MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2544 plasmid

Total Repeats: 557

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022354	CTT	3	9	24	32	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950742
2	NC_022354	CAT	2	6	40	45	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543950742
3	NC_022354	TGC	2	6	50	55	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543950742
4	NC_022354	TTG	2	6	71	76	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543950742
5	NC_022354	CTT	2	6	84	89	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950742
6	NC_022354	GCA	2	6	90	95	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543950742
7	NC_022354	TCA	3	9	111	119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543950742
8	NC_022354	CTT	2	6	237	242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950742
9	NC_022354	TAT	2	6	355	360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543950742
10	NC_022354	TGA	2	6	407	412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543950742
11	NC_022354	TTG	2	6	470	475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543950742
12	NC_022354	ACT	2	6	757	762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543950743
13	NC_022354	TCT	2	6	771	776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950743
14	NC_022354	TTC	2	6	797	802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950743
15	NC_022354	ATT	3	9	892	900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543950743
16	NC_022354	TAA	2	6	910	915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543950744
17	NC_022354	AAG	2	6	997	1002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543950744
18	NC_022354	ACT	2	6	1007	1012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543950744
19	NC_022354	ATC	2	6	1145	1150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543950744
20	NC_022354	AAT	3	9	1214	1222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543950744
21	NC_022354	TTA	2	6	1224	1229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543950744
22	NC_022354	AAT	2	6	1238	1243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543950744
23	NC_022354	ACC	2	6	1268	1273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543950744
24	NC_022354	ACC	2	6	1424	1429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543950744
25	NC_022354	ACA	2	6	1440	1445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543950744
26	NC_022354	TCT	2	6	1579	1584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950745
27	NC_022354	CAT	2	6	1664	1669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543950745
28	NC_022354	TCT	2	6	1677	1682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950745
29	NC_022354	TAT	3	9	1760	1768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543950745
30	NC_022354	TTA	2	6	1783	1788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543950746
31	NC_022354	TCT	2	6	1837	1842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950746
32	NC_022354	TCT	2	6	1862	1867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950746
33	NC_022354	ATA	2	6	1954	1959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543950746
34	NC_022354	CAT	2	6	2010	2015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543950746
35	NC_022354	ATC	2	6	2038	2043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543950746
36	NC_022354	GTT	2	6	2065	2070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543950746
37	NC_022354	ATC	2	6	2089	2094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543950746
38	NC_022354	CTT	2	6	2103	2108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950746
39	NC_022354	TCT	3	9	2198	2206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950746
40	NC_022354	AAC	2	6	2275	2280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543950746
41	NC_022354	TAC	2	6	2332	2337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543950746
42	NC_022354	TCC	2	6	2347	2352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	543950747
43	NC_022354	AAC	2	6	2424	2429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543950747
44	NC_022354	TCA	2	6	2479	2484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543950747
45	NC_022354	ATA	2	6	2641	2646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543950747
46	NC_022354	TAA	2	6	2717	2722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543950747
47	NC_022354	ATC	2	6	2772	2777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543950747
48	NC_022354	ACT	2	6	2784	2789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543950747
49	NC_022354	CTA	2	6	2831	2836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543950747
50	NC_022354	ATC	2	6	4074	4079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543950748
51	NC_022354	CTT	2	6	4085	4090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950748
52	NC_022354	TCT	2	6	4186	4191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950748
53	NC_022354	ATA	2	6	4233	4238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543950748
54	NC_022354	CCA	2	6	4286	4291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543950748
55	NC_022354	CTT	2	6	4331	4336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950748
56	NC_022354	CTT	2	6	4402	4407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950748
57	NC_022354	TCT	2	6	4427	4432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950748
58	NC_022354	TCC	2	6	4491	4496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	543950748
59	NC_022354	ATA	2	6	5009	5014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543950749
60	NC_022354	TTC	2	6	5075	5080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950749
61	NC_022354	TCC	2	6	5088	5093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	543950749
62	NC_022354	TCT	2	6	5295	5300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950749
63	NC_022354	CAT	2	6	5530	5535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543950749
64	NC_022354	CAT	2	6	5588	5593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543950749
65	NC_022354	CAT	2	6	5611	5616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543950749
66	NC_022354	GGT	2	6	5618	5623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543950749
67	NC_022354	CCA	2	6	5674	5679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543950749
68	NC_022354	TGT	2	6	5879	5884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543950750
69	NC_022354	TCA	2	6	6249	6254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543950750
70	NC_022354	AGT	2	6	6390	6395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543950750
71	NC_022354	GTT	2	6	6435	6440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543950750
72	NC_022354	AAG	2	6	6633	6638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543950750
73	NC_022354	ATT	2	6	6758	6763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543950750
74	NC_022354	TAA	2	6	6782	6787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543950750
75	NC_022354	TAT	2	6	7083	7088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543950750
76	NC_022354	TAA	2	6	7119	7124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543950750
77	NC_022354	ATT	3	9	7129	7137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543950750
78	NC_022354	ACC	2	6	7152	7157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543950751
79	NC_022354	CTT	2	6	7159	7164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950751
80	NC_022354	ATT	2	6	7233	7238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543950751
81	NC_022354	TTC	3	9	7259	7267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950751
82	NC_022354	TTC	2	6	7280	7285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950751
83	NC_022354	TTA	4	12	7294	7305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543950751
84	NC_022354	CTT	2	6	7312	7317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950751
85	NC_022354	ATA	2	6	7442	7447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543950751
86	NC_022354	TTA	2	6	7531	7536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543950751
87	NC_022354	ATC	2	6	7538	7543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543950751
88	NC_022354	TTA	2	6	7596	7601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543950751
89	NC_022354	ATC	2	6	7670	7675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543950751
90	NC_022354	TAA	2	6	7682	7687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543950751
91	NC_022354	ATA	2	6	7756	7761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543950751
92	NC_022354	GCG	2	6	8559	8564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	543950752
93	NC_022354	CAT	2	6	8756	8761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543950752
94	NC_022354	AGC	2	6	8872	8877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543950752
95	NC_022354	GTA	2	6	9283	9288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543950752
96	NC_022354	ATA	2	6	9294	9299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543950752
97	NC_022354	GTT	2	6	9382	9387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543950752
98	NC_022354	CAT	2	6	9470	9475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543950752
99	NC_022354	TAA	2	6	9584	9589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543950752
100	NC_022354	CGC	2	6	9637	9642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	543950752
101	NC_022354	TGA	2	6	9705	9710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543950752
102	NC_022354	TTC	2	6	9816	9821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950752
103	NC_022354	TGC	2	6	9946	9951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543950752
104	NC_022354	GAA	2	6	9979	9984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543950752
105	NC_022354	TGA	2	6	10046	10051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543950752
106	NC_022354	TAA	2	6	10134	10139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543950752
107	NC_022354	TCC	2	6	10228	10233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	543950752
108	NC_022354	CTG	2	6	10250	10255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543950752
109	NC_022354	TTG	2	6	10304	10309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543950752
110	NC_022354	CAC	2	6	10343	10348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543950752
111	NC_022354	TGT	2	6	10374	10379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543950752
112	NC_022354	ATT	2	6	10417	10422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543950752
113	NC_022354	CAA	2	6	11007	11012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543950753
114	NC_022354	CTT	2	6	11022	11027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950753
115	NC_022354	CTC	2	6	11109	11114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	543950753
116	NC_022354	TCT	3	9	11161	11169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950753
117	NC_022354	TTC	2	6	11239	11244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950753
118	NC_022354	TCT	2	6	11267	11272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950753
119	NC_022354	ATT	2	6	11383	11388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543950753
120	NC_022354	TAA	2	6	11505	11510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543950753
121	NC_022354	TAA	2	6	11541	11546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543950753
122	NC_022354	ATT	3	9	11563	11571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543950753
123	NC_022354	CTT	2	6	11745	11750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543950753
124	NC_022354	ATA	2	6	11881	11886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543950753
125	NC_022354	ATT	2	6	11899	11904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543950753
126	NC_022354	TAA	2	6	11908	11913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543950753
127	NC_022354	TAT	2	6	11970	11975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543950753
128	NC_022354	ATG	2	6	11984	11989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543950753
129	NC_022354	ATA	2	6	12248	12253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543950753
130	NC_022354	TAA	2	6	12279	12284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543950753
131	NC_022354	CAA	2	6	12370	12375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543950753
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259	NC_022354	GTT	2	6	21914	21919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543950762
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