MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2544 genome

Total Repeats: 18508

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022353	CAT	2	6	213	218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543948973
2	NC_022353	CAA	2	6	249	254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543948973
3	NC_022353	CTT	2	6	308	313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543948973
4	NC_022353	TGT	2	6	330	335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543948973
5	NC_022353	TCA	2	6	524	529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543948973
6	NC_022353	GAT	2	6	610	615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543948973
7	NC_022353	AAG	2	6	647	652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543948973
8	NC_022353	ATC	2	6	697	702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543948973
9	NC_022353	CAT	2	6	819	824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543948973
10	NC_022353	CTT	2	6	887	892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543948973
11	NC_022353	ATA	2	6	899	904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543948973
12	NC_022353	ATC	2	6	922	927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543948973
13	NC_022353	TGA	2	6	992	997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543948973
14	NC_022353	ATT	2	6	1187	1192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543948973
15	NC_022353	ATG	2	6	1256	1261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543948973
16	NC_022353	GAA	2	6	1282	1287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543948973
17	NC_022353	TGA	2	6	1593	1598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543948974
18	NC_022353	CTT	2	6	1606	1611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543948974
19	NC_022353	TTA	2	6	1715	1720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543948974
20	NC_022353	GAA	2	6	1735	1740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543948974
21	NC_022353	AAT	2	6	2035	2040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543948974
22	NC_022353	TAT	2	6	2073	2078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543948974
23	NC_022353	ATC	2	6	2323	2328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543948974
24	NC_022353	GAA	2	6	2395	2400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543948974
25	NC_022353	AGA	3	9	2451	2459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543948974
26	NC_022353	TAA	2	6	2548	2553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543948974
27	NC_022353	TCA	2	6	2683	2688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543948975
28	NC_022353	ACT	2	6	2765	2770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543948975
29	NC_022353	TGT	2	6	2851	2856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543948975
30	NC_022353	AAC	2	6	3067	3072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543948975
31	NC_022353	TGA	2	6	3088	3093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543948975
32	NC_022353	GAA	2	6	3305	3310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543948975
33	NC_022353	ATA	2	6	3378	3383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543948975
34	NC_022353	TGG	2	6	3397	3402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543948975
35	NC_022353	ATA	2	6	3486	3491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543948975
36	NC_022353	TGA	2	6	3502	3507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543948975
37	NC_022353	GAA	2	6	3650	3655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543948975
38	NC_022353	AGC	2	6	3715	3720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543948975
39	NC_022353	AGG	2	6	3850	3855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	543948975
40	NC_022353	ATC	3	9	4040	4048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543948975
41	NC_022353	TCT	2	6	4101	4106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543948975
42	NC_022353	ACC	2	6	4156	4161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543948975
43	NC_022353	ATT	2	6	4290	4295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543948975
44	NC_022353	GAA	2	6	4409	4414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543948975
45	NC_022353	AGA	2	6	4522	4527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543948975
46	NC_022353	GAA	2	6	4541	4546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543948975
47	NC_022353	GAA	2	6	4568	4573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543948975
48	NC_022353	CTA	2	6	4674	4679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543948975
49	NC_022353	AAG	2	6	4750	4755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543948975
50	NC_022353	TGA	2	6	4819	4824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543948975
51	NC_022353	TTC	2	6	4912	4917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543948976
52	NC_022353	TTC	3	9	4954	4962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543948976
53	NC_022353	ATA	2	6	4982	4987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543948976
54	NC_022353	GCT	2	6	5070	5075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543948976
55	NC_022353	CCT	2	6	5306	5311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	543948977
56	NC_022353	ATA	2	6	5380	5385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543948977
57	NC_022353	TTG	2	6	5391	5396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543948977
58	NC_022353	CAT	2	6	5703	5708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543948977
59	NC_022353	ACC	2	6	5767	5772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543948977
60	NC_022353	CTC	2	6	5874	5879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	543948977
61	NC_022353	TTC	2	6	5896	5901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543948977
62	NC_022353	ATA	2	6	5926	5931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543948977
63	NC_022353	CAT	2	6	5946	5951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543948977
64	NC_022353	TCT	2	6	6128	6133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543948977
65	NC_022353	TGG	2	6	6223	6228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543948977
66	NC_022353	ATT	2	6	6235	6240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543948977
67	NC_022353	CTG	2	6	6300	6305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543948977
68	NC_022353	GTT	2	6	6742	6747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543948978
69	NC_022353	TGA	2	6	6749	6754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543948978
70	NC_022353	TTG	2	6	6809	6814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543948978
71	NC_022353	TTG	2	6	7075	7080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543948978
72	NC_022353	TAA	2	6	7104	7109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543948978
73	NC_022353	TAC	2	6	7158	7163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543948978
74	NC_022353	AAT	2	6	7234	7239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543948978
75	NC_022353	ATG	2	6	7256	7261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543948978
76	NC_022353	GCT	2	6	7282	7287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543948978
77	NC_022353	AAG	2	6	7352	7357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543948978
78	NC_022353	TGA	2	6	7545	7550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543948978
79	NC_022353	ATG	2	6	7561	7566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543948978
80	NC_022353	TTG	2	6	7589	7594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543948978
81	NC_022353	AGT	2	6	7632	7637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543948978
82	NC_022353	ATC	2	6	7717	7722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543948978
83	NC_022353	CTT	2	6	7739	7744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543948978
84	NC_022353	TTA	2	6	7814	7819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543948978
85	NC_022353	AAC	2	6	7875	7880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543948978
86	NC_022353	ACT	2	6	7888	7893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543948978
87	NC_022353	ACA	2	6	7914	7919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543948978
88	NC_022353	ATT	2	6	7971	7976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543948978
89	NC_022353	GTA	2	6	7985	7990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543948978
90	NC_022353	AAT	2	6	8168	8173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543948979
91	NC_022353	CTT	2	6	8253	8258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543948979
92	NC_022353	TGA	2	6	8289	8294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543948979
93	NC_022353	GGT	2	6	8309	8314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543948979
94	NC_022353	GAA	2	6	8324	8329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543948979
95	NC_022353	AGA	2	6	8467	8472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543948979
96	NC_022353	TTC	2	6	8722	8727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543948979
97	NC_022353	CTT	2	6	8753	8758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543948979
98	NC_022353	ATA	2	6	9036	9041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543948979
99	NC_022353	AGA	2	6	9076	9081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543948979
100	NC_022353	ATG	3	9	9089	9097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543948979
101	NC_022353	CTG	2	6	9192	9197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543948979
102	NC_022353	TAT	2	6	9266	9271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543948979
103	NC_022353	GAT	2	6	9281	9286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543948979
104	NC_022353	TGA	2	6	9325	9330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543948979
105	NC_022353	AGA	2	6	9523	9528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543948979
106	NC_022353	ATG	2	6	9567	9572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543948979
107	NC_022353	GCT	2	6	9590	9595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543948979
108	NC_022353	AAG	2	6	9612	9617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543948979
109	NC_022353	AGC	2	6	9622	9627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543948979
110	NC_022353	ATT	2	6	9684	9689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543948979
111	NC_022353	AAC	2	6	9693	9698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543948979
112	NC_022353	TCC	2	6	9718	9723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	543948979
113	NC_022353	TTA	2	6	9788	9793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543948979
114	NC_022353	GAA	2	6	9851	9856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543948979
115	NC_022353	ATT	2	6	9915	9920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543948979
116	NC_022353	AGA	2	6	9967	9972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543948979
117	NC_022353	TAT	2	6	9994	9999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543948979
118	NC_022353	ATC	2	6	10074	10079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543948979
119	NC_022353	ATC	2	6	10115	10120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543948979
120	NC_022353	GTG	2	6	10125	10130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543948979
121	NC_022353	TCA	2	6	10144	10149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543948979
122	NC_022353	TTA	2	6	10182	10187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543948979
123	NC_022353	TCA	2	6	10272	10277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543948979
124	NC_022353	AGA	2	6	10438	10443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543948979
125	NC_022353	AGA	2	6	10540	10545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543948979
126	NC_022353	CAA	2	6	10594	10599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543948979
127	NC_022353	TAG	2	6	10632	10637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543948979
128	NC_022353	AAG	2	6	10773	10778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543948979
129	NC_022353	GGT	2	6	10838	10843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543948979
130	NC_022353	GAA	2	6	10850	10855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543948979
131	NC_022353	ACT	2	6	10935	10940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543948979
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133	NC_022353	CAT	2	6	11087	11092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543948979
134	NC_022353	TGC	2	6	11203	11208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543948979
135	NC_022353	ATG	2	6	11253	11258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543948979
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138	NC_022353	ATG	2	6	11486	11491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543948979
139	NC_022353	GAT	2	6	11573	11578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543948979
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145	NC_022353	GAA	2	6	12131	12136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543948979
146	NC_022353	ATC	2	6	12140	12145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543948979
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152	NC_022353	ATT	2	6	12897	12902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543948980
153	NC_022353	ACA	2	6	12946	12951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543948980
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161	NC_022353	TAG	2	6	13743	13748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543948980
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212	NC_022353	TCA	2	6	17883	17888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543948985
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240	NC_022353	TCT	2	6	20594	20599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543948987
241	NC_022353	TTC	3	9	20602	20610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543948987
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250	NC_022353	TGA	2	6	21583	21588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543948988
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252	NC_022353	ACT	2	6	21983	21988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543948989
253	NC_022353	TCT	2	6	21989	21994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543948989
254	NC_022353	CTT	2	6	22101	22106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543948989
255	NC_022353	TGT	2	6	22191	22196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543948989
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