MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Sulfuricella denitrificans skB26 DNA

Total Repeats: 64

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022357	CCCGAC	2	12	25886	25897	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_022357	CGGTCA	2	12	28268	28279	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_022357	CCCCAT	2	12	98931	98942	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_022357	GATAAA	2	12	133240	133251	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022357	AATGTA	2	12	133625	133636	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022357	CCCCGA	2	12	268188	268199	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_022357	GAGGCA	2	12	460341	460352	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_022357	AAAGCC	2	12	470118	470129	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_022357	GCTACC	2	12	478012	478023	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
10	NC_022357	ATTCCG	2	12	483335	483346	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_022357	TTAATC	2	12	485448	485459	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_022357	AGCAGT	2	12	504687	504698	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_022357	CGCCTA	2	12	517987	517998	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
14	NC_022357	AGGATG	2	12	566412	566423	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022357	GTTGAT	2	12	575314	575325	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022357	GAATTT	2	12	677389	677400	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022357	AGGGGG	2	12	721020	721031	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022357	AGAGGG	2	12	724553	724564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022357	CAAAAC	2	12	898075	898086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_022357	TAAAAA	2	12	904951	904962	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022357	AAGGCC	2	12	971202	971213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_022357	GACCGG	2	12	1018799	1018810	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_022357	GAATTA	2	12	1067528	1067539	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022357	GGTGTC	2	12	1071483	1071494	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_022357	TGATGT	2	12	1076352	1076363	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022357	ATCCAG	2	12	1098190	1098201	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_022357	TTGTGA	2	12	1127097	1127108	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022357	TTAGAA	2	12	1188917	1188928	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022357	TGCTTA	2	12	1198512	1198523	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_022357	TAAGCA	2	12	1210906	1210917	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_022357	TTTATT	2	12	1245537	1245548	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022357	GCAGGA	2	12	1262682	1262693	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_022357	GCTTTT	2	12	1354685	1354696	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_022357	TGAGCC	2	12	1501352	1501363	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_022357	TAAATA	2	12	1533823	1533834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022357	CTCGGC	2	12	1569688	1569699	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
37	NC_022357	TTTAAA	2	12	1596578	1596589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022357	AAATTC	2	12	1650512	1650523	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_022357	GGGCGA	2	12	1683083	1683094	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_022357	AAATAA	2	12	1721457	1721468	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022357	GGCTGC	2	12	1763432	1763443	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_022357	GGGGAA	2	12	1851144	1851155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022357	GCCTCA	2	12	1853790	1853801	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
44	NC_022357	ACCCAA	2	12	1915198	1915209	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_022357	TTGTTT	2	12	1969441	1969452	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022357	CCATCC	2	12	2127958	2127969	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_022357	CAAAAA	2	12	2129937	2129948	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_022357	GCATCA	2	12	2226565	2226576	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_022357	CTGAAA	2	12	2234523	2234534	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_022357	ACAATA	2	12	2313271	2313282	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_022357	CCAGCC	2	12	2375770	2375781	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_022357	GGCCGT	2	12	2387218	2387229	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_022357	ATAGTT	2	12	2453408	2453419	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022357	CCAGCC	2	12	2517787	2517798	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_022357	CAGTTC	2	12	2538184	2538195	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_022357	AGGGGG	2	12	2587011	2587022	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022357	TGAAGT	2	12	2602787	2602798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022357	TCGAGA	2	12	2607024	2607035	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_022357	GGGCTG	2	12	2625866	2625877	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_022357	GTAAAC	2	12	2697989	2698000	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_022357	ACAAAA	2	12	2705182	2705193	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_022357	GGAATG	2	12	2952020	2952031	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022357	CAAAAA	2	12	3020130	3020141	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_022357	CGTTTA	2	12	3130360	3130371	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.