MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2425

Total Repeats: 239

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022362	TTTTA	2	10	6527	6536	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022362	TAAAA	2	10	6619	6628	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022362	GTATT	2	10	17431	17440	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022362	AAAAT	2	10	19799	19808	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022362	AAAAT	2	10	23623	23632	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022362	GTTAA	2	10	23650	23659	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022362	TATAT	2	10	38743	38752	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022362	CTTTT	2	10	39036	39045	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_022362	CTTTT	2	10	39206	39215	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_022362	GGTAA	2	10	39518	39527	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022362	TCGTG	2	10	40314	40323	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_022362	TCTTT	2	10	41343	41352	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_022362	TAACT	2	10	41357	41366	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_022362	CCGTA	2	10	43201	43210	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_022362	AGCTT	2	10	52665	52674	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_022362	AAAAT	2	10	67231	67240	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022362	ATTAC	2	10	67587	67596	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_022362	TTTAT	2	10	70944	70953	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022362	CAAGA	2	10	73000	73009	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_022362	GAGCA	2	10	73370	73379	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_022362	TCTCT	2	10	77149	77158	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
22	NC_022362	TAGGA	2	10	83885	83894	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022362	AAAAT	2	10	83911	83920	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022362	ATTTT	2	10	83921	83930	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022362	TTAAT	2	10	84646	84655	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022362	TATTT	2	10	84714	84723	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022362	TATAA	2	10	84731	84740	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022362	TAAAA	2	10	89480	89489	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022362	TTGGC	2	10	94841	94850	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_022362	AAGAT	2	10	94928	94937	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022362	TTAAT	2	10	146787	146796	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022362	TTATG	2	10	153215	153224	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022362	ATTTA	2	10	158795	158804	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022362	TTTAA	2	10	159635	159644	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022362	TAAAA	2	10	161662	161671	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022362	AATTT	2	10	161708	161717	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022362	ATTTT	2	10	163545	163554	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022362	TAAAA	2	10	178506	178515	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022362	AAAAT	2	10	188578	188587	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022362	TTTTA	2	10	188675	188684	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022362	ATCCT	2	10	190033	190042	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
42	NC_022362	TTCAC	2	10	191213	191222	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
43	NC_022362	ATTTT	2	10	194095	194104	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022362	ATTTT	2	10	198262	198271	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022362	AAATA	2	10	208453	208462	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022362	TAAAA	2	10	209749	209758	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022362	CTATT	2	10	241239	241248	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_022362	ATATT	2	10	245734	245743	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022362	ATTAA	2	10	249011	249020	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022362	TTAAT	2	10	250927	250936	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022362	AAGTA	2	10	268268	268277	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022362	ATAAA	2	10	269287	269296	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022362	AAAAT	2	10	273616	273625	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022362	AAAAT	2	10	273637	273646	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022362	ATTTT	2	10	273663	273672	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022362	AAGAA	2	10	279281	279290	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022362	ATTTT	2	10	307477	307486	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022362	TTTTG	2	10	308640	308649	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022362	AATTT	2	10	315794	315803	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022362	TTAAA	3	15	340742	340756	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022362	GAGTA	2	10	347390	347399	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022362	TTTTA	2	10	359665	359674	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022362	ATTAA	2	10	375739	375748	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022362	ATTAA	2	10	378232	378241	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022362	CTTTT	2	10	432802	432811	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_022362	CTTTT	2	10	432972	432981	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_022362	GGTAA	2	10	433284	433293	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022362	TCGTG	2	10	434080	434089	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_022362	TCTTT	2	10	435109	435118	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_022362	TAACT	2	10	435123	435132	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_022362	CCGTA	2	10	436967	436976	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
72	NC_022362	CTTAT	2	10	444069	444078	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_022362	ATTTT	2	10	448596	448605	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022362	TCAAA	2	10	451239	451248	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_022362	AAGGT	2	10	452254	452263	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022362	CAAAT	2	10	452746	452755	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_022362	TTGGT	2	10	452951	452960	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022362	ATAGA	2	10	452965	452974	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022362	GATGG	2	10	453232	453241	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022362	TAAAT	2	10	469901	469910	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022362	TTGCT	2	10	473263	473272	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_022362	TTTAT	2	10	496022	496031	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022362	GATTT	2	10	496545	496554	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022362	TTTTA	2	10	504089	504098	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022362	TTGTG	2	10	504308	504317	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022362	TTTTA	2	10	524560	524569	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022362	TGCTT	2	10	525118	525127	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_022362	TTTAA	2	10	525442	525451	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022362	AAATA	2	10	525498	525507	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022362	AAAAT	2	10	548998	549007	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022362	GTTTT	2	10	552094	552103	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022362	AAATA	2	10	552403	552412	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022362	CATTC	2	10	553120	553129	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
94	NC_022362	TTTTA	2	10	561410	561419	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022362	AAAAT	2	10	561444	561453	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022362	AATTA	2	10	563904	563913	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022362	TTTGA	2	10	579066	579075	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022362	ATTTG	2	10	580227	580236	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022362	TAAAA	2	10	594089	594098	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022362	ATTTT	2	10	601712	601721	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022362	GATAA	2	10	617240	617249	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022362	TTTAA	2	10	626630	626639	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022362	AGGTC	2	10	626951	626960	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_022362	GCTTT	2	10	629276	629285	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_022362	GAAAA	2	10	637684	637693	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022362	TTTGC	2	10	641205	641214	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_022362	TGATT	2	10	655860	655869	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022362	AATTA	2	10	657246	657255	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022362	TTTAA	2	10	666230	666239	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022362	CTTTG	2	10	667888	667897	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_022362	ATTTT	2	10	668155	668164	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022362	TACTT	2	10	668779	668788	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_022362	AGAAA	2	10	668867	668876	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022362	TGGCT	2	10	669424	669433	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_022362	ATTTA	2	10	680613	680622	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022362	AAAGC	2	10	685604	685613	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_022362	TTTCT	2	10	686516	686525	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_022362	GTTTT	2	10	687240	687249	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022362	TTAGA	2	10	687269	687278	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022362	GTTTT	2	10	688946	688955	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022362	TAAAA	3	15	696757	696771	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022362	ATAAA	2	10	697580	697589	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022362	ATTTA	2	10	699166	699175	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022362	TTTAA	2	10	706495	706504	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022362	TAAAA	2	10	729565	729574	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022362	AAAAT	2	10	729635	729644	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022362	TTTTA	2	10	729723	729732	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022362	TTGTA	2	10	734904	734913	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022362	CTTTT	2	10	736933	736942	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_022362	CTTTT	2	10	737103	737112	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_022362	GGTAA	2	10	737415	737424	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022362	TCGTG	2	10	738211	738220	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_022362	TCTTT	2	10	739240	739249	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_022362	TAACT	2	10	739254	739263	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_022362	CCGTA	2	10	741098	741107	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
136	NC_022362	TTTAT	2	10	743109	743118	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022362	TAAAT	2	10	743377	743386	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022362	AATTA	2	10	743401	743410	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022362	TTTTA	2	10	743505	743514	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022362	GCAAA	2	10	744197	744206	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_022362	ATTTT	2	10	745906	745915	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022362	ATTAA	2	10	746150	746159	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022362	AATAA	2	10	752016	752025	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022362	ATTTA	2	10	754790	754799	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022362	TTTTC	2	10	785150	785159	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_022362	ATTTT	2	10	846822	846831	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022362	TTTTA	2	10	850813	850822	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_022362	ATTCA	2	10	853447	853456	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_022362	TTGCC	2	10	854666	854675	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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178	NC_022362	AATTT	2	10	1213837	1213846	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_022362	TATTT	2	10	1271080	1271089	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_022362	TATTT	2	10	1287965	1287974	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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235	NC_022362	AAAAT	2	10	1709499	1709508	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.