MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli LY180

Total Repeats: 167

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022364	GAAAAT	2	12	11891	11902	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022364	AAGGGA	2	12	86006	86017	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022364	TCTCCC	2	12	165900	165911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_022364	TCACCC	2	12	165951	165962	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_022364	GTAGTG	2	12	200897	200908	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022364	GTTTTT	2	12	329337	329348	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022364	AGGGAG	2	12	332117	332128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022364	AGGGAG	2	12	339320	339331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022364	GGGAGA	2	12	339385	339396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022364	GTGCAG	2	12	366730	366741	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_022364	TCTGGT	2	12	372874	372885	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_022364	TAAGGG	2	12	381076	381087	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022364	TGTGGA	2	12	382223	382234	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022364	TTTTCT	2	12	392609	392620	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_022364	CTATTT	2	12	393645	393656	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_022364	TGCGGA	2	12	412254	412265	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_022364	TTTATT	2	12	425292	425303	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022364	TATTGA	2	12	464953	464964	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022364	AACAAT	2	12	476941	476952	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_022364	TATTGA	2	12	479787	479798	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022364	TTTTCA	2	12	544308	544319	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_022364	TTTCAG	2	12	549034	549045	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_022364	CAGGCG	2	12	563150	563161	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_022364	GATTAC	2	12	632656	632667	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_022364	TGCAAA	2	12	677114	677125	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_022364	ATTTTT	2	12	773093	773104	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022364	TTTACC	2	12	784004	784015	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_022364	TTTTCT	2	12	854531	854542	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_022364	AATATT	2	12	880340	880351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022364	TAACCG	2	12	983573	983584	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_022364	AAATAA	2	12	1015674	1015685	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022364	CTGGAA	2	12	1025237	1025248	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_022364	TTCGTA	2	12	1047434	1047445	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_022364	AAAGAT	2	12	1048209	1048220	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022364	TGTCCA	2	12	1069008	1069019	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_022364	TAAGGA	2	12	1091311	1091322	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022364	ATAATG	2	12	1092725	1092736	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022364	AATGAT	2	12	1124698	1124709	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022364	GATGGC	2	12	1125085	1125096	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_022364	CAAAAA	2	12	1176945	1176956	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_022364	TTTTGT	2	12	1260134	1260145	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022364	ACGCTT	2	12	1280770	1280781	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_022364	ACTCGA	2	12	1280790	1280801	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_022364	CAGGCT	2	12	1280922	1280933	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_022364	CTTGAT	2	12	1314998	1315009	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_022364	CTTATT	2	12	1333968	1333979	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_022364	CAAAAG	2	12	1339908	1339919	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_022364	GGGGGT	2	12	1348128	1348139	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022364	CTGATC	2	12	1350386	1350397	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_022364	AAAGTT	2	12	1354640	1354651	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022364	CTATAA	2	12	1394619	1394630	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_022364	AAGTGA	2	12	1467215	1467226	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022364	AAAAAC	2	12	1617693	1617704	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_022364	ATTAAT	2	12	1618382	1618393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022364	GATACT	2	12	1624842	1624853	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_022364	ACCGTT	2	12	1632566	1632577	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_022364	TGGTTA	2	12	1641396	1641407	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022364	CAAAAA	2	12	1680316	1680327	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_022364	TAAATA	2	12	1682116	1682127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022364	TTTTTC	2	12	1683838	1683849	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_022364	AAAAAC	2	12	1718610	1718621	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_022364	GCTGGC	2	12	1816435	1816446	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_022364	ATACTT	2	12	1824540	1824551	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_022364	AAAATA	2	12	1838197	1838208	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022364	TGTTTT	2	12	1838830	1838841	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022364	AAGACT	2	12	1839090	1839101	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_022364	TATTAC	2	12	1956456	1956467	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_022364	TTTCTT	2	12	1976445	1976456	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_022364	ATAACC	2	12	1980389	1980400	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_022364	ACTGTC	2	12	2024045	2024056	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_022364	TTAATG	2	12	2066541	2066552	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022364	AATTCA	2	12	2073666	2073677	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_022364	TTCTGA	2	12	2075252	2075263	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_022364	TCTTAT	2	12	2087482	2087493	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_022364	GTGTAT	2	12	2102299	2102310	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022364	ATATTT	2	12	2123725	2123736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022364	CCTGAC	2	12	2136026	2136037	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
78	NC_022364	ATTTTT	2	12	2149109	2149120	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022364	TCCCCC	2	12	2231439	2231450	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
80	NC_022364	CCTTAC	2	12	2312724	2312735	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_022364	CCTTAC	2	12	2313332	2313343	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_022364	ACGCAG	2	12	2343228	2343239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_022364	TCTTCC	2	12	2372890	2372901	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_022364	CAACAT	2	12	2418900	2418911	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_022364	CGCCGT	2	12	2419275	2419286	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
86	NC_022364	CCACTA	2	12	2449419	2449430	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_022364	TTACCC	2	12	2480346	2480357	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_022364	TAAATG	2	12	2498212	2498223	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022364	TGTCAC	2	12	2511944	2511955	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_022364	AGAAAA	2	12	2522224	2522235	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022364	GTTAAC	2	12	2560673	2560684	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_022364	GTTAAC	2	12	2560737	2560748	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_022364	AAATAT	2	12	2563430	2563441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022364	CTGATG	2	12	2582162	2582173	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_022364	GTTATG	2	12	2600003	2600014	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022364	CAAGTG	2	12	2613122	2613133	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_022364	TCCTTC	2	12	2713710	2713721	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_022364	TGGACA	2	12	2764677	2764688	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_022364	CAGTTT	2	12	2779282	2779293	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_022364	CGGTTT	2	12	2962500	2962511	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_022364	GGTTTT	2	12	2976644	2976655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022364	ACAAGA	2	12	2980975	2980986	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_022364	ATATTT	2	12	3031636	3031647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022364	AATCAT	2	12	3082843	3082854	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_022364	GTAAGG	2	12	3158976	3158987	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022364	GTAAGG	2	12	3159368	3159379	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022364	ACTGAG	2	12	3187491	3187502	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_022364	TTTTCG	2	12	3243361	3243372	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_022364	ATTTAA	2	12	3256561	3256572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022364	TTATAT	2	12	3305618	3305629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022364	CACCCC	2	12	3322112	3322123	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
112	NC_022364	AGTTGT	2	12	3329901	3329912	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022364	CTTTTT	2	12	3334577	3334588	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_022364	AATGAT	2	12	3335412	3335423	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022364	TCTCCC	2	12	3359360	3359371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_022364	GTAACC	2	12	3392603	3392614	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_022364	AGACAA	2	12	3394223	3394234	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_022364	TGCATT	2	12	3403474	3403485	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_022364	TTTTAT	2	12	3405371	3405382	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022364	ATATAA	2	12	3416137	3416148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022364	CTTTCT	2	12	3440147	3440158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_022364	AGCGTT	2	12	3540065	3540076	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_022364	CCCTAT	2	12	3650756	3650767	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_022364	AATTTA	2	12	3653549	3653560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022364	ACATCA	2	12	3729469	3729480	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_022364	CCCTGA	2	12	3729501	3729512	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
127	NC_022364	GTGATG	2	12	3730070	3730081	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022364	GAAATA	2	12	3759512	3759523	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022364	AGATGC	2	12	3760401	3760412	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_022364	TGAAAA	2	12	3775273	3775284	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022364	AGGGAG	2	12	3782016	3782027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022364	CATCAC	2	12	3809046	3809057	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_022364	TTTGCC	2	12	3812946	3812957	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_022364	ACTTCA	2	12	3823186	3823197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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136	NC_022364	AATCAA	2	12	3963117	3963128	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_022364	CGGTCA	2	12	3970788	3970799	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_022364	AGGTAA	2	12	4054463	4054474	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022364	CTTTTT	2	12	4082532	4082543	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_022364	AGGGAG	2	12	4100677	4100688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022364	GCGTAA	2	12	4204001	4204012	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_022364	GGGAGT	2	12	4231040	4231051	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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144	NC_022364	CATTCA	2	12	4261308	4261319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_022364	AACTAA	2	12	4277014	4277025	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
146	NC_022364	TTTGTT	2	12	4399081	4399092	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022364	CAAAAA	2	12	4399098	4399109	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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149	NC_022364	CTTTTA	2	12	4425467	4425478	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
150	NC_022364	GTCTTT	2	12	4467765	4467776	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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152	NC_022364	GGGAGA	2	12	4505262	4505273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_022364	GATGGT	2	12	4514239	4514250	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
155	NC_022364	CTGATA	2	12	4531728	4531739	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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157	NC_022364	TTTTTA	2	12	4584809	4584820	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_022364	TTTAAT	2	12	4617349	4617360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_022364	TTTCAC	2	12	4665766	4665777	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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162	NC_022364	TTTAAA	2	12	4690654	4690665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_022364	AACAGG	2	12	4741413	4741424	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
164	NC_022364	TTTTCA	2	12	4791369	4791380	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
165	NC_022364	AATGAT	2	12	4801111	4801122	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
166	NC_022364	AGTAAA	2	12	4824724	4824735	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
167	NC_022364	TGGCAG	2	12	4835503	4835514	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.