MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Sulfuricella denitrificans skB26 plasmid pSCD DNA

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022358	TGGGTT	2	12	4927	4938	0 %	50 %	50 %	0 %	543966433
2	NC_022358	GATGGG	2	12	6285	6296	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	543966434
3	NC_022358	GTGGCG	2	12	13344	13355	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	543966443
4	NC_022358	CAGGAT	2	12	19081	19092	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	543966448
5	NC_022358	CGGGTG	2	12	29801	29812	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	543966460
6	NC_022358	TGATGG	2	12	29985	29996	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	543966460
7	NC_022358	CGTGGC	2	12	31897	31908	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	543966462
8	NC_022358	TGCCGG	2	12	32067	32078	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	543966462
9	NC_022358	GCTGGC	2	12	32094	32105	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	543966462
10	NC_022358	CACCGA	2	12	32289	32300	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	543966462
11	NC_022358	CACCAG	2	12	33257	33268	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	543966463
12	NC_022358	AGCGCC	2	12	42865	42876	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	543966475
13	NC_022358	GTCGTA	2	12	43536	43547	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	543966475
14	NC_022358	CTTGAC	2	12	44109	44120	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	543966475
15	NC_022358	CGCGCA	2	12	46648	46659	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	543966476
16	NC_022358	GGCCAG	2	12	46930	46941	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	543966477
17	NC_022358	GCCAGC	2	12	48750	48761	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	543966478
18	NC_022358	CAGGGT	2	12	51331	51342	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	543966481
19	NC_022358	TGCCAG	2	12	52790	52801	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	543966483
20	NC_022358	ATATCA	2	12	52922	52933	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	543966484
21	NC_022358	AGGCAG	2	12	53191	53202	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	543966484
22	NC_022358	CCCAGC	2	12	54243	54254	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	543966485
23	NC_022358	GATGGC	2	12	58149	58160	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	543966489
24	NC_022358	TTGCCG	2	12	58171	58182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543966489
25	NC_022358	GCATCG	2	12	59830	59841	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	543966490
26	NC_022358	CGGGCG	2	12	60216	60227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	543966491
27	NC_022358	TCGGCG	2	12	60366	60377	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	543966491
28	NC_022358	CCACGT	2	12	62263	62274	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	543966493
29	NC_022358	AGCGCC	2	12	65173	65184	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	543966499
30	NC_022358	CTGCAC	2	12	68107	68118	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	543966503
31	NC_022358	CGCACA	2	12	68621	68632	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	543966504
32	NC_022358	ATGGTC	2	12	69957	69968	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	543966505
33	NC_022358	TTGATC	2	12	72595	72606	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	543966507
34	NC_022358	GTGGGC	2	12	77469	77480	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	543966511
35	NC_022358	GATGGC	2	12	77493	77504	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	543966511
36	NC_022358	CAGGAA	2	12	79547	79558	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	543966512
37	NC_022358	TGCTGG	2	12	81766	81777	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	543966514
38	NC_022358	ACGCCT	2	12	81892	81903	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	543966514

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.