MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis str. Haarlem

Total Repeats: 77699

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022350	CGT	2	6	97	102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197737989
2	NC_022350	CAC	2	6	128	133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197737989
3	NC_022350	GTC	2	6	147	152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197737989
4	NC_022350	GAC	2	6	180	185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197737989
5	NC_022350	CAG	2	6	191	196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197737989
6	NC_022350	TCG	2	6	268	273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197737989
7	NC_022350	AGC	2	6	300	305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197737989
8	NC_022350	GCC	2	6	361	366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197737989
9	NC_022350	CCG	2	6	405	410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197737989
10	NC_022350	CGA	2	6	425	430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197737989
11	NC_022350	GCC	2	6	440	445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197737989
12	NC_022350	ACG	2	6	490	495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197737989
13	NC_022350	TGA	2	6	500	505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197737989
14	NC_022350	CGC	3	9	662	670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197737989
15	NC_022350	GTT	2	6	782	787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197737989
16	NC_022350	CGA	2	6	911	916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197737989
17	NC_022350	TTC	2	6	957	962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197737989
18	NC_022350	CAA	2	6	989	994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197737989
19	NC_022350	AGC	2	6	1027	1032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197737989
20	NC_022350	ACC	2	6	1094	1099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197737989
21	NC_022350	CGA	2	6	1163	1168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197737989
22	NC_022350	CAG	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197737989
23	NC_022350	GCG	2	6	1338	1343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197737989
24	NC_022350	CCG	2	6	1360	1365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197737989
25	NC_022350	CAC	2	6	1592	1597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197737989
26	NC_022350	GTT	2	6	2287	2292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197737990
27	NC_022350	CCG	2	6	2343	2348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197737990
28	NC_022350	TTG	2	6	2405	2410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197737990
29	NC_022350	CGA	2	6	2508	2513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197737990
30	NC_022350	TTG	2	6	2564	2569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197737990
31	NC_022350	ATT	2	6	2578	2583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197737990
32	NC_022350	CGC	2	6	2611	2616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197737990
33	NC_022350	GAC	2	6	2624	2629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197737990
34	NC_022350	GGT	2	6	2677	2682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197737990
35	NC_022350	CGT	2	6	2736	2741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197737990
36	NC_022350	GCC	2	6	2792	2797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197737990
37	NC_022350	CGG	2	6	2809	2814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197737990
38	NC_022350	GCA	2	6	2895	2900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197737990
39	NC_022350	CTT	2	6	2909	2914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197737990
40	NC_022350	CCA	2	6	2970	2975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197737990
41	NC_022350	GAT	2	6	3089	3094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197737990
42	NC_022350	TTG	3	9	3117	3125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197737990
43	NC_022350	CGG	2	6	3306	3311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197737990
44	NC_022350	TTG	2	6	3463	3468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197737991
45	NC_022350	CGA	2	6	3517	3522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197737991
46	NC_022350	GTG	2	6	3600	3605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197737991
47	NC_022350	ACG	2	6	3607	3612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197737991
48	NC_022350	CAA	2	6	3656	3661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197737991
49	NC_022350	ATC	2	6	3677	3682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197737991
50	NC_022350	TGT	2	6	3724	3729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197737991
51	NC_022350	CGG	2	6	3774	3779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197737991
52	NC_022350	GAT	2	6	3789	3794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197737991
53	NC_022350	TGG	2	6	3970	3975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197737991
54	NC_022350	GAA	2	6	4016	4021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197737991
55	NC_022350	AGC	2	6	4130	4135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197737991
56	NC_022350	GGC	2	6	4145	4150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197737991
57	NC_022350	GGC	2	6	4154	4159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197737991
58	NC_022350	GAC	2	6	4212	4217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197737991
59	NC_022350	GGC	2	6	4301	4306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197737991
60	NC_022350	TGG	2	6	4328	4333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197737991
61	NC_022350	GTT	2	6	4343	4348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197737991
62	NC_022350	CGA	2	6	4352	4357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197737991
63	NC_022350	CGG	2	6	4402	4407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197737991
64	NC_022350	CCG	2	6	4414	4419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197737991
65	NC_022350	CCG	2	6	4459	4464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197737991
66	NC_022350	GGT	2	6	4523	4528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197737991
67	NC_022350	TGC	3	9	4633	4641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197737992
68	NC_022350	CGA	2	6	4712	4717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197737992
69	NC_022350	GGT	2	6	4846	4851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197737992
70	NC_022350	CCA	2	6	4855	4860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197737992
71	NC_022350	ACG	2	6	4893	4898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197737992
72	NC_022350	CGC	2	6	4978	4983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197737992
73	NC_022350	CGG	2	6	5028	5033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197737992
74	NC_022350	AGA	2	6	5242	5247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	544161317
75	NC_022350	GTG	2	6	5275	5280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	544161317
76	NC_022350	GCG	2	6	5292	5297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	544161317
77	NC_022350	GAG	2	6	5323	5328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	544161317
78	NC_022350	AAG	2	6	5356	5361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	544161317
79	NC_022350	GGT	2	6	5484	5489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	544161317
80	NC_022350	CGA	2	6	5502	5507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	544161317
81	NC_022350	TGC	2	6	5543	5548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544161317
82	NC_022350	CGA	2	6	5574	5579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	544161317
83	NC_022350	GTG	2	6	5632	5637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	544161317
84	NC_022350	CGG	2	6	5655	5660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	544161317
85	NC_022350	TGG	2	6	5691	5696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	544161317
86	NC_022350	GGT	2	6	5718	5723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	544161317
87	NC_022350	AAG	2	6	5833	5838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	544161317
88	NC_022350	CAA	2	6	5940	5945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	544161317
89	NC_022350	CGA	2	6	5967	5972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	544161317
90	NC_022350	GTC	2	6	5992	5997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544161317
91	NC_022350	TGG	2	6	6110	6115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	544161317
92	NC_022350	AGC	2	6	6157	6162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	544161317
93	NC_022350	GGC	2	6	6277	6282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	544161317
94	NC_022350	GGT	2	6	6318	6323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	544161317
95	NC_022350	GCG	2	6	6621	6626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	544161317
96	NC_022350	ATC	2	6	6793	6798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	544161317
97	NC_022350	ATC	2	6	6853	6858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	544161317
98	NC_022350	ACG	2	6	6881	6886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	544161317
99	NC_022350	TGT	2	6	6968	6973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	544161317
100	NC_022350	GTT	3	9	6978	6986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	544161317
101	NC_022350	CCG	2	6	7036	7041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	544161317
102	NC_022350	CTG	2	6	7108	7113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	544161317
103	NC_022350	GAA	2	6	7134	7139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	544161317
104	NC_022350	CAA	2	6	7143	7148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	544161317
105	NC_022350	ACC	2	6	7210	7215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	544161317
106	NC_022350	GAC	2	6	7255	7260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	544161317
107	NC_022350	GCC	4	12	7261	7272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	544161317
108	NC_022350	GTT	2	6	7278	7283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	544161317
109	NC_022350	GCC	2	6	7420	7425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197737994
110	NC_022350	GAC	2	6	7427	7432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197737994
111	NC_022350	CAG	2	6	7463	7468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197737994
112	NC_022350	TCG	2	6	7509	7514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197737994
113	NC_022350	ACC	2	6	7653	7658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197737994
114	NC_022350	TGG	2	6	7728	7733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197737994
115	NC_022350	CGG	2	6	7773	7778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197737994
116	NC_022350	CGA	2	6	7837	7842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197737994
117	NC_022350	ACG	2	6	7869	7874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197737994
118	NC_022350	CTG	2	6	7919	7924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197737994
119	NC_022350	GGC	2	6	7937	7942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197737994
120	NC_022350	CGC	2	6	7971	7976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197737994
121	NC_022350	ACG	2	6	8025	8030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197737994
122	NC_022350	CGA	2	6	8032	8037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197737994
123	NC_022350	CCG	2	6	8091	8096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197737994
124	NC_022350	TCG	2	6	8103	8108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197737994
125	NC_022350	GTT	2	6	8168	8173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197737994
126	NC_022350	AGA	2	6	8179	8184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197737994
127	NC_022350	TCA	2	6	8250	8255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197737994
128	NC_022350	GGT	2	6	8377	8382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197737994
129	NC_022350	TCG	2	6	8445	8450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197737994
130	NC_022350	ACC	2	6	8502	8507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197737994
131	NC_022350	GCG	2	6	8524	8529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197737994
132	NC_022350	CAC	2	6	8530	8535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197737994
133	NC_022350	GCT	2	6	8671	8676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197737994
134	NC_022350	CGA	2	6	8683	8688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197737994
135	NC_022350	GCG	2	6	8722	8727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197737994
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138	NC_022350	CGA	2	6	8842	8847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197737994
139	NC_022350	CGA	2	6	8875	8880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197737994
140	NC_022350	ATC	2	6	8894	8899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197737994
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250	NC_022350	ACG	2	6	16820	16825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197738002
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499	NC_022350	ACG	2	6	32350	32355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197738016
500	NC_022350	AGA	3	9	32405	32413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197738016

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