MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2544 genome

Total Repeats: 1700

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022353	CAAAG	2	10	94	103	60 %	0 %	20 %	20 %	543948973
2	NC_022353	AAAGA	2	10	1009	1018	80 %	0 %	20 %	0 %	543948973
3	NC_022353	TGAAA	2	10	1194	1203	60 %	20 %	20 %	0 %	543948973
4	NC_022353	AAAAT	2	10	1292	1301	80 %	20 %	0 %	0 %	543948973
5	NC_022353	GCTTT	2	10	3329	3338	0 %	60 %	20 %	20 %	543948975
6	NC_022353	GTTTT	2	10	4923	4932	0 %	80 %	20 %	0 %	543948976
7	NC_022353	TTTTA	2	10	6527	6536	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022353	TAAAA	2	10	6619	6628	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022353	GTTTT	2	10	7487	7496	0 %	80 %	20 %	0 %	543948978
10	NC_022353	ATTTT	2	10	8704	8713	20 %	80 %	0 %	0 %	543948979
11	NC_022353	AAGAG	2	10	9736	9745	60 %	0 %	40 %	0 %	543948979
12	NC_022353	TGCTT	2	10	10045	10054	0 %	60 %	20 %	20 %	543948979
13	NC_022353	ACTTC	2	10	10398	10407	20 %	40 %	0 %	40 %	543948979
14	NC_022353	TCAAA	2	10	10960	10969	60 %	20 %	0 %	20 %	543948979
15	NC_022353	TTTTA	2	10	13052	13061	20 %	80 %	0 %	0 %	543948980
16	NC_022353	AATTT	2	10	13236	13245	40 %	60 %	0 %	0 %	543948980
17	NC_022353	TAGAT	2	10	13264	13273	40 %	40 %	20 %	0 %	543948980
18	NC_022353	TATTT	2	10	13709	13718	20 %	80 %	0 %	0 %	543948980
19	NC_022353	CTTTA	2	10	14037	14046	20 %	60 %	0 %	20 %	543948980
20	NC_022353	GACAA	2	10	15321	15330	60 %	0 %	20 %	20 %	543948981
21	NC_022353	CTTAA	2	10	16750	16759	40 %	40 %	0 %	20 %	543948984
22	NC_022353	CATTT	2	10	17300	17309	20 %	60 %	0 %	20 %	543948984
23	NC_022353	GTATT	2	10	17431	17440	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022353	GCGAT	2	10	17570	17579	20 %	20 %	40 %	20 %	543948985
25	NC_022353	AAAAT	2	10	19799	19808	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022353	TTTCA	2	10	20266	20275	20 %	60 %	0 %	20 %	543948987
27	NC_022353	AAGAT	2	10	21819	21828	60 %	20 %	20 %	0 %	543948988
28	NC_022353	ACCAA	2	10	23482	23491	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_022353	AAAAT	2	10	23623	23632	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022353	GTTAA	2	10	23650	23659	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022353	GTTGA	2	10	24939	24948	20 %	40 %	40 %	0 %	543948990
32	NC_022353	TTTAT	2	10	27411	27420	20 %	80 %	0 %	0 %	543948993
33	NC_022353	TTCTT	2	10	28166	28175	0 %	80 %	0 %	20 %	543948993
34	NC_022353	TTTGG	2	10	28839	28848	0 %	60 %	40 %	0 %	543948994
35	NC_022353	AGATA	2	10	29924	29933	60 %	20 %	20 %	0 %	543948995
36	NC_022353	GCTTT	2	10	30438	30447	0 %	60 %	20 %	20 %	543948995
37	NC_022353	ATACT	2	10	31847	31856	40 %	40 %	0 %	20 %	543948995
38	NC_022353	AATCC	2	10	32298	32307	40 %	20 %	0 %	40 %	543948996
39	NC_022353	TGTTT	2	10	33285	33294	0 %	80 %	20 %	0 %	543948996
40	NC_022353	GCAAA	2	10	33352	33361	60 %	0 %	20 %	20 %	543948996
41	NC_022353	AAAGT	2	10	34254	34263	60 %	20 %	20 %	0 %	543948997
42	NC_022353	AAAAT	2	10	35506	35515	80 %	20 %	0 %	0 %	543948998
43	NC_022353	ATTAT	2	10	36251	36260	40 %	60 %	0 %	0 %	543948999
44	NC_022353	AAATC	2	10	36921	36930	60 %	20 %	0 %	20 %	543948999
45	NC_022353	AAAAT	2	10	39266	39275	80 %	20 %	0 %	0 %	543949000
46	NC_022353	TTGAC	2	10	40991	41000	20 %	40 %	20 %	20 %	543949001
47	NC_022353	AAGAA	2	10	41895	41904	80 %	0 %	20 %	0 %	543949001
48	NC_022353	ATGTT	2	10	41993	42002	20 %	60 %	20 %	0 %	543949001
49	NC_022353	GAAAT	2	10	43397	43406	60 %	20 %	20 %	0 %	543949001
50	NC_022353	AAAAG	2	10	43731	43740	80 %	0 %	20 %	0 %	543949001
51	NC_022353	AAAAT	2	10	44075	44084	80 %	20 %	0 %	0 %	543949001
52	NC_022353	AAATT	2	10	46302	46311	60 %	40 %	0 %	0 %	543949002
53	NC_022353	AGCTT	2	10	46615	46624	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_022353	AGCAA	2	10	47765	47774	60 %	0 %	20 %	20 %	543949004
55	NC_022353	CAAAT	2	10	48664	48673	60 %	20 %	0 %	20 %	543949005
56	NC_022353	TACTC	2	10	50944	50953	20 %	40 %	0 %	40 %	543949006
57	NC_022353	GATAA	2	10	51342	51351	60 %	20 %	20 %	0 %	543949007
58	NC_022353	ACCGC	2	10	52260	52269	20 %	0 %	20 %	60 %	543949008
59	NC_022353	CTTTT	2	10	52426	52435	0 %	80 %	0 %	20 %	543949008
60	NC_022353	ACCGC	2	10	52452	52461	20 %	0 %	20 %	60 %	543949008
61	NC_022353	TTTCA	2	10	52673	52682	20 %	60 %	0 %	20 %	543949008
62	NC_022353	AAGAT	2	10	54065	54074	60 %	20 %	20 %	0 %	543949009
63	NC_022353	TAATG	2	10	54117	54126	40 %	40 %	20 %	0 %	543949009
64	NC_022353	GATAA	2	10	54444	54453	60 %	20 %	20 %	0 %	543949010
65	NC_022353	AAATT	2	10	55353	55362	60 %	40 %	0 %	0 %	543949010
66	NC_022353	TACTA	2	10	57209	57218	40 %	40 %	0 %	20 %	543949012
67	NC_022353	TGCTT	2	10	58003	58012	0 %	60 %	20 %	20 %	543949012
68	NC_022353	AATAT	2	10	58188	58197	60 %	40 %	0 %	0 %	543949012
69	NC_022353	CATTT	2	10	58787	58796	20 %	60 %	0 %	20 %	543949013
70	NC_022353	AATTT	2	10	58801	58810	40 %	60 %	0 %	0 %	543949013
71	NC_022353	ATTTC	2	10	58903	58912	20 %	60 %	0 %	20 %	543949013
72	NC_022353	TGATT	2	10	58954	58963	20 %	60 %	20 %	0 %	543949013
73	NC_022353	TTTTA	2	10	59021	59030	20 %	80 %	0 %	0 %	543949013
74	NC_022353	GATAA	2	10	59955	59964	60 %	20 %	20 %	0 %	543949013
75	NC_022353	TCAAA	2	10	60506	60515	60 %	20 %	0 %	20 %	543949014
76	NC_022353	TGTGT	2	10	61001	61010	0 %	60 %	40 %	0 %	543949014
77	NC_022353	AAAAT	2	10	61181	61190	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022353	ATTAC	2	10	61537	61546	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_022353	AAAAT	2	10	62229	62238	80 %	20 %	0 %	0 %	543949016
80	NC_022353	ATATT	2	10	64507	64516	40 %	60 %	0 %	0 %	543949020
81	NC_022353	TTTAT	2	10	64894	64903	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022353	CAAGA	2	10	66950	66959	60 %	0 %	20 %	20 %	543949023
83	NC_022353	GAGCA	2	10	67320	67329	40 %	0 %	40 %	20 %	543949024
84	NC_022353	ATCAA	2	10	67799	67808	60 %	20 %	0 %	20 %	543949025
85	NC_022353	CTCTT	2	10	70794	70803	0 %	60 %	0 %	40 %	543949029
86	NC_022353	TTTTC	2	10	70835	70844	0 %	80 %	0 %	20 %	543949029
87	NC_022353	TCTCT	2	10	71099	71108	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
88	NC_022353	ATCTC	2	10	71650	71659	20 %	40 %	0 %	40 %	543949030
89	NC_022353	GCCAA	2	10	71788	71797	40 %	0 %	20 %	40 %	543949030
90	NC_022353	TTTTG	2	10	73032	73041	0 %	80 %	20 %	0 %	543949031
91	NC_022353	AGTAA	2	10	73605	73614	60 %	20 %	20 %	0 %	543949032
92	NC_022353	TAAGG	2	10	77506	77515	40 %	20 %	40 %	0 %	543949035
93	NC_022353	ATTTT	2	10	77559	77568	20 %	80 %	0 %	0 %	543949035
94	NC_022353	TAGGA	2	10	77835	77844	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022353	AAAAT	2	10	77861	77870	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022353	ATTTT	2	10	77871	77880	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022353	TAAGA	2	10	78287	78296	60 %	20 %	20 %	0 %	543949036
98	NC_022353	TTAAT	2	10	78596	78605	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022353	TATTT	2	10	78664	78673	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022353	TATAA	2	10	78681	78690	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022353	TTTGC	2	10	79360	79369	0 %	60 %	20 %	20 %	543949038
102	NC_022353	TGGAC	2	10	79709	79718	20 %	20 %	40 %	20 %	543949039
103	NC_022353	TAAAA	2	10	82458	82467	80 %	20 %	0 %	0 %	543949041
104	NC_022353	CAAAA	2	10	82991	83000	80 %	0 %	0 %	20 %	543949041
105	NC_022353	TAAAA	2	10	83430	83439	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022353	TAAAA	2	10	85701	85710	80 %	20 %	0 %	0 %	543949044
107	NC_022353	GAAAT	2	10	86573	86582	60 %	20 %	20 %	0 %	543949046
108	NC_022353	TGGTT	2	10	86757	86766	0 %	60 %	40 %	0 %	543949046
109	NC_022353	TCCAT	2	10	87370	87379	20 %	40 %	0 %	40 %	543949046
110	NC_022353	TATTT	2	10	87917	87926	20 %	80 %	0 %	0 %	543949047
111	NC_022353	TTTTA	2	10	87929	87938	20 %	80 %	0 %	0 %	543949047
112	NC_022353	TATTT	2	10	88277	88286	20 %	80 %	0 %	0 %	543949047
113	NC_022353	TTGGC	2	10	88791	88800	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_022353	AAGAT	2	10	88878	88887	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022353	GTAAA	2	10	89527	89536	60 %	20 %	20 %	0 %	543949048
116	NC_022353	AGAAT	2	10	90057	90066	60 %	20 %	20 %	0 %	543949049
117	NC_022353	AAGAA	2	10	90739	90748	80 %	0 %	20 %	0 %	543949050
118	NC_022353	CCTTG	2	10	91180	91189	0 %	40 %	20 %	40 %	543949050
119	NC_022353	AGGTA	2	10	91696	91705	40 %	20 %	40 %	0 %	543949050
120	NC_022353	GTGCA	2	10	93354	93363	20 %	20 %	40 %	20 %	543949051
121	NC_022353	ACCTT	2	10	94465	94474	20 %	40 %	0 %	40 %	543949052
122	NC_022353	TATTT	2	10	94980	94989	20 %	80 %	0 %	0 %	543949053
123	NC_022353	TCAAA	2	10	95038	95047	60 %	20 %	0 %	20 %	543949053
124	NC_022353	TTAGA	2	10	95309	95318	40 %	40 %	20 %	0 %	543949053
125	NC_022353	GCTTT	2	10	95400	95409	0 %	60 %	20 %	20 %	543949054
126	NC_022353	GTTTA	2	10	95917	95926	20 %	60 %	20 %	0 %	543949054
127	NC_022353	TAAAA	2	10	95982	95991	80 %	20 %	0 %	0 %	543949054
128	NC_022353	AAATG	2	10	96168	96177	60 %	20 %	20 %	0 %	543949055
129	NC_022353	AGGCA	2	10	96804	96813	40 %	0 %	40 %	20 %	543949055
130	NC_022353	TAAAA	2	10	97167	97176	80 %	20 %	0 %	0 %	543949055
131	NC_022353	AAATT	2	10	98162	98171	60 %	40 %	0 %	0 %	543949056
132	NC_022353	AAAGC	2	10	98857	98866	60 %	0 %	20 %	20 %	543949057
133	NC_022353	AAGAA	2	10	100231	100240	80 %	0 %	20 %	0 %	543949059
134	NC_022353	ACTCA	2	10	102367	102376	40 %	20 %	0 %	40 %	543949062
135	NC_022353	TTTTG	2	10	105705	105714	0 %	80 %	20 %	0 %	543949067
136	NC_022353	ATTTC	2	10	107824	107833	20 %	60 %	0 %	20 %	543949069
137	NC_022353	CAAGA	2	10	108479	108488	60 %	0 %	20 %	20 %	543949069
138	NC_022353	AATGA	2	10	109148	109157	60 %	20 %	20 %	0 %	543949070
139	NC_022353	AAGAT	2	10	110190	110199	60 %	20 %	20 %	0 %	543949071
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161	NC_022353	AAAAT	2	10	135707	135716	80 %	20 %	0 %	0 %	543949101
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246	NC_022353	GTTTT	2	10	224815	224824	0 %	80 %	20 %	0 %	543949211
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248	NC_022353	AAGTG	2	10	227503	227512	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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250	NC_022353	TAAAA	2	10	230043	230052	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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254	NC_022353	AGCGT	2	10	234931	234940	20 %	20 %	40 %	20 %	543949218
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257	NC_022353	AAAAT	2	10	243995	244004	80 %	20 %	0 %	0 %	543949235
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259	NC_022353	GCATA	2	10	246118	246127	40 %	20 %	20 %	20 %	543949237
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267	NC_022353	AAATT	2	10	250822	250831	60 %	40 %	0 %	0 %	543949244
268	NC_022353	CGTTG	2	10	255037	255046	0 %	40 %	40 %	20 %	543949247
269	NC_022353	AAAAT	2	10	255173	255182	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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