MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio alginolyticus NBRC 15630 = ATCC 17749 chromosome 1

Total Repeats: 107

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022349	CAAAAT	2	12	12505	12516	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_022349	TATAAA	2	12	20683	20694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022349	TTTCAT	2	12	33674	33685	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_022349	ATTGTG	2	12	33697	33708	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022349	AAAAAG	2	12	112273	112284	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022349	AGAGCA	2	12	142192	142203	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_022349	TTTTAC	2	12	149851	149862	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_022349	TACTTT	2	12	150085	150096	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_022349	GATGGA	2	12	158136	158147	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022349	ATTGCA	2	12	162020	162031	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_022349	TCGCTC	2	12	214376	214387	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
12	NC_022349	TTTCCA	2	12	223391	223402	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_022349	ACTTTA	2	12	223412	223423	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_022349	TAAGTA	2	12	272050	272061	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022349	TTGTTA	2	12	274937	274948	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022349	CATCGA	2	12	339904	339915	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_022349	AAACAA	2	12	371094	371105	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_022349	AATGCT	2	12	376028	376039	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_022349	AATTAT	2	12	397168	397179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022349	GTTTTT	2	12	412962	412973	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022349	ATGAAA	2	12	413031	413042	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022349	GTTTTG	2	12	525848	525859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022349	TTATTT	2	12	540647	540658	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022349	TAATGA	2	12	545443	545454	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022349	AAAAGT	2	12	556248	556259	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022349	AACATC	2	12	623611	623622	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_022349	AAAAGC	2	12	629136	629147	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_022349	ATTACC	2	12	646763	646774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_022349	GCAAAC	2	12	697639	697650	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_022349	TTCCCT	2	12	777789	777800	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_022349	ACAATA	2	12	783405	783416	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_022349	ATGAAA	2	12	785451	785462	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022349	GAAATA	2	12	818646	818657	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022349	TTACCT	2	12	855049	855060	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_022349	CTCTTT	2	12	860737	860748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_022349	AAATAC	2	12	871985	871996	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_022349	TGTTAT	2	12	936368	936379	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022349	ACCAAA	2	12	964367	964378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_022349	TAACGA	2	12	1023138	1023149	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_022349	AATAAA	2	12	1059043	1059054	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022349	TTATCT	2	12	1077032	1077043	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_022349	GATACA	2	12	1078362	1078373	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_022349	TATTTT	2	12	1096650	1096661	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022349	GTCATT	2	12	1118581	1118592	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_022349	AAAATT	2	12	1155762	1155773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022349	CTTTTT	2	12	1155876	1155887	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_022349	TTTAAA	2	12	1165139	1165150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022349	AAGTTA	2	12	1188263	1188274	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022349	AAAAAG	2	12	1323948	1323959	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022349	GAACCA	2	12	1337439	1337450	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_022349	TCAAAA	2	12	1352982	1352993	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_022349	AAATTG	2	12	1401693	1401704	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022349	AAAGAG	2	12	1426254	1426265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022349	TATCAA	2	12	1519027	1519038	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_022349	TGATAT	2	12	1522689	1522700	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022349	AAACAT	2	12	1604325	1604336	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_022349	ATTATG	2	12	1609098	1609109	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022349	CAATGC	2	12	1654151	1654162	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_022349	AGTATG	2	12	1826514	1826525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022349	ATTTCA	2	12	1847831	1847842	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_022349	ATATTT	2	12	1858798	1858809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022349	AAAATA	2	12	1875020	1875031	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022349	ATTTCA	2	12	1953359	1953370	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_022349	ATTTCA	2	12	1958881	1958892	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_022349	TAACCT	2	12	1976874	1976885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_022349	GTATCA	2	12	1977015	1977026	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_022349	GATCGA	2	12	2048898	2048909	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_022349	ATTTCA	2	12	2133827	2133838	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_022349	ATTTCA	2	12	2139533	2139544	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_022349	AGAGAT	9	54	2148287	2148340	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022349	TTGTTC	2	12	2154021	2154032	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_022349	ATTTCA	2	12	2182875	2182886	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_022349	ATTTCA	2	12	2262701	2262712	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_022349	TAAATA	2	12	2304920	2304931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022349	ATTTCA	2	12	2306510	2306521	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_022349	CAAAAA	2	12	2361797	2361808	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_022349	ATTTTT	2	12	2374818	2374829	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022349	GAAAAA	2	12	2377062	2377073	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022349	TGAAAT	2	12	2397785	2397796	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022349	CTTTTT	2	12	2435180	2435191	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_022349	AAATAA	2	12	2466359	2466370	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022349	TGAGTG	2	12	2481215	2481226	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022349	TATTTT	2	12	2482517	2482528	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022349	TTTTAA	2	12	2511376	2511387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022349	AAGTAG	3	18	2594288	2594305	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022349	CACCTA	2	12	2594372	2594383	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_022349	CTAGTT	2	12	2598201	2598212	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_022349	GTGTTT	2	12	2633598	2633609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022349	TGTTTT	2	12	2749103	2749114	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022349	TTTTCT	2	12	2832650	2832661	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_022349	ACCTTT	2	12	2869504	2869515	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_022349	CTTGTT	2	12	2869854	2869865	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_022349	AGAAAA	2	12	2898709	2898720	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022349	TTTGTT	2	12	2921774	2921785	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022349	TGAAAT	2	12	2939902	2939913	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022349	ATACAA	2	12	2962180	2962191	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_022349	TATTAG	2	12	2963101	2963112	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022349	TATTTT	2	12	3010443	3010454	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022349	ATGACA	2	12	3022568	3022579	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_022349	CTTTTT	2	12	3062435	3062446	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_022349	ACGTTT	2	12	3094611	3094622	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_022349	CTATTT	2	12	3145975	3145986	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_022349	TTTTTA	2	12	3153382	3153393	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022349	GAGATG	2	12	3163974	3163985	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022349	ATTCCC	2	12	3192089	3192100	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_022349	GAAAAC	2	12	3259797	3259808	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_022349	TTTACT	2	12	3303086	3303097	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.