MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2544 plasmid

Total Repeats: 174

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022354	ATTG	2	8	165	172	25 %	50 %	25 %	0 %	543950742
2	NC_022354	ATTT	2	8	175	182	25 %	75 %	0 %	0 %	543950742
3	NC_022354	GTTC	2	8	420	427	0 %	50 %	25 %	25 %	543950742
4	NC_022354	CTTT	2	8	1230	1237	0 %	75 %	0 %	25 %	543950744
5	NC_022354	AAAT	2	8	1519	1526	75 %	25 %	0 %	0 %	543950745
6	NC_022354	TTTA	2	8	1731	1738	25 %	75 %	0 %	0 %	543950745
7	NC_022354	TAAA	2	8	2508	2515	75 %	25 %	0 %	0 %	543950747
8	NC_022354	ATTT	2	8	2571	2578	25 %	75 %	0 %	0 %	543950747
9	NC_022354	ATAA	2	8	2730	2737	75 %	25 %	0 %	0 %	543950747
10	NC_022354	ATTA	2	8	3318	3325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022354	AATC	2	8	3503	3510	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_022354	AAAT	2	8	3737	3744	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022354	GACT	2	8	4557	4564	25 %	25 %	25 %	25 %	543950748
14	NC_022354	AGCT	2	8	4762	4769	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_022354	ACTT	2	8	5168	5175	25 %	50 %	0 %	25 %	543950749
16	NC_022354	AGTA	2	8	5340	5347	50 %	25 %	25 %	0 %	543950749
17	NC_022354	CTCA	2	8	5504	5511	25 %	25 %	0 %	50 %	543950749
18	NC_022354	TTCC	2	8	5572	5579	0 %	50 %	0 %	50 %	543950749
19	NC_022354	TTCC	2	8	5704	5711	0 %	50 %	0 %	50 %	543950749
20	NC_022354	TTCC	2	8	5787	5794	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_022354	ACAA	2	8	5865	5872	75 %	0 %	0 %	25 %	543950750
22	NC_022354	TCTA	2	8	6031	6038	25 %	50 %	0 %	25 %	543950750
23	NC_022354	TCTT	2	8	6800	6807	0 %	75 %	0 %	25 %	543950750
24	NC_022354	TACT	2	8	6909	6916	25 %	50 %	0 %	25 %	543950750
25	NC_022354	CTTG	2	8	6993	7000	0 %	50 %	25 %	25 %	543950750
26	NC_022354	TTTA	2	8	7289	7296	25 %	75 %	0 %	0 %	543950751
27	NC_022354	GTCT	2	8	7363	7370	0 %	50 %	25 %	25 %	543950751
28	NC_022354	TTTA	2	8	7613	7620	25 %	75 %	0 %	0 %	543950751
29	NC_022354	TCAT	2	8	7886	7893	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_022354	ACCC	2	8	8175	8182	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
31	NC_022354	AATC	2	8	8331	8338	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_022354	TCCT	2	8	8389	8396	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_022354	AAAT	2	8	8573	8580	75 %	25 %	0 %	0 %	543950752
34	NC_022354	GCTG	2	8	8590	8597	0 %	25 %	50 %	25 %	543950752
35	NC_022354	TCCA	2	8	8951	8958	25 %	25 %	0 %	50 %	543950752
36	NC_022354	GATT	2	8	9013	9020	25 %	50 %	25 %	0 %	543950752
37	NC_022354	ACAT	2	8	9541	9548	50 %	25 %	0 %	25 %	543950752
38	NC_022354	AATC	2	8	10019	10026	50 %	25 %	0 %	25 %	543950752
39	NC_022354	TTTA	2	8	10651	10658	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022354	TTTG	2	8	10951	10958	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022354	ATTT	2	8	11073	11080	25 %	75 %	0 %	0 %	543950753
42	NC_022354	TTAA	2	8	11375	11382	50 %	50 %	0 %	0 %	543950753
43	NC_022354	CTTT	2	8	11456	11463	0 %	75 %	0 %	25 %	543950753
44	NC_022354	ATTT	2	8	11697	11704	25 %	75 %	0 %	0 %	543950753
45	NC_022354	AATT	2	8	11712	11719	50 %	50 %	0 %	0 %	543950753
46	NC_022354	ATTT	2	8	11857	11864	25 %	75 %	0 %	0 %	543950753
47	NC_022354	ATTT	2	8	12043	12050	25 %	75 %	0 %	0 %	543950753
48	NC_022354	TATT	2	8	12386	12393	25 %	75 %	0 %	0 %	543950753
49	NC_022354	AAAT	2	8	12488	12495	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022354	TTGC	2	8	12671	12678	0 %	50 %	25 %	25 %	543950754
51	NC_022354	GTTT	2	8	12828	12835	0 %	75 %	25 %	0 %	543950754
52	NC_022354	TTAA	2	8	13013	13020	50 %	50 %	0 %	0 %	543950754
53	NC_022354	TACT	2	8	13065	13072	25 %	50 %	0 %	25 %	543950754
54	NC_022354	TTTG	2	8	13265	13272	0 %	75 %	25 %	0 %	543950754
55	NC_022354	AGAT	2	8	13323	13330	50 %	25 %	25 %	0 %	543950754
56	NC_022354	CTAT	2	8	13373	13380	25 %	50 %	0 %	25 %	543950754
57	NC_022354	AATT	2	8	13914	13921	50 %	50 %	0 %	0 %	543950754
58	NC_022354	CTAC	2	8	14123	14130	25 %	25 %	0 %	50 %	543950754
59	NC_022354	ATTA	2	8	14308	14315	50 %	50 %	0 %	0 %	543950754
60	NC_022354	CTTT	2	8	14465	14472	0 %	75 %	0 %	25 %	543950754
61	NC_022354	AATT	2	8	14879	14886	50 %	50 %	0 %	0 %	543950755
62	NC_022354	AAAT	2	8	15092	15099	75 %	25 %	0 %	0 %	543950755
63	NC_022354	AATT	2	8	15703	15710	50 %	50 %	0 %	0 %	543950756
64	NC_022354	TTGT	2	8	16013	16020	0 %	75 %	25 %	0 %	543950756
65	NC_022354	TTCA	2	8	16135	16142	25 %	50 %	0 %	25 %	543950756
66	NC_022354	CTTT	2	8	16284	16291	0 %	75 %	0 %	25 %	543950757
67	NC_022354	AATT	2	8	16915	16922	50 %	50 %	0 %	0 %	543950757
68	NC_022354	TTCA	2	8	16925	16932	25 %	50 %	0 %	25 %	543950757
69	NC_022354	CTTT	2	8	17026	17033	0 %	75 %	0 %	25 %	543950758
70	NC_022354	TCCA	2	8	17392	17399	25 %	25 %	0 %	50 %	543950758
71	NC_022354	AGTT	2	8	17708	17715	25 %	50 %	25 %	0 %	543950759
72	NC_022354	CTAC	2	8	17842	17849	25 %	25 %	0 %	50 %	543950759
73	NC_022354	CCTT	2	8	18548	18555	0 %	50 %	0 %	50 %	543950760
74	NC_022354	AAAT	2	8	18783	18790	75 %	25 %	0 %	0 %	543950760
75	NC_022354	ATAA	2	8	19191	19198	75 %	25 %	0 %	0 %	543950760
76	NC_022354	GTCT	2	8	19355	19362	0 %	50 %	25 %	25 %	543950760
77	NC_022354	AAAT	2	8	19606	19613	75 %	25 %	0 %	0 %	543950760
78	NC_022354	AAAG	2	8	19733	19740	75 %	0 %	25 %	0 %	543950760
79	NC_022354	TTTA	2	8	19822	19829	25 %	75 %	0 %	0 %	543950760
80	NC_022354	AAAT	2	8	19955	19962	75 %	25 %	0 %	0 %	543950761
81	NC_022354	TCTT	2	8	20488	20495	0 %	75 %	0 %	25 %	543950761
82	NC_022354	AAGA	2	8	20697	20704	75 %	0 %	25 %	0 %	543950761
83	NC_022354	ATCA	2	8	21029	21036	50 %	25 %	0 %	25 %	543950762
84	NC_022354	GCAA	2	8	21428	21435	50 %	0 %	25 %	25 %	543950762
85	NC_022354	TATT	2	8	22108	22115	25 %	75 %	0 %	0 %	543950763
86	NC_022354	TTTA	2	8	22151	22158	25 %	75 %	0 %	0 %	543950763
87	NC_022354	CTTT	2	8	22293	22300	0 %	75 %	0 %	25 %	543950763
88	NC_022354	TTTA	2	8	22454	22461	25 %	75 %	0 %	0 %	543950763
89	NC_022354	GTTT	2	8	22625	22632	0 %	75 %	25 %	0 %	543950763
90	NC_022354	AGTA	2	8	23314	23321	50 %	25 %	25 %	0 %	543950764
91	NC_022354	AGTA	2	8	23503	23510	50 %	25 %	25 %	0 %	543950764
92	NC_022354	TCAT	2	8	23643	23650	25 %	50 %	0 %	25 %	543950764
93	NC_022354	TTTA	2	8	23657	23664	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022354	TGAT	2	8	23676	23683	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022354	ATCC	2	8	23688	23695	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_022354	AATT	2	8	23783	23790	50 %	50 %	0 %	0 %	543950765
97	NC_022354	ATCC	2	8	24133	24140	25 %	25 %	0 %	50 %	543950765
98	NC_022354	TCCA	2	8	24510	24517	25 %	25 %	0 %	50 %	543950765
99	NC_022354	AAGT	2	8	24596	24603	50 %	25 %	25 %	0 %	543950765
100	NC_022354	TCAT	2	8	24778	24785	25 %	50 %	0 %	25 %	543950765
101	NC_022354	CTTT	2	8	24990	24997	0 %	75 %	0 %	25 %	543950766
102	NC_022354	TGAT	2	8	25878	25885	25 %	50 %	25 %	0 %	543950767
103	NC_022354	ATTG	2	8	26242	26249	25 %	50 %	25 %	0 %	543950768
104	NC_022354	TTAT	2	8	26538	26545	25 %	75 %	0 %	0 %	543950769
105	NC_022354	ATAA	2	8	27208	27215	75 %	25 %	0 %	0 %	543950770
106	NC_022354	TATT	2	8	27236	27243	25 %	75 %	0 %	0 %	543950770
107	NC_022354	TTTC	2	8	27389	27396	0 %	75 %	0 %	25 %	543950770
108	NC_022354	TGAA	2	8	27429	27436	50 %	25 %	25 %	0 %	543950770
109	NC_022354	TTAA	2	8	27816	27823	50 %	50 %	0 %	0 %	543950771
110	NC_022354	AAAT	2	8	28217	28224	75 %	25 %	0 %	0 %	543950771
111	NC_022354	CTTT	2	8	28376	28383	0 %	75 %	0 %	25 %	543950771
112	NC_022354	TAAA	2	8	28625	28632	75 %	25 %	0 %	0 %	543950771
113	NC_022354	TTTA	2	8	28796	28803	25 %	75 %	0 %	0 %	543950771
114	NC_022354	GATG	2	8	28940	28947	25 %	25 %	50 %	0 %	543950771
115	NC_022354	AATT	2	8	30044	30051	50 %	50 %	0 %	0 %	543950771
116	NC_022354	TTTA	2	8	30790	30797	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022354	TTTA	2	8	31037	31044	25 %	75 %	0 %	0 %	543950772
118	NC_022354	TGAT	2	8	31057	31064	25 %	50 %	25 %	0 %	543950772
119	NC_022354	AATT	2	8	31186	31193	50 %	50 %	0 %	0 %	543950773
120	NC_022354	TAAT	2	8	31808	31815	50 %	50 %	0 %	0 %	543950774
121	NC_022354	TATC	2	8	32084	32091	25 %	50 %	0 %	25 %	543950774
122	NC_022354	ATCA	2	8	32313	32320	50 %	25 %	0 %	25 %	543950775
123	NC_022354	AAGA	2	8	32727	32734	75 %	0 %	25 %	0 %	543950775
124	NC_022354	TAAA	2	8	33250	33257	75 %	25 %	0 %	0 %	543950775
125	NC_022354	TCAT	2	8	33272	33279	25 %	50 %	0 %	25 %	543950775
126	NC_022354	CAAG	2	8	33477	33484	50 %	0 %	25 %	25 %	543950775
127	NC_022354	CGAA	2	8	33519	33526	50 %	0 %	25 %	25 %	543950775
128	NC_022354	TAAA	2	8	34388	34395	75 %	25 %	0 %	0 %	543950776
129	NC_022354	ATCC	2	8	34486	34493	25 %	25 %	0 %	50 %	543950776
130	NC_022354	AAAT	2	8	34589	34596	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022354	TTTC	2	8	35163	35170	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_022354	AGCA	2	8	35601	35608	50 %	0 %	25 %	25 %	543950777
133	NC_022354	TTAT	2	8	35746	35753	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022354	TCAC	2	8	35915	35922	25 %	25 %	0 %	50 %	543950778
135	NC_022354	CCAT	2	8	36755	36762	25 %	25 %	0 %	50 %	543950778
136	NC_022354	ATTC	2	8	37106	37113	25 %	50 %	0 %	25 %	543950779
137	NC_022354	ATTA	2	8	37371	37378	50 %	50 %	0 %	0 %	543950779
138	NC_022354	TTTA	2	8	37536	37543	25 %	75 %	0 %	0 %	543950779
139	NC_022354	TTAT	2	8	37723	37730	25 %	75 %	0 %	0 %	543950780
140	NC_022354	ATTT	2	8	37806	37813	25 %	75 %	0 %	0 %	543950780
141	NC_022354	CTTT	2	8	37936	37943	0 %	75 %	0 %	25 %	543950780
142	NC_022354	AAAT	2	8	38316	38323	75 %	25 %	0 %	0 %	543950781
143	NC_022354	AAAT	2	8	38585	38592	75 %	25 %	0 %	0 %	543950781
144	NC_022354	TAAA	2	8	38603	38610	75 %	25 %	0 %	0 %	543950781
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.