MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Sulfuricella denitrificans skB26 plasmid pSCD DNA

Total Repeats: 188

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022358	GTTT	2	8	429	436	0 %	75 %	25 %	0 %	543966429
2	NC_022358	CAAT	2	8	1484	1491	50 %	25 %	0 %	25 %	543966430
3	NC_022358	TTAT	2	8	1520	1527	25 %	75 %	0 %	0 %	543966430
4	NC_022358	AACA	2	8	1568	1575	75 %	0 %	0 %	25 %	543966430
5	NC_022358	TCCT	2	8	1791	1798	0 %	50 %	0 %	50 %	543966430
6	NC_022358	AATT	2	8	1853	1860	50 %	50 %	0 %	0 %	543966430
7	NC_022358	AGCT	2	8	2508	2515	25 %	25 %	25 %	25 %	543966431
8	NC_022358	TCAT	2	8	2576	2583	25 %	50 %	0 %	25 %	543966431
9	NC_022358	GTCA	2	8	4107	4114	25 %	25 %	25 %	25 %	543966432
10	NC_022358	TCGT	2	8	4162	4169	0 %	50 %	25 %	25 %	543966432
11	NC_022358	TTCC	2	8	4171	4178	0 %	50 %	0 %	50 %	543966432
12	NC_022358	CGTG	2	8	4244	4251	0 %	25 %	50 %	25 %	543966432
13	NC_022358	GATC	2	8	4292	4299	25 %	25 %	25 %	25 %	543966432
14	NC_022358	CTTT	2	8	4333	4340	0 %	75 %	0 %	25 %	543966432
15	NC_022358	TGCA	2	8	5115	5122	25 %	25 %	25 %	25 %	543966433
16	NC_022358	CGTT	2	8	5246	5253	0 %	50 %	25 %	25 %	543966433
17	NC_022358	ACGG	2	8	5269	5276	25 %	0 %	50 %	25 %	543966433
18	NC_022358	GCCA	2	8	5323	5330	25 %	0 %	25 %	50 %	543966433
19	NC_022358	CCAG	2	8	6017	6024	25 %	0 %	25 %	50 %	543966434
20	NC_022358	TTCC	2	8	6092	6099	0 %	50 %	0 %	50 %	543966434
21	NC_022358	GTGG	2	8	6228	6235	0 %	25 %	75 %	0 %	543966434
22	NC_022358	TTGA	2	8	6559	6566	25 %	50 %	25 %	0 %	543966434
23	NC_022358	TCTG	2	8	6774	6781	0 %	50 %	25 %	25 %	543966435
24	NC_022358	GAAA	2	8	6826	6833	75 %	0 %	25 %	0 %	543966435
25	NC_022358	GGCA	2	8	6863	6870	25 %	0 %	50 %	25 %	543966435
26	NC_022358	TAGA	2	8	6876	6883	50 %	25 %	25 %	0 %	543966435
27	NC_022358	TATC	2	8	7902	7909	25 %	50 %	0 %	25 %	543966436
28	NC_022358	AAGG	2	8	7918	7925	50 %	0 %	50 %	0 %	543966436
29	NC_022358	GTGG	2	8	8174	8181	0 %	25 %	75 %	0 %	543966436
30	NC_022358	CGCT	2	8	8270	8277	0 %	25 %	25 %	50 %	543966436
31	NC_022358	GCCA	2	8	8336	8343	25 %	0 %	25 %	50 %	543966436
32	NC_022358	ACAA	2	8	8485	8492	75 %	0 %	0 %	25 %	543966437
33	NC_022358	CATC	2	8	8911	8918	25 %	25 %	0 %	50 %	543966437
34	NC_022358	GCCT	2	8	8952	8959	0 %	25 %	25 %	50 %	543966437
35	NC_022358	TCGA	2	8	9187	9194	25 %	25 %	25 %	25 %	543966437
36	NC_022358	CGAC	2	8	10353	10360	25 %	0 %	25 %	50 %	543966438
37	NC_022358	GCCT	2	8	10928	10935	0 %	25 %	25 %	50 %	543966439
38	NC_022358	ATGA	2	8	10998	11005	50 %	25 %	25 %	0 %	543966439
39	NC_022358	CAAA	2	8	11524	11531	75 %	0 %	0 %	25 %	543966440
40	NC_022358	ATGT	2	8	11782	11789	25 %	50 %	25 %	0 %	543966441
41	NC_022358	ATAC	2	8	12398	12405	50 %	25 %	0 %	25 %	543966442
42	NC_022358	CTAT	2	8	12427	12434	25 %	50 %	0 %	25 %	543966442
43	NC_022358	AGGC	2	8	12492	12499	25 %	0 %	50 %	25 %	543966442
44	NC_022358	AAAT	2	8	12666	12673	75 %	25 %	0 %	0 %	543966442
45	NC_022358	GATC	2	8	14037	14044	25 %	25 %	25 %	25 %	543966444
46	NC_022358	TTCA	2	8	15340	15347	25 %	50 %	0 %	25 %	543966444
47	NC_022358	AAAT	2	8	16068	16075	75 %	25 %	0 %	0 %	543966444
48	NC_022358	GTAT	2	8	16900	16907	25 %	50 %	25 %	0 %	543966445
49	NC_022358	GCAG	2	8	16927	16934	25 %	0 %	50 %	25 %	543966445
50	NC_022358	CTCA	2	8	17273	17280	25 %	25 %	0 %	50 %	543966446
51	NC_022358	GCAA	2	8	17701	17708	50 %	0 %	25 %	25 %	543966446
52	NC_022358	CTCC	2	8	18220	18227	0 %	25 %	0 %	75 %	543966447
53	NC_022358	GTTC	2	8	18442	18449	0 %	50 %	25 %	25 %	543966448
54	NC_022358	TTCT	2	8	18817	18824	0 %	75 %	0 %	25 %	543966448
55	NC_022358	AGGC	2	8	19335	19342	25 %	0 %	50 %	25 %	543966448
56	NC_022358	GCCA	2	8	20755	20762	25 %	0 %	25 %	50 %	543966449
57	NC_022358	CAGG	2	8	20793	20800	25 %	0 %	50 %	25 %	543966449
58	NC_022358	GAAA	2	8	21029	21036	75 %	0 %	25 %	0 %	543966449
59	NC_022358	AGCG	2	8	21892	21899	25 %	0 %	50 %	25 %	543966450
60	NC_022358	AAGG	2	8	22357	22364	50 %	0 %	50 %	0 %	543966450
61	NC_022358	GCTG	2	8	23483	23490	0 %	25 %	50 %	25 %	543966451
62	NC_022358	GATG	2	8	23573	23580	25 %	25 %	50 %	0 %	543966451
63	NC_022358	AATG	2	8	24659	24666	50 %	25 %	25 %	0 %	543966452
64	NC_022358	GCTG	2	8	26850	26857	0 %	25 %	50 %	25 %	543966455
65	NC_022358	TGTT	2	8	27395	27402	0 %	75 %	25 %	0 %	543966456
66	NC_022358	ATTC	2	8	28095	28102	25 %	50 %	0 %	25 %	543966458
67	NC_022358	TGCT	2	8	28144	28151	0 %	50 %	25 %	25 %	543966458
68	NC_022358	AGGT	2	8	28788	28795	25 %	25 %	50 %	0 %	543966459
69	NC_022358	TAAG	2	8	28845	28852	50 %	25 %	25 %	0 %	543966459
70	NC_022358	AGCC	2	8	28875	28882	25 %	0 %	25 %	50 %	543966459
71	NC_022358	TCGA	2	8	29301	29308	25 %	25 %	25 %	25 %	543966459
72	NC_022358	GCCG	2	8	29576	29583	0 %	0 %	50 %	50 %	543966460
73	NC_022358	ATCA	2	8	29779	29786	50 %	25 %	0 %	25 %	543966460
74	NC_022358	GTAC	2	8	30057	30064	25 %	25 %	25 %	25 %	543966460
75	NC_022358	CAGC	2	8	30140	30147	25 %	0 %	25 %	50 %	543966460
76	NC_022358	GGCT	2	8	30602	30609	0 %	25 %	50 %	25 %	543966461
77	NC_022358	GGGT	2	8	30759	30766	0 %	25 %	75 %	0 %	543966461
78	NC_022358	CCCA	2	8	30920	30927	25 %	0 %	0 %	75 %	543966461
79	NC_022358	GGCC	2	8	31200	31207	0 %	0 %	50 %	50 %	543966462
80	NC_022358	GCCG	2	8	31347	31354	0 %	0 %	50 %	50 %	543966462
81	NC_022358	GTGG	2	8	31792	31799	0 %	25 %	75 %	0 %	543966462
82	NC_022358	GCGA	2	8	32054	32061	25 %	0 %	50 %	25 %	543966462
83	NC_022358	CACC	2	8	32484	32491	25 %	0 %	0 %	75 %	543966462
84	NC_022358	GCCA	2	8	32888	32895	25 %	0 %	25 %	50 %	543966463
85	NC_022358	GCGG	2	8	32921	32928	0 %	0 %	75 %	25 %	543966463
86	NC_022358	CGCC	2	8	33109	33116	0 %	0 %	25 %	75 %	543966463
87	NC_022358	TCGG	2	8	34909	34916	0 %	25 %	50 %	25 %	543966467
88	NC_022358	TCAG	2	8	35032	35039	25 %	25 %	25 %	25 %	543966468
89	NC_022358	GGCA	2	8	35409	35416	25 %	0 %	50 %	25 %	543966468
90	NC_022358	CAGC	2	8	36005	36012	25 %	0 %	25 %	50 %	543966468
91	NC_022358	GCAC	2	8	36154	36161	25 %	0 %	25 %	50 %	543966468
92	NC_022358	CGAC	2	8	36295	36302	25 %	0 %	25 %	50 %	543966468
93	NC_022358	ATTC	2	8	36330	36337	25 %	50 %	0 %	25 %	543966468
94	NC_022358	TCCA	2	8	36513	36520	25 %	25 %	0 %	50 %	543966469
95	NC_022358	TCAG	2	8	37859	37866	25 %	25 %	25 %	25 %	543966470
96	NC_022358	CAAG	2	8	37905	37912	50 %	0 %	25 %	25 %	543966470
97	NC_022358	AAGT	2	8	37914	37921	50 %	25 %	25 %	0 %	543966470
98	NC_022358	TCCA	2	8	38020	38027	25 %	25 %	0 %	50 %	543966470
99	NC_022358	CCGG	2	8	38343	38350	0 %	0 %	50 %	50 %	543966470
100	NC_022358	CCCA	2	8	38560	38567	25 %	0 %	0 %	75 %	543966470
101	NC_022358	GCGT	2	8	39033	39040	0 %	25 %	50 %	25 %	543966470
102	NC_022358	CTGG	2	8	39303	39310	0 %	25 %	50 %	25 %	543966470
103	NC_022358	GCAG	2	8	40237	40244	25 %	0 %	50 %	25 %	543966471
104	NC_022358	CCCG	2	8	40822	40829	0 %	0 %	25 %	75 %	543966472
105	NC_022358	AAAC	2	8	40832	40839	75 %	0 %	0 %	25 %	543966472
106	NC_022358	CAGT	2	8	41056	41063	25 %	25 %	25 %	25 %	543966472
107	NC_022358	TGTC	2	8	41588	41595	0 %	50 %	25 %	25 %	543966473
108	NC_022358	TCAT	2	8	41910	41917	25 %	50 %	0 %	25 %	543966474
109	NC_022358	CCAG	2	8	43111	43118	25 %	0 %	25 %	50 %	543966475
110	NC_022358	GGGC	2	8	43145	43152	0 %	0 %	75 %	25 %	543966475
111	NC_022358	CGGG	2	8	43283	43290	0 %	0 %	75 %	25 %	543966475
112	NC_022358	CACG	2	8	43391	43398	25 %	0 %	25 %	50 %	543966475
113	NC_022358	CGGT	2	8	44074	44081	0 %	25 %	50 %	25 %	543966475
114	NC_022358	GCCA	2	8	44245	44252	25 %	0 %	25 %	50 %	543966475
115	NC_022358	CAAG	2	8	44327	44334	50 %	0 %	25 %	25 %	543966475
116	NC_022358	CAGC	2	8	45734	45741	25 %	0 %	25 %	50 %	543966475
117	NC_022358	GGCG	2	8	46264	46271	0 %	0 %	75 %	25 %	543966476
118	NC_022358	CGCC	2	8	46492	46499	0 %	0 %	25 %	75 %	543966476
119	NC_022358	GGCC	2	8	46624	46631	0 %	0 %	50 %	50 %	543966476
120	NC_022358	CAGC	2	8	46873	46880	25 %	0 %	25 %	50 %	543966476
121	NC_022358	TGAG	2	8	47739	47746	25 %	25 %	50 %	0 %	543966477
122	NC_022358	CAAT	2	8	48126	48133	50 %	25 %	0 %	25 %	543966477
123	NC_022358	CCGC	2	8	49174	49181	0 %	0 %	25 %	75 %	543966478
124	NC_022358	CCTG	2	8	50180	50187	0 %	25 %	25 %	50 %	543966479
125	NC_022358	GCAA	2	8	50643	50650	50 %	0 %	25 %	25 %	543966480
126	NC_022358	CGGT	2	8	50915	50922	0 %	25 %	50 %	25 %	543966480
127	NC_022358	ACGA	2	8	51841	51848	50 %	0 %	25 %	25 %	543966482
128	NC_022358	CGGG	2	8	52064	52071	0 %	0 %	75 %	25 %	543966482
129	NC_022358	GCGG	2	8	52994	53001	0 %	0 %	75 %	25 %	543966484
130	NC_022358	AGGC	2	8	54086	54093	25 %	0 %	50 %	25 %	543966485
131	NC_022358	CCTT	2	8	56152	56159	0 %	50 %	0 %	50 %	543966489
132	NC_022358	GACC	2	8	56774	56781	25 %	0 %	25 %	50 %	543966489
133	NC_022358	TGCG	2	8	57085	57092	0 %	25 %	50 %	25 %	543966489
134	NC_022358	GCAG	2	8	57382	57389	25 %	0 %	50 %	25 %	543966489
135	NC_022358	GCAG	2	8	59207	59214	25 %	0 %	50 %	25 %	543966490
136	NC_022358	GCCT	2	8	60632	60639	0 %	25 %	25 %	50 %	543966491
137	NC_022358	TGCA	2	8	61350	61357	25 %	25 %	25 %	25 %	543966491
138	NC_022358	GGCA	2	8	61749	61756	25 %	0 %	50 %	25 %	543966492
139	NC_022358	TGCG	2	8	63240	63247	0 %	25 %	50 %	25 %	543966496
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.