MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Campylobacter coli CVM N29710 plasmid pN29710-1

Total Repeats: 118

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022355	GA	3	6	96	101	50 %	0 %	50 %	0 %	543950818
2	NC_022355	CA	3	6	389	394	50 %	0 %	0 %	50 %	543950818
3	NC_022355	GT	3	6	696	701	0 %	50 %	50 %	0 %	543950818
4	NC_022355	GA	3	6	1089	1094	50 %	0 %	50 %	0 %	543950818
5	NC_022355	AG	3	6	1119	1124	50 %	0 %	50 %	0 %	543950818
6	NC_022355	AT	3	6	1242	1247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022355	AT	3	6	1297	1302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022355	AT	3	6	1728	1733	50 %	50 %	0 %	0 %	543950820
9	NC_022355	AT	4	8	1937	1944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022355	TA	3	6	1978	1983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022355	TA	4	8	1986	1993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022355	TC	4	8	2277	2284	0 %	50 %	0 %	50 %	543950821
13	NC_022355	AG	3	6	3423	3428	50 %	0 %	50 %	0 %	543950822
14	NC_022355	AT	3	6	3608	3613	50 %	50 %	0 %	0 %	543950823
15	NC_022355	TA	3	6	3625	3630	50 %	50 %	0 %	0 %	543950823
16	NC_022355	TA	3	6	3776	3781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022355	TA	3	6	4591	4596	50 %	50 %	0 %	0 %	543950825
18	NC_022355	AG	3	6	4919	4924	50 %	0 %	50 %	0 %	543950826
19	NC_022355	AG	3	6	5044	5049	50 %	0 %	50 %	0 %	543950826
20	NC_022355	AT	3	6	5727	5732	50 %	50 %	0 %	0 %	543950827
21	NC_022355	TA	3	6	5993	5998	50 %	50 %	0 %	0 %	543950827
22	NC_022355	TA	4	8	7714	7721	50 %	50 %	0 %	0 %	543950827
23	NC_022355	AC	3	6	8000	8005	50 %	0 %	0 %	50 %	543950827
24	NC_022355	AT	3	6	8362	8367	50 %	50 %	0 %	0 %	543950827
25	NC_022355	TG	3	6	8791	8796	0 %	50 %	50 %	0 %	543950827
26	NC_022355	CA	3	6	8983	8988	50 %	0 %	0 %	50 %	543950827
27	NC_022355	TA	3	6	9174	9179	50 %	50 %	0 %	0 %	543950827
28	NC_022355	GA	3	6	9454	9459	50 %	0 %	50 %	0 %	543950827
29	NC_022355	TC	3	6	10691	10696	0 %	50 %	0 %	50 %	543950828
30	NC_022355	TA	3	6	11654	11659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022355	TA	3	6	12078	12083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022355	CT	3	6	12314	12319	0 %	50 %	0 %	50 %	543950829
33	NC_022355	TC	4	8	12340	12347	0 %	50 %	0 %	50 %	543950829
34	NC_022355	TC	3	6	12422	12427	0 %	50 %	0 %	50 %	543950829
35	NC_022355	AT	4	8	13622	13629	50 %	50 %	0 %	0 %	543950830
36	NC_022355	TA	3	6	13961	13966	50 %	50 %	0 %	0 %	543950830
37	NC_022355	AT	3	6	14700	14705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022355	AG	3	6	15386	15391	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022355	AT	4	8	15578	15585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022355	TA	3	6	15715	15720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022355	TA	3	6	16729	16734	50 %	50 %	0 %	0 %	543950832
42	NC_022355	AT	3	6	17141	17146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022355	TA	3	6	17153	17158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022355	AT	3	6	17171	17176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022355	AG	3	6	17495	17500	50 %	0 %	50 %	0 %	543950833
46	NC_022355	TA	3	6	19812	19817	50 %	50 %	0 %	0 %	543950837
47	NC_022355	TC	3	6	19968	19973	0 %	50 %	0 %	50 %	543950837
48	NC_022355	AT	3	6	20134	20139	50 %	50 %	0 %	0 %	543950837
49	NC_022355	AT	3	6	20503	20508	50 %	50 %	0 %	0 %	543950837
50	NC_022355	TA	3	6	20595	20600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022355	TA	3	6	20625	20630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022355	AT	3	6	21311	21316	50 %	50 %	0 %	0 %	543950838
53	NC_022355	TA	4	8	21847	21854	50 %	50 %	0 %	0 %	543950840
54	NC_022355	AT	3	6	24320	24325	50 %	50 %	0 %	0 %	543950842
55	NC_022355	AC	3	6	24376	24381	50 %	0 %	0 %	50 %	543950842
56	NC_022355	TC	3	6	25541	25546	0 %	50 %	0 %	50 %	543950843
57	NC_022355	AG	3	6	28095	28100	50 %	0 %	50 %	0 %	543950847
58	NC_022355	GT	3	6	29131	29136	0 %	50 %	50 %	0 %	543950849
59	NC_022355	TC	3	6	29516	29521	0 %	50 %	0 %	50 %	543950850
60	NC_022355	AT	3	6	30545	30550	50 %	50 %	0 %	0 %	543950851
61	NC_022355	CA	3	6	30858	30863	50 %	0 %	0 %	50 %	543950852
62	NC_022355	TA	3	6	31413	31418	50 %	50 %	0 %	0 %	543950852
63	NC_022355	TA	3	6	32399	32404	50 %	50 %	0 %	0 %	543950853
64	NC_022355	AG	3	6	33251	33256	50 %	0 %	50 %	0 %	543950854
65	NC_022355	GA	3	6	33779	33784	50 %	0 %	50 %	0 %	543950854
66	NC_022355	TA	3	6	34880	34885	50 %	50 %	0 %	0 %	543950855
67	NC_022355	AG	3	6	35210	35215	50 %	0 %	50 %	0 %	543950855
68	NC_022355	AG	3	6	35865	35870	50 %	0 %	50 %	0 %	543950856
69	NC_022355	TC	3	6	36603	36608	0 %	50 %	0 %	50 %	543950857
70	NC_022355	GA	3	6	36621	36626	50 %	0 %	50 %	0 %	543950857
71	NC_022355	AT	3	6	37271	37276	50 %	50 %	0 %	0 %	543950858
72	NC_022355	TA	3	6	37387	37392	50 %	50 %	0 %	0 %	543950858
73	NC_022355	TA	3	6	37583	37588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022355	TA	3	6	38365	38370	50 %	50 %	0 %	0 %	543950860
75	NC_022355	AT	3	6	38409	38414	50 %	50 %	0 %	0 %	543950860
76	NC_022355	AT	3	6	38556	38561	50 %	50 %	0 %	0 %	543950860
77	NC_022355	AT	3	6	38739	38744	50 %	50 %	0 %	0 %	543950860
78	NC_022355	AT	3	6	39088	39093	50 %	50 %	0 %	0 %	543950861
79	NC_022355	AG	3	6	40622	40627	50 %	0 %	50 %	0 %	543950861
80	NC_022355	TA	3	6	40628	40633	50 %	50 %	0 %	0 %	543950861
81	NC_022355	AT	3	6	41903	41908	50 %	50 %	0 %	0 %	543950862
82	NC_022355	AT	3	6	42113	42118	50 %	50 %	0 %	0 %	543950862
83	NC_022355	TA	3	6	42278	42283	50 %	50 %	0 %	0 %	543950862
84	NC_022355	CT	3	6	43079	43084	0 %	50 %	0 %	50 %	543950863
85	NC_022355	TC	3	6	43849	43854	0 %	50 %	0 %	50 %	543950863
86	NC_022355	CA	3	6	43922	43927	50 %	0 %	0 %	50 %	543950863
87	NC_022355	CG	4	8	44115	44122	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_022355	AT	3	6	45190	45195	50 %	50 %	0 %	0 %	543950864
89	NC_022355	TA	4	8	45433	45440	50 %	50 %	0 %	0 %	543950864
90	NC_022355	TG	3	6	45507	45512	0 %	50 %	50 %	0 %	543950864
91	NC_022355	TA	4	8	45880	45887	50 %	50 %	0 %	0 %	543950864
92	NC_022355	TC	3	6	46276	46281	0 %	50 %	0 %	50 %	543950864
93	NC_022355	GA	3	6	47329	47334	50 %	0 %	50 %	0 %	543950866
94	NC_022355	GA	3	6	48170	48175	50 %	0 %	50 %	0 %	543950868
95	NC_022355	AT	3	6	48663	48668	50 %	50 %	0 %	0 %	543950869
96	NC_022355	GA	3	6	48913	48918	50 %	0 %	50 %	0 %	543950869
97	NC_022355	GA	3	6	49215	49220	50 %	0 %	50 %	0 %	543950869
98	NC_022355	AT	3	6	49318	49323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022355	GA	3	6	49496	49501	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022355	AG	3	6	49523	49528	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022355	CA	3	6	49668	49673	50 %	0 %	0 %	50 %	543950870
102	NC_022355	AT	3	6	50004	50009	50 %	50 %	0 %	0 %	543950870
103	NC_022355	AG	4	8	50151	50158	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022355	AT	3	6	50538	50543	50 %	50 %	0 %	0 %	543950871
105	NC_022355	GA	3	6	50605	50610	50 %	0 %	50 %	0 %	543950871
106	NC_022355	GA	4	8	50630	50637	50 %	0 %	50 %	0 %	543950871
107	NC_022355	GA	3	6	50909	50914	50 %	0 %	50 %	0 %	543950871
108	NC_022355	GA	3	6	51055	51060	50 %	0 %	50 %	0 %	543950871
109	NC_022355	GA	3	6	51124	51129	50 %	0 %	50 %	0 %	543950872
110	NC_022355	CG	3	6	51344	51349	0 %	0 %	50 %	50 %	543950872
111	NC_022355	CA	3	6	51771	51776	50 %	0 %	0 %	50 %	543950873
112	NC_022355	TA	3	6	52020	52025	50 %	50 %	0 %	0 %	543950873
113	NC_022355	AT	3	6	52474	52479	50 %	50 %	0 %	0 %	543950874
114	NC_022355	TA	3	6	52571	52576	50 %	50 %	0 %	0 %	543950874
115	NC_022355	GC	3	6	52623	52628	0 %	0 %	50 %	50 %	543950874
116	NC_022355	AT	3	6	52635	52640	50 %	50 %	0 %	0 %	543950874
117	NC_022355	TA	3	6	53006	53011	50 %	50 %	0 %	0 %	543950875
118	NC_022355	CG	3	6	53417	53422	0 %	0 %	50 %	50 %	543950875

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.