MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2544 plasmid

Total Repeats: 84

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022354	TC	3	6	221	226	0 %	50 %	0 %	50 %	543950742
2	NC_022354	TC	3	6	346	351	0 %	50 %	0 %	50 %	543950742
3	NC_022354	TA	3	6	675	680	50 %	50 %	0 %	0 %	543950743
4	NC_022354	TA	3	6	1489	1494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022354	TA	3	6	1640	1645	50 %	50 %	0 %	0 %	543950745
6	NC_022354	AT	3	6	1657	1662	50 %	50 %	0 %	0 %	543950745
7	NC_022354	GA	4	8	2985	2992	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022354	TA	4	8	3277	3284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022354	TA	3	6	3287	3292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022354	AT	4	8	3326	3333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022354	AT	3	6	3537	3542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022354	TA	3	6	3967	3972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022354	AT	3	6	4023	4028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022354	CT	3	6	4146	4151	0 %	50 %	0 %	50 %	543950748
15	NC_022354	TC	3	6	4176	4181	0 %	50 %	0 %	50 %	543950748
16	NC_022354	CA	3	6	4568	4573	50 %	0 %	0 %	50 %	543950748
17	NC_022354	CG	3	6	5272	5277	0 %	0 %	50 %	50 %	543950749
18	NC_022354	TA	3	6	5683	5688	50 %	50 %	0 %	0 %	543950749
19	NC_022354	CA	3	6	6277	6282	50 %	0 %	0 %	50 %	543950750
20	NC_022354	GA	3	6	6660	6665	50 %	0 %	50 %	0 %	543950750
21	NC_022354	TA	3	6	7826	7831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022354	GA	3	6	8773	8778	50 %	0 %	50 %	0 %	543950752
23	NC_022354	AT	4	8	9166	9173	50 %	50 %	0 %	0 %	543950752
24	NC_022354	TA	4	8	9614	9621	50 %	50 %	0 %	0 %	543950752
25	NC_022354	AT	3	6	9859	9864	50 %	50 %	0 %	0 %	543950752
26	NC_022354	TA	3	6	11425	11430	50 %	50 %	0 %	0 %	543950753
27	NC_022354	AT	3	6	11590	11595	50 %	50 %	0 %	0 %	543950753
28	NC_022354	TA	3	6	11799	11804	50 %	50 %	0 %	0 %	543950753
29	NC_022354	TA	3	6	13075	13080	50 %	50 %	0 %	0 %	543950754
30	NC_022354	CT	3	6	13081	13086	0 %	50 %	0 %	50 %	543950754
31	NC_022354	TA	3	6	14614	14619	50 %	50 %	0 %	0 %	543950754
32	NC_022354	AT	3	6	14964	14969	50 %	50 %	0 %	0 %	543950755
33	NC_022354	TA	3	6	15146	15151	50 %	50 %	0 %	0 %	543950755
34	NC_022354	AT	3	6	15294	15299	50 %	50 %	0 %	0 %	543950755
35	NC_022354	TA	3	6	15338	15343	50 %	50 %	0 %	0 %	543950755
36	NC_022354	TA	3	6	16120	16125	50 %	50 %	0 %	0 %	543950756
37	NC_022354	TA	3	6	16316	16321	50 %	50 %	0 %	0 %	543950757
38	NC_022354	AT	3	6	16432	16437	50 %	50 %	0 %	0 %	543950757
39	NC_022354	TC	3	6	17082	17087	0 %	50 %	0 %	50 %	543950758
40	NC_022354	GA	3	6	17100	17105	50 %	0 %	50 %	0 %	543950758
41	NC_022354	CT	3	6	18493	18498	0 %	50 %	0 %	50 %	543950760
42	NC_022354	TA	3	6	18823	18828	50 %	50 %	0 %	0 %	543950760
43	NC_022354	TC	3	6	19924	19929	0 %	50 %	0 %	50 %	543950761
44	NC_022354	TA	3	6	20496	20501	50 %	50 %	0 %	0 %	543950761
45	NC_022354	TA	3	6	21482	21487	50 %	50 %	0 %	0 %	543950762
46	NC_022354	TG	3	6	22040	22045	0 %	50 %	50 %	0 %	543950762
47	NC_022354	GA	3	6	23376	23381	50 %	0 %	50 %	0 %	543950764
48	NC_022354	CT	3	6	24797	24802	0 %	50 %	0 %	50 %	543950766
49	NC_022354	AG	3	6	27350	27355	50 %	0 %	50 %	0 %	543950770
50	NC_022354	TG	3	6	28515	28520	0 %	50 %	50 %	0 %	543950771
51	NC_022354	AT	3	6	28572	28577	50 %	50 %	0 %	0 %	543950771
52	NC_022354	TA	4	8	31043	31050	50 %	50 %	0 %	0 %	543950772
53	NC_022354	AT	3	6	31581	31586	50 %	50 %	0 %	0 %	543950774
54	NC_022354	TA	3	6	32268	32273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022354	TA	3	6	32298	32303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022354	AT	3	6	32390	32395	50 %	50 %	0 %	0 %	543950775
57	NC_022354	AT	3	6	32759	32764	50 %	50 %	0 %	0 %	543950775
58	NC_022354	GA	3	6	32925	32930	50 %	0 %	50 %	0 %	543950775
59	NC_022354	AT	3	6	33080	33085	50 %	50 %	0 %	0 %	543950775
60	NC_022354	CT	3	6	35398	35403	0 %	50 %	0 %	50 %	543950777
61	NC_022354	TA	3	6	35723	35728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022354	TA	3	6	35740	35745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022354	AT	3	6	35752	35757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022354	TA	3	6	36164	36169	50 %	50 %	0 %	0 %	543950778
65	NC_022354	AT	3	6	37465	37470	50 %	50 %	0 %	0 %	543950779
66	NC_022354	AT	3	6	37848	37853	50 %	50 %	0 %	0 %	543950780
67	NC_022354	AT	3	6	38202	38207	50 %	50 %	0 %	0 %	543950781
68	NC_022354	AT	4	8	38540	38547	50 %	50 %	0 %	0 %	543950781
69	NC_022354	AT	3	6	38639	38644	50 %	50 %	0 %	0 %	543950781
70	NC_022354	TA	3	6	39049	39054	50 %	50 %	0 %	0 %	543950782
71	NC_022354	AG	3	6	39741	39746	50 %	0 %	50 %	0 %	543950782
72	NC_022354	GA	4	8	39822	39829	50 %	0 %	50 %	0 %	543950782
73	NC_022354	TA	3	6	40086	40091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022354	TA	3	6	40511	40516	50 %	50 %	0 %	0 %	543950783
75	NC_022354	GA	3	6	41474	41479	50 %	0 %	50 %	0 %	543950784
76	NC_022354	TC	3	6	42711	42716	0 %	50 %	0 %	50 %	543950785
77	NC_022354	TA	3	6	42991	42996	50 %	50 %	0 %	0 %	543950785
78	NC_022354	TG	3	6	43182	43187	0 %	50 %	50 %	0 %	543950785
79	NC_022354	CA	3	6	43374	43379	50 %	0 %	0 %	50 %	543950785
80	NC_022354	AT	3	6	43803	43808	50 %	50 %	0 %	0 %	543950785
81	NC_022354	GT	3	6	44165	44170	0 %	50 %	50 %	0 %	543950785
82	NC_022354	TA	4	8	44449	44456	50 %	50 %	0 %	0 %	543950785
83	NC_022354	TA	3	6	46172	46177	50 %	50 %	0 %	0 %	543950785
84	NC_022354	AT	3	6	46438	46443	50 %	50 %	0 %	0 %	543950785

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.