MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Sulfuricella denitrificans skB26 plasmid pSCD DNA

Total Repeats: 206

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022358	GTTT	2	8	429	436	0 %	75 %	25 %	0 %	543966429
2	NC_022358	ATAA	2	8	1109	1116	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022358	TATT	2	8	1148	1155	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022358	CAAA	2	8	1179	1186	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_022358	CAAT	2	8	1484	1491	50 %	25 %	0 %	25 %	543966430
6	NC_022358	TTAT	2	8	1520	1527	25 %	75 %	0 %	0 %	543966430
7	NC_022358	AACA	2	8	1568	1575	75 %	0 %	0 %	25 %	543966430
8	NC_022358	TCCT	2	8	1791	1798	0 %	50 %	0 %	50 %	543966430
9	NC_022358	AATT	2	8	1853	1860	50 %	50 %	0 %	0 %	543966430
10	NC_022358	AGCT	2	8	2508	2515	25 %	25 %	25 %	25 %	543966431
11	NC_022358	TCAT	2	8	2576	2583	25 %	50 %	0 %	25 %	543966431
12	NC_022358	GTCA	2	8	4107	4114	25 %	25 %	25 %	25 %	543966432
13	NC_022358	TCGT	2	8	4162	4169	0 %	50 %	25 %	25 %	543966432
14	NC_022358	TTCC	2	8	4171	4178	0 %	50 %	0 %	50 %	543966432
15	NC_022358	CGTG	2	8	4244	4251	0 %	25 %	50 %	25 %	543966432
16	NC_022358	GATC	2	8	4292	4299	25 %	25 %	25 %	25 %	543966432
17	NC_022358	CTTT	2	8	4333	4340	0 %	75 %	0 %	25 %	543966432
18	NC_022358	TGCA	2	8	5115	5122	25 %	25 %	25 %	25 %	543966433
19	NC_022358	CGTT	2	8	5246	5253	0 %	50 %	25 %	25 %	543966433
20	NC_022358	ACGG	2	8	5269	5276	25 %	0 %	50 %	25 %	543966433
21	NC_022358	GCCA	2	8	5323	5330	25 %	0 %	25 %	50 %	543966433
22	NC_022358	CCAG	2	8	6017	6024	25 %	0 %	25 %	50 %	543966434
23	NC_022358	TTCC	2	8	6092	6099	0 %	50 %	0 %	50 %	543966434
24	NC_022358	GTGG	2	8	6228	6235	0 %	25 %	75 %	0 %	543966434
25	NC_022358	TTGA	2	8	6559	6566	25 %	50 %	25 %	0 %	543966434
26	NC_022358	TCTG	2	8	6774	6781	0 %	50 %	25 %	25 %	543966435
27	NC_022358	GAAA	2	8	6826	6833	75 %	0 %	25 %	0 %	543966435
28	NC_022358	GGCA	2	8	6863	6870	25 %	0 %	50 %	25 %	543966435
29	NC_022358	TAGA	2	8	6876	6883	50 %	25 %	25 %	0 %	543966435
30	NC_022358	ATAA	2	8	7453	7460	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022358	AATT	2	8	7496	7503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022358	TATC	2	8	7902	7909	25 %	50 %	0 %	25 %	543966436
33	NC_022358	AAGG	2	8	7918	7925	50 %	0 %	50 %	0 %	543966436
34	NC_022358	GTGG	2	8	8174	8181	0 %	25 %	75 %	0 %	543966436
35	NC_022358	CGCT	2	8	8270	8277	0 %	25 %	25 %	50 %	543966436
36	NC_022358	GCCA	2	8	8336	8343	25 %	0 %	25 %	50 %	543966436
37	NC_022358	ACAA	2	8	8485	8492	75 %	0 %	0 %	25 %	543966437
38	NC_022358	CATC	2	8	8911	8918	25 %	25 %	0 %	50 %	543966437
39	NC_022358	GCCT	2	8	8952	8959	0 %	25 %	25 %	50 %	543966437
40	NC_022358	TCGA	2	8	9187	9194	25 %	25 %	25 %	25 %	543966437
41	NC_022358	ATTG	2	8	9914	9921	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022358	CGAC	2	8	10353	10360	25 %	0 %	25 %	50 %	543966438
43	NC_022358	GCCT	2	8	10928	10935	0 %	25 %	25 %	50 %	543966439
44	NC_022358	ATGA	2	8	10998	11005	50 %	25 %	25 %	0 %	543966439
45	NC_022358	CAAA	2	8	11524	11531	75 %	0 %	0 %	25 %	543966440
46	NC_022358	ATGT	2	8	11782	11789	25 %	50 %	25 %	0 %	543966441
47	NC_022358	GCAT	2	8	12007	12014	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_022358	ATAC	2	8	12398	12405	50 %	25 %	0 %	25 %	543966442
49	NC_022358	CTAT	2	8	12427	12434	25 %	50 %	0 %	25 %	543966442
50	NC_022358	AGGC	2	8	12492	12499	25 %	0 %	50 %	25 %	543966442
51	NC_022358	AAAT	2	8	12666	12673	75 %	25 %	0 %	0 %	543966442
52	NC_022358	GAGG	2	8	12974	12981	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022358	TCTA	2	8	13854	13861	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_022358	GATC	2	8	14037	14044	25 %	25 %	25 %	25 %	543966444
55	NC_022358	TTCA	2	8	15340	15347	25 %	50 %	0 %	25 %	543966444
56	NC_022358	AAAT	2	8	16068	16075	75 %	25 %	0 %	0 %	543966444
57	NC_022358	GTAT	2	8	16900	16907	25 %	50 %	25 %	0 %	543966445
58	NC_022358	GCAG	2	8	16927	16934	25 %	0 %	50 %	25 %	543966445
59	NC_022358	CTCA	2	8	17273	17280	25 %	25 %	0 %	50 %	543966446
60	NC_022358	GCAA	2	8	17701	17708	50 %	0 %	25 %	25 %	543966446
61	NC_022358	CTCC	2	8	18220	18227	0 %	25 %	0 %	75 %	543966447
62	NC_022358	GTTC	2	8	18442	18449	0 %	50 %	25 %	25 %	543966448
63	NC_022358	TTCT	2	8	18817	18824	0 %	75 %	0 %	25 %	543966448
64	NC_022358	AGGC	2	8	19335	19342	25 %	0 %	50 %	25 %	543966448
65	NC_022358	TTTA	2	8	20686	20693	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022358	GCCA	2	8	20755	20762	25 %	0 %	25 %	50 %	543966449
67	NC_022358	CAGG	2	8	20793	20800	25 %	0 %	50 %	25 %	543966449
68	NC_022358	GAAA	2	8	21029	21036	75 %	0 %	25 %	0 %	543966449
69	NC_022358	AGCG	2	8	21892	21899	25 %	0 %	50 %	25 %	543966450
70	NC_022358	AAGG	2	8	22357	22364	50 %	0 %	50 %	0 %	543966450
71	NC_022358	GCTG	2	8	23483	23490	0 %	25 %	50 %	25 %	543966451
72	NC_022358	GATG	2	8	23573	23580	25 %	25 %	50 %	0 %	543966451
73	NC_022358	AATG	2	8	24659	24666	50 %	25 %	25 %	0 %	543966452
74	NC_022358	AAGT	2	8	24806	24813	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022358	AGTT	2	8	25032	25039	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022358	AATA	2	8	25056	25063	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022358	GATT	2	8	25275	25282	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022358	CCGT	2	8	25532	25539	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_022358	GCTG	2	8	26850	26857	0 %	25 %	50 %	25 %	543966455
80	NC_022358	TGTT	2	8	27395	27402	0 %	75 %	25 %	0 %	543966456
81	NC_022358	ATTC	2	8	28095	28102	25 %	50 %	0 %	25 %	543966458
82	NC_022358	TGCT	2	8	28144	28151	0 %	50 %	25 %	25 %	543966458
83	NC_022358	AGGT	2	8	28788	28795	25 %	25 %	50 %	0 %	543966459
84	NC_022358	TAAG	2	8	28845	28852	50 %	25 %	25 %	0 %	543966459
85	NC_022358	AGCC	2	8	28875	28882	25 %	0 %	25 %	50 %	543966459
86	NC_022358	TCGA	2	8	29301	29308	25 %	25 %	25 %	25 %	543966459
87	NC_022358	GCCG	2	8	29576	29583	0 %	0 %	50 %	50 %	543966460
88	NC_022358	ATCA	2	8	29779	29786	50 %	25 %	0 %	25 %	543966460
89	NC_022358	GTAC	2	8	30057	30064	25 %	25 %	25 %	25 %	543966460
90	NC_022358	CAGC	2	8	30140	30147	25 %	0 %	25 %	50 %	543966460
91	NC_022358	GGCT	2	8	30602	30609	0 %	25 %	50 %	25 %	543966461
92	NC_022358	GGGT	2	8	30759	30766	0 %	25 %	75 %	0 %	543966461
93	NC_022358	CCCA	2	8	30920	30927	25 %	0 %	0 %	75 %	543966461
94	NC_022358	GGCC	2	8	31200	31207	0 %	0 %	50 %	50 %	543966462
95	NC_022358	GCCG	2	8	31347	31354	0 %	0 %	50 %	50 %	543966462
96	NC_022358	GTGG	2	8	31792	31799	0 %	25 %	75 %	0 %	543966462
97	NC_022358	GCGA	2	8	32054	32061	25 %	0 %	50 %	25 %	543966462
98	NC_022358	CACC	2	8	32484	32491	25 %	0 %	0 %	75 %	543966462
99	NC_022358	GCCA	2	8	32888	32895	25 %	0 %	25 %	50 %	543966463
100	NC_022358	GCGG	2	8	32921	32928	0 %	0 %	75 %	25 %	543966463
101	NC_022358	CGCC	2	8	33109	33116	0 %	0 %	25 %	75 %	543966463
102	NC_022358	TCGG	2	8	34909	34916	0 %	25 %	50 %	25 %	543966467
103	NC_022358	TCAG	2	8	35032	35039	25 %	25 %	25 %	25 %	543966468
104	NC_022358	GGCA	2	8	35409	35416	25 %	0 %	50 %	25 %	543966468
105	NC_022358	CAGC	2	8	36005	36012	25 %	0 %	25 %	50 %	543966468
106	NC_022358	GCAC	2	8	36154	36161	25 %	0 %	25 %	50 %	543966468
107	NC_022358	CGAC	2	8	36295	36302	25 %	0 %	25 %	50 %	543966468
108	NC_022358	ATTC	2	8	36330	36337	25 %	50 %	0 %	25 %	543966468
109	NC_022358	TCCA	2	8	36513	36520	25 %	25 %	0 %	50 %	543966469
110	NC_022358	TCAG	2	8	37859	37866	25 %	25 %	25 %	25 %	543966470
111	NC_022358	CAAG	2	8	37905	37912	50 %	0 %	25 %	25 %	543966470
112	NC_022358	AAGT	2	8	37914	37921	50 %	25 %	25 %	0 %	543966470
113	NC_022358	TCCA	2	8	38020	38027	25 %	25 %	0 %	50 %	543966470
114	NC_022358	CCGG	2	8	38343	38350	0 %	0 %	50 %	50 %	543966470
115	NC_022358	CCCA	2	8	38560	38567	25 %	0 %	0 %	75 %	543966470
116	NC_022358	GCGT	2	8	39033	39040	0 %	25 %	50 %	25 %	543966470
117	NC_022358	CTGG	2	8	39303	39310	0 %	25 %	50 %	25 %	543966470
118	NC_022358	GCAG	2	8	40237	40244	25 %	0 %	50 %	25 %	543966471
119	NC_022358	CCCG	2	8	40822	40829	0 %	0 %	25 %	75 %	543966472
120	NC_022358	AAAC	2	8	40832	40839	75 %	0 %	0 %	25 %	543966472
121	NC_022358	CAGT	2	8	41056	41063	25 %	25 %	25 %	25 %	543966472
122	NC_022358	TGTC	2	8	41588	41595	0 %	50 %	25 %	25 %	543966473
123	NC_022358	TCAT	2	8	41910	41917	25 %	50 %	0 %	25 %	543966474
124	NC_022358	CCAG	2	8	43111	43118	25 %	0 %	25 %	50 %	543966475
125	NC_022358	GGGC	2	8	43145	43152	0 %	0 %	75 %	25 %	543966475
126	NC_022358	CGGG	2	8	43283	43290	0 %	0 %	75 %	25 %	543966475
127	NC_022358	CACG	2	8	43391	43398	25 %	0 %	25 %	50 %	543966475
128	NC_022358	CGGT	2	8	44074	44081	0 %	25 %	50 %	25 %	543966475
129	NC_022358	GCCA	2	8	44245	44252	25 %	0 %	25 %	50 %	543966475
130	NC_022358	CAAG	2	8	44327	44334	50 %	0 %	25 %	25 %	543966475
131	NC_022358	CAGC	2	8	45734	45741	25 %	0 %	25 %	50 %	543966475
132	NC_022358	GGCG	2	8	46264	46271	0 %	0 %	75 %	25 %	543966476
133	NC_022358	CGCC	2	8	46492	46499	0 %	0 %	25 %	75 %	543966476
134	NC_022358	GGCC	2	8	46624	46631	0 %	0 %	50 %	50 %	543966476
135	NC_022358	CAGC	2	8	46873	46880	25 %	0 %	25 %	50 %	543966476
136	NC_022358	TGAG	2	8	47739	47746	25 %	25 %	50 %	0 %	543966477
137	NC_022358	CAAT	2	8	48126	48133	50 %	25 %	0 %	25 %	543966477
138	NC_022358	CCGC	2	8	49174	49181	0 %	0 %	25 %	75 %	543966478
139	NC_022358	CCTG	2	8	50180	50187	0 %	25 %	25 %	50 %	543966479
140	NC_022358	GCAA	2	8	50643	50650	50 %	0 %	25 %	25 %	543966480
141	NC_022358	CGGT	2	8	50915	50922	0 %	25 %	50 %	25 %	543966480
142	NC_022358	ACGA	2	8	51841	51848	50 %	0 %	25 %	25 %	543966482
143	NC_022358	CGGG	2	8	52064	52071	0 %	0 %	75 %	25 %	543966482
144	NC_022358	GCGG	2	8	52994	53001	0 %	0 %	75 %	25 %	543966484
145	NC_022358	AGGC	2	8	54086	54093	25 %	0 %	50 %	25 %	543966485
146	NC_022358	CCTT	2	8	56152	56159	0 %	50 %	0 %	50 %	543966489
147	NC_022358	GACC	2	8	56774	56781	25 %	0 %	25 %	50 %	543966489
148	NC_022358	TGCG	2	8	57085	57092	0 %	25 %	50 %	25 %	543966489
149	NC_022358	GCAG	2	8	57382	57389	25 %	0 %	50 %	25 %	543966489
150	NC_022358	GCAG	2	8	59207	59214	25 %	0 %	50 %	25 %	543966490
151	NC_022358	GCCT	2	8	60632	60639	0 %	25 %	25 %	50 %	543966491
152	NC_022358	TGCA	2	8	61350	61357	25 %	25 %	25 %	25 %	543966491
153	NC_022358	ACGA	2	8	61488	61495	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
154	NC_022358	GGCA	2	8	61749	61756	25 %	0 %	50 %	25 %	543966492
155	NC_022358	TGCG	2	8	63240	63247	0 %	25 %	50 %	25 %	543966496
156	NC_022358	AGGA	2	8	65212	65219	50 %	0 %	50 %	0 %	543966499
157	NC_022358	GGCA	2	8	65770	65777	25 %	0 %	50 %	25 %	543966500
158	NC_022358	CAGC	2	8	66841	66848	25 %	0 %	25 %	50 %	543966501
159	NC_022358	TGCT	2	8	67159	67166	0 %	50 %	25 %	25 %	543966502
160	NC_022358	CAAG	2	8	67941	67948	50 %	0 %	25 %	25 %	543966503
161	NC_022358	GTTC	2	8	68705	68712	0 %	50 %	25 %	25 %	543966504
162	NC_022358	TCCC	2	8	68837	68844	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
163	NC_022358	TCAT	2	8	69894	69901	25 %	50 %	0 %	25 %	543966505
164	NC_022358	GATG	2	8	70873	70880	25 %	25 %	50 %	0 %	543966506
165	NC_022358	GTCG	2	8	72567	72574	0 %	25 %	50 %	25 %	543966507
166	NC_022358	GGCG	2	8	72896	72903	0 %	0 %	75 %	25 %	543966507
167	NC_022358	CGAT	2	8	73229	73236	25 %	25 %	25 %	25 %	543966508
168	NC_022358	TCCA	2	8	73699	73706	25 %	25 %	0 %	50 %	543966508
169	NC_022358	ATGG	2	8	74295	74302	25 %	25 %	50 %	0 %	543966509
170	NC_022358	CCCA	2	8	74415	74422	25 %	0 %	0 %	75 %	543966509
171	NC_022358	CTTC	2	8	74740	74747	0 %	50 %	0 %	50 %	543966509
172	NC_022358	GCCA	2	8	74919	74926	25 %	0 %	25 %	50 %	543966509
173	NC_022358	CGAC	2	8	75139	75146	25 %	0 %	25 %	50 %	543966509
174	NC_022358	CTCG	2	8	75209	75216	0 %	25 %	25 %	50 %	543966509
175	NC_022358	ACGC	2	8	75697	75704	25 %	0 %	25 %	50 %	543966510
176	NC_022358	GGAT	2	8	76387	76394	25 %	25 %	50 %	0 %	543966511
177	NC_022358	GGCA	2	8	76533	76540	25 %	0 %	50 %	25 %	543966511
178	NC_022358	GCAG	2	8	76567	76574	25 %	0 %	50 %	25 %	543966511
179	NC_022358	CAGG	2	8	77057	77064	25 %	0 %	50 %	25 %	543966511
180	NC_022358	CCCT	2	8	77394	77401	0 %	25 %	0 %	75 %	543966511
181	NC_022358	CAGG	2	8	77618	77625	25 %	0 %	50 %	25 %	543966511
182	NC_022358	TTGC	2	8	77709	77716	0 %	50 %	25 %	25 %	543966511
183	NC_022358	CCGT	2	8	78088	78095	0 %	25 %	25 %	50 %	543966511
184	NC_022358	GCCA	2	8	78864	78871	25 %	0 %	25 %	50 %	543966511
185	NC_022358	TGGT	2	8	79454	79461	0 %	50 %	50 %	0 %	543966512
186	NC_022358	GTTC	2	8	79468	79475	0 %	50 %	25 %	25 %	543966512
187	NC_022358	TGCC	2	8	79496	79503	0 %	25 %	25 %	50 %	543966512
188	NC_022358	GGCA	2	8	79578	79585	25 %	0 %	50 %	25 %	543966512
189	NC_022358	GCAC	2	8	79760	79767	25 %	0 %	25 %	50 %	543966512
190	NC_022358	CTAT	2	8	80358	80365	25 %	50 %	0 %	25 %	543966513
191	NC_022358	CCGC	2	8	80699	80706	0 %	0 %	25 %	75 %	543966513
192	NC_022358	TCGC	2	8	80722	80729	0 %	25 %	25 %	50 %	543966513
193	NC_022358	AGTC	2	8	80946	80953	25 %	25 %	25 %	25 %	543966513
194	NC_022358	GGTT	2	8	81065	81072	0 %	50 %	50 %	0 %	543966513
195	NC_022358	AGCG	2	8	81966	81973	25 %	0 %	50 %	25 %	543966514
196	NC_022358	CAGC	2	8	83097	83104	25 %	0 %	25 %	50 %	543966515
197	NC_022358	CCAC	2	8	83463	83470	25 %	0 %	0 %	75 %	543966515
198	NC_022358	TGGC	2	8	83585	83592	0 %	25 %	50 %	25 %	543966515
199	NC_022358	TGCT	2	8	84000	84007	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
200	NC_022358	GCCC	2	8	84713	84720	0 %	0 %	25 %	75 %	543966516
201	NC_022358	TCAT	2	8	84798	84805	25 %	50 %	0 %	25 %	543966516
202	NC_022358	GAGC	2	8	84931	84938	25 %	0 %	50 %	25 %	543966517
203	NC_022358	CGTT	2	8	84960	84967	0 %	50 %	25 %	25 %	543966517
204	NC_022358	CAGC	2	8	85475	85482	25 %	0 %	25 %	50 %	543966518
205	NC_022358	TGCT	2	8	85516	85523	0 %	50 %	25 %	25 %	543966518
206	NC_022358	TCCG	2	8	85984	85991	0 %	25 %	25 %	50 %	543966518

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.