MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Haemophilus influenzae KR494

Total Repeats: 115

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022356	TTTTCT	2	12	469	480	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_022356	ATTTTT	2	12	16319	16330	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022356	CTTTTA	2	12	34107	34118	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_022356	GAAATA	2	12	57798	57809	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022356	CCTAAT	2	12	74820	74831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_022356	CATATT	2	12	75551	75562	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_022356	TTAATT	2	12	84477	84488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022356	TAACCA	2	12	131437	131448	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_022356	AAAAAC	2	12	178845	178856	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_022356	CGTCTT	2	12	179301	179312	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_022356	ATTTCA	2	12	180106	180117	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_022356	CTTTCG	2	12	181863	181874	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_022356	AACCCC	2	12	183545	183556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_022356	GCCTTC	2	12	183654	183665	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
15	NC_022356	ATTAAT	2	12	194364	194375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022356	CGTCTT	2	12	235592	235603	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_022356	ATTTCA	2	12	236397	236408	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_022356	CTTTCG	2	12	238154	238165	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_022356	AACCCC	2	12	239836	239847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_022356	GCCTTC	2	12	239945	239956	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
21	NC_022356	AATTTT	2	12	241855	241866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022356	AATAAA	2	12	243116	243127	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022356	ATAAAA	2	12	280044	280055	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022356	AAAAAT	2	12	306826	306837	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022356	AAAATA	2	12	313175	313186	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022356	AATTTT	2	12	329369	329380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022356	TAAAAA	2	12	371297	371308	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022356	AAACTA	2	12	380124	380135	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_022356	TATCTT	2	12	380751	380762	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_022356	AACAGA	2	12	384390	384401	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_022356	ATTTTT	2	12	385607	385618	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022356	TACAGA	2	12	406765	406776	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_022356	ATAACG	2	12	437763	437774	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_022356	TCTTTT	2	12	469582	469593	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_022356	ATTTTA	2	12	487321	487332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022356	AAAAAT	2	12	528029	528040	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022356	TAATGA	2	12	624879	624890	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022356	TTTATA	2	12	639613	639624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022356	TTTATA	2	12	644171	644182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022356	ATATTC	2	12	660107	660118	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_022356	TTTCAT	2	12	674867	674878	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_022356	TTAATA	2	12	678937	678948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022356	TCCGGT	2	12	692535	692546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_022356	CGTTTT	2	12	692610	692621	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_022356	GAAGGT	2	12	692890	692901	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022356	GTTTGT	2	12	698407	698418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022356	ATTTTT	2	12	801052	801063	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022356	TCATTT	2	12	891702	891713	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_022356	ATATGT	2	12	907653	907664	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022356	TTGTAA	2	12	913219	913230	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022356	GTCTTC	2	12	916783	916794	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_022356	AAAGAA	2	12	924275	924286	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022356	AATTTA	2	12	963667	963678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022356	AAACAA	2	12	1024829	1024840	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_022356	TTTTAA	2	12	1025160	1025171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022356	ATTTTT	2	12	1087579	1087590	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022356	TTTTAA	2	12	1108114	1108125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022356	ACTTTT	2	12	1142469	1142480	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_022356	TTTTAT	2	12	1163323	1163334	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022356	AAATAA	2	12	1164550	1164561	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022356	ATAGTA	2	12	1184189	1184200	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022356	ATAGTA	2	12	1186304	1186315	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022356	TTTCTG	2	12	1194724	1194735	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_022356	TTAATA	2	12	1196131	1196142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022356	TTAATC	2	12	1211648	1211659	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_022356	AAATTG	2	12	1212064	1212075	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022356	TAAAAA	2	12	1218443	1218454	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022356	TAAGGC	2	12	1229859	1229870	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_022356	AAAGCC	2	12	1254686	1254697	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_022356	ATCACA	2	12	1254759	1254770	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_022356	AAATAT	2	12	1255052	1255063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022356	ATAAAA	2	12	1267371	1267382	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022356	TTCAAA	2	12	1369722	1369733	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_022356	TTCAAA	2	12	1369890	1369901	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_022356	AGCAAA	2	12	1370010	1370021	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_022356	TCTAAA	2	12	1394586	1394597	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_022356	ATTTAA	2	12	1407187	1407198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022356	AGGTTT	2	12	1428398	1428409	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022356	TAAAAA	2	12	1433541	1433552	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022356	TTTAAT	2	12	1436111	1436122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022356	CGTCTT	2	12	1437278	1437289	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_022356	ATTTCA	2	12	1438083	1438094	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_022356	CTTTCG	2	12	1439840	1439851	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_022356	AACCCC	2	12	1441279	1441290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_022356	GCCTTC	2	12	1441388	1441399	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
86	NC_022356	AAATTA	2	12	1455174	1455185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022356	TGTTTA	2	12	1488738	1488749	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022356	GAAAAA	2	12	1535640	1535651	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022356	ATCCCC	2	12	1620433	1620444	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_022356	AGAAGC	2	12	1624808	1624819	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_022356	CGTCTT	2	12	1629160	1629171	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_022356	ATTTCA	2	12	1629965	1629976	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_022356	CTTTCG	2	12	1631722	1631733	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_022356	AACCCC	2	12	1633404	1633415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_022356	GCCTTC	2	12	1633513	1633524	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
96	NC_022356	CGTCTT	2	12	1662078	1662089	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_022356	CGTCTT	2	12	1662260	1662271	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_022356	ATTTCA	2	12	1663065	1663076	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_022356	CTTTCG	2	12	1664822	1664833	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_022356	AACCCC	2	12	1666504	1666515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_022356	GCCTTC	2	12	1666613	1666624	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
102	NC_022356	TTTATT	2	12	1672894	1672905	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022356	CTAAAT	2	12	1689435	1689446	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_022356	GTAATA	2	12	1689608	1689619	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022356	CATGTC	2	12	1717408	1717419	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_022356	CGTCTT	2	12	1719039	1719050	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_022356	ATTTCA	2	12	1719844	1719855	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_022356	CTTTCG	2	12	1721601	1721612	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_022356	AACCCC	2	12	1723283	1723294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_022356	GCCTTC	2	12	1723392	1723403	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
111	NC_022356	AAAATT	2	12	1750243	1750254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022356	AAAAAT	2	12	1805008	1805019	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022356	ACCTTA	2	12	1832534	1832545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_022356	ACGTAA	2	12	1851042	1851053	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_022356	AAAAAT	2	12	1853395	1853406	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.