MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2544 genome

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022353	TAAAAT	2	12	1455	1466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022353	AATTTA	2	12	21111	21122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022353	TTTTCT	2	12	23500	23511	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_022353	GTTTTT	2	12	60267	60278	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022353	TAAAAT	2	12	90699	90710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022353	ATTAAA	2	12	134958	134969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022353	CTTAAA	2	12	135752	135763	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_022353	AAATAA	2	12	179270	179281	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022353	ATTTTT	2	12	196676	196687	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022353	ATATTA	2	12	203713	203724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022353	AATATT	2	12	203855	203866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022353	AAAATT	2	12	239934	239945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022353	TATTTT	2	12	240209	240220	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022353	TTAATT	2	12	255088	255099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022353	TATATT	2	12	255661	255672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022353	AAAAAT	2	12	257071	257082	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022353	AATAAC	2	12	270480	270491	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_022353	AAAATT	2	12	299385	299396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022353	ATTTAT	2	12	345718	345729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022353	TATTTT	2	12	394751	394762	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022353	TGTGTT	2	12	402182	402193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022353	TTTATT	2	12	424485	424496	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022353	TTTTAT	2	12	473284	473295	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022353	AATTTA	2	12	502503	502514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022353	AAAATA	2	12	518861	518872	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022353	TTTTAA	2	12	547449	547460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022353	CCTTAT	2	12	552098	552109	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_022353	ATATTT	2	12	603082	603093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022353	TAATAG	2	12	639669	639680	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022353	ATTTAA	2	12	648612	648623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022353	TTTATT	2	12	658753	658764	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022353	TAAATT	2	12	658822	658833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022353	ATTTTT	2	12	665001	665012	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022353	ATAATT	2	12	692477	692488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022353	TTAAAT	2	12	712058	712069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022353	TCTTAT	2	12	719294	719305	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_022353	GGGTTG	2	12	719651	719662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022353	GTTTGG	2	12	719833	719844	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022353	AATTAA	2	12	721138	721149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022353	TCAAAA	2	12	721170	721181	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_022353	TTAGCT	2	12	721619	721630	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_022353	CTTCTA	2	12	721637	721648	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_022353	AAATTT	2	12	786070	786081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022353	AAGCAA	2	12	796039	796050	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_022353	ATATTT	2	12	823353	823364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022353	AAATTA	2	12	827146	827157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022353	ACAAAG	2	12	839976	839987	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_022353	TTTTTA	2	12	842453	842464	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022353	AATTTT	2	12	868862	868873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022353	AATAAA	2	12	888850	888861	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022353	TTTTAT	2	12	916762	916773	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022353	ATCTTA	2	12	917555	917566	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_022353	ATCTTA	2	12	922769	922780	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_022353	TATAAA	2	12	923026	923037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022353	ATCTTA	2	12	923052	923063	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_022353	ATTTTA	2	12	1047412	1047423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022353	TTAATT	2	12	1145389	1145400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022353	TTAATT	2	12	1173376	1173387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022353	AATTTT	2	12	1208835	1208846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022353	TTTATT	2	12	1237599	1237610	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022353	AATTTA	2	12	1237629	1237640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022353	GAAAAA	2	12	1242210	1242221	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022353	TTTGTA	2	12	1244081	1244092	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022353	TATAAT	2	12	1244691	1244702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022353	GCAAGG	2	12	1260719	1260730	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_022353	ATAAAA	2	12	1267768	1267779	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022353	CTTTAT	2	12	1293095	1293106	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_022353	CAAAAA	2	12	1342072	1342083	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_022353	TTAATT	2	12	1352123	1352134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022353	TATAAT	2	12	1485423	1485434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022353	TAGCTT	2	12	1516015	1516026	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_022353	ATAAAA	2	12	1517501	1517512	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022353	TAAAAA	2	12	1549146	1549157	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022353	GCAAAA	2	12	1582345	1582356	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_022353	ATTTTT	2	12	1607330	1607341	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022353	TAAAAA	2	12	1648007	1648018	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022353	GCAGGC	2	12	1655661	1655672	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_022353	TAAAAT	2	12	1659547	1659558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022353	AAGCCT	2	12	1659651	1659662	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.