MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis str. Haarlem

Total Repeats: 147

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022350	ACCGCG	2	12	31171	31182	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2	NC_022350	CGTCGG	2	12	66817	66828	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_022350	CAACGG	2	12	76339	76350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_022350	TCACCT	2	12	80532	80543	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_022350	GCGGTG	2	12	104880	104891	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_022350	CTCGGT	2	12	149512	149523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_022350	GCCGCG	2	12	181250	181261	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_022350	ACAGCC	2	12	218798	218809	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
9	NC_022350	AGATTC	2	12	330684	330695	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_022350	GGTCGC	2	12	345222	345233	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_022350	ATAGTC	2	12	547478	547489	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_022350	ACCAGT	2	12	595370	595381	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_022350	CGCCGT	2	12	724386	724397	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
14	NC_022350	CGCGGG	2	12	834924	834935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_022350	CCGGCG	2	12	868080	868091	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_022350	ACCGGG	2	12	874801	874812	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_022350	GCGGCC	2	12	911692	911703	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_022350	ACAGCA	2	12	913065	913076	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_022350	CTGGGT	2	12	927813	927824	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_022350	TCGGGT	2	12	969149	969160	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_022350	CAACGG	2	12	1032937	1032948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_022350	GATCGA	2	12	1032988	1032999	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_022350	GACTGC	2	12	1037392	1037403	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_022350	CGCCGG	2	12	1056256	1056267	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_022350	CTACAA	2	12	1097467	1097478	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_022350	GGCGCA	2	12	1099413	1099424	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_022350	GGCGCA	2	12	1101520	1101531	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_022350	CAATGC	2	12	1128612	1128623	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_022350	TTGGTG	2	12	1156748	1156759	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022350	TTCCGT	2	12	1167441	1167452	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_022350	TAGCCA	2	12	1201410	1201421	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_022350	AGTTAC	2	12	1227114	1227125	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_022350	AGGACG	2	12	1288107	1288118	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_022350	AGGCCA	2	12	1346467	1346478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_022350	TCGACA	2	12	1373918	1373929	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_022350	CCGAGT	2	12	1424996	1425007	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_022350	CACGCG	2	12	1526987	1526998	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
38	NC_022350	CGGCCG	2	12	1555034	1555045	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_022350	TCGACG	2	12	1560048	1560059	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_022350	ATATTC	2	12	1562011	1562022	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_022350	ACCCCG	2	12	1573883	1573894	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_022350	CGTCGA	2	12	1612899	1612910	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_022350	GCCCCT	2	12	1635526	1635537	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_022350	GCCCCT	2	12	1639116	1639127	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_022350	CGAGTG	2	12	1783141	1783152	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_022350	GGCGCC	2	12	1829366	1829377	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_022350	CCGCGG	2	12	1893035	1893046	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_022350	CGCCGA	2	12	1910809	1910820	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
49	NC_022350	TAGCGG	2	12	1920140	1920151	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_022350	ACCGCA	2	12	1922077	1922088	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
51	NC_022350	GTTCAT	2	12	1981013	1981024	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_022350	GGTGAT	2	12	2041094	2041105	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022350	CGGGGC	3	18	2041401	2041418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_022350	TGCCGC	2	12	2042552	2042563	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
55	NC_022350	TTCGGC	2	12	2055004	2055015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_022350	AGAGGG	2	12	2075082	2075093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022350	GCTGGG	2	12	2144185	2144196	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_022350	CCGCCC	2	12	2157218	2157229	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
59	NC_022350	CGCGAG	2	12	2176182	2176193	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_022350	CGGTTG	2	12	2230576	2230587	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_022350	GCCGCA	2	12	2233481	2233492	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
62	NC_022350	CGGCTC	2	12	2262794	2262805	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
63	NC_022350	TGCACT	2	12	2343216	2343227	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_022350	CCAACA	2	12	2344022	2344033	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_022350	CCAACA	2	12	2344100	2344111	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_022350	CCCACC	2	12	2344144	2344155	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
67	NC_022350	GTTGGT	2	12	2344196	2344207	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022350	ATAGAA	2	12	2368566	2368577	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022350	CTCAAC	2	12	2411315	2411326	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_022350	CCGCTG	2	12	2431918	2431929	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
71	NC_022350	GCGTCG	2	12	2492690	2492701	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_022350	GCAACC	2	12	2627343	2627354	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
73	NC_022350	CACGTG	2	12	2711327	2711338	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_022350	GAGGTC	2	12	2714939	2714950	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_022350	CCGGCA	2	12	2728990	2729001	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
76	NC_022350	CGCCAC	2	12	2787177	2787188	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_022350	TCAAAC	2	12	2788930	2788941	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_022350	GCACCC	2	12	2817000	2817011	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_022350	CGACGG	2	12	2865937	2865948	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_022350	GCCCGA	2	12	2873032	2873043	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
81	NC_022350	GTATTG	2	12	2911467	2911478	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022350	CCGTTG	2	12	2921403	2921414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_022350	GGCGCC	2	12	2941091	2941102	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_022350	CGGAAG	2	12	2948560	2948571	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_022350	CATATT	2	12	3009139	3009150	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_022350	CCGGCA	2	12	3073216	3073227	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
87	NC_022350	CGTTGC	2	12	3094230	3094241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_022350	GACATC	2	12	3117551	3117562	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_022350	CATCAC	2	12	3180287	3180298	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_022350	CCCCGC	2	12	3239073	3239084	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
91	NC_022350	TCGCCG	2	12	3287354	3287365	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
92	NC_022350	TCGCCG	2	12	3287411	3287422	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
93	NC_022350	CGCCAC	2	12	3303432	3303443	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_022350	GGCCGG	2	12	3309131	3309142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_022350	TCCGAA	2	12	3321980	3321991	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_022350	CGTAGG	2	12	3374816	3374827	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_022350	TGTACA	2	12	3424067	3424078	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_022350	ACCAAC	2	12	3429416	3429427	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_022350	CCGTTG	2	12	3451114	3451125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_022350	GCTCCT	2	12	3481496	3481507	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
101	NC_022350	GCATCA	2	12	3484313	3484324	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_022350	CATCGA	2	12	3485169	3485180	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_022350	TCCGCT	2	12	3542566	3542577	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
104	NC_022350	GCCTCC	2	12	3633083	3633094	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_022350	CGTCGA	2	12	3669823	3669834	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_022350	GGTGCC	2	12	3670279	3670290	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_022350	GGGTTT	2	12	3671449	3671460	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022350	CGCTCG	2	12	3671625	3671636	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
109	NC_022350	TGCCGG	2	12	3752431	3752442	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_022350	GCCCAC	2	12	3752462	3752473	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_022350	TGCCGG	2	12	3754096	3754107	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_022350	CCCGAT	2	12	3754178	3754189	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
113	NC_022350	TGCCGG	2	12	3754192	3754203	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_022350	GCAGCG	2	12	3754876	3754887	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_022350	ACCGGG	2	12	3755854	3755865	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_022350	CCCGAT	2	12	3755948	3755959	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
117	NC_022350	TGCCGG	2	12	3755962	3755973	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_022350	GCTGCC	2	12	3756020	3756031	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
119	NC_022350	GGGGAT	2	12	3757172	3757183	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022350	TGCCGG	2	12	3757633	3757644	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_022350	TGCCGG	2	12	3757663	3757674	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_022350	CCCGAT	2	12	3757745	3757756	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
123	NC_022350	GCCCAG	2	12	3757946	3757957	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
124	NC_022350	CGGGAT	2	12	3758402	3758413	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_022350	TGCCGG	2	12	3759424	3759435	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_022350	CCCGAT	2	12	3759506	3759517	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
127	NC_022350	GCCCAG	2	12	3759707	3759718	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
128	NC_022350	CAACGG	2	12	3760274	3760285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_022350	GGTGTT	2	12	3760925	3760936	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022350	CTCGGC	2	12	3761729	3761740	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
131	NC_022350	CGGCCG	2	12	3761896	3761907	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_022350	GCGCAG	2	12	3773460	3773471	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_022350	TGTACA	2	12	3792807	3792818	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_022350	TCCTCT	2	12	3868847	3868858	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_022350	CGCTGC	2	12	3882247	3882258	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
136	NC_022350	TCGGAG	2	12	3902373	3902384	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_022350	CCGCTC	2	12	3906402	3906413	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_022350	CGTTGG	2	12	3919042	3919053	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_022350	CGGCCG	2	12	3923182	3923193	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_022350	CGAGGG	2	12	3957265	3957276	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_022350	GGCGAG	2	12	4107341	4107352	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_022350	GCGCCG	2	12	4147799	4147810	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_022350	TGGCGG	2	12	4195967	4195978	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
144	NC_022350	CTCATC	2	12	4263508	4263519	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_022350	GGGTTG	2	12	4320773	4320784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022350	ATTGCC	2	12	4365420	4365431	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_022350	CGCGGC	2	12	4366999	4367010	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.