MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2544 genome

Total Repeats: 193

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022353	TTTTA	2	10	6527	6536	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022353	TAAAA	2	10	6619	6628	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022353	GTATT	2	10	17431	17440	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022353	AAAAT	2	10	19799	19808	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022353	ACCAA	2	10	23482	23491	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_022353	AAAAT	2	10	23623	23632	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022353	GTTAA	2	10	23650	23659	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022353	AGCTT	2	10	46615	46624	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_022353	AAAAT	2	10	61181	61190	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022353	ATTAC	2	10	61537	61546	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_022353	TTTAT	2	10	64894	64903	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022353	TCTCT	2	10	71099	71108	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_022353	TAGGA	2	10	77835	77844	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022353	AAAAT	2	10	77861	77870	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022353	ATTTT	2	10	77871	77880	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022353	TTAAT	2	10	78596	78605	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022353	TATTT	2	10	78664	78673	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022353	TATAA	2	10	78681	78690	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022353	TAAAA	2	10	83430	83439	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022353	TTGGC	2	10	88791	88800	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_022353	AAGAT	2	10	88878	88887	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022353	ATTTT	2	10	135733	135742	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022353	AAGAA	2	10	141351	141360	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022353	ATTTT	2	10	169547	169556	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022353	TTTTG	2	10	170710	170719	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022353	TTAAT	2	10	179292	179301	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022353	TATTT	2	10	183031	183040	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022353	TTATT	2	10	197242	197251	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022353	AAAGC	2	10	203635	203644	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_022353	TATTT	2	10	210265	210274	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022353	TAAAA	2	10	220455	220464	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022353	AAAAT	2	10	224623	224632	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022353	AAGTG	2	10	227503	227512	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022353	AGGAT	2	10	228685	228694	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022353	TAAAA	2	10	230043	230052	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022353	TAGAT	2	10	239726	239735	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022353	AAAAT	2	10	255173	255182	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022353	AAATT	2	10	257010	257019	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022353	CTTTT	2	10	257055	257064	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_022353	ATTAA	2	10	259082	259091	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022353	TAAAT	2	10	259923	259932	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022353	CATAA	2	10	265503	265512	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_022353	AAAGC	2	10	268882	268891	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_022353	ATTCA	2	10	270237	270246	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_022353	CTATT	2	10	271290	271299	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_022353	ATATT	2	10	275785	275794	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022353	ATTAA	2	10	279062	279071	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022353	TTAAT	2	10	280978	280987	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022353	ATAAA	2	10	299338	299347	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022353	AATTT	2	10	307291	307300	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022353	AATGA	2	10	322905	322914	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022353	TTAAA	3	15	332391	332405	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022353	GAGTA	2	10	339039	339048	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022353	TTTTA	2	10	351314	351323	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022353	ATTAA	2	10	367388	367397	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022353	ATTAA	2	10	369881	369890	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022353	AATTT	2	10	393117	393126	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022353	CTTAT	2	10	429878	429887	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_022353	ATTTT	2	10	434405	434414	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022353	TAAAT	2	10	455809	455818	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022353	TTGCT	2	10	459171	459180	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_022353	TTTAT	2	10	481930	481939	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022353	GATTT	2	10	482453	482462	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022353	TTTTA	2	10	489997	490006	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022353	TTTTA	2	10	510467	510476	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022353	TTTAA	2	10	511349	511358	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022353	AAATA	2	10	511405	511414	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022353	AAAAT	2	10	534905	534914	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022353	GTTTT	2	10	538003	538012	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022353	AAATA	2	10	538312	538321	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022353	CATTC	2	10	539029	539038	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
72	NC_022353	TTTTA	2	10	547319	547328	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022353	AAAAT	2	10	547353	547362	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022353	AATTA	2	10	549813	549822	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022353	AATAT	2	10	552110	552119	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022353	TTTGA	2	10	564974	564983	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022353	ATTTG	2	10	566135	566144	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022353	TAAAA	2	10	579997	580006	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022353	GATAA	2	10	603148	603157	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022353	TTTAA	2	10	612538	612547	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022353	GAAAA	2	10	620126	620135	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022353	TTTGC	2	10	623647	623656	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_022353	AATTA	2	10	639687	639696	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022353	TTTAA	2	10	648671	648680	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022353	CTTTG	2	10	650329	650338	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_022353	ATTTT	2	10	650596	650605	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022353	TACTT	2	10	651220	651229	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_022353	AGAAA	2	10	651308	651317	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022353	ATTTA	2	10	663052	663061	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022353	TAAAA	3	15	679196	679210	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022353	ATAAA	2	10	680019	680028	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022353	ATTTA	2	10	681605	681614	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022353	TTTAA	2	10	688934	688943	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022353	TAAAA	2	10	712005	712014	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022353	AAAAT	2	10	712075	712084	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022353	TTTTA	2	10	712163	712172	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022353	TTGTA	2	10	717344	717353	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022353	TTTAT	2	10	719622	719631	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022353	TAAAT	2	10	719890	719899	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022353	AATTA	2	10	719914	719923	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022353	TTTTA	2	10	720018	720027	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022353	GCAAA	2	10	720710	720719	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_022353	ATTTT	2	10	722419	722428	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022353	ATTAA	2	10	722663	722672	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022353	AATAA	2	10	728529	728538	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022353	ATTTA	2	10	731303	731312	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022353	TTTTC	2	10	761663	761672	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_022353	TAAAA	2	10	796402	796411	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022353	AGACA	2	10	807085	807094	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_022353	ATTTT	2	10	823335	823344	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022353	TTTTA	2	10	827326	827335	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022353	TTGCC	2	10	831179	831188	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
113	NC_022353	AGGTT	2	10	831982	831991	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022353	AAAAT	2	10	840048	840057	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022353	TTTCT	2	10	868987	868996	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_022353	AAAAT	2	10	870936	870945	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022353	ATTTT	2	10	876600	876609	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022353	AAAAT	2	10	908407	908416	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022353	TTAAT	2	10	920385	920394	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022353	ATAAA	2	10	922975	922984	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022353	AATTA	2	10	944970	944979	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022353	TAAAA	2	10	945013	945022	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022353	TAAAA	2	10	973609	973618	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022353	TTTAT	2	10	979434	979443	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022353	TTAAT	2	10	984533	984542	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022353	CTTTT	2	10	1027756	1027765	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_022353	AAAAT	2	10	1036884	1036893	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022353	TATAT	2	10	1063643	1063652	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022353	TTTTA	2	10	1069077	1069086	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022353	AGTTT	2	10	1126891	1126900	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022353	ATTTT	2	10	1131084	1131093	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022353	TATCA	2	10	1137047	1137056	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_022353	TAAAA	2	10	1139438	1139447	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022353	TTTTA	2	10	1144517	1144526	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022353	TTTAT	2	10	1166216	1166225	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022353	AAACT	2	10	1166245	1166254	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_022353	TTTAA	2	10	1166266	1166275	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022353	ATTTA	2	10	1170260	1170269	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022353	TATTT	2	10	1186240	1186249	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022353	TTTAT	2	10	1186288	1186297	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022353	AATTT	2	10	1188041	1188050	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022353	TTTCT	2	10	1193513	1193522	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_022353	TAGAT	2	10	1231078	1231087	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022353	ATTTT	2	10	1231124	1231133	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022353	GCTTT	2	10	1238723	1238732	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_022353	CTTTT	2	10	1238811	1238820	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_022353	TTATT	2	10	1239274	1239283	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_022353	TTTAA	2	10	1242276	1242285	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_022353	TATTT	2	10	1245284	1245293	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_022353	TATTT	2	10	1262169	1262178	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_022353	ATGTG	2	10	1269047	1269056	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
152	NC_022353	TTTAA	2	10	1269193	1269202	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_022353	AAAAT	2	10	1269214	1269223	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_022353	ATATT	2	10	1290211	1290220	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_022353	TAAAA	2	10	1294372	1294381	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_022353	TATAT	2	10	1298899	1298908	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_022353	TAAAG	2	10	1317490	1317499	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_022353	TAAAT	2	10	1369395	1369404	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_022353	AGAAA	2	10	1370857	1370866	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
164	NC_022353	ATGCA	2	10	1388735	1388744	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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166	NC_022353	ATTAA	2	10	1419749	1419758	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_022353	TAAAA	2	10	1440454	1440463	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_022353	AAATT	2	10	1453211	1453220	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_022353	ATAAA	2	10	1464610	1464619	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_022353	TTATT	2	10	1466364	1466373	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_022353	TAAAA	2	10	1468554	1468563	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_022353	TAAAA	2	10	1480844	1480853	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_022353	TAAAA	2	10	1485559	1485568	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_022353	ATACT	2	10	1502834	1502843	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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176	NC_022353	TAAAA	2	10	1538403	1538412	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_022353	TAAAA	2	10	1564466	1564475	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_022353	TATTT	2	10	1564618	1564627	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_022353	ATATA	2	10	1598836	1598845	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_022353	TAACT	2	10	1599079	1599088	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
184	NC_022353	TTGAA	2	10	1613951	1613960	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_022353	AAAAT	2	10	1618684	1618693	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_022353	AAAAC	2	10	1631204	1631213	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
188	NC_022353	ATTTT	2	10	1648069	1648078	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_022353	AAAAT	2	10	1653673	1653682	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
190	NC_022353	TAGTA	2	10	1655249	1655258	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
191	NC_022353	TCAAA	2	10	1655431	1655440	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
192	NC_022353	ATATT	2	10	1656430	1656439	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_022353	ATTAA	2	10	1659475	1659484	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.