MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium tuberculosis str. Haarlem

Total Repeats: 3506

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022350	TCATC	2	10	1003	1012	20 %	40 %	0 %	40 %	197737989
2	NC_022350	CGTTT	2	10	2193	2202	0 %	60 %	20 %	20 %	197737990
3	NC_022350	CGGTT	2	10	3342	3351	0 %	40 %	40 %	20 %	197737990
4	NC_022350	GTCGG	2	10	4690	4699	0 %	20 %	60 %	20 %	197737992
5	NC_022350	GCAGC	2	10	7474	7483	20 %	0 %	40 %	40 %	197737994
6	NC_022350	CGGTG	2	10	9382	9391	0 %	20 %	60 %	20 %	197737994
7	NC_022350	CAGAC	2	10	9900	9909	40 %	0 %	20 %	40 %	197737994
8	NC_022350	CGCAA	2	10	10424	10433	40 %	0 %	20 %	40 %	197737995
9	NC_022350	CGGCG	2	10	10550	10559	0 %	0 %	60 %	40 %	197737995
10	NC_022350	ACCCG	2	10	11380	11389	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
11	NC_022350	CGACC	2	10	13773	13782	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
12	NC_022350	GGCGT	2	10	14255	14264	0 %	20 %	60 %	20 %	197738000
13	NC_022350	GGGCC	2	10	14538	14547	0 %	0 %	60 %	40 %	197738000
14	NC_022350	GCGTT	2	10	15283	15292	0 %	40 %	40 %	20 %	197738001
15	NC_022350	CCAGC	2	10	15823	15832	20 %	0 %	20 %	60 %	197738002
16	NC_022350	ACCGA	2	10	16586	16595	40 %	0 %	20 %	40 %	197738002
17	NC_022350	ATCGG	2	10	16978	16987	20 %	20 %	40 %	20 %	197738002
18	NC_022350	CGGCC	2	10	17987	17996	0 %	0 %	40 %	60 %	197738003
19	NC_022350	TTAGC	2	10	19138	19147	20 %	40 %	20 %	20 %	197738004
20	NC_022350	GGTCC	2	10	19210	19219	0 %	20 %	40 %	40 %	197738004
21	NC_022350	GTCGT	2	10	21729	21738	0 %	40 %	40 %	20 %	197738005
22	NC_022350	ATCAC	2	10	24002	24011	40 %	20 %	0 %	40 %	197738008
23	NC_022350	GCCGG	2	10	24689	24698	0 %	0 %	60 %	40 %	197738008
24	NC_022350	CGAGC	2	10	27051	27060	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_022350	GGCAA	2	10	29384	29393	40 %	0 %	40 %	20 %	197738012
26	NC_022350	CGATC	2	10	30209	30218	20 %	20 %	20 %	40 %	197738013
27	NC_022350	CGACG	2	10	32392	32401	20 %	0 %	40 %	40 %	197738016
28	NC_022350	GCGTC	2	10	32447	32456	0 %	20 %	40 %	40 %	197738016
29	NC_022350	GACAC	2	10	32544	32553	40 %	0 %	20 %	40 %	197738016
30	NC_022350	CCGCC	2	10	33890	33899	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
31	NC_022350	TCCTG	2	10	37548	37557	0 %	40 %	20 %	40 %	197738022
32	NC_022350	CTCGG	2	10	37641	37650	0 %	20 %	40 %	40 %	197738022
33	NC_022350	GGCGC	2	10	38184	38193	0 %	0 %	60 %	40 %	197738022
34	NC_022350	TGGCC	2	10	38332	38341	0 %	20 %	40 %	40 %	197738022
35	NC_022350	CGGCG	2	10	38864	38873	0 %	0 %	60 %	40 %	197738022
36	NC_022350	GTCCA	2	10	39476	39485	20 %	20 %	20 %	40 %	197738023
37	NC_022350	GCCAA	2	10	41610	41619	40 %	0 %	20 %	40 %	197738025
38	NC_022350	GCGTC	2	10	42025	42034	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
39	NC_022350	GCACA	2	10	42409	42418	40 %	0 %	20 %	40 %	544161324
40	NC_022350	GGTAC	2	10	44943	44952	20 %	20 %	40 %	20 %	197738027
41	NC_022350	TCGAA	2	10	45175	45184	40 %	20 %	20 %	20 %	197738027
42	NC_022350	GCACC	2	10	46105	46114	20 %	0 %	20 %	60 %	197738027
43	NC_022350	CGGTG	2	10	47139	47148	0 %	20 %	60 %	20 %	197738028
44	NC_022350	TCATG	2	10	47285	47294	20 %	40 %	20 %	20 %	197738028
45	NC_022350	ATCGG	2	10	47432	47441	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_022350	GCAGC	2	10	48679	48688	20 %	0 %	40 %	40 %	197738030
47	NC_022350	CCCGA	2	10	48762	48771	20 %	0 %	20 %	60 %	197738030
48	NC_022350	CAGCG	2	10	49887	49896	20 %	0 %	40 %	40 %	197738031
49	NC_022350	CTCCC	2	10	56321	56330	0 %	20 %	0 %	80 %	197738037
50	NC_022350	CGGCG	2	10	56770	56779	0 %	0 %	60 %	40 %	197738037
51	NC_022350	CGACC	2	10	58302	58311	20 %	0 %	20 %	60 %	197738039
52	NC_022350	CTTCG	2	10	58989	58998	0 %	40 %	20 %	40 %	197738040
53	NC_022350	CGGTG	2	10	60045	60054	0 %	20 %	60 %	20 %	197738043
54	NC_022350	TCAGG	2	10	62531	62540	20 %	20 %	40 %	20 %	544161327
55	NC_022350	TGCCG	2	10	65562	65571	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
56	NC_022350	GGCGA	2	10	66494	66503	20 %	0 %	60 %	20 %	197738048
57	NC_022350	GGTGT	2	10	69070	69079	0 %	40 %	60 %	0 %	544161330
58	NC_022350	ATCGG	2	10	69707	69716	20 %	20 %	40 %	20 %	544161330
59	NC_022350	CCGCG	2	10	70244	70253	0 %	0 %	40 %	60 %	544161330
60	NC_022350	GGCAA	2	10	70595	70604	40 %	0 %	40 %	20 %	544161330
61	NC_022350	CGACC	2	10	70884	70893	20 %	0 %	20 %	60 %	544161330
62	NC_022350	CGGGT	2	10	71338	71347	0 %	20 %	60 %	20 %	544161330
63	NC_022350	GGTCG	2	10	71398	71407	0 %	20 %	60 %	20 %	544161330
64	NC_022350	TGCCT	2	10	72139	72148	0 %	40 %	20 %	40 %	197738050
65	NC_022350	GTCCA	2	10	73010	73019	20 %	20 %	20 %	40 %	197738051
66	NC_022350	TGACC	2	10	75634	75643	20 %	20 %	20 %	40 %	197738053
67	NC_022350	GCCAA	2	10	75948	75957	40 %	0 %	20 %	40 %	197738053
68	NC_022350	GTCGC	2	10	76025	76034	0 %	20 %	40 %	40 %	197738053
69	NC_022350	GCGCG	2	10	77113	77122	0 %	0 %	60 %	40 %	197738054
70	NC_022350	CACGA	2	10	79988	79997	40 %	0 %	20 %	40 %	544161332
71	NC_022350	GCACC	2	10	80428	80437	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
72	NC_022350	CCACC	2	10	80621	80630	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
73	NC_022350	GAGCA	2	10	82526	82535	40 %	0 %	40 %	20 %	197738058
74	NC_022350	GCCGG	2	10	82625	82634	0 %	0 %	60 %	40 %	197738058
75	NC_022350	GCGAC	2	10	82701	82710	20 %	0 %	40 %	40 %	197738058
76	NC_022350	ATCCG	2	10	83471	83480	20 %	20 %	20 %	40 %	197738059
77	NC_022350	CACCG	2	10	84251	84260	20 %	0 %	20 %	60 %	197738060
78	NC_022350	TGGTC	2	10	86386	86395	0 %	40 %	40 %	20 %	197738062
79	NC_022350	GCTGG	2	10	87023	87032	0 %	20 %	60 %	20 %	197738063
80	NC_022350	TGGGT	2	10	90061	90070	0 %	40 %	60 %	0 %	197738068
81	NC_022350	TCGCC	2	10	90268	90277	0 %	20 %	20 %	60 %	197738068
82	NC_022350	GGGCC	2	10	91241	91250	0 %	0 %	60 %	40 %	544161333
83	NC_022350	GGCCG	2	10	92560	92569	0 %	0 %	60 %	40 %	197738069
84	NC_022350	GCGCC	2	10	93212	93221	0 %	0 %	40 %	60 %	197738069
85	NC_022350	GCTTG	2	10	95244	95253	0 %	40 %	40 %	20 %	197738070
86	NC_022350	CGTGT	2	10	95676	95685	0 %	40 %	40 %	20 %	197738071
87	NC_022350	AGATC	2	10	95755	95764	40 %	20 %	20 %	20 %	197738071
88	NC_022350	CGGCG	2	10	99336	99345	0 %	0 %	60 %	40 %	197738074
89	NC_022350	CGGCG	2	10	99463	99472	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
90	NC_022350	GCGGT	2	10	100412	100421	0 %	20 %	60 %	20 %	197738075
91	NC_022350	GGTGA	2	10	100630	100639	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022350	GCGCC	2	10	103244	103253	0 %	0 %	40 %	60 %	197738077
93	NC_022350	GGTGG	2	10	103932	103941	0 %	20 %	80 %	0 %	544161335
94	NC_022350	GGCTT	2	10	104945	104954	0 %	40 %	40 %	20 %	197738079
95	NC_022350	CTGGC	2	10	105667	105676	0 %	20 %	40 %	40 %	197738080
96	NC_022350	GCACA	2	10	106788	106797	40 %	0 %	20 %	40 %	197738080
97	NC_022350	CTGAA	2	10	109118	109127	40 %	20 %	20 %	20 %	197738083
98	NC_022350	ATCGC	2	10	109613	109622	20 %	20 %	20 %	40 %	197738083
99	NC_022350	TCTGA	2	10	110947	110956	20 %	40 %	20 %	20 %	197738085
100	NC_022350	CGGTC	2	10	111222	111231	0 %	20 %	40 %	40 %	197738085
101	NC_022350	GACCA	2	10	112360	112369	40 %	0 %	20 %	40 %	197738085
102	NC_022350	GGCTG	2	10	114924	114933	0 %	20 %	60 %	20 %	197738085
103	NC_022350	CCGCG	2	10	118844	118853	0 %	0 %	40 %	60 %	197738086
104	NC_022350	TCGTG	2	10	122797	122806	0 %	40 %	40 %	20 %	197738088
105	NC_022350	GCACG	2	10	124452	124461	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
106	NC_022350	CCGGA	2	10	124578	124587	20 %	0 %	40 %	40 %	197738090
107	NC_022350	TGCGC	2	10	127051	127060	0 %	20 %	40 %	40 %	197738091
108	NC_022350	GCGAG	2	10	127562	127571	20 %	0 %	60 %	20 %	197738091
109	NC_022350	GGGGT	2	10	128571	128580	0 %	20 %	80 %	0 %	197738091
110	NC_022350	CCCAC	2	10	129133	129142	20 %	0 %	0 %	80 %	197738091
111	NC_022350	CCGGC	2	10	129643	129652	0 %	0 %	40 %	60 %	197738091
112	NC_022350	TGCGG	2	10	130053	130062	0 %	20 %	60 %	20 %	197738091
113	NC_022350	ATCAC	2	10	131532	131541	40 %	20 %	0 %	40 %	544161338
114	NC_022350	ATCGG	2	10	131580	131589	20 %	20 %	40 %	20 %	544161338
115	NC_022350	CGGGC	2	10	132671	132680	0 %	0 %	60 %	40 %	544161338
116	NC_022350	GCGAT	2	10	134476	134485	20 %	20 %	40 %	20 %	197738094
117	NC_022350	GTTCG	2	10	134697	134706	0 %	40 %	40 %	20 %	197738094
118	NC_022350	CCTGG	2	10	135089	135098	0 %	20 %	40 %	40 %	197738094
119	NC_022350	GGCCC	2	10	135195	135204	0 %	0 %	40 %	60 %	197738094
120	NC_022350	CGTTG	2	10	135707	135716	0 %	40 %	40 %	20 %	197738094
121	NC_022350	CGACC	2	10	135779	135788	20 %	0 %	20 %	60 %	197738094
122	NC_022350	GAGAT	2	10	138799	138808	40 %	20 %	40 %	0 %	544161340
123	NC_022350	CGGCG	2	10	140953	140962	0 %	0 %	60 %	40 %	197738098
124	NC_022350	TGCGG	2	10	141586	141595	0 %	20 %	60 %	20 %	544161341
125	NC_022350	CGCTG	2	10	142293	142302	0 %	20 %	40 %	40 %	197738100
126	NC_022350	GTTGC	2	10	142839	142848	0 %	40 %	40 %	20 %	197738100
127	NC_022350	CCGAT	2	10	143587	143596	20 %	20 %	20 %	40 %	197738100
128	NC_022350	ATCGC	2	10	144278	144287	20 %	20 %	20 %	40 %	544161342
129	NC_022350	AACCG	2	10	145017	145026	40 %	0 %	20 %	40 %	544161342
130	NC_022350	CCGCC	2	10	145604	145613	0 %	0 %	20 %	80 %	544161342
131	NC_022350	CCGCC	2	10	146247	146256	0 %	0 %	20 %	80 %	197738102
132	NC_022350	GGGTC	2	10	148001	148010	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
133	NC_022350	ATCGG	2	10	149731	149740	20 %	20 %	40 %	20 %	544161344
134	NC_022350	ATTGG	2	10	152566	152575	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022350	AGCGA	2	10	154469	154478	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_022350	AGCGA	2	10	154522	154531	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_022350	TCGTC	2	10	154869	154878	0 %	40 %	20 %	40 %	197738107
138	NC_022350	CACGC	2	10	155333	155342	20 %	0 %	20 %	60 %	197738107
139	NC_022350	ATTCT	2	10	156177	156186	20 %	60 %	0 %	20 %	197738108
140	NC_022350	AGGCG	2	10	156705	156714	20 %	0 %	60 %	20 %	197738108
141	NC_022350	TGACC	2	10	159709	159718	20 %	20 %	20 %	40 %	197738111
142	NC_022350	CGGCG	2	10	159955	159964	0 %	0 %	60 %	40 %	197738111
143	NC_022350	GCACC	2	10	160125	160134	20 %	0 %	20 %	60 %	197738112
144	NC_022350	CCGCA	2	10	161303	161312	20 %	0 %	20 %	60 %	197738113
145	NC_022350	CGCGG	2	10	161382	161391	0 %	0 %	60 %	40 %	197738113
146	NC_022350	CGGTT	2	10	161709	161718	0 %	40 %	40 %	20 %	197738113
147	NC_022350	GTCGC	2	10	161871	161880	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
148	NC_022350	GCCGG	2	10	162170	162179	0 %	0 %	60 %	40 %	197738114
149	NC_022350	GCGCG	2	10	162292	162301	0 %	0 %	60 %	40 %	197738114
150	NC_022350	CTGGG	2	10	164506	164515	0 %	20 %	60 %	20 %	197738116
151	NC_022350	GCCGG	2	10	165099	165108	0 %	0 %	60 %	40 %	197738117
152	NC_022350	GTTGG	2	10	167068	167077	0 %	40 %	60 %	0 %	197738119
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154	NC_022350	GCCGC	2	10	168907	168916	0 %	0 %	40 %	60 %	197738122
155	NC_022350	CCGCC	2	10	170158	170167	0 %	0 %	20 %	80 %	197738123
156	NC_022350	GCATG	2	10	171521	171530	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
157	NC_022350	CTACC	2	10	172124	172133	20 %	20 %	0 %	60 %	197738125
158	NC_022350	GCGCC	2	10	174283	174292	0 %	0 %	40 %	60 %	197738127
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160	NC_022350	CCCGA	2	10	175000	175009	20 %	0 %	20 %	60 %	197738127
161	NC_022350	TGGTC	2	10	175657	175666	0 %	40 %	40 %	20 %	197738128
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163	NC_022350	GGGCT	2	10	176596	176605	0 %	20 %	60 %	20 %	197738129
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172	NC_022350	GGCTG	2	10	191281	191290	0 %	20 %	60 %	20 %	197738141
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175	NC_022350	GGAAG	2	10	195291	195300	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
176	NC_022350	GGCCG	2	10	196697	196706	0 %	0 %	60 %	40 %	197738146
177	NC_022350	CGGCG	2	10	197451	197460	0 %	0 %	60 %	40 %	197738147
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179	NC_022350	GACCT	2	10	205370	205379	20 %	20 %	20 %	40 %	544161351
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181	NC_022350	TTGCG	2	10	207431	207440	0 %	40 %	40 %	20 %	544161352
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186	NC_022350	GCCGA	2	10	215246	215255	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
187	NC_022350	CCTCG	2	10	215682	215691	0 %	20 %	20 %	60 %	197738163
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196	NC_022350	CCGTG	2	10	222395	222404	0 %	20 %	40 %	40 %	197738169
197	NC_022350	GGTGC	2	10	222519	222528	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
198	NC_022350	GCCGC	2	10	222855	222864	0 %	0 %	40 %	60 %	197738170
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237	NC_022350	GCAGT	2	10	276323	276332	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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249	NC_022350	TGCGC	2	10	302511	302520	0 %	20 %	40 %	40 %	197738225
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260	NC_022350	CGCAG	2	10	314941	314950	20 %	0 %	40 %	40 %	197738234
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263	NC_022350	TCGGC	2	10	316782	316791	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
264	NC_022350	CCTGG	2	10	317330	317339	0 %	20 %	40 %	40 %	197738237
265	NC_022350	GGCCG	2	10	320435	320444	0 %	0 %	60 %	40 %	197738238
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