MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2544 plasmid

Total Repeats: 28

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022354	TTTGTG	2	12	267	278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543950742
2	NC_022354	CTAAAT	2	12	698	709	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	543950743
3	NC_022354	TTTCTC	2	12	1100	1111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950744
4	NC_022354	CTCTTT	2	12	1843	1854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950746
5	NC_022354	ATTAAA	2	12	3302	3313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022354	GTCCTC	2	12	4127	4138	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	543950748
7	NC_022354	TAGATT	2	12	6871	6882	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	543950750
8	NC_022354	AAATTC	2	12	12124	12135	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	543950753
9	NC_022354	TATTAA	2	12	12473	12484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022354	GTCTTT	2	12	13156	13167	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	543950754
11	NC_022354	TAAATA	2	12	15125	15136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543950755
12	NC_022354	AATTTT	2	12	16440	16451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543950757
13	NC_022354	TTTATA	2	12	17419	17430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543950758
14	NC_022354	AATTTT	2	12	18148	18159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543950760
15	NC_022354	AAATCA	2	12	18860	18871	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	543950760
16	NC_022354	CTTAAT	2	12	18884	18895	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	543950760
17	NC_022354	CTACAT	2	12	19128	19139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543950760
18	NC_022354	ATCTTT	2	12	26159	26170	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	543950768
19	NC_022354	CATCTT	2	12	26227	26238	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	543950768
20	NC_022354	TGGATT	2	12	31095	31106	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	543950772
21	NC_022354	GAAGGA	2	12	31152	31163	50 %	0 %	50 %	0 %	543950772
22	NC_022354	TCATTT	2	12	32435	32446	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	543950775
23	NC_022354	AAAATT	2	12	34896	34907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022354	ATAGAA	2	12	34952	34963	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022354	TTTTCT	2	12	37864	37875	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	543950780
26	NC_022354	AAAAAT	2	12	39434	39445	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	543950782
27	NC_022354	ATTTTT	2	12	40828	40839	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	543950784
28	NC_022354	TCTTGT	2	12	46776	46787	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.