MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio alginolyticus NBRC 15630 = ATCC 17749 chromosome 1

Total Repeats: 423

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022349	TTAAT	2	10	18338	18347	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022349	TATCA	2	10	18367	18376	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_022349	AAGGA	2	10	18490	18499	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022349	TTTTA	2	10	20808	20817	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022349	AAGCT	2	10	26180	26189	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_022349	AATGA	2	10	29204	29213	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022349	GTAAG	2	10	50310	50319	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022349	GCAAG	2	10	65445	65454	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_022349	TTATT	2	10	67779	67788	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022349	CAACA	2	10	76215	76224	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
11	NC_022349	AAATA	2	10	76234	76243	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022349	GTTTT	2	10	102765	102774	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022349	GAATA	2	10	111496	111505	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022349	ATAAG	2	10	120604	120613	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022349	AGAAA	2	10	120881	120890	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022349	TTTTC	2	10	141988	141997	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_022349	GTTTT	2	10	154142	154151	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022349	AACAT	2	10	154693	154702	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_022349	TTGCC	2	10	157649	157658	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_022349	GGTGT	2	10	158279	158288	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022349	TTTAT	2	10	166641	166650	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022349	TTTAT	2	10	167242	167251	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022349	ATTTC	2	10	180840	180849	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_022349	CAACA	2	10	189266	189275	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
25	NC_022349	TCCAT	2	10	201001	201010	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
26	NC_022349	CGTAT	2	10	207609	207618	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_022349	GTTAC	2	10	209575	209584	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_022349	TGGGT	2	10	210649	210658	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022349	AATTT	2	10	210768	210777	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022349	TGTGT	2	10	221778	221787	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022349	CGATT	2	10	228705	228714	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_022349	TCGTT	2	10	244291	244300	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_022349	CTTAA	2	10	272320	272329	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_022349	AAATG	2	10	275553	275562	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022349	AGGGT	2	10	275615	275624	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022349	GAATG	2	10	282246	282255	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022349	TGGTT	3	15	321325	321339	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022349	TAGGA	2	10	337558	337567	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022349	ACAAA	2	10	355159	355168	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_022349	AAAAC	2	10	357303	357312	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_022349	CTTTC	2	10	357856	357865	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
42	NC_022349	GTTTA	2	10	358158	358167	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022349	TTTTG	2	10	359214	359223	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022349	TCTTT	2	10	372657	372666	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_022349	CGCAG	2	10	393060	393069	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
46	NC_022349	TTAAT	2	10	397217	397226	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022349	ATCCA	2	10	399005	399014	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
48	NC_022349	TCTTG	2	10	410354	410363	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_022349	TTTAA	2	10	412925	412934	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022349	GGCTC	2	10	421885	421894	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
51	NC_022349	TGAAT	2	10	427891	427900	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022349	ATGCA	2	10	428163	428172	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_022349	GGAGG	2	10	429303	429312	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022349	AACAT	2	10	429939	429948	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_022349	TTTCA	2	10	432444	432453	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_022349	TTTAA	2	10	439431	439440	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022349	GTTTT	2	10	439517	439526	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022349	TAAAA	2	10	451515	451524	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022349	AGCAA	2	10	475507	475516	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_022349	TCAAC	2	10	479180	479189	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_022349	ATCAA	2	10	522082	522091	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_022349	TCATA	2	10	525040	525049	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_022349	TGTTT	2	10	525763	525772	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022349	TATTT	2	10	532717	532726	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022349	TTGTT	2	10	537394	537403	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022349	GCAAT	2	10	558591	558600	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_022349	GTTTT	2	10	561065	561074	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022349	AATTA	2	10	570091	570100	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022349	CAAAA	2	10	580807	580816	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_022349	CTTTT	2	10	583462	583471	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_022349	AAAAG	2	10	587053	587062	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022349	TCCCA	2	10	597645	597654	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
73	NC_022349	CATCT	2	10	614009	614018	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
74	NC_022349	GTAAG	2	10	634250	634259	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022349	TAAAT	2	10	645324	645333	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022349	TTGTC	2	10	647769	647778	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_022349	CCAAA	2	10	650166	650175	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
78	NC_022349	TAAAT	2	10	658508	658517	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022349	TCAAA	2	10	678616	678625	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_022349	GTTTG	2	10	679476	679485	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022349	CAAAT	2	10	679503	679512	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_022349	TAAAA	2	10	690295	690304	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022349	ATACA	2	10	697519	697528	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_022349	CAAAA	2	10	724567	724576	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_022349	TTTTA	2	10	761568	761577	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022349	TTAAA	2	10	764438	764447	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022349	CAAAA	2	10	779027	779036	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_022349	TTTAT	2	10	780341	780350	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022349	GGCGA	2	10	781512	781521	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
90	NC_022349	AATTG	2	10	784355	784364	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022349	CTTTT	2	10	792416	792425	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_022349	ATCTA	2	10	794468	794477	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_022349	TATCT	2	10	794501	794510	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_022349	ATCTT	2	10	801280	801289	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_022349	AATGG	2	10	803633	803642	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022349	GTTTA	2	10	814693	814702	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022349	TCATC	2	10	826159	826168	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
98	NC_022349	AAAGA	2	10	854982	854991	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022349	AAATT	2	10	855228	855237	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022349	GCCAA	2	10	855276	855285	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_022349	TTTAT	2	10	855433	855442	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022349	GATTA	2	10	877298	877307	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022349	AATTA	2	10	878402	878411	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022349	AATTA	2	10	896838	896847	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022349	CGATT	2	10	899340	899349	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_022349	TGCTT	2	10	903246	903255	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_022349	CTGAT	2	10	912321	912330	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_022349	TTACC	2	10	914425	914434	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
109	NC_022349	AGGTT	2	10	914591	914600	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022349	TCTCT	2	10	921019	921028	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
111	NC_022349	AGTTC	2	10	941300	941309	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_022349	AGCGA	2	10	943925	943934	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
113	NC_022349	AAGCT	2	10	948405	948414	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_022349	CCACA	2	10	952011	952020	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
115	NC_022349	AGCGA	2	10	953514	953523	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_022349	AACTG	2	10	953627	953636	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_022349	AGCGA	2	10	954303	954312	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
118	NC_022349	ACTAA	2	10	955574	955583	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_022349	AACAA	2	10	956486	956495	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_022349	AACTT	2	10	957573	957582	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_022349	AGCGA	2	10	957738	957747	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
122	NC_022349	CCAAA	2	10	960737	960746	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
123	NC_022349	AAAGC	2	10	965805	965814	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_022349	TTTGA	2	10	967239	967248	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022349	ACGCA	2	10	967650	967659	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
126	NC_022349	TCACA	2	10	968527	968536	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
127	NC_022349	ACGCA	2	10	971250	971259	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
128	NC_022349	ACCTA	2	10	973066	973075	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
129	NC_022349	ATTTG	2	10	973852	973861	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022349	ACGCA	2	10	976423	976432	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
131	NC_022349	ACGCA	2	10	977499	977508	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
132	NC_022349	AACCA	2	10	980039	980048	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
133	NC_022349	GCCAA	2	10	980199	980208	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
134	NC_022349	ACGCA	2	10	980502	980511	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
135	NC_022349	ACGCA	2	10	980922	980931	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
136	NC_022349	ACGCA	2	10	983737	983746	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
137	NC_022349	ACGCA	2	10	988631	988640	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
138	NC_022349	ACGCA	2	10	990753	990762	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
139	NC_022349	ACGCA	2	10	993308	993317	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
140	NC_022349	ACGCA	2	10	998316	998325	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
141	NC_022349	ACGCA	2	10	1000412	1000421	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
142	NC_022349	AGCGA	2	10	1003302	1003311	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
143	NC_022349	AAAGC	2	10	1004688	1004697	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_022349	CATGC	2	10	1018953	1018962	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
145	NC_022349	TCACA	2	10	1037598	1037607	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
146	NC_022349	GTTGA	2	10	1039493	1039502	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022349	CCTAA	2	10	1041256	1041265	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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267	NC_022349	TCGGT	2	10	2135108	2135117	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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279	NC_022349	CTTTA	2	10	2185350	2185359	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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283	NC_022349	TAAAA	2	10	2233393	2233402	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_022349	TTATT	2	10	2253165	2253174	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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422	NC_022349	TTTCG	2	10	3307674	3307683	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
423	NC_022349	GGGAT	2	10	3313701	3313710	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.