MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Sulfuricella denitrificans skB26 plasmid pSCD DNA

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022358	ATTTA	2	10	644	653	40 %	60 %	0 %	0 %	543966429
2	NC_022358	TCAAG	2	10	828	837	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_022358	AGATC	2	10	4010	4019	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_022358	AGGTG	2	10	6327	6336	20 %	20 %	60 %	0 %	543966434
5	NC_022358	TTGGA	2	10	7805	7814	20 %	40 %	40 %	0 %	543966436
6	NC_022358	CAATC	2	10	10091	10100	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
7	NC_022358	AGTTG	2	10	10179	10188	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022358	CTTTT	2	10	10476	10485	0 %	80 %	0 %	20 %	543966438
9	NC_022358	TCCCC	2	10	11055	11064	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
10	NC_022358	CCACT	2	10	11220	11229	20 %	20 %	0 %	60 %	543966440
11	NC_022358	TTTTC	2	10	12359	12368	0 %	80 %	0 %	20 %	543966442
12	NC_022358	CTGCA	2	10	17488	17497	20 %	20 %	20 %	40 %	543966446
13	NC_022358	ATTCA	2	10	17954	17963	40 %	40 %	0 %	20 %	543966446
14	NC_022358	CTGGA	2	10	21513	21522	20 %	20 %	40 %	20 %	543966449
15	NC_022358	ATTGA	2	10	27075	27084	40 %	40 %	20 %	0 %	543966455
16	NC_022358	AACCA	2	10	27949	27958	60 %	0 %	0 %	40 %	543966458
17	NC_022358	TTTCA	2	10	28363	28372	20 %	60 %	0 %	20 %	543966458
18	NC_022358	GCGCC	2	10	30640	30649	0 %	0 %	40 %	60 %	543966461
19	NC_022358	GCCTG	2	10	34504	34513	0 %	20 %	40 %	40 %	543966466
20	NC_022358	CACTC	2	10	34553	34562	20 %	20 %	0 %	60 %	543966467
21	NC_022358	CCATT	2	10	37203	37212	20 %	40 %	0 %	40 %	543966469
22	NC_022358	GCAAA	2	10	38242	38251	60 %	0 %	20 %	20 %	543966470
23	NC_022358	CGGTA	2	10	39207	39216	20 %	20 %	40 %	20 %	543966470
24	NC_022358	GCACC	2	10	39428	39437	20 %	0 %	20 %	60 %	543966471
25	NC_022358	TGGCG	2	10	42424	42433	0 %	20 %	60 %	20 %	543966474
26	NC_022358	TGCGG	2	10	46148	46157	0 %	20 %	60 %	20 %	543966476
27	NC_022358	ACACC	2	10	46381	46390	40 %	0 %	0 %	60 %	543966476
28	NC_022358	CCGCG	2	10	46457	46466	0 %	0 %	40 %	60 %	543966476
29	NC_022358	TGCAT	2	10	48379	48388	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_022358	TCCGT	2	10	49786	49795	0 %	40 %	20 %	40 %	543966479
31	NC_022358	GCCCG	2	10	50004	50013	0 %	0 %	40 %	60 %	543966479
32	NC_022358	TGGCG	2	10	50033	50042	0 %	20 %	60 %	20 %	543966479
33	NC_022358	GCCAG	2	10	50827	50836	20 %	0 %	40 %	40 %	543966480
34	NC_022358	CCAGA	2	10	53111	53120	40 %	0 %	20 %	40 %	543966484
35	NC_022358	GCCCG	2	10	55491	55500	0 %	0 %	40 %	60 %	543966488
36	NC_022358	GGCCG	2	10	59146	59155	0 %	0 %	60 %	40 %	543966490
37	NC_022358	CCCTG	2	10	59357	59366	0 %	20 %	20 %	60 %	543966490
38	NC_022358	TTGCT	2	10	59644	59653	0 %	60 %	20 %	20 %	543966490
39	NC_022358	TTTCA	2	10	62739	62748	20 %	60 %	0 %	20 %	543966494
40	NC_022358	CCCCG	2	10	63494	63503	0 %	0 %	20 %	80 %	543966497
41	NC_022358	TCACT	2	10	64071	64080	20 %	40 %	0 %	40 %	543966497
42	NC_022358	GCGCC	2	10	64742	64751	0 %	0 %	40 %	60 %	543966499
43	NC_022358	CGCCC	2	10	65466	65475	0 %	0 %	20 %	80 %	543966499
44	NC_022358	GCGCC	2	10	65946	65955	0 %	0 %	40 %	60 %	543966501
45	NC_022358	GCCAG	2	10	66579	66588	20 %	0 %	40 %	40 %	543966501
46	NC_022358	GCCAG	2	10	67512	67521	20 %	0 %	40 %	40 %	543966503
47	NC_022358	TCCAC	2	10	67788	67797	20 %	20 %	0 %	60 %	543966503
48	NC_022358	CTCCA	2	10	67880	67889	20 %	20 %	0 %	60 %	543966503
49	NC_022358	TGACC	2	10	70612	70621	20 %	20 %	20 %	40 %	543966506
50	NC_022358	TCGGC	2	10	71805	71814	0 %	20 %	40 %	40 %	543966506
51	NC_022358	GCCGA	2	10	74616	74625	20 %	0 %	40 %	40 %	543966509
52	NC_022358	GGCAA	2	10	80061	80070	40 %	0 %	40 %	20 %	543966512
53	NC_022358	TTGGC	2	10	80201	80210	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_022358	TGCCC	2	10	82316	82325	0 %	20 %	20 %	60 %	543966514
55	NC_022358	GCAAG	2	10	83185	83194	40 %	0 %	40 %	20 %	543966515

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.