MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 00-2538 genome

Total Repeats: 1701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022351	CAAAG	2	10	94	103	60 %	0 %	20 %	20 %	543945415
2	NC_022351	AAAGA	2	10	1009	1018	80 %	0 %	20 %	0 %	543945415
3	NC_022351	TGAAA	2	10	1194	1203	60 %	20 %	20 %	0 %	543945415
4	NC_022351	AAAAT	2	10	1292	1301	80 %	20 %	0 %	0 %	543945415
5	NC_022351	GCTTT	2	10	3329	3338	0 %	60 %	20 %	20 %	543945417
6	NC_022351	GTTTT	2	10	4923	4932	0 %	80 %	20 %	0 %	543945418
7	NC_022351	TTTTA	2	10	6527	6536	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022351	TAAAA	2	10	6619	6628	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022351	GTTTT	2	10	7487	7496	0 %	80 %	20 %	0 %	543945420
10	NC_022351	ATTTT	2	10	8704	8713	20 %	80 %	0 %	0 %	543945421
11	NC_022351	AAGAG	2	10	9736	9745	60 %	0 %	40 %	0 %	543945421
12	NC_022351	TGCTT	2	10	10045	10054	0 %	60 %	20 %	20 %	543945421
13	NC_022351	ACTTC	2	10	10398	10407	20 %	40 %	0 %	40 %	543945421
14	NC_022351	TCAAA	2	10	10960	10969	60 %	20 %	0 %	20 %	543945421
15	NC_022351	TTTTA	2	10	13052	13061	20 %	80 %	0 %	0 %	543945422
16	NC_022351	AATTT	2	10	13236	13245	40 %	60 %	0 %	0 %	543945422
17	NC_022351	TAGAT	2	10	13264	13273	40 %	40 %	20 %	0 %	543945422
18	NC_022351	TATTT	2	10	13709	13718	20 %	80 %	0 %	0 %	543945422
19	NC_022351	CTTTA	2	10	14037	14046	20 %	60 %	0 %	20 %	543945422
20	NC_022351	GACAA	2	10	15321	15330	60 %	0 %	20 %	20 %	543945423
21	NC_022351	CTTAA	2	10	16750	16759	40 %	40 %	0 %	20 %	543945426
22	NC_022351	CATTT	2	10	17300	17309	20 %	60 %	0 %	20 %	543945426
23	NC_022351	GTATT	2	10	17431	17440	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022351	GCGAT	2	10	17570	17579	20 %	20 %	40 %	20 %	543945427
25	NC_022351	AAAAT	2	10	19799	19808	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022351	TTTCA	2	10	20266	20275	20 %	60 %	0 %	20 %	543945429
27	NC_022351	AAGAT	2	10	21819	21828	60 %	20 %	20 %	0 %	543945430
28	NC_022351	ACCAA	2	10	23482	23491	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_022351	AAAAT	2	10	23623	23632	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022351	GTTAA	2	10	23650	23659	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022351	GTTGA	2	10	24939	24948	20 %	40 %	40 %	0 %	543945432
32	NC_022351	TTTAT	2	10	27411	27420	20 %	80 %	0 %	0 %	543945435
33	NC_022351	TTCTT	2	10	28166	28175	0 %	80 %	0 %	20 %	543945435
34	NC_022351	TTTGG	2	10	28839	28848	0 %	60 %	40 %	0 %	543945436
35	NC_022351	AGATA	2	10	29924	29933	60 %	20 %	20 %	0 %	543945437
36	NC_022351	GCTTT	2	10	30438	30447	0 %	60 %	20 %	20 %	543945437
37	NC_022351	ATACT	2	10	31847	31856	40 %	40 %	0 %	20 %	543945437
38	NC_022351	AATCC	2	10	32298	32307	40 %	20 %	0 %	40 %	543945438
39	NC_022351	TGTTT	2	10	33285	33294	0 %	80 %	20 %	0 %	543945438
40	NC_022351	GCAAA	2	10	33352	33361	60 %	0 %	20 %	20 %	543945438
41	NC_022351	AAAGT	2	10	34254	34263	60 %	20 %	20 %	0 %	543945439
42	NC_022351	AAAAT	2	10	35506	35515	80 %	20 %	0 %	0 %	543945440
43	NC_022351	ATTAT	2	10	36251	36260	40 %	60 %	0 %	0 %	543945441
44	NC_022351	AAATC	2	10	36921	36930	60 %	20 %	0 %	20 %	543945441
45	NC_022351	TATAT	2	10	38743	38752	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022351	AAAAT	2	10	39412	39421	80 %	20 %	0 %	0 %	543945443
47	NC_022351	TTGAC	2	10	41137	41146	20 %	40 %	20 %	20 %	543945444
48	NC_022351	AAGAA	2	10	42041	42050	80 %	0 %	20 %	0 %	543945444
49	NC_022351	ATGTT	2	10	42139	42148	20 %	60 %	20 %	0 %	543945444
50	NC_022351	GAAAT	2	10	43543	43552	60 %	20 %	20 %	0 %	543945444
51	NC_022351	AAAAG	2	10	43877	43886	80 %	0 %	20 %	0 %	543945444
52	NC_022351	AAAAT	2	10	44221	44230	80 %	20 %	0 %	0 %	543945444
53	NC_022351	AAATT	2	10	46448	46457	60 %	40 %	0 %	0 %	543945445
54	NC_022351	AGCTT	2	10	46761	46770	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_022351	AGCAA	2	10	47911	47920	60 %	0 %	20 %	20 %	543945447
56	NC_022351	CAAAT	2	10	48810	48819	60 %	20 %	0 %	20 %	543945448
57	NC_022351	TACTC	2	10	51090	51099	20 %	40 %	0 %	40 %	543945449
58	NC_022351	GATAA	2	10	51488	51497	60 %	20 %	20 %	0 %	543945450
59	NC_022351	ACCGC	2	10	52406	52415	20 %	0 %	20 %	60 %	543945451
60	NC_022351	CTTTT	2	10	52572	52581	0 %	80 %	0 %	20 %	543945451
61	NC_022351	ACCGC	2	10	52598	52607	20 %	0 %	20 %	60 %	543945451
62	NC_022351	TTTCA	2	10	52819	52828	20 %	60 %	0 %	20 %	543945451
63	NC_022351	AAGAT	2	10	54211	54220	60 %	20 %	20 %	0 %	543945452
64	NC_022351	TAATG	2	10	54263	54272	40 %	40 %	20 %	0 %	543945452
65	NC_022351	GATAA	2	10	54590	54599	60 %	20 %	20 %	0 %	543945453
66	NC_022351	AAATT	2	10	55499	55508	60 %	40 %	0 %	0 %	543945453
67	NC_022351	TACTA	2	10	57355	57364	40 %	40 %	0 %	20 %	543945455
68	NC_022351	TGCTT	2	10	58149	58158	0 %	60 %	20 %	20 %	543945455
69	NC_022351	AATAT	2	10	58334	58343	60 %	40 %	0 %	0 %	543945455
70	NC_022351	CATTT	2	10	58933	58942	20 %	60 %	0 %	20 %	543945456
71	NC_022351	AATTT	2	10	58947	58956	40 %	60 %	0 %	0 %	543945456
72	NC_022351	ATTTC	2	10	59049	59058	20 %	60 %	0 %	20 %	543945456
73	NC_022351	TGATT	2	10	59100	59109	20 %	60 %	20 %	0 %	543945456
74	NC_022351	TTTTA	2	10	59167	59176	20 %	80 %	0 %	0 %	543945456
75	NC_022351	GATAA	2	10	60101	60110	60 %	20 %	20 %	0 %	543945456
76	NC_022351	TCAAA	2	10	60652	60661	60 %	20 %	0 %	20 %	543945457
77	NC_022351	TGTGT	2	10	61147	61156	0 %	60 %	40 %	0 %	543945457
78	NC_022351	AAAAT	2	10	61327	61336	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022351	ATTAC	2	10	61683	61692	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_022351	AAAAT	2	10	62375	62384	80 %	20 %	0 %	0 %	543945459
81	NC_022351	ATATT	2	10	64653	64662	40 %	60 %	0 %	0 %	543945462
82	NC_022351	TTTAT	2	10	65040	65049	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022351	CAAGA	2	10	67096	67105	60 %	0 %	20 %	20 %	543945465
84	NC_022351	GAGCA	2	10	67466	67475	40 %	0 %	40 %	20 %	543945466
85	NC_022351	ATCAA	2	10	67945	67954	60 %	20 %	0 %	20 %	543945467
86	NC_022351	CTCTT	2	10	70940	70949	0 %	60 %	0 %	40 %	543945471
87	NC_022351	TTTTC	2	10	70981	70990	0 %	80 %	0 %	20 %	543945471
88	NC_022351	TCTCT	2	10	71245	71254	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
89	NC_022351	ATCTC	2	10	71796	71805	20 %	40 %	0 %	40 %	543945472
90	NC_022351	GCCAA	2	10	71934	71943	40 %	0 %	20 %	40 %	543945472
91	NC_022351	TTTTG	2	10	73178	73187	0 %	80 %	20 %	0 %	543945473
92	NC_022351	AGTAA	2	10	73751	73760	60 %	20 %	20 %	0 %	543945474
93	NC_022351	TAAGG	2	10	77652	77661	40 %	20 %	40 %	0 %	543945477
94	NC_022351	ATTTT	2	10	77705	77714	20 %	80 %	0 %	0 %	543945477
95	NC_022351	TAGGA	2	10	77981	77990	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022351	AAAAT	2	10	78007	78016	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022351	ATTTT	2	10	78017	78026	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022351	TAAGA	2	10	78433	78442	60 %	20 %	20 %	0 %	543945478
99	NC_022351	TTAAT	2	10	78742	78751	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022351	TATTT	2	10	78810	78819	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022351	TATAA	2	10	78827	78836	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022351	TTTGC	2	10	79506	79515	0 %	60 %	20 %	20 %	543945480
103	NC_022351	TGGAC	2	10	79855	79864	20 %	20 %	40 %	20 %	543945481
104	NC_022351	TAAAA	2	10	82604	82613	80 %	20 %	0 %	0 %	543945483
105	NC_022351	CAAAA	2	10	83137	83146	80 %	0 %	0 %	20 %	543945483
106	NC_022351	TAAAA	2	10	83576	83585	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022351	TAAAA	2	10	85847	85856	80 %	20 %	0 %	0 %	543945486
108	NC_022351	GAAAT	2	10	86719	86728	60 %	20 %	20 %	0 %	543945488
109	NC_022351	TGGTT	2	10	86903	86912	0 %	60 %	40 %	0 %	543945488
110	NC_022351	TCCAT	2	10	87516	87525	20 %	40 %	0 %	40 %	543945488
111	NC_022351	TATTT	2	10	88063	88072	20 %	80 %	0 %	0 %	543945489
112	NC_022351	TTTTA	2	10	88075	88084	20 %	80 %	0 %	0 %	543945489
113	NC_022351	TATTT	2	10	88423	88432	20 %	80 %	0 %	0 %	543945489
114	NC_022351	TTGGC	2	10	88937	88946	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_022351	AAGAT	2	10	89024	89033	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022351	GTAAA	2	10	89673	89682	60 %	20 %	20 %	0 %	543945490
117	NC_022351	AGAAT	2	10	90203	90212	60 %	20 %	20 %	0 %	543945491
118	NC_022351	AAGAA	2	10	90885	90894	80 %	0 %	20 %	0 %	543945492
119	NC_022351	CCTTG	2	10	91326	91335	0 %	40 %	20 %	40 %	543945492
120	NC_022351	AGGTA	2	10	91842	91851	40 %	20 %	40 %	0 %	543945492
121	NC_022351	GTGCA	2	10	93500	93509	20 %	20 %	40 %	20 %	543945493
122	NC_022351	ACCTT	2	10	94611	94620	20 %	40 %	0 %	40 %	543945494
123	NC_022351	TATTT	2	10	95126	95135	20 %	80 %	0 %	0 %	543945495
124	NC_022351	TCAAA	2	10	95184	95193	60 %	20 %	0 %	20 %	543945495
125	NC_022351	TTAGA	2	10	95455	95464	40 %	40 %	20 %	0 %	543945495
126	NC_022351	GCTTT	2	10	95546	95555	0 %	60 %	20 %	20 %	543945496
127	NC_022351	GTTTA	2	10	96063	96072	20 %	60 %	20 %	0 %	543945496
128	NC_022351	TAAAA	2	10	96128	96137	80 %	20 %	0 %	0 %	543945496
129	NC_022351	AAATG	2	10	96314	96323	60 %	20 %	20 %	0 %	543945497
130	NC_022351	AGGCA	2	10	96950	96959	40 %	0 %	40 %	20 %	543945497
131	NC_022351	TAAAA	2	10	97313	97322	80 %	20 %	0 %	0 %	543945497
132	NC_022351	AAATT	2	10	98308	98317	60 %	40 %	0 %	0 %	543945498
133	NC_022351	AAAGC	2	10	99003	99012	60 %	0 %	20 %	20 %	543945499
134	NC_022351	AAGAA	2	10	100377	100386	80 %	0 %	20 %	0 %	543945501
135	NC_022351	ACTCA	2	10	102513	102522	40 %	20 %	0 %	40 %	543945504
136	NC_022351	TTTTG	2	10	105851	105860	0 %	80 %	20 %	0 %	543945509
137	NC_022351	ATTTC	2	10	107970	107979	20 %	60 %	0 %	20 %	543945511
138	NC_022351	CAAGA	2	10	108625	108634	60 %	0 %	20 %	20 %	543945511
139	NC_022351	AATGA	2	10	109294	109303	60 %	20 %	20 %	0 %	543945512
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258	NC_022351	ATATT	2	10	237373	237382	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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