MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2538 genome

Total Repeats: 1014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022351	TTTAGT	2	12	2047	2058	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	543945416
2	NC_022351	AAGCTA	2	12	3666	3677	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	543945417
3	NC_022351	AAGTGA	2	12	3811	3822	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	543945417
4	NC_022351	ATGCTA	2	12	9432	9443	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	543945421
5	NC_022351	ATTTAA	2	12	10236	10247	50 %	50 %	0 %	0 %	543945421
6	NC_022351	GAAAAT	2	12	13085	13096	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	543945422
7	NC_022351	TATTGC	2	12	13414	13425	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	543945422
8	NC_022351	AAATGA	2	12	14200	14211	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	543945422
9	NC_022351	GCTTTA	2	12	16567	16578	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	543945425
10	NC_022351	TTTTCA	2	12	17147	17158	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	543945426
11	NC_022351	ATGGGT	2	12	18925	18936	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	543945427
12	NC_022351	TTCATT	2	12	20077	20088	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	543945429
13	NC_022351	AAGAAA	2	12	21291	21302	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	543945430
14	NC_022351	AAGATA	2	12	22210	22221	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	543945431
15	NC_022351	GCAAAA	2	12	22994	23005	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	543945431
16	NC_022351	TATAAG	2	12	27931	27942	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	543945435
17	NC_022351	TTTTAT	2	12	28294	28305	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	543945435
18	NC_022351	TTATGC	2	12	29356	29367	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	543945436
19	NC_022351	GAACTT	2	12	29841	29852	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	543945437
20	NC_022351	CTTTAA	2	12	31603	31614	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	543945437
21	NC_022351	ATGTGT	2	12	32417	32428	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	543945438
22	NC_022351	ATGGAT	2	12	36284	36295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543945441
23	NC_022351	GAAATT	2	12	36493	36504	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	543945441
24	NC_022351	AACAAA	2	12	39882	39893	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	543945443
25	NC_022351	TTTGAA	2	12	44828	44839	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	543945445
26	NC_022351	GAAAGA	2	12	45229	45240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543945445
27	NC_022351	TACACT	2	12	47368	47379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945446
28	NC_022351	ATGAAA	2	12	49117	49128	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	543945448
29	NC_022351	TAAACT	2	12	49649	49660	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	543945448
30	NC_022351	AGTTTT	2	12	51831	51842	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	543945450
31	NC_022351	TTCTTT	2	12	52047	52058	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	543945451
32	NC_022351	CGCCTT	2	12	52452	52463	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	543945451
33	NC_022351	CCAATG	2	12	55875	55886	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	543945453
34	NC_022351	CAAAAT	2	12	55991	56002	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	543945453
35	NC_022351	TTCATC	2	12	56925	56936	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	543945454
36	NC_022351	TAATTT	2	12	58719	58730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945456
37	NC_022351	ATTTTA	2	12	58971	58982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945456
38	NC_022351	AAATAT	2	12	59328	59339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945456
39	NC_022351	GTTGGA	2	12	60268	60279	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	543945456
40	NC_022351	TACAGC	2	12	62447	62458	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	543945459
41	NC_022351	CTTTTA	2	12	62712	62723	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	543947126
42	NC_022351	GCTTTA	2	12	69177	69188	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	543945469
43	NC_022351	TTCATT	2	12	71534	71545	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	543945472
44	NC_022351	CATCTT	2	12	73280	73291	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	543945473
45	NC_022351	TTTAAA	2	12	75700	75711	50 %	50 %	0 %	0 %	543945475
46	NC_022351	CTAGCT	2	12	76132	76143	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	543945476
47	NC_022351	GAATGA	2	12	76386	76397	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	543945476
48	NC_022351	GATGCT	2	12	77548	77559	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	543945477
49	NC_022351	TAAATT	2	12	79262	79273	50 %	50 %	0 %	0 %	543945480
50	NC_022351	TTTTTG	2	12	86125	86136	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	543945487
51	NC_022351	GAATTT	2	12	86445	86456	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	543945488
52	NC_022351	AACTCA	2	12	86960	86971	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	543945488
53	NC_022351	ATTTAT	2	12	88521	88532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945489
54	NC_022351	CTTTAA	2	12	88740	88751	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	543945489
55	NC_022351	ATATTT	2	12	89500	89511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543945490
56	NC_022351	GTAACT	2	12	91909	91920	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	543945492
57	NC_022351	CAGGAA	2	12	92615	92626	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	543945493
58	NC_022351	TTGTGT	2	12	93201	93212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543945493
59	NC_022351	ATAAAA	2	12	95026	95037	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	543945494
60	NC_022351	TTAATG	2	12	97243	97254	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	543945497
61	NC_022351	GCAAGC	2	12	97323	97334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543945497
62	NC_022351	AACTTA	2	12	100061	100072	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	543945501
63	NC_022351	GAACTT	2	12	102307	102318	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	543945503
64	NC_022351	TTAGAA	2	12	102358	102369	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	543945503
65	NC_022351	TGGCTG	2	12	103196	103207	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	543945505
66	NC_022351	AAAAAT	2	12	104661	104672	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	543945506
67	NC_022351	GGTTTG	2	12	110367	110378	0 %	50 %	50 %	0 %	543945513
68	NC_022351	AAAGAA	2	12	110646	110657	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	543945514
69	NC_022351	AAAATA	2	12	112178	112189	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	543945516
70	NC_022351	ATTTTG	2	12	113715	113726	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	543945518
71	NC_022351	GAAAAA	2	12	114622	114633	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	543945519
72	NC_022351	GTTGTG	2	12	115469	115480	0 %	50 %	50 %	0 %	543945520
73	NC_022351	GGACAT	2	12	115510	115521	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	543945520
74	NC_022351	TTTGAT	2	12	117095	117106	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	543945522
75	NC_022351	TTCTTT	2	12	126238	126249	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	543945534
76	NC_022351	GGGCTT	2	12	126917	126928	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	543945535
77	NC_022351	AAAGAT	2	12	129989	130000	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	543945537
78	NC_022351	TTGTTA	2	12	132077	132088	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	543945540
79	NC_022351	AAAGAA	2	12	132216	132227	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	543945540
80	NC_022351	GAAAAA	2	12	134932	134943	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	543945542
81	NC_022351	AGATGA	2	12	135213	135224	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	543945543
82	NC_022351	ACCTTT	2	12	138223	138234	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	543945544
83	NC_022351	CTATAC	2	12	138871	138882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945545
84	NC_022351	TAAGGA	2	12	141470	141481	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	543945548
85	NC_022351	TTTTAC	2	12	143485	143496	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	543945549
86	NC_022351	CTGCTC	2	12	145361	145372	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	543945552
87	NC_022351	ATTTTC	2	12	146283	146294	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	543945553
88	NC_022351	AAAACT	2	12	149322	149333	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	543945556
89	NC_022351	ATAAAA	2	12	149390	149401	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	543945556
90	NC_022351	TTTTGC	2	12	149946	149957	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	543945557
91	NC_022351	AGCTAT	2	12	151001	151012	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	543945559
92	NC_022351	GGCTAA	2	12	151400	151411	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	543945559
93	NC_022351	TCAAAT	2	12	153026	153037	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	543945561
94	NC_022351	AAATAA	2	12	155795	155806	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	543945566
95	NC_022351	ATTTTC	2	12	157867	157878	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	543945568
96	NC_022351	AGCTTT	2	12	158563	158574	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	543945569
97	NC_022351	GGCTGT	2	12	159205	159216	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	543945570
98	NC_022351	TATAAA	2	12	160613	160624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945572
99	NC_022351	AAAAGC	2	12	162117	162128	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	543945573
100	NC_022351	AACAAG	2	12	162909	162920	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	543945574
101	NC_022351	TAAAAA	2	12	165830	165841	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	543945576
102	NC_022351	TGGAAA	2	12	165891	165902	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	543945576
103	NC_022351	TTAAAT	2	12	168658	168669	50 %	50 %	0 %	0 %	543945578
104	NC_022351	CTTTCT	2	12	168745	168756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543945578
105	NC_022351	ATTCTA	2	12	170746	170757	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	543945581
106	NC_022351	GCTATT	2	12	170973	170984	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	543945581
107	NC_022351	TTGCAG	2	12	172320	172331	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	543945582
108	NC_022351	TGACTT	2	12	175009	175020	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	543945585
109	NC_022351	AAAACC	2	12	176113	176124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543945587
110	NC_022351	CAAGGA	2	12	178483	178494	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	543945589
111	NC_022351	AATGAA	2	12	182886	182897	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	543945594
112	NC_022351	AAGTGC	2	12	184091	184102	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	543945594
113	NC_022351	CCTAAT	2	12	184110	184121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543945594
114	NC_022351	CTTACT	2	12	185710	185721	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	543945596
115	NC_022351	AATTAA	2	12	187088	187099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945597
116	NC_022351	AAATTC	2	12	187802	187813	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	543945598
117	NC_022351	TTTTAG	2	12	196490	196501	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	543945605
118	NC_022351	AAAGAA	2	12	196629	196640	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	543945606
119	NC_022351	GTTTAT	2	12	199155	199166	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	543945610
120	NC_022351	TGAACT	2	12	202041	202052	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	543945617
121	NC_022351	TTTGAT	2	12	202837	202848	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	543945617
122	NC_022351	TAAAAT	2	12	204059	204070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543945619
123	NC_022351	GAAATA	2	12	206195	206206	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	543945622
124	NC_022351	TGATTT	2	12	206972	206983	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	543945623
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220	NC_022351	ATGTTT	2	12	383948	383959	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	543945832
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222	NC_022351	GCTAAA	2	12	387042	387053	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	543945834
223	NC_022351	ATTGAT	2	12	387699	387710	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	543945834
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225	NC_022351	CATTGA	2	12	392749	392760	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	543945838
226	NC_022351	CAAATT	2	12	393337	393348	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	543945839
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228	NC_022351	ATTTAA	2	12	398562	398573	50 %	50 %	0 %	0 %	543945845
229	NC_022351	AAAGAA	2	12	398860	398871	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	543945845
230	NC_022351	TTTAAA	2	12	399134	399145	50 %	50 %	0 %	0 %	543945846
231	NC_022351	TATGCC	2	12	406151	406162	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	543945853
232	NC_022351	AAATGA	2	12	409299	409310	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	543945855
233	NC_022351	TTTATT	2	12	410654	410665	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	543945856
234	NC_022351	GAAAAA	2	12	411015	411026	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	543945856
235	NC_022351	CAAACT	2	12	411651	411662	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	543945857
236	NC_022351	AAGGAG	2	12	411715	411726	50 %	0 %	50 %	0 %	543945857
237	NC_022351	ATTTTC	2	12	416402	416413	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	543945862
238	NC_022351	AAAAGA	2	12	419422	419433	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	543945866
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342	NC_022351	AAGCTC	2	12	594781	594792	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	543946040
343	NC_022351	ATGAAG	2	12	595044	595055	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	543946040
344	NC_022351	AAGTGG	2	12	595218	595229	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	543946041
345	NC_022351	AGTTCT	2	12	598991	599002	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	543946043
346	NC_022351	AAGATT	2	12	599263	599274	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	543946043
347	NC_022351	AAAGCA	2	12	601224	601235	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	543946045
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349	NC_022351	GCTCCA	2	12	602391	602402	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	543946046
350	NC_022351	TTAGCA	2	12	603065	603076	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	543946047
351	NC_022351	AACGGT	2	12	604444	604455	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	543946048
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462	NC_022351	TTGTAA	2	12	781628	781639	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	543946226
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464	NC_022351	ATTTTA	2	12	785921	785932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543946232
465	NC_022351	GTTAAA	2	12	786214	786225	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	543946232
466	NC_022351	GTTTTG	2	12	786493	786504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543946233
467	NC_022351	AAAATC	2	12	787140	787151	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	543946233
468	NC_022351	ATATAG	2	12	789044	789055	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	543946235
469	NC_022351	TGCACC	2	12	790968	790979	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	543946238
470	NC_022351	AAAAGA	2	12	792757	792768	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	543946240
471	NC_022351	AGATGA	2	12	792793	792804	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	543946240
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491	NC_022351	CATGAT	2	12	826271	826282	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	543946273
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498	NC_022351	TTTGGT	2	12	834454	834465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543946281
499	NC_022351	ATTTAA	3	18	839792	839809	50 %	50 %	0 %	0 %	543946290
500	NC_022351	TCTTAT	2	12	840883	840894	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	543946291

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