MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Campylobacter coli CVM N29710 plasmid pN29710-1

Total Repeats: 185

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022355	AAGT	2	8	173	180	50 %	25 %	25 %	0 %	543950818
2	NC_022355	TCCG	2	8	650	657	0 %	25 %	25 %	50 %	543950818
3	NC_022355	AGTC	2	8	706	713	25 %	25 %	25 %	25 %	543950818
4	NC_022355	ATTT	2	8	1526	1533	25 %	75 %	0 %	0 %	543950819
5	NC_022355	GATT	2	8	1760	1767	25 %	50 %	25 %	0 %	543950820
6	NC_022355	TAAT	2	8	1945	1952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022355	ATTT	2	8	2132	2139	25 %	75 %	0 %	0 %	543950821
8	NC_022355	TTAT	2	8	2533	2540	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022355	AAAT	2	8	2692	2699	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022355	TATT	2	8	2752	2759	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022355	TAAA	2	8	3532	3539	75 %	25 %	0 %	0 %	543950823
12	NC_022355	ATTT	2	8	3744	3751	25 %	75 %	0 %	0 %	543950823
13	NC_022355	AAAG	2	8	4034	4041	75 %	0 %	25 %	0 %	543950824
14	NC_022355	ATAA	2	8	4368	4375	75 %	25 %	0 %	0 %	543950824
15	NC_022355	GAAC	2	8	4844	4851	50 %	0 %	25 %	25 %	543950826
16	NC_022355	TCAA	2	8	5098	5105	50 %	25 %	0 %	25 %	543950826
17	NC_022355	ATCT	2	8	5288	5295	25 %	50 %	0 %	25 %	543950827
18	NC_022355	AGAT	2	8	5308	5315	50 %	25 %	25 %	0 %	543950827
19	NC_022355	TAAA	2	8	5400	5407	75 %	25 %	0 %	0 %	543950827
20	NC_022355	ATTT	2	8	5784	5791	25 %	75 %	0 %	0 %	543950827
21	NC_022355	TAAG	2	8	6453	6460	50 %	25 %	25 %	0 %	543950827
22	NC_022355	CAAA	2	8	6759	6766	75 %	0 %	0 %	25 %	543950827
23	NC_022355	ACAA	2	8	7257	7264	75 %	0 %	0 %	25 %	543950827
24	NC_022355	ATTT	2	8	7305	7312	25 %	75 %	0 %	0 %	543950827
25	NC_022355	ATTT	2	8	7413	7420	25 %	75 %	0 %	0 %	543950827
26	NC_022355	TAAA	2	8	7824	7831	75 %	25 %	0 %	0 %	543950827
27	NC_022355	AACA	2	8	8079	8086	75 %	0 %	0 %	25 %	543950827
28	NC_022355	ATTA	2	8	8239	8246	50 %	50 %	0 %	0 %	543950827
29	NC_022355	ATAC	2	8	8449	8456	50 %	25 %	0 %	25 %	543950827
30	NC_022355	ACTT	2	8	8835	8842	25 %	50 %	0 %	25 %	543950827
31	NC_022355	TAAA	2	8	9069	9076	75 %	25 %	0 %	0 %	543950827
32	NC_022355	AACA	2	8	9108	9115	75 %	0 %	0 %	25 %	543950827
33	NC_022355	TTCA	2	8	9233	9240	25 %	50 %	0 %	25 %	543950827
34	NC_022355	GAAA	2	8	9947	9954	75 %	0 %	25 %	0 %	543950827
35	NC_022355	AAAG	2	8	10311	10318	75 %	0 %	25 %	0 %	543950827
36	NC_022355	TATG	2	8	10776	10783	25 %	50 %	25 %	0 %	543950828
37	NC_022355	AATT	2	8	11346	11353	50 %	50 %	0 %	0 %	543950828
38	NC_022355	AAAC	2	8	11371	11378	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_022355	ATTT	2	8	11417	11424	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022355	TTTA	2	8	11448	11455	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022355	ATTA	2	8	11766	11773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022355	TAAC	2	8	11851	11858	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_022355	TTTC	2	8	12256	12263	0 %	75 %	0 %	25 %	543950829
44	NC_022355	CTTT	2	8	12504	12511	0 %	75 %	0 %	25 %	543950829
45	NC_022355	ATTT	2	8	12786	12793	25 %	75 %	0 %	0 %	543950829
46	NC_022355	CCTT	2	8	13108	13115	0 %	50 %	0 %	50 %	543950829
47	NC_022355	ATTT	2	8	13577	13584	25 %	75 %	0 %	0 %	543950830
48	NC_022355	ATTT	2	8	13846	13853	25 %	75 %	0 %	0 %	543950830
49	NC_022355	GTTT	2	8	13946	13953	0 %	75 %	25 %	0 %	543950830
50	NC_022355	AAAG	2	8	14226	14233	75 %	0 %	25 %	0 %	543950831
51	NC_022355	AAAT	2	8	14356	14363	75 %	25 %	0 %	0 %	543950831
52	NC_022355	TAAA	2	8	14627	14634	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022355	TAAT	2	8	14792	14799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022355	TGAA	2	8	15058	15065	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022355	TAAA	2	8	15082	15089	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022355	CAAT	2	8	15522	15529	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_022355	TTAA	2	8	15760	15767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022355	ATGG	2	8	16136	16143	25 %	25 %	50 %	0 %	543950832
59	NC_022355	GTGA	2	8	16976	16983	25 %	25 %	50 %	0 %	543950832
60	NC_022355	TGCT	2	8	17290	17297	0 %	50 %	25 %	25 %	543950833
61	NC_022355	GAAA	2	8	17728	17735	75 %	0 %	25 %	0 %	543950834
62	NC_022355	ATTT	2	8	18302	18309	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022355	GGAT	2	8	18405	18412	25 %	25 %	50 %	0 %	543950835
64	NC_022355	TTTA	2	8	18503	18510	25 %	75 %	0 %	0 %	543950835
65	NC_022355	TTCG	2	8	19372	19379	0 %	50 %	25 %	25 %	543950837
66	NC_022355	GCTT	2	8	19413	19420	0 %	50 %	25 %	25 %	543950837
67	NC_022355	AATG	2	8	19618	19625	50 %	25 %	25 %	0 %	543950837
68	NC_022355	ATTT	2	8	20463	20470	25 %	75 %	0 %	0 %	543950837
69	NC_022355	TGAT	2	8	20578	20585	25 %	50 %	25 %	0 %	543950837
70	NC_022355	TAAA	2	8	20702	20709	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022355	ATTT	2	8	20711	20718	25 %	75 %	0 %	0 %	543950838
72	NC_022355	GATA	2	8	20806	20813	50 %	25 %	25 %	0 %	543950838
73	NC_022355	ATTA	2	8	21082	21089	50 %	50 %	0 %	0 %	543950838
74	NC_022355	AATT	2	8	21704	21711	50 %	50 %	0 %	0 %	543950839
75	NC_022355	AATC	2	8	21832	21839	50 %	25 %	0 %	25 %	543950840
76	NC_022355	TAAA	2	8	22100	22107	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022355	AATT	2	8	22846	22853	50 %	50 %	0 %	0 %	543950842
78	NC_022355	CAAA	2	8	24049	24056	75 %	0 %	0 %	25 %	543950842
79	NC_022355	TAAA	2	8	24094	24101	75 %	25 %	0 %	0 %	543950842
80	NC_022355	ATTT	2	8	24264	24271	25 %	75 %	0 %	0 %	543950842
81	NC_022355	ATTT	2	8	24673	24680	25 %	75 %	0 %	0 %	543950842
82	NC_022355	TTAA	2	8	25074	25081	50 %	50 %	0 %	0 %	543950842
83	NC_022355	TTCA	2	8	25461	25468	25 %	50 %	0 %	25 %	543950843
84	NC_022355	AGAA	2	8	25500	25507	75 %	0 %	25 %	0 %	543950843
85	NC_022355	TTAT	2	8	25682	25689	25 %	75 %	0 %	0 %	543950843
86	NC_022355	GACG	2	8	26220	26227	25 %	0 %	50 %	25 %	543950844
87	NC_022355	CAAT	2	8	26648	26655	50 %	25 %	0 %	25 %	543950845
88	NC_022355	ATCA	2	8	27012	27019	50 %	25 %	0 %	25 %	543950846
89	NC_022355	AAAG	2	8	27900	27907	75 %	0 %	25 %	0 %	543950847
90	NC_022355	AATG	2	8	28111	28118	50 %	25 %	25 %	0 %	543950847
91	NC_022355	ACTT	2	8	28294	28301	25 %	50 %	0 %	25 %	543950848
92	NC_022355	ATGG	2	8	28379	28386	25 %	25 %	50 %	0 %	543950848
93	NC_022355	GGAT	2	8	28757	28764	25 %	25 %	50 %	0 %	543950848
94	NC_022355	ATCA	2	8	29214	29221	50 %	25 %	0 %	25 %	543950849
95	NC_022355	TAAA	2	8	29233	29240	75 %	25 %	0 %	0 %	543950849
96	NC_022355	ATGA	2	8	29247	29254	50 %	25 %	25 %	0 %	543950849
97	NC_022355	CTTA	2	8	29385	29392	25 %	50 %	0 %	25 %	543950850
98	NC_022355	ACTC	2	8	29577	29584	25 %	25 %	0 %	50 %	543950850
99	NC_022355	CTTT	2	8	29931	29938	0 %	75 %	0 %	25 %	543950851
100	NC_022355	AAAC	2	8	30271	30278	75 %	0 %	0 %	25 %	543950851
101	NC_022355	AAAG	2	8	30603	30610	75 %	0 %	25 %	0 %	543950851
102	NC_022355	TAAA	2	8	30745	30752	75 %	25 %	0 %	0 %	543950851
103	NC_022355	AAAT	2	8	30787	30794	75 %	25 %	0 %	0 %	543950851
104	NC_022355	TGAT	2	8	31864	31871	25 %	50 %	25 %	0 %	543950852
105	NC_022355	TTCT	2	8	32195	32202	0 %	75 %	0 %	25 %	543950853
106	NC_022355	AAGA	2	8	32405	32412	75 %	0 %	25 %	0 %	543950853
107	NC_022355	ATTT	2	8	32938	32945	25 %	75 %	0 %	0 %	543950853
108	NC_022355	TGGA	2	8	32981	32988	25 %	25 %	50 %	0 %	543950853
109	NC_022355	GCGT	2	8	33330	33337	0 %	25 %	50 %	25 %	543950854
110	NC_022355	CTTT	2	8	33968	33975	0 %	75 %	0 %	25 %	543950855
111	NC_022355	ATTT	2	8	34095	34102	25 %	75 %	0 %	0 %	543950855
112	NC_022355	AGAC	2	8	34346	34353	50 %	0 %	25 %	25 %	543950855
113	NC_022355	TTAT	2	8	34510	34517	25 %	75 %	0 %	0 %	543950855
114	NC_022355	ATTT	2	8	34918	34925	25 %	75 %	0 %	0 %	543950855
115	NC_022355	AAGG	2	8	35153	35160	50 %	0 %	50 %	0 %	543950855
116	NC_022355	TTAA	2	8	35874	35881	50 %	50 %	0 %	0 %	543950856
117	NC_022355	AACT	2	8	35993	36000	50 %	25 %	0 %	25 %	543950856
118	NC_022355	TGGA	2	8	36309	36316	25 %	25 %	50 %	0 %	543950857
119	NC_022355	ATGA	2	8	36775	36782	50 %	25 %	25 %	0 %	543950858
120	NC_022355	AATT	2	8	36786	36793	50 %	50 %	0 %	0 %	543950858
121	NC_022355	CTTA	2	8	37381	37388	25 %	50 %	0 %	25 %	543950858
122	NC_022355	AAAG	2	8	37417	37424	75 %	0 %	25 %	0 %	543950858
123	NC_022355	TGAA	2	8	37566	37573	50 %	25 %	25 %	0 %	543950858
124	NC_022355	ACAA	2	8	37688	37695	75 %	0 %	0 %	25 %	543950859
125	NC_022355	AATT	2	8	37998	38005	50 %	50 %	0 %	0 %	543950859
126	NC_022355	ATTT	2	8	38609	38616	25 %	75 %	0 %	0 %	543950860
127	NC_022355	AATT	2	8	38822	38829	50 %	50 %	0 %	0 %	543950860
128	NC_022355	TAAT	2	8	39393	39400	50 %	50 %	0 %	0 %	543950861
129	NC_022355	GTAG	2	8	39578	39585	25 %	25 %	50 %	0 %	543950861
130	NC_022355	AATT	2	8	39787	39794	50 %	50 %	0 %	0 %	543950861
131	NC_022355	AATT	2	8	40243	40250	50 %	50 %	0 %	0 %	543950861
132	NC_022355	ATAG	2	8	40328	40335	50 %	25 %	25 %	0 %	543950861
133	NC_022355	TATC	2	8	40377	40384	25 %	50 %	0 %	25 %	543950861
134	NC_022355	CAAA	2	8	40436	40443	75 %	0 %	0 %	25 %	543950861
135	NC_022355	AAGT	2	8	40635	40642	50 %	25 %	25 %	0 %	543950861
136	NC_022355	TTAA	2	8	40688	40695	50 %	50 %	0 %	0 %	543950861
137	NC_022355	AAAC	2	8	40873	40880	75 %	0 %	0 %	25 %	543950861
138	NC_022355	AGCA	2	8	41029	41036	50 %	0 %	25 %	25 %	543950861
139	NC_022355	ATTT	2	8	41213	41220	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022355	TAAT	2	8	41221	41228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022355	AAAT	2	8	41658	41665	75 %	25 %	0 %	0 %	543950862
142	NC_022355	AATT	2	8	41989	41996	50 %	50 %	0 %	0 %	543950862
143	NC_022355	TAAA	2	8	42003	42010	75 %	25 %	0 %	0 %	543950862
144	NC_022355	AGAA	2	8	42243	42250	75 %	0 %	25 %	0 %	543950862
145	NC_022355	ACAA	2	8	42749	42756	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_022355	TTTC	2	8	43138	43145	0 %	75 %	0 %	25 %	543950863
147	NC_022355	AAGC	2	8	43577	43584	50 %	0 %	25 %	25 %	543950863
148	NC_022355	TAAA	2	8	44396	44403	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_022355	GATT	2	8	45028	45035	25 %	50 %	25 %	0 %	543950864
150	NC_022355	ATCC	2	8	45534	45541	25 %	25 %	0 %	50 %	543950864
151	NC_022355	CTTT	2	8	45788	45795	0 %	75 %	0 %	25 %	543950864
152	NC_022355	AATC	2	8	46034	46041	50 %	25 %	0 %	25 %	543950864
153	NC_022355	ATGG	2	8	46095	46102	25 %	25 %	50 %	0 %	543950864
154	NC_022355	CCAG	2	8	46456	46463	25 %	0 %	25 %	50 %	543950864
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156	NC_022355	AGGA	2	8	46658	46665	50 %	0 %	50 %	0 %	543950865
157	NC_022355	AAGA	2	8	46710	46717	75 %	0 %	25 %	0 %	543950865
158	NC_022355	GGGT	2	8	46872	46879	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
159	NC_022355	CAGG	2	8	47236	47243	25 %	0 %	50 %	25 %	543950866
160	NC_022355	AAGA	2	8	47541	47548	75 %	0 %	25 %	0 %	543950867
161	NC_022355	AGAT	2	8	47947	47954	50 %	25 %	25 %	0 %	543950868
162	NC_022355	AAGA	2	8	48475	48482	75 %	0 %	25 %	0 %	543950868
163	NC_022355	AAAT	2	8	48558	48565	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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168	NC_022355	CAGA	2	8	50137	50144	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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172	NC_022355	CTTT	2	8	50833	50840	0 %	75 %	0 %	25 %	543950871
173	NC_022355	AAAG	2	8	51069	51076	75 %	0 %	25 %	0 %	543950871
174	NC_022355	AATC	2	8	51131	51138	50 %	25 %	0 %	25 %	543950872
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176	NC_022355	GGAT	2	8	52063	52070	25 %	25 %	50 %	0 %	543950873
177	NC_022355	AGGA	2	8	52899	52906	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
178	NC_022355	GGAA	2	8	52983	52990	50 %	0 %	50 %	0 %	543950875
179	NC_022355	GGAA	2	8	53115	53122	50 %	0 %	50 %	0 %	543950875
180	NC_022355	TGAG	2	8	53183	53190	25 %	25 %	50 %	0 %	543950875
181	NC_022355	TTAC	2	8	53346	53353	25 %	50 %	0 %	25 %	543950875
182	NC_022355	AAGT	2	8	53519	53526	50 %	25 %	25 %	0 %	543950875
183	NC_022355	TAGA	2	8	53829	53836	50 %	25 %	25 %	0 %	543950876
184	NC_022355	CCTG	2	8	54329	54336	0 %	25 %	25 %	50 %	543950876
185	NC_022355	TTGA	2	8	54794	54801	25 %	50 %	25 %	0 %	543950877

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.