MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2544 plasmid

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022354	AGATA	2	10	2757	2766	60 %	20 %	20 %	0 %	543950747
2	NC_022354	CTTTC	2	10	8062	8071	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
3	NC_022354	GCTTT	2	10	9986	9995	0 %	60 %	20 %	20 %	543950752
4	NC_022354	TTAAT	2	10	11400	11409	40 %	60 %	0 %	0 %	543950753
5	NC_022354	TATTT	2	10	11531	11540	20 %	80 %	0 %	0 %	543950753
6	NC_022354	GCTAT	2	10	12230	12239	20 %	40 %	20 %	20 %	543950753
7	NC_022354	ATTGC	2	10	12640	12649	20 %	40 %	20 %	20 %	543950754
8	NC_022354	TTGTT	2	10	12679	12688	0 %	80 %	20 %	0 %	543950754
9	NC_022354	ATTGC	2	10	12802	12811	20 %	40 %	20 %	20 %	543950754
10	NC_022354	TGTCA	2	10	12976	12985	20 %	40 %	20 %	20 %	543950754
11	NC_022354	ATTTT	2	10	13565	13574	20 %	80 %	0 %	0 %	543950754
12	NC_022354	TTTCA	2	10	15526	15535	20 %	60 %	0 %	20 %	543950756
13	NC_022354	GCTTT	2	10	18056	18065	0 %	60 %	20 %	20 %	543950759
14	NC_022354	TCCAT	2	10	21321	21330	20 %	40 %	0 %	40 %	543950762
15	NC_022354	ATTCT	2	10	23045	23054	20 %	60 %	0 %	20 %	543950764
16	NC_022354	TTTGT	2	10	26612	26621	0 %	80 %	20 %	0 %	543950769
17	NC_022354	TTTTC	2	10	26830	26839	0 %	80 %	0 %	20 %	543950769
18	NC_022354	TAATT	2	10	30744	30753	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022354	TTTGT	2	10	30754	30763	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022354	GATTT	2	10	31128	31137	20 %	60 %	20 %	0 %	543950772
21	NC_022354	TTTAA	2	10	32537	32546	40 %	60 %	0 %	0 %	543950775
22	NC_022354	TTTTA	2	10	34915	34924	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022354	AAGAG	2	10	35274	35283	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022354	GTTTT	2	10	37660	37669	0 %	80 %	20 %	0 %	543950780
25	NC_022354	TAAAT	2	10	37779	37788	60 %	40 %	0 %	0 %	543950780
26	NC_022354	AAATA	2	10	38340	38349	80 %	20 %	0 %	0 %	543950781
27	NC_022354	TTAAA	2	10	39397	39406	60 %	40 %	0 %	0 %	543950782
28	NC_022354	TTGAG	2	10	41937	41946	20 %	40 %	40 %	0 %	543950785
29	NC_022354	TTGCT	2	10	42622	42631	0 %	60 %	20 %	20 %	543950785
30	NC_022354	AATTG	2	10	43745	43754	40 %	40 %	20 %	0 %	543950785
31	NC_022354	TGCTT	2	10	45057	45066	0 %	60 %	20 %	20 %	543950785
32	NC_022354	GTAGC	2	10	46791	46800	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.