MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2544 plasmid

Total Repeats: 23

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022354	TTTGTG	2	12	267	278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543950742
2	NC_022354	CTAAAT	2	12	698	709	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	543950743
3	NC_022354	TTTCTC	2	12	1100	1111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950744
4	NC_022354	CTCTTT	2	12	1843	1854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950746
5	NC_022354	GTCCTC	2	12	4127	4138	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	543950748
6	NC_022354	TAGATT	2	12	6871	6882	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	543950750
7	NC_022354	AAATTC	2	12	12124	12135	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	543950753
8	NC_022354	GTCTTT	2	12	13156	13167	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	543950754
9	NC_022354	TAAATA	2	12	15125	15136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543950755
10	NC_022354	AATTTT	2	12	16440	16451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543950757
11	NC_022354	TTTATA	2	12	17419	17430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543950758
12	NC_022354	AATTTT	2	12	18148	18159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543950760
13	NC_022354	AAATCA	2	12	18860	18871	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	543950760
14	NC_022354	CTTAAT	2	12	18884	18895	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	543950760
15	NC_022354	CTACAT	2	12	19128	19139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543950760
16	NC_022354	ATCTTT	2	12	26159	26170	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	543950768
17	NC_022354	CATCTT	2	12	26227	26238	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	543950768
18	NC_022354	TGGATT	2	12	31095	31106	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	543950772
19	NC_022354	GAAGGA	2	12	31152	31163	50 %	0 %	50 %	0 %	543950772
20	NC_022354	TCATTT	2	12	32435	32446	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	543950775
21	NC_022354	TTTTCT	2	12	37864	37875	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	543950780
22	NC_022354	AAAAAT	2	12	39434	39445	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	543950782
23	NC_022354	ATTTTT	2	12	40828	40839	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	543950784

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.