MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2544 plasmid

Total Repeats: 152

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022354	ATTG	2	8	165	172	25 %	50 %	25 %	0 %	543950742
2	NC_022354	ATTT	2	8	175	182	25 %	75 %	0 %	0 %	543950742
3	NC_022354	GTTC	2	8	420	427	0 %	50 %	25 %	25 %	543950742
4	NC_022354	CTTT	2	8	1230	1237	0 %	75 %	0 %	25 %	543950744
5	NC_022354	AAAT	2	8	1519	1526	75 %	25 %	0 %	0 %	543950745
6	NC_022354	TTTA	2	8	1731	1738	25 %	75 %	0 %	0 %	543950745
7	NC_022354	TAAA	2	8	2508	2515	75 %	25 %	0 %	0 %	543950747
8	NC_022354	ATTT	2	8	2571	2578	25 %	75 %	0 %	0 %	543950747
9	NC_022354	ATAA	2	8	2730	2737	75 %	25 %	0 %	0 %	543950747
10	NC_022354	GACT	2	8	4557	4564	25 %	25 %	25 %	25 %	543950748
11	NC_022354	ACTT	2	8	5168	5175	25 %	50 %	0 %	25 %	543950749
12	NC_022354	AGTA	2	8	5340	5347	50 %	25 %	25 %	0 %	543950749
13	NC_022354	CTCA	2	8	5504	5511	25 %	25 %	0 %	50 %	543950749
14	NC_022354	TTCC	2	8	5572	5579	0 %	50 %	0 %	50 %	543950749
15	NC_022354	TTCC	2	8	5704	5711	0 %	50 %	0 %	50 %	543950749
16	NC_022354	ACAA	2	8	5865	5872	75 %	0 %	0 %	25 %	543950750
17	NC_022354	TCTA	2	8	6031	6038	25 %	50 %	0 %	25 %	543950750
18	NC_022354	TCTT	2	8	6800	6807	0 %	75 %	0 %	25 %	543950750
19	NC_022354	TACT	2	8	6909	6916	25 %	50 %	0 %	25 %	543950750
20	NC_022354	CTTG	2	8	6993	7000	0 %	50 %	25 %	25 %	543950750
21	NC_022354	TTTA	2	8	7289	7296	25 %	75 %	0 %	0 %	543950751
22	NC_022354	GTCT	2	8	7363	7370	0 %	50 %	25 %	25 %	543950751
23	NC_022354	TTTA	2	8	7613	7620	25 %	75 %	0 %	0 %	543950751
24	NC_022354	AAAT	2	8	8573	8580	75 %	25 %	0 %	0 %	543950752
25	NC_022354	GCTG	2	8	8590	8597	0 %	25 %	50 %	25 %	543950752
26	NC_022354	TCCA	2	8	8951	8958	25 %	25 %	0 %	50 %	543950752
27	NC_022354	GATT	2	8	9013	9020	25 %	50 %	25 %	0 %	543950752
28	NC_022354	ACAT	2	8	9541	9548	50 %	25 %	0 %	25 %	543950752
29	NC_022354	AATC	2	8	10019	10026	50 %	25 %	0 %	25 %	543950752
30	NC_022354	ATTT	2	8	11073	11080	25 %	75 %	0 %	0 %	543950753
31	NC_022354	TTAA	2	8	11375	11382	50 %	50 %	0 %	0 %	543950753
32	NC_022354	CTTT	2	8	11456	11463	0 %	75 %	0 %	25 %	543950753
33	NC_022354	ATTT	2	8	11697	11704	25 %	75 %	0 %	0 %	543950753
34	NC_022354	AATT	2	8	11712	11719	50 %	50 %	0 %	0 %	543950753
35	NC_022354	ATTT	2	8	11857	11864	25 %	75 %	0 %	0 %	543950753
36	NC_022354	ATTT	2	8	12043	12050	25 %	75 %	0 %	0 %	543950753
37	NC_022354	TATT	2	8	12386	12393	25 %	75 %	0 %	0 %	543950753
38	NC_022354	TTGC	2	8	12671	12678	0 %	50 %	25 %	25 %	543950754
39	NC_022354	GTTT	2	8	12828	12835	0 %	75 %	25 %	0 %	543950754
40	NC_022354	TTAA	2	8	13013	13020	50 %	50 %	0 %	0 %	543950754
41	NC_022354	TACT	2	8	13065	13072	25 %	50 %	0 %	25 %	543950754
42	NC_022354	TTTG	2	8	13265	13272	0 %	75 %	25 %	0 %	543950754
43	NC_022354	AGAT	2	8	13323	13330	50 %	25 %	25 %	0 %	543950754
44	NC_022354	CTAT	2	8	13373	13380	25 %	50 %	0 %	25 %	543950754
45	NC_022354	AATT	2	8	13914	13921	50 %	50 %	0 %	0 %	543950754
46	NC_022354	CTAC	2	8	14123	14130	25 %	25 %	0 %	50 %	543950754
47	NC_022354	ATTA	2	8	14308	14315	50 %	50 %	0 %	0 %	543950754
48	NC_022354	CTTT	2	8	14465	14472	0 %	75 %	0 %	25 %	543950754
49	NC_022354	AATT	2	8	14879	14886	50 %	50 %	0 %	0 %	543950755
50	NC_022354	AAAT	2	8	15092	15099	75 %	25 %	0 %	0 %	543950755
51	NC_022354	AATT	2	8	15703	15710	50 %	50 %	0 %	0 %	543950756
52	NC_022354	TTGT	2	8	16013	16020	0 %	75 %	25 %	0 %	543950756
53	NC_022354	TTCA	2	8	16135	16142	25 %	50 %	0 %	25 %	543950756
54	NC_022354	CTTT	2	8	16284	16291	0 %	75 %	0 %	25 %	543950757
55	NC_022354	AATT	2	8	16915	16922	50 %	50 %	0 %	0 %	543950757
56	NC_022354	TTCA	2	8	16925	16932	25 %	50 %	0 %	25 %	543950757
57	NC_022354	CTTT	2	8	17026	17033	0 %	75 %	0 %	25 %	543950758
58	NC_022354	TCCA	2	8	17392	17399	25 %	25 %	0 %	50 %	543950758
59	NC_022354	AGTT	2	8	17708	17715	25 %	50 %	25 %	0 %	543950759
60	NC_022354	CTAC	2	8	17842	17849	25 %	25 %	0 %	50 %	543950759
61	NC_022354	CCTT	2	8	18548	18555	0 %	50 %	0 %	50 %	543950760
62	NC_022354	AAAT	2	8	18783	18790	75 %	25 %	0 %	0 %	543950760
63	NC_022354	ATAA	2	8	19191	19198	75 %	25 %	0 %	0 %	543950760
64	NC_022354	GTCT	2	8	19355	19362	0 %	50 %	25 %	25 %	543950760
65	NC_022354	AAAT	2	8	19606	19613	75 %	25 %	0 %	0 %	543950760
66	NC_022354	AAAG	2	8	19733	19740	75 %	0 %	25 %	0 %	543950760
67	NC_022354	TTTA	2	8	19822	19829	25 %	75 %	0 %	0 %	543950760
68	NC_022354	AAAT	2	8	19955	19962	75 %	25 %	0 %	0 %	543950761
69	NC_022354	TCTT	2	8	20488	20495	0 %	75 %	0 %	25 %	543950761
70	NC_022354	AAGA	2	8	20697	20704	75 %	0 %	25 %	0 %	543950761
71	NC_022354	ATCA	2	8	21029	21036	50 %	25 %	0 %	25 %	543950762
72	NC_022354	GCAA	2	8	21428	21435	50 %	0 %	25 %	25 %	543950762
73	NC_022354	TATT	2	8	22108	22115	25 %	75 %	0 %	0 %	543950763
74	NC_022354	TTTA	2	8	22151	22158	25 %	75 %	0 %	0 %	543950763
75	NC_022354	CTTT	2	8	22293	22300	0 %	75 %	0 %	25 %	543950763
76	NC_022354	TTTA	2	8	22454	22461	25 %	75 %	0 %	0 %	543950763
77	NC_022354	GTTT	2	8	22625	22632	0 %	75 %	25 %	0 %	543950763
78	NC_022354	AGTA	2	8	23314	23321	50 %	25 %	25 %	0 %	543950764
79	NC_022354	AGTA	2	8	23503	23510	50 %	25 %	25 %	0 %	543950764
80	NC_022354	TCAT	2	8	23643	23650	25 %	50 %	0 %	25 %	543950764
81	NC_022354	AATT	2	8	23783	23790	50 %	50 %	0 %	0 %	543950765
82	NC_022354	ATCC	2	8	24133	24140	25 %	25 %	0 %	50 %	543950765
83	NC_022354	TCCA	2	8	24510	24517	25 %	25 %	0 %	50 %	543950765
84	NC_022354	AAGT	2	8	24596	24603	50 %	25 %	25 %	0 %	543950765
85	NC_022354	TCAT	2	8	24778	24785	25 %	50 %	0 %	25 %	543950765
86	NC_022354	CTTT	2	8	24990	24997	0 %	75 %	0 %	25 %	543950766
87	NC_022354	TGAT	2	8	25878	25885	25 %	50 %	25 %	0 %	543950767
88	NC_022354	ATTG	2	8	26242	26249	25 %	50 %	25 %	0 %	543950768
89	NC_022354	TTAT	2	8	26538	26545	25 %	75 %	0 %	0 %	543950769
90	NC_022354	ATAA	2	8	27208	27215	75 %	25 %	0 %	0 %	543950770
91	NC_022354	TATT	2	8	27236	27243	25 %	75 %	0 %	0 %	543950770
92	NC_022354	TTTC	2	8	27389	27396	0 %	75 %	0 %	25 %	543950770
93	NC_022354	TGAA	2	8	27429	27436	50 %	25 %	25 %	0 %	543950770
94	NC_022354	TTAA	2	8	27816	27823	50 %	50 %	0 %	0 %	543950771
95	NC_022354	AAAT	2	8	28217	28224	75 %	25 %	0 %	0 %	543950771
96	NC_022354	CTTT	2	8	28376	28383	0 %	75 %	0 %	25 %	543950771
97	NC_022354	TAAA	2	8	28625	28632	75 %	25 %	0 %	0 %	543950771
98	NC_022354	TTTA	2	8	28796	28803	25 %	75 %	0 %	0 %	543950771
99	NC_022354	GATG	2	8	28940	28947	25 %	25 %	50 %	0 %	543950771
100	NC_022354	AATT	2	8	30044	30051	50 %	50 %	0 %	0 %	543950771
101	NC_022354	TTTA	2	8	31037	31044	25 %	75 %	0 %	0 %	543950772
102	NC_022354	TGAT	2	8	31057	31064	25 %	50 %	25 %	0 %	543950772
103	NC_022354	AATT	2	8	31186	31193	50 %	50 %	0 %	0 %	543950773
104	NC_022354	TAAT	2	8	31808	31815	50 %	50 %	0 %	0 %	543950774
105	NC_022354	TATC	2	8	32084	32091	25 %	50 %	0 %	25 %	543950774
106	NC_022354	ATCA	2	8	32313	32320	50 %	25 %	0 %	25 %	543950775
107	NC_022354	AAGA	2	8	32727	32734	75 %	0 %	25 %	0 %	543950775
108	NC_022354	TAAA	2	8	33250	33257	75 %	25 %	0 %	0 %	543950775
109	NC_022354	TCAT	2	8	33272	33279	25 %	50 %	0 %	25 %	543950775
110	NC_022354	CAAG	2	8	33477	33484	50 %	0 %	25 %	25 %	543950775
111	NC_022354	CGAA	2	8	33519	33526	50 %	0 %	25 %	25 %	543950775
112	NC_022354	TAAA	2	8	34388	34395	75 %	25 %	0 %	0 %	543950776
113	NC_022354	ATCC	2	8	34486	34493	25 %	25 %	0 %	50 %	543950776
114	NC_022354	AGCA	2	8	35601	35608	50 %	0 %	25 %	25 %	543950777
115	NC_022354	TCAC	2	8	35915	35922	25 %	25 %	0 %	50 %	543950778
116	NC_022354	CCAT	2	8	36755	36762	25 %	25 %	0 %	50 %	543950778
117	NC_022354	ATTC	2	8	37106	37113	25 %	50 %	0 %	25 %	543950779
118	NC_022354	ATTA	2	8	37371	37378	50 %	50 %	0 %	0 %	543950779
119	NC_022354	TTTA	2	8	37536	37543	25 %	75 %	0 %	0 %	543950779
120	NC_022354	TTAT	2	8	37723	37730	25 %	75 %	0 %	0 %	543950780
121	NC_022354	ATTT	2	8	37806	37813	25 %	75 %	0 %	0 %	543950780
122	NC_022354	CTTT	2	8	37936	37943	0 %	75 %	0 %	25 %	543950780
123	NC_022354	AAAT	2	8	38316	38323	75 %	25 %	0 %	0 %	543950781
124	NC_022354	AAAT	2	8	38585	38592	75 %	25 %	0 %	0 %	543950781
125	NC_022354	TAAA	2	8	38603	38610	75 %	25 %	0 %	0 %	543950781
126	NC_022354	GATA	2	8	38976	38983	50 %	25 %	25 %	0 %	543950782
127	NC_022354	AAAT	2	8	39376	39383	75 %	25 %	0 %	0 %	543950782
128	NC_022354	AAAG	2	8	39658	39665	75 %	0 %	25 %	0 %	543950782
129	NC_022354	AAGA	2	8	39904	39911	75 %	0 %	25 %	0 %	543950782
130	NC_022354	GTTT	2	8	40162	40169	0 %	75 %	25 %	0 %	543950783
131	NC_022354	TAAT	2	8	40397	40404	50 %	50 %	0 %	0 %	543950783
132	NC_022354	TAAA	2	8	40715	40722	75 %	25 %	0 %	0 %	543950783
133	NC_022354	AAAT	2	8	40746	40753	75 %	25 %	0 %	0 %	543950783
134	NC_022354	TTGT	2	8	40790	40797	0 %	75 %	25 %	0 %	543950783
135	NC_022354	CATA	2	8	41387	41394	50 %	25 %	0 %	25 %	543950784
136	NC_022354	CTTT	2	8	41852	41859	0 %	75 %	0 %	25 %	543950785
137	NC_022354	TTCT	2	8	42124	42131	0 %	75 %	0 %	25 %	543950785
138	NC_022354	TTTC	2	8	42216	42223	0 %	75 %	0 %	25 %	543950785
139	NC_022354	TGAA	2	8	42930	42937	50 %	25 %	25 %	0 %	543950785
140	NC_022354	TTTA	2	8	43094	43101	25 %	75 %	0 %	0 %	543950785
141	NC_022354	CAAG	2	8	43323	43330	50 %	0 %	25 %	25 %	543950785
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.