MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2426 genome

Total Repeats: 985

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022352	TTTAGT	2	12	2047	2058	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	543947232
2	NC_022352	AAGCTA	2	12	3666	3677	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	543947233
3	NC_022352	AAGTGA	2	12	3811	3822	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	543947233
4	NC_022352	ATGCTA	2	12	9432	9443	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	543947237
5	NC_022352	ATTTAA	2	12	10236	10247	50 %	50 %	0 %	0 %	543947237
6	NC_022352	GAAAAT	2	12	13085	13096	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	543947238
7	NC_022352	TATTGC	2	12	13414	13425	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	543947238
8	NC_022352	AAATGA	2	12	14200	14211	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	543947238
9	NC_022352	GCTTTA	2	12	16567	16578	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	543947241
10	NC_022352	TTTTCA	2	12	17147	17158	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	543947242
11	NC_022352	ATGGGT	2	12	18925	18936	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	543947243
12	NC_022352	TTCATT	2	12	20077	20088	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	543947245
13	NC_022352	AAGAAA	2	12	21291	21302	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	543947246
14	NC_022352	AAGATA	2	12	22210	22221	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	543947247
15	NC_022352	GCAAAA	2	12	22994	23005	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	543947247
16	NC_022352	TATAAG	2	12	27931	27942	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	543947251
17	NC_022352	TTTTAT	2	12	28294	28305	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	543947251
18	NC_022352	TTATGC	2	12	29356	29367	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	543947252
19	NC_022352	GAACTT	2	12	29841	29852	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	543947253
20	NC_022352	CTTTAA	2	12	31603	31614	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	543947253
21	NC_022352	ATGTGT	2	12	32417	32428	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	543947254
22	NC_022352	ATGGAT	2	12	36284	36295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947257
23	NC_022352	GAAATT	2	12	36493	36504	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	543947257
24	NC_022352	AACAAA	2	12	39885	39896	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	543947259
25	NC_022352	TTTGAA	2	12	44831	44842	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	543947261
26	NC_022352	GAAAGA	2	12	45232	45243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543947261
27	NC_022352	TACACT	2	12	47371	47382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947262
28	NC_022352	ATGAAA	2	12	49120	49131	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	543947264
29	NC_022352	TAAACT	2	12	49652	49663	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	543947264
30	NC_022352	AGTTTT	2	12	51834	51845	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	543947266
31	NC_022352	TTCTTT	2	12	52050	52061	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	543947267
32	NC_022352	CGCCTT	2	12	52455	52466	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	543947267
33	NC_022352	CCAATG	2	12	55878	55889	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	543947269
34	NC_022352	CAAAAT	2	12	55994	56005	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	543947269
35	NC_022352	TTCATC	2	12	56928	56939	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	543947270
36	NC_022352	TAATTT	2	12	58722	58733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543947272
37	NC_022352	ATTTTA	2	12	58974	58985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543947272
38	NC_022352	AAATAT	2	12	59331	59342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543947272
39	NC_022352	GTTGGA	2	12	60271	60282	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	543947272
40	NC_022352	TACAGC	2	12	62450	62461	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	543947275
41	NC_022352	CTTTTA	2	12	62715	62726	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	543948916
42	NC_022352	GCTTTA	2	12	69180	69191	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	543947285
43	NC_022352	TTCATT	2	12	71537	71548	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	543947288
44	NC_022352	CATCTT	2	12	73283	73294	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	543947289
45	NC_022352	TTTAAA	2	12	75703	75714	50 %	50 %	0 %	0 %	543947291
46	NC_022352	CTAGCT	2	12	76135	76146	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	543947292
47	NC_022352	GAATGA	2	12	76389	76400	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	543947292
48	NC_022352	GATGCT	2	12	77551	77562	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	543947293
49	NC_022352	TAAATT	2	12	79265	79276	50 %	50 %	0 %	0 %	543947296
50	NC_022352	TTTTTG	2	12	86128	86139	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	543947303
51	NC_022352	GAATTT	2	12	86448	86459	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	543947304
52	NC_022352	AACTCA	2	12	86963	86974	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	543947304
53	NC_022352	ATTTAT	2	12	88524	88535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543947305
54	NC_022352	CTTTAA	2	12	88743	88754	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	543947305
55	NC_022352	ATATTT	2	12	89503	89514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543947307
56	NC_022352	GTAACT	2	12	91912	91923	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	543947309
57	NC_022352	CAGGAA	2	12	92618	92629	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	543947310
58	NC_022352	TTGTGT	2	12	93204	93215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543947310
59	NC_022352	ATAAAA	2	12	95029	95040	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	543947311
60	NC_022352	TTAATG	2	12	97246	97257	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	543947314
61	NC_022352	GCAAGC	2	12	97326	97337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543947314
62	NC_022352	AACTTA	2	12	100064	100075	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	543947318
63	NC_022352	GAACTT	2	12	102310	102321	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	543947320
64	NC_022352	TTAGAA	2	12	102361	102372	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	543947320
65	NC_022352	TGGCTG	2	12	103199	103210	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	543947322
66	NC_022352	AAAAAT	2	12	104664	104675	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	543947323
67	NC_022352	GGTTTG	2	12	110370	110381	0 %	50 %	50 %	0 %	543947330
68	NC_022352	AAAGAA	2	12	110649	110660	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	543947331
69	NC_022352	AAAATA	2	12	112181	112192	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	543947333
70	NC_022352	ATTTTG	2	12	113718	113729	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	543947335
71	NC_022352	GAAAAA	2	12	114625	114636	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	543947336
72	NC_022352	GTTGTG	2	12	115472	115483	0 %	50 %	50 %	0 %	543947337
73	NC_022352	GGACAT	2	12	115513	115524	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	543947337
74	NC_022352	TTTGAT	2	12	117098	117109	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	543947339
75	NC_022352	TTCTTT	2	12	126241	126252	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	543947351
76	NC_022352	GGGCTT	2	12	126920	126931	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	543947352
77	NC_022352	AAAGAT	2	12	129992	130003	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	543947354
78	NC_022352	TTGTTA	2	12	132080	132091	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	543947358
79	NC_022352	AAAGAA	2	12	132219	132230	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	543947358
80	NC_022352	GAAAAA	2	12	134935	134946	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	543947360
81	NC_022352	AGATGA	2	12	135216	135227	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	543947361
82	NC_022352	ACCTTT	2	12	138226	138237	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	543947362
83	NC_022352	CTATAC	2	12	138874	138885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947363
84	NC_022352	TAAGGA	2	12	141469	141480	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	543947366
85	NC_022352	TTTTAC	2	12	143484	143495	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	543947367
86	NC_022352	CTGCTC	2	12	145360	145371	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	543947370
87	NC_022352	ATTTTC	2	12	146282	146293	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	543947371
88	NC_022352	AAAACT	2	12	149321	149332	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	543947374
89	NC_022352	ATAAAA	2	12	149389	149400	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	543947374
90	NC_022352	TTTTGC	2	12	149945	149956	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	543947375
91	NC_022352	AGCTAT	2	12	151000	151011	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	543947377
92	NC_022352	GGCTAA	2	12	151399	151410	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	543947377
93	NC_022352	TCAAAT	2	12	153025	153036	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	543947380
94	NC_022352	AAATAA	2	12	155794	155805	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	543947385
95	NC_022352	ATTTTC	2	12	157866	157877	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	543947387
96	NC_022352	AGCTTT	2	12	158562	158573	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	543947388
97	NC_022352	GGCTGT	2	12	159204	159215	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	543947389
98	NC_022352	TATAAA	2	12	160614	160625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543947392
99	NC_022352	AAAAGC	2	12	162118	162129	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	543947393
100	NC_022352	AACAAG	2	12	162910	162921	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	543947394
101	NC_022352	TAAAAA	2	12	165831	165842	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	543947397
102	NC_022352	TGGAAA	2	12	165892	165903	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	543947397
103	NC_022352	TTAAAT	2	12	168659	168670	50 %	50 %	0 %	0 %	543947399
104	NC_022352	CTTTCT	2	12	168746	168757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543947399
105	NC_022352	ATTCTA	2	12	170747	170758	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	543947402
106	NC_022352	GCTATT	2	12	170974	170985	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	543947402
107	NC_022352	TTGCAG	2	12	172321	172332	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	543947403
108	NC_022352	TGACTT	2	12	175012	175023	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	543947407
109	NC_022352	AAAACC	2	12	176116	176127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543947409
110	NC_022352	CAAGGA	2	12	178486	178497	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	543947411
111	NC_022352	AATGAA	2	12	182889	182900	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	543947416
112	NC_022352	AAGTGC	2	12	184094	184105	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	543947416
113	NC_022352	CCTAAT	2	12	184113	184124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543947416
114	NC_022352	CTTACT	2	12	185713	185724	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	543947418
115	NC_022352	AATTAA	2	12	187091	187102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543947419
116	NC_022352	AAATTC	2	12	187805	187816	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	543947420
117	NC_022352	TTTTAG	2	12	196493	196504	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	543947426
118	NC_022352	AAAGAA	2	12	196632	196643	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	543947427
119	NC_022352	GTTTAT	2	12	199158	199169	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	543947431
120	NC_022352	TGAACT	2	12	202044	202055	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	543947437
121	NC_022352	TTTGAT	2	12	202840	202851	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	543947437
122	NC_022352	TAAAAT	2	12	204062	204073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543947439
123	NC_022352	GAAATA	2	12	206198	206209	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	543947442
124	NC_022352	TGATTT	2	12	206975	206986	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	543947443
125	NC_022352	TTCTTT	2	12	209004	209015	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	543947444
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127	NC_022352	TAGCTT	2	12	210255	210266	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	543947447
128	NC_022352	AATTTA	2	12	212645	212656	50 %	50 %	0 %	0 %	543947451
129	NC_022352	ATAAAG	2	12	217689	217700	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	543947455
130	NC_022352	TGGTTT	2	12	220320	220331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543947458
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142	NC_022352	GCTTAT	2	12	243086	243097	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	543947486
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147	NC_022352	TTCTGT	2	12	252484	252495	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	543947494
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158	NC_022352	TTTAAA	2	12	277820	277831	50 %	50 %	0 %	0 %	543947526
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219	NC_022352	TGCAAG	2	12	387297	387308	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	543947641
220	NC_022352	AACAAA	2	12	387468	387479	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	543947641
221	NC_022352	AGTAAA	2	12	387487	387498	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	543947641
222	NC_022352	GAAAAA	2	12	389296	389307	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	543947642
223	NC_022352	TGTTTT	2	12	389766	389777	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	543947642
224	NC_022352	GATGCA	2	12	395979	395990	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	543947650
225	NC_022352	TTTTGG	2	12	397351	397362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543947651
226	NC_022352	TAATTG	2	12	397711	397722	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	543947652
227	NC_022352	AGGCTT	2	12	398335	398346	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	543947652
228	NC_022352	TAAGGA	2	12	399458	399469	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	543947654
229	NC_022352	GATTTA	2	12	403872	403883	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	543947661
230	NC_022352	GTAAAA	2	12	406408	406419	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	543947663
231	NC_022352	AGTATA	2	12	412022	412033	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	543947670
232	NC_022352	ATTTTG	2	12	413942	413953	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	543947672
233	NC_022352	TAAAAT	2	12	417529	417540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543947675
234	NC_022352	GATTTT	2	12	417800	417811	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	543947676
235	NC_022352	TCCAAC	2	12	421157	421168	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	543947679
236	NC_022352	ATTAAA	2	12	422704	422715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543947682
237	NC_022352	TAAAAA	2	12	424596	424607	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	543947685
238	NC_022352	AGCTGA	2	12	424955	424966	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	543947686
239	NC_022352	CATTTT	2	12	427364	427375	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	543947687
240	NC_022352	TTTTTA	2	12	434165	434176	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	543947689
241	NC_022352	AATGAA	2	12	435996	436007	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	543947691
242	NC_022352	AGTTAG	2	12	437203	437214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543947693
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245	NC_022352	ATTTTT	2	12	438182	438193	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	543947693
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255	NC_022352	ATGAAA	2	12	447296	447307	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	543947703
256	NC_022352	TGATTT	2	12	447810	447821	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	543947705
257	NC_022352	TTTGAA	2	12	448621	448632	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	543947705
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265	NC_022352	TTAAAA	2	12	467712	467723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543947723
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272	NC_022352	ATTTAA	2	12	478438	478449	50 %	50 %	0 %	0 %	543947737
273	NC_022352	ATTTAA	2	12	479560	479571	50 %	50 %	0 %	0 %	543947737
274	NC_022352	TTAAAT	2	12	482638	482649	50 %	50 %	0 %	0 %	543947739
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338	NC_022352	GATTTT	2	12	566544	566555	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	543947829
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340	NC_022352	TTTGTG	2	12	572595	572606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543947834
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342	NC_022352	ATTTAA	2	12	577330	577341	50 %	50 %	0 %	0 %	543947838
343	NC_022352	GAAACA	2	12	577857	577868	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	543947838
344	NC_022352	TAGCTT	2	12	578389	578400	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	543947839
345	NC_022352	TTTAAA	2	12	578822	578833	50 %	50 %	0 %	0 %	543947839
346	NC_022352	GCTTTA	2	12	579736	579747	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	543947840
347	NC_022352	TATGAA	2	12	580105	580116	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	543947840
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349	NC_022352	CTTACT	2	12	582877	582888	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	543947845
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453	NC_022352	GCTAAA	2	12	756454	756465	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	543948027
454	NC_022352	CATTAA	2	12	758901	758912	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	543948028
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456	NC_022352	AATTTT	2	12	760839	760850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543948029
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458	NC_022352	GGCAAA	2	12	765914	765925	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	543948033
459	NC_022352	TTCAAG	2	12	767033	767044	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	543948035
460	NC_022352	ATTTTG	2	12	767699	767710	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	543948035
461	NC_022352	TTTATA	2	12	772104	772115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543948040
462	NC_022352	TTTATT	2	12	772169	772180	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	543948040
463	NC_022352	TGTTGA	2	12	772465	772476	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	543948040
464	NC_022352	ATCTTC	2	12	774087	774098	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	543948042
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466	NC_022352	AAAATA	2	12	777599	777610	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	543948045
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468	NC_022352	GATAAA	2	12	781688	781699	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	543948050
469	NC_022352	CATGAT	2	12	781763	781774	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	543948050
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