MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Sulfuricella denitrificans skB26 DNA

Total Repeats: 270

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022357	GTTGG	2	10	6073	6082	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022357	GGGTT	2	10	11985	11994	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022357	ATGTC	2	10	26627	26636	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_022357	AGGTA	2	10	97387	97396	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022357	CAAAC	2	10	98920	98929	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_022357	GAGGT	2	10	105313	105322	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022357	TTGCA	2	10	125226	125235	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_022357	GCGGA	2	10	125921	125930	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
9	NC_022357	CCTTG	2	10	125974	125983	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_022357	GACCA	2	10	132480	132489	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_022357	AAGCC	2	10	132881	132890	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_022357	CGTAT	2	10	139881	139890	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_022357	TGGCG	2	10	149531	149540	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
14	NC_022357	GCGCC	2	10	175272	175281	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
15	NC_022357	TATTT	2	10	183403	183412	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022357	CTCAT	2	10	204503	204512	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_022357	TTTGG	2	10	233309	233318	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022357	GTACT	2	10	260969	260978	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_022357	CCGCC	2	10	268256	268265	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
20	NC_022357	GTCCT	2	10	271840	271849	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_022357	TCTGC	2	10	310483	310492	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_022357	AATTT	2	10	396929	396938	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022357	GCCCG	2	10	397428	397437	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
24	NC_022357	CTGCA	2	10	403041	403050	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_022357	TGGAA	2	10	426541	426550	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022357	TGGAA	2	10	436424	436433	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022357	TAGGA	2	10	443582	443591	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022357	TTGTG	2	10	446610	446619	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022357	TGTTT	2	10	446648	446657	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022357	GGTTG	2	10	452504	452513	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022357	CGATG	2	10	455256	455265	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_022357	GGTTG	2	10	472250	472259	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022357	CCTTG	2	10	491412	491421	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_022357	CAAAA	2	10	498878	498887	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_022357	CTGGC	2	10	502869	502878	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
36	NC_022357	GGCGT	2	10	503971	503980	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
37	NC_022357	TAATT	2	10	512407	512416	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022357	AATGT	2	10	525499	525508	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022357	GTGCG	2	10	526103	526112	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
40	NC_022357	GCCAG	2	10	528605	528614	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
41	NC_022357	GCCAA	2	10	540624	540633	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
42	NC_022357	GATTT	2	10	551068	551077	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022357	TGCTG	2	10	563417	563426	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_022357	CTATG	2	10	566725	566734	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_022357	AAATC	2	10	572036	572045	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_022357	TGGTT	2	10	574947	574956	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022357	CCATT	2	10	603604	603613	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
48	NC_022357	AATTT	2	10	614604	614613	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022357	TGTAT	2	10	615406	615415	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022357	GCGGT	2	10	677340	677349	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
51	NC_022357	AAGTT	2	10	678704	678713	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022357	CTTTC	2	10	700585	700594	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
53	NC_022357	CGGCC	2	10	704312	704321	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
54	NC_022357	ATTCA	2	10	719105	719114	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_022357	TGCCT	2	10	721460	721469	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
56	NC_022357	TTCCA	2	10	724510	724519	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
57	NC_022357	AAAGC	2	10	727511	727520	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_022357	TTGAA	2	10	729830	729839	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022357	TAAAA	2	10	731849	731858	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022357	GGATG	2	10	733517	733526	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022357	GGTAG	2	10	739870	739879	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022357	TGCGC	2	10	749906	749915	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
63	NC_022357	CAGAA	2	10	760101	760110	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_022357	TGAGA	2	10	802118	802127	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022357	AGGGA	2	10	842518	842527	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022357	GCACC	2	10	862828	862837	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
67	NC_022357	TCCGC	2	10	871022	871031	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
68	NC_022357	TAGCC	2	10	880898	880907	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
69	NC_022357	CGCTA	2	10	894938	894947	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
70	NC_022357	TGTTT	2	10	910878	910887	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022357	GAAGA	2	10	913869	913878	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022357	AAAAT	2	10	913879	913888	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022357	TAAAT	2	10	975469	975478	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022357	ATGAC	2	10	977857	977866	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_022357	TCTGG	2	10	980995	981004	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_022357	TTCTG	2	10	990484	990493	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_022357	GGCTT	2	10	992681	992690	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_022357	TTTTC	2	10	994836	994845	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_022357	TTATC	2	10	1001957	1001966	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_022357	GCGCG	2	10	1006354	1006363	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
81	NC_022357	GACTG	2	10	1006379	1006388	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_022357	TGAAA	2	10	1009818	1009827	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022357	AGGTG	2	10	1012566	1012575	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022357	TCATA	2	10	1029493	1029502	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_022357	GCAAG	2	10	1041848	1041857	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
86	NC_022357	TGGAA	2	10	1066005	1066014	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022357	TTTTC	2	10	1069082	1069091	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_022357	CTTCA	2	10	1069227	1069236	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
89	NC_022357	GCTTT	2	10	1074015	1074024	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_022357	TTTTG	2	10	1076479	1076488	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022357	CTCGA	2	10	1098082	1098091	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
92	NC_022357	CGTGT	2	10	1113330	1113339	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
93	NC_022357	CGTTT	2	10	1114284	1114293	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_022357	TTTTG	2	10	1114403	1114412	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022357	GGCCC	2	10	1127156	1127165	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
96	NC_022357	TTGGC	2	10	1151123	1151132	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
97	NC_022357	AAATT	2	10	1168621	1168630	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022357	CATGC	2	10	1192045	1192054	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_022357	TGCAT	2	10	1195027	1195036	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_022357	TTTGT	2	10	1198438	1198447	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022357	TTGAG	2	10	1203961	1203970	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022357	GTTTT	2	10	1208547	1208556	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022357	CCATT	2	10	1211494	1211503	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
104	NC_022357	AAGTC	2	10	1218917	1218926	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_022357	TGCTG	2	10	1219106	1219115	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_022357	TCCAT	2	10	1219278	1219287	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
107	NC_022357	GCTGG	2	10	1219319	1219328	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
108	NC_022357	GAATG	2	10	1262803	1262812	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022357	AATAT	2	10	1268804	1268813	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022357	TTCGA	2	10	1293098	1293107	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_022357	GCCAG	2	10	1301336	1301345	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
112	NC_022357	GTTTT	2	10	1318603	1318612	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022357	TGTAT	2	10	1318967	1318976	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022357	GTAGA	2	10	1320073	1320082	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022357	ATGCA	2	10	1320318	1320327	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_022357	ACCAA	2	10	1320370	1320379	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
117	NC_022357	AAAGA	2	10	1335307	1335316	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022357	ATTAC	2	10	1346666	1346675	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_022357	CCTTG	2	10	1355239	1355248	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
120	NC_022357	CCAGG	2	10	1361337	1361346	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
121	NC_022357	CTGTA	2	10	1385700	1385709	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_022357	GCAGG	2	10	1386157	1386166	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
123	NC_022357	AAGCT	2	10	1396182	1396191	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_022357	AATCA	2	10	1427091	1427100	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_022357	GCTAC	2	10	1427494	1427503	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
126	NC_022357	TGACA	2	10	1427583	1427592	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_022357	TGAAG	2	10	1433791	1433800	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022357	CAATT	2	10	1439422	1439431	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_022357	CGCTG	2	10	1440237	1440246	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
130	NC_022357	GCAAA	2	10	1447804	1447813	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_022357	GAAAT	2	10	1448876	1448885	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022357	GCATG	2	10	1458313	1458322	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_022357	ACTTC	2	10	1472042	1472051	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
134	NC_022357	ACCCC	2	10	1525071	1525080	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
135	NC_022357	TTTAT	2	10	1533813	1533822	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022357	TACCG	2	10	1549391	1549400	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
137	NC_022357	ATCAA	2	10	1561259	1561268	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_022357	AACTA	2	10	1561372	1561381	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_022357	CAGAT	2	10	1569946	1569955	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_022357	CATTT	2	10	1574504	1574513	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_022357	GTATC	2	10	1575830	1575839	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_022357	CTGCC	2	10	1597168	1597177	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
143	NC_022357	ATATT	2	10	1597556	1597565	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022357	TTAAT	2	10	1626024	1626033	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022357	CCGAT	2	10	1634753	1634762	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
146	NC_022357	AACTT	2	10	1651421	1651430	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_022357	GGTAG	2	10	1667853	1667862	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
148	NC_022357	TACCG	2	10	1694070	1694079	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
149	NC_022357	ATCAA	2	10	1701481	1701490	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
150	NC_022357	GCAAC	2	10	1735123	1735132	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
151	NC_022357	GGGAT	2	10	1741846	1741855	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
152	NC_022357	CTCCC	2	10	1744503	1744512	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
153	NC_022357	CACGA	2	10	1746037	1746046	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
154	NC_022357	TCTCC	2	10	1746274	1746283	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
155	NC_022357	CAACC	2	10	1747526	1747535	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
156	NC_022357	GACGC	2	10	1790799	1790808	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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158	NC_022357	AGCAA	2	10	1810246	1810255	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
159	NC_022357	TACTT	2	10	1822805	1822814	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
160	NC_022357	ATTAA	2	10	1829800	1829809	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_022357	TTTAA	2	10	1835467	1835476	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_022357	CCGGC	2	10	1841998	1842007	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
163	NC_022357	ACGCC	2	10	1848241	1848250	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
164	NC_022357	GGTTT	2	10	1862466	1862475	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
165	NC_022357	TTTTC	2	10	1872952	1872961	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
166	NC_022357	GAACA	2	10	1929149	1929158	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
167	NC_022357	CTGAA	2	10	1949630	1949639	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
168	NC_022357	GCTGA	2	10	1954534	1954543	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
169	NC_022357	ACACC	2	10	1956051	1956060	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
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172	NC_022357	ATTGC	2	10	1999496	1999505	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
173	NC_022357	ATCGC	2	10	2012447	2012456	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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177	NC_022357	TGCAA	2	10	2048945	2048954	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
178	NC_022357	ACCAC	2	10	2084828	2084837	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
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182	NC_022357	CCATC	2	10	2111841	2111850	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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184	NC_022357	ATGCA	2	10	2113546	2113555	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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186	NC_022357	CGATA	2	10	2154922	2154931	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
187	NC_022357	AGGGC	2	10	2157113	2157122	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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189	NC_022357	TGAAA	2	10	2163010	2163019	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_022357	CAATG	2	10	2190809	2190818	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
192	NC_022357	TCGCT	2	10	2202897	2202906	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
193	NC_022357	GCCAT	2	10	2226693	2226702	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
194	NC_022357	TCACA	2	10	2227604	2227613	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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259	NC_022357	TTATT	2	10	2953386	2953395	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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261	NC_022357	AAATT	2	10	2985915	2985924	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_022357	ATTTT	2	10	2993917	2993926	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NC_022357	ACGGG	2	10	3001207	3001216	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
264	NC_022357	TTTTA	2	10	3004021	3004030	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
265	NC_022357	TCCCG	2	10	3008501	3008510	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
266	NC_022357	TTTAA	2	10	3010865	3010874	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
267	NC_022357	GCAAT	2	10	3063047	3063056	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
268	NC_022357	GAAGG	2	10	3077082	3077091	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
269	NC_022357	TTTTG	2	10	3115358	3115367	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
270	NC_022357	AGAAT	2	10	3130510	3130519	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.