MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2426 genome

Total Repeats: 170

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022352	TTTTA	2	10	6527	6536	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022352	TAAAA	2	10	6619	6628	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022352	GTATT	2	10	17431	17440	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022352	AAAAT	2	10	19799	19808	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022352	ACCAA	2	10	23482	23491	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_022352	AAAAT	2	10	23623	23632	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022352	GTTAA	2	10	23650	23659	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022352	TATAT	2	10	38743	38752	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022352	AGCTT	2	10	46764	46773	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_022352	AAAAT	2	10	61330	61339	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022352	ATTAC	2	10	61686	61695	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_022352	TTTAT	2	10	65043	65052	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022352	TCTCT	2	10	71248	71257	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_022352	TAGGA	2	10	77984	77993	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022352	AAAAT	2	10	78010	78019	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022352	ATTTT	2	10	78020	78029	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022352	TTAAT	2	10	78745	78754	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022352	TATTT	2	10	78813	78822	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022352	TATAA	2	10	78830	78839	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022352	TAAAA	2	10	83579	83588	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022352	AAGAT	2	10	89027	89036	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022352	TTAAT	2	10	140886	140895	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022352	TATTT	2	10	144621	144630	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022352	TTATT	2	10	158832	158841	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022352	TATTT	2	10	171855	171864	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022352	TAAAA	2	10	182047	182056	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022352	AAAAT	2	10	186215	186224	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022352	AAGTG	2	10	189095	189104	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022352	AGGAT	2	10	190277	190286	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022352	TAAAA	2	10	191635	191644	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022352	TAGAT	2	10	201318	201327	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022352	AAAAT	2	10	216765	216774	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022352	AAATT	2	10	218602	218611	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022352	TTTTA	2	10	218648	218657	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022352	TAAAT	2	10	221515	221524	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022352	CATAA	2	10	227095	227104	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_022352	ATTCA	2	10	231825	231834	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_022352	CTATT	2	10	232878	232887	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_022352	ATATT	2	10	237373	237382	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022352	ATTAA	2	10	240650	240659	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022352	TTAAT	2	10	242566	242575	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022352	ATAAA	2	10	260926	260935	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022352	AATTT	2	10	268879	268888	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022352	TTAAA	3	15	293827	293841	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022352	GAGTA	2	10	300475	300484	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022352	TTTTA	2	10	312750	312759	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022352	ATTAA	2	10	328824	328833	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022352	ATTAA	2	10	331317	331326	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022352	CTTAT	2	10	391311	391320	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_022352	TAAAT	2	10	417143	417152	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022352	TTGCT	2	10	420505	420514	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_022352	TTTAT	2	10	443264	443273	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022352	GATTT	2	10	443787	443796	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022352	TTTTA	2	10	471858	471867	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022352	TTTAA	2	10	472740	472749	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022352	AAATA	2	10	472796	472805	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022352	AAAAT	2	10	496296	496305	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022352	GTTTT	2	10	499392	499401	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022352	AAATA	2	10	499701	499710	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022352	CATTC	2	10	500418	500427	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_022352	TTTTA	2	10	508708	508717	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022352	AAAAT	2	10	508742	508751	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022352	AATTA	2	10	511202	511211	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022352	TTTGA	2	10	526365	526374	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022352	ATTTG	2	10	527526	527535	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022352	TAAAA	2	10	541388	541397	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022352	TTTAA	2	10	573930	573939	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022352	GAAAA	2	10	581522	581531	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022352	TTTGC	2	10	585043	585052	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_022352	AATTA	2	10	601084	601093	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022352	TTTAA	2	10	610068	610077	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022352	CTTTG	2	10	611726	611735	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_022352	ATTTT	2	10	611993	612002	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022352	ATTTA	2	10	624449	624458	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022352	TAAAA	3	15	640592	640606	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022352	ATAAA	2	10	641415	641424	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022352	ATTTA	2	10	643001	643010	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022352	TTTAA	2	10	650330	650339	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022352	TAAAA	2	10	673400	673409	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022352	AAAAT	2	10	673470	673479	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022352	TTTTA	2	10	673558	673567	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022352	TTGTA	2	10	678739	678748	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022352	TTTAT	2	10	681093	681102	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022352	TAAAT	2	10	681361	681370	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022352	AATTA	2	10	681385	681394	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022352	TTTTA	2	10	681489	681498	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022352	GCAAA	2	10	682181	682190	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_022352	ATTTT	2	10	683890	683899	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022352	ATTAA	2	10	684134	684143	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022352	AATAA	2	10	690000	690009	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022352	ATTTA	2	10	692774	692783	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022352	TTTTC	2	10	723134	723143	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_022352	TAAAA	2	10	757873	757882	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022352	AGACA	2	10	768556	768565	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_022352	ATTTT	2	10	784806	784815	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022352	TTTTA	2	10	788797	788806	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022352	TTGCC	2	10	792650	792659	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
98	NC_022352	AGGTT	2	10	793453	793462	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022352	AAAAT	2	10	801519	801528	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022352	AAAAT	2	10	832406	832415	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022352	ATTTT	2	10	838070	838079	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022352	AAAAT	2	10	869956	869965	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022352	TTAAT	2	10	881934	881943	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022352	ATAAA	2	10	884524	884533	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022352	AATTA	2	10	906520	906529	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022352	TAAAA	2	10	906563	906572	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022352	TAAAA	2	10	935159	935168	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022352	TTTAT	2	10	940984	940993	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022352	TTAAT	2	10	946083	946092	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022352	AAAAT	2	10	998435	998444	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022352	TATAT	2	10	1025194	1025203	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022352	TTTTA	2	10	1030628	1030637	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022352	AGTTT	2	10	1088191	1088200	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022352	ATTTT	2	10	1092384	1092393	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022352	TATCA	2	10	1098347	1098356	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_022352	TAAAA	2	10	1100754	1100763	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022352	TTTTA	2	10	1105833	1105842	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022352	TTTAT	2	10	1127532	1127541	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022352	AAACT	2	10	1127561	1127570	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_022352	TTTAA	2	10	1127582	1127591	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022352	ATTTA	2	10	1131576	1131585	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022352	TATTT	2	10	1147556	1147565	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022352	TTTAT	2	10	1147604	1147613	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022352	AATTT	2	10	1149357	1149366	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022352	TTTCT	2	10	1154829	1154838	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_022352	TAGAT	2	10	1192394	1192403	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022352	ATTTT	2	10	1192440	1192449	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022352	TTATT	2	10	1200590	1200599	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022352	TTTAA	2	10	1203592	1203601	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022352	TATTT	2	10	1206600	1206609	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022352	TATTT	2	10	1223485	1223494	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022352	ATGTG	2	10	1230364	1230373	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022352	TTTAA	2	10	1230510	1230519	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022352	AAAAT	2	10	1230531	1230540	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022352	ATATT	2	10	1250587	1250596	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022352	TAAAA	2	10	1254747	1254756	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022352	ATTTT	2	10	1259249	1259258	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022352	TATAT	2	10	1259274	1259283	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022352	TAAAG	2	10	1275297	1275306	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022352	ACAAA	2	10	1275952	1275961	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_022352	AAAGA	2	10	1276009	1276018	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022352	TAATA	2	10	1312625	1312634	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022352	TAAAT	2	10	1327200	1327209	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022352	AGAAA	2	10	1328662	1328671	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022352	TTTAA	2	10	1366978	1366987	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022352	ATTAA	2	10	1372937	1372946	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022352	TAAAA	2	10	1393642	1393651	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_022352	ATAAA	2	10	1417798	1417807	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_022352	TTATT	2	10	1419552	1419561	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_022352	TAAAA	2	10	1421742	1421751	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_022352	TAAAA	2	10	1438549	1438558	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_022352	ATACT	2	10	1455824	1455833	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
153	NC_022352	AAATT	2	10	1486657	1486666	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_022352	TAAAA	2	10	1491389	1491398	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_022352	TAAAA	2	10	1517452	1517461	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_022352	TATTT	2	10	1517604	1517613	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_022352	AAATT	2	10	1525631	1525640	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_022352	ACTTT	2	10	1526752	1526761	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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162	NC_022352	TAAAT	2	10	1567003	1567012	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_022352	AAAAT	2	10	1571670	1571679	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_022352	AAAAC	2	10	1583193	1583202	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
165	NC_022352	ATTTT	2	10	1600058	1600067	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_022352	AAAAT	2	10	1605662	1605671	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_022352	TAGTA	2	10	1607238	1607247	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_022352	ATATT	2	10	1608419	1608428	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_022352	ATTAA	2	10	1611464	1611473	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.