408913	2408922	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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457	NC_022369	TCCCT	2	10	2421649	2421658	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
458	NC_022369	CACGA	2	10	2425157	2425166	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
459	NC_022369	CTCTC	2	10	2425565	2425574	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
460	NC_022369	AATTA	2	10	2426553	2426562	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
461	NC_022369	CTTTT	2	10	2426597	2426606	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
462	NC_022369	TAGTT	2	10	2426727	2426736	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.