MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2426 genome

Total Repeats: 1645

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022352	CAAAG	2	10	94	103	60 %	0 %	20 %	20 %	543947231
2	NC_022352	AAAGA	2	10	1009	1018	80 %	0 %	20 %	0 %	543947231
3	NC_022352	TGAAA	2	10	1194	1203	60 %	20 %	20 %	0 %	543947231
4	NC_022352	AAAAT	2	10	1292	1301	80 %	20 %	0 %	0 %	543947231
5	NC_022352	GCTTT	2	10	3329	3338	0 %	60 %	20 %	20 %	543947233
6	NC_022352	GTTTT	2	10	4923	4932	0 %	80 %	20 %	0 %	543947234
7	NC_022352	TTTTA	2	10	6527	6536	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022352	TAAAA	2	10	6619	6628	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022352	GTTTT	2	10	7487	7496	0 %	80 %	20 %	0 %	543947236
10	NC_022352	ATTTT	2	10	8704	8713	20 %	80 %	0 %	0 %	543947237
11	NC_022352	AAGAG	2	10	9736	9745	60 %	0 %	40 %	0 %	543947237
12	NC_022352	TGCTT	2	10	10045	10054	0 %	60 %	20 %	20 %	543947237
13	NC_022352	ACTTC	2	10	10398	10407	20 %	40 %	0 %	40 %	543947237
14	NC_022352	TCAAA	2	10	10960	10969	60 %	20 %	0 %	20 %	543947237
15	NC_022352	TTTTA	2	10	13052	13061	20 %	80 %	0 %	0 %	543947238
16	NC_022352	AATTT	2	10	13236	13245	40 %	60 %	0 %	0 %	543947238
17	NC_022352	TAGAT	2	10	13264	13273	40 %	40 %	20 %	0 %	543947238
18	NC_022352	TATTT	2	10	13709	13718	20 %	80 %	0 %	0 %	543947238
19	NC_022352	CTTTA	2	10	14037	14046	20 %	60 %	0 %	20 %	543947238
20	NC_022352	GACAA	2	10	15321	15330	60 %	0 %	20 %	20 %	543947239
21	NC_022352	CTTAA	2	10	16750	16759	40 %	40 %	0 %	20 %	543947242
22	NC_022352	CATTT	2	10	17300	17309	20 %	60 %	0 %	20 %	543947242
23	NC_022352	GTATT	2	10	17431	17440	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022352	GCGAT	2	10	17570	17579	20 %	20 %	40 %	20 %	543947243
25	NC_022352	AAAAT	2	10	19799	19808	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022352	TTTCA	2	10	20266	20275	20 %	60 %	0 %	20 %	543947245
27	NC_022352	AAGAT	2	10	21819	21828	60 %	20 %	20 %	0 %	543947246
28	NC_022352	ACCAA	2	10	23482	23491	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_022352	AAAAT	2	10	23623	23632	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022352	GTTAA	2	10	23650	23659	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022352	GTTGA	2	10	24939	24948	20 %	40 %	40 %	0 %	543947248
32	NC_022352	TTTAT	2	10	27411	27420	20 %	80 %	0 %	0 %	543947251
33	NC_022352	TTCTT	2	10	28166	28175	0 %	80 %	0 %	20 %	543947251
34	NC_022352	TTTGG	2	10	28839	28848	0 %	60 %	40 %	0 %	543947252
35	NC_022352	AGATA	2	10	29924	29933	60 %	20 %	20 %	0 %	543947253
36	NC_022352	GCTTT	2	10	30438	30447	0 %	60 %	20 %	20 %	543947253
37	NC_022352	ATACT	2	10	31847	31856	40 %	40 %	0 %	20 %	543947253
38	NC_022352	AATCC	2	10	32298	32307	40 %	20 %	0 %	40 %	543947254
39	NC_022352	TGTTT	2	10	33285	33294	0 %	80 %	20 %	0 %	543947254
40	NC_022352	GCAAA	2	10	33352	33361	60 %	0 %	20 %	20 %	543947254
41	NC_022352	AAAGT	2	10	34254	34263	60 %	20 %	20 %	0 %	543947255
42	NC_022352	AAAAT	2	10	35506	35515	80 %	20 %	0 %	0 %	543947256
43	NC_022352	ATTAT	2	10	36251	36260	40 %	60 %	0 %	0 %	543947257
44	NC_022352	AAATC	2	10	36921	36930	60 %	20 %	0 %	20 %	543947257
45	NC_022352	TATAT	2	10	38743	38752	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022352	AAAAT	2	10	39415	39424	80 %	20 %	0 %	0 %	543947259
47	NC_022352	TTGAC	2	10	41140	41149	20 %	40 %	20 %	20 %	543947260
48	NC_022352	AAGAA	2	10	42044	42053	80 %	0 %	20 %	0 %	543947260
49	NC_022352	ATGTT	2	10	42142	42151	20 %	60 %	20 %	0 %	543947260
50	NC_022352	GAAAT	2	10	43546	43555	60 %	20 %	20 %	0 %	543947260
51	NC_022352	AAAAG	2	10	43880	43889	80 %	0 %	20 %	0 %	543947260
52	NC_022352	AAAAT	2	10	44224	44233	80 %	20 %	0 %	0 %	543947260
53	NC_022352	AAATT	2	10	46451	46460	60 %	40 %	0 %	0 %	543947261
54	NC_022352	AGCTT	2	10	46764	46773	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_022352	AGCAA	2	10	47914	47923	60 %	0 %	20 %	20 %	543947263
56	NC_022352	CAAAT	2	10	48813	48822	60 %	20 %	0 %	20 %	543947264
57	NC_022352	TACTC	2	10	51093	51102	20 %	40 %	0 %	40 %	543947265
58	NC_022352	GATAA	2	10	51491	51500	60 %	20 %	20 %	0 %	543947266
59	NC_022352	ACCGC	2	10	52409	52418	20 %	0 %	20 %	60 %	543947267
60	NC_022352	CTTTT	2	10	52575	52584	0 %	80 %	0 %	20 %	543947267
61	NC_022352	ACCGC	2	10	52601	52610	20 %	0 %	20 %	60 %	543947267
62	NC_022352	TTTCA	2	10	52822	52831	20 %	60 %	0 %	20 %	543947267
63	NC_022352	AAGAT	2	10	54214	54223	60 %	20 %	20 %	0 %	543947268
64	NC_022352	TAATG	2	10	54266	54275	40 %	40 %	20 %	0 %	543947268
65	NC_022352	GATAA	2	10	54593	54602	60 %	20 %	20 %	0 %	543947269
66	NC_022352	AAATT	2	10	55502	55511	60 %	40 %	0 %	0 %	543947269
67	NC_022352	TACTA	2	10	57358	57367	40 %	40 %	0 %	20 %	543947271
68	NC_022352	TGCTT	2	10	58152	58161	0 %	60 %	20 %	20 %	543947271
69	NC_022352	AATAT	2	10	58337	58346	60 %	40 %	0 %	0 %	543947271
70	NC_022352	CATTT	2	10	58936	58945	20 %	60 %	0 %	20 %	543947272
71	NC_022352	AATTT	2	10	58950	58959	40 %	60 %	0 %	0 %	543947272
72	NC_022352	ATTTC	2	10	59052	59061	20 %	60 %	0 %	20 %	543947272
73	NC_022352	TGATT	2	10	59103	59112	20 %	60 %	20 %	0 %	543947272
74	NC_022352	TTTTA	2	10	59170	59179	20 %	80 %	0 %	0 %	543947272
75	NC_022352	GATAA	2	10	60104	60113	60 %	20 %	20 %	0 %	543947272
76	NC_022352	TCAAA	2	10	60655	60664	60 %	20 %	0 %	20 %	543947273
77	NC_022352	TGTGT	2	10	61150	61159	0 %	60 %	40 %	0 %	543947273
78	NC_022352	AAAAT	2	10	61330	61339	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022352	ATTAC	2	10	61686	61695	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_022352	AAAAT	2	10	62378	62387	80 %	20 %	0 %	0 %	543947275
81	NC_022352	ATATT	2	10	64656	64665	40 %	60 %	0 %	0 %	543947278
82	NC_022352	TTTAT	2	10	65043	65052	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022352	CAAGA	2	10	67099	67108	60 %	0 %	20 %	20 %	543947281
84	NC_022352	GAGCA	2	10	67469	67478	40 %	0 %	40 %	20 %	543947282
85	NC_022352	ATCAA	2	10	67948	67957	60 %	20 %	0 %	20 %	543947283
86	NC_022352	CTCTT	2	10	70943	70952	0 %	60 %	0 %	40 %	543947287
87	NC_022352	TTTTC	2	10	70984	70993	0 %	80 %	0 %	20 %	543947287
88	NC_022352	TCTCT	2	10	71248	71257	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
89	NC_022352	ATCTC	2	10	71799	71808	20 %	40 %	0 %	40 %	543947288
90	NC_022352	GCCAA	2	10	71937	71946	40 %	0 %	20 %	40 %	543947288
91	NC_022352	TTTTG	2	10	73181	73190	0 %	80 %	20 %	0 %	543947289
92	NC_022352	AGTAA	2	10	73754	73763	60 %	20 %	20 %	0 %	543947290
93	NC_022352	TAAGG	2	10	77655	77664	40 %	20 %	40 %	0 %	543947293
94	NC_022352	ATTTT	2	10	77708	77717	20 %	80 %	0 %	0 %	543947293
95	NC_022352	TAGGA	2	10	77984	77993	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022352	AAAAT	2	10	78010	78019	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022352	ATTTT	2	10	78020	78029	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022352	TAAGA	2	10	78436	78445	60 %	20 %	20 %	0 %	543947294
99	NC_022352	TTAAT	2	10	78745	78754	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022352	TATTT	2	10	78813	78822	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022352	TATAA	2	10	78830	78839	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022352	TTTGC	2	10	79509	79518	0 %	60 %	20 %	20 %	543947296
103	NC_022352	TGGAC	2	10	79858	79867	20 %	20 %	40 %	20 %	543947297
104	NC_022352	TAAAA	2	10	82607	82616	80 %	20 %	0 %	0 %	543947299
105	NC_022352	CAAAA	2	10	83140	83149	80 %	0 %	0 %	20 %	543947299
106	NC_022352	TAAAA	2	10	83579	83588	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022352	TAAAA	2	10	85850	85859	80 %	20 %	0 %	0 %	543947302
108	NC_022352	GAAAT	2	10	86722	86731	60 %	20 %	20 %	0 %	543947304
109	NC_022352	TGGTT	2	10	86906	86915	0 %	60 %	40 %	0 %	543947304
110	NC_022352	TCCAT	2	10	87519	87528	20 %	40 %	0 %	40 %	543947304
111	NC_022352	TATTT	2	10	88066	88075	20 %	80 %	0 %	0 %	543947305
112	NC_022352	TTTTA	2	10	88078	88087	20 %	80 %	0 %	0 %	543947305
113	NC_022352	TATTT	2	10	88426	88435	20 %	80 %	0 %	0 %	543947305
114	NC_022352	TTGGC	2	10	88940	88949	0 %	40 %	40 %	20 %	543947306
115	NC_022352	AAGAT	2	10	89027	89036	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022352	GTAAA	2	10	89676	89685	60 %	20 %	20 %	0 %	543947307
117	NC_022352	AGAAT	2	10	90206	90215	60 %	20 %	20 %	0 %	543947308
118	NC_022352	AAGAA	2	10	90888	90897	80 %	0 %	20 %	0 %	543947309
119	NC_022352	CCTTG	2	10	91329	91338	0 %	40 %	20 %	40 %	543947309
120	NC_022352	AGGTA	2	10	91845	91854	40 %	20 %	40 %	0 %	543947309
121	NC_022352	GTGCA	2	10	93503	93512	20 %	20 %	40 %	20 %	543947310
122	NC_022352	ACCTT	2	10	94614	94623	20 %	40 %	0 %	40 %	543947311
123	NC_022352	TATTT	2	10	95129	95138	20 %	80 %	0 %	0 %	543947312
124	NC_022352	TCAAA	2	10	95187	95196	60 %	20 %	0 %	20 %	543947312
125	NC_022352	TTAGA	2	10	95458	95467	40 %	40 %	20 %	0 %	543947312
126	NC_022352	GCTTT	2	10	95549	95558	0 %	60 %	20 %	20 %	543947313
127	NC_022352	GTTTA	2	10	96066	96075	20 %	60 %	20 %	0 %	543947313
128	NC_022352	TAAAA	2	10	96131	96140	80 %	20 %	0 %	0 %	543947313
129	NC_022352	AAATG	2	10	96317	96326	60 %	20 %	20 %	0 %	543947314
130	NC_022352	AGGCA	2	10	96953	96962	40 %	0 %	40 %	20 %	543947314
131	NC_022352	TAAAA	2	10	97316	97325	80 %	20 %	0 %	0 %	543947314
132	NC_022352	AAATT	2	10	98311	98320	60 %	40 %	0 %	0 %	543947315
133	NC_022352	AAAGC	2	10	99006	99015	60 %	0 %	20 %	20 %	543947316
134	NC_022352	AAGAA	2	10	100380	100389	80 %	0 %	20 %	0 %	543947318
135	NC_022352	ACTCA	2	10	102516	102525	40 %	20 %	0 %	40 %	543947321
136	NC_022352	TTTTG	2	10	105854	105863	0 %	80 %	20 %	0 %	543947326
137	NC_022352	ATTTC	2	10	107973	107982	20 %	60 %	0 %	20 %	543947328
138	NC_022352	CAAGA	2	10	108628	108637	60 %	0 %	20 %	20 %	543947328
139	NC_022352	AATGA	2	10	109297	109306	60 %	20 %	20 %	0 %	543947329
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258	NC_022352	ATATT	2	10	237373	237382	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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400	NC_022352	AGTGT	2	10	386833	386842	20 %	40 %	40 %	0 %	543947640
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