MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2538 genome

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022351	TAAAAT	2	12	1455	1466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022351	AATTTA	2	12	21111	21122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022351	TTTTCT	2	12	23500	23511	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_022351	GTTTTT	2	12	60413	60424	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022351	TAAAAT	2	12	90845	90856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022351	ATTAAA	2	12	135104	135115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022351	AAATAA	2	12	140861	140872	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022351	ATTTTT	2	12	158267	158278	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022351	ATATTA	2	12	165302	165313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022351	AATATT	2	12	165444	165455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022351	AAAATT	2	12	201523	201534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022351	TTTGAA	2	12	201698	201709	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022351	TATTTT	2	12	201798	201809	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022351	TTAATT	2	12	216677	216688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022351	TATATT	2	12	217250	217261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022351	AAAAAT	2	12	218660	218671	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022351	AATAAC	2	12	232069	232080	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_022351	AAAATT	2	12	260973	260984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022351	CTTAAA	2	12	265321	265332	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_022351	ATTTAT	2	12	345708	345719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022351	TATTTT	2	12	394741	394752	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022351	TGTGTT	2	12	402172	402183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022351	TATTTA	2	12	426601	426612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022351	TTTATT	2	12	429236	429247	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022351	TTTTAT	2	12	477935	477946	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022351	AATTTA	2	12	507155	507166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022351	AAAATA	2	12	523513	523524	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022351	TTTTAA	2	12	552099	552110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022351	CCTTAT	2	12	556748	556759	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_022351	ATATTT	2	12	607735	607746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022351	ATATAA	2	12	617309	617320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022351	TAATAG	2	12	645593	645604	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022351	ATTTAA	2	12	654536	654547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022351	TTTATT	2	12	664679	664690	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022351	TAAATT	2	12	664748	664759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022351	ATTTTT	2	12	670927	670938	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022351	ATAATT	2	12	698403	698414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022351	TTAAAT	2	12	717983	717994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022351	TCTTAT	2	12	725273	725284	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_022351	GGGTTG	2	12	725630	725641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022351	GTTTGG	2	12	725812	725823	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022351	AATTAA	2	12	727117	727128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022351	TCAAAA	2	12	727149	727160	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_022351	TTAGCT	2	12	727598	727609	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_022351	CTTCTA	2	12	727616	727627	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_022351	AAATTT	2	12	792049	792060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022351	AAGCAA	2	12	802018	802029	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_022351	ATATTT	2	12	829332	829343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022351	AAATTA	2	12	833125	833136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022351	ACAAAG	2	12	845955	845966	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_022351	TTTTTA	2	12	848432	848443	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022351	AATAAA	2	12	894828	894839	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022351	TTTTAT	2	12	923190	923201	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022351	ATCTTA	2	12	923983	923994	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_022351	ATCTTA	2	12	929197	929208	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_022351	TATAAA	2	12	929454	929465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022351	ATCTTA	2	12	929480	929491	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_022351	ATTTTA	2	12	1053841	1053852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022351	TTAATT	2	12	1151853	1151864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022351	TTAATT	2	12	1179840	1179851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022351	AATTTT	2	12	1215299	1215310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022351	TTTATT	2	12	1244063	1244074	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022351	AATTTA	2	12	1244093	1244104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022351	GAAAAA	2	12	1248674	1248685	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022351	TTTGTA	2	12	1250545	1250556	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022351	TATAAT	2	12	1251155	1251166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022351	GCAAGG	2	12	1267183	1267194	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_022351	ATAAAA	2	12	1274232	1274243	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022351	CTTTAT	2	12	1299558	1299569	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_022351	CAAAAA	2	12	1348525	1348536	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_022351	TTAATT	2	12	1358576	1358587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022351	TATAAT	2	12	1487062	1487073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022351	TAGCTT	2	12	1517654	1517665	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_022351	ATAAAA	2	12	1519140	1519151	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022351	TAAAAA	2	12	1550785	1550796	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022351	GCAAAA	2	12	1583984	1583995	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_022351	ATTTTT	2	12	1608968	1608979	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022351	TAAAAA	2	12	1649645	1649656	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022351	GCAGGC	2	12	1657299	1657310	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_022351	TAAAAT	2	12	1661185	1661196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022351	AAGCCT	2	12	1661289	1661300	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.