MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio alginolyticus NBRC 15630 = ATCC 17749 chromosome 2

Total Repeats: 73

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022359	TCTTAA	2	12	10385	10396	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_022359	AAAAAG	2	12	106985	106996	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022359	AACGAA	2	12	128051	128062	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_022359	TTCATA	2	12	153703	153714	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_022359	AGGATA	2	12	168418	168429	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022359	TAATGA	2	12	270345	270356	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022359	AAAAGC	2	12	277329	277340	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_022359	ATTGCA	2	12	288526	288537	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_022359	AAACTA	2	12	292764	292775	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_022359	ATTGAT	2	12	313712	313723	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022359	TAAAAA	2	12	429184	429195	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022359	ATCGCT	2	12	529682	529693	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_022359	TGAAAT	2	12	538938	538949	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022359	TGCAAA	2	12	547822	547833	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_022359	GGATAA	2	12	574675	574686	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022359	TTTTTA	2	12	597565	597576	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022359	AACCTA	2	12	602930	602941	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_022359	TCGATA	2	12	631741	631752	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_022359	ATAACA	2	12	681976	681987	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_022359	GAAGAG	2	12	686565	686576	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022359	ACTTTA	2	12	690372	690383	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_022359	GAGTGG	2	12	706174	706185	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022359	ATTCAA	2	12	723072	723083	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_022359	AATTAA	2	12	727782	727793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022359	ATTGAA	2	12	794471	794482	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022359	TATTCT	2	12	827894	827905	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_022359	TGAACA	2	12	853070	853081	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_022359	TTTTTG	2	12	861433	861444	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022359	GAAAAG	2	12	872176	872187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022359	TATTTC	2	12	877836	877847	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_022359	GAAGTA	2	12	902326	902337	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022359	TTTTAG	2	12	923229	923240	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022359	ATGGAA	2	12	923261	923272	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022359	ACATAT	2	12	927016	927027	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_022359	CAGATT	2	12	930194	930205	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_022359	TTAAAA	2	12	952052	952063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022359	CGTTAA	2	12	1060359	1060370	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_022359	ATGTTT	2	12	1082128	1082139	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022359	TTTTGG	2	12	1090987	1090998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022359	TTTTCT	2	12	1094477	1094488	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_022359	CTAAGT	2	12	1094657	1094668	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_022359	AAAAGC	2	12	1115134	1115145	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_022359	GAAATA	2	12	1132432	1132443	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022359	AAAAAG	2	12	1133275	1133286	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022359	TTATTT	2	12	1175624	1175635	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022359	AACGGC	2	12	1193657	1193668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_022359	AAAATG	2	12	1203703	1203714	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022359	CAAAAA	2	12	1230562	1230573	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_022359	AGTAAG	2	12	1251240	1251251	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022359	TTCCCT	2	12	1264284	1264295	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_022359	AATTGG	2	12	1270567	1270578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022359	ATGTAA	2	12	1292588	1292599	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022359	ATAAAG	2	12	1300450	1300461	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022359	ATGACT	2	12	1355897	1355908	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_022359	TTGGTT	2	12	1373451	1373462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022359	GAAAGT	2	12	1398221	1398232	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022359	TTTGAT	2	12	1426616	1426627	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022359	TTCTCA	2	12	1476022	1476033	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_022359	GATTCA	2	12	1476162	1476173	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_022359	CGCCTG	2	12	1488625	1488636	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
61	NC_022359	TATAGA	2	12	1509549	1509560	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022359	TGTAAA	2	12	1520369	1520380	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022359	ATTTGT	2	12	1554878	1554889	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022359	ATTTCT	2	12	1589700	1589711	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_022359	TTTTTG	2	12	1637050	1637061	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022359	ATTTTG	2	12	1638717	1638728	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022359	TACCTT	2	12	1695527	1695538	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_022359	CTACGC	2	12	1708001	1708012	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
69	NC_022359	TGTTTT	2	12	1731692	1731703	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022359	TACTCA	2	12	1735053	1735064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_022359	CAAATC	2	12	1756471	1756482	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_022359	AACTAA	2	12	1764723	1764734	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_022359	TCAGAT	2	12	1795601	1795612	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.