MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter coli CVM N29710

Total Repeats: 264

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022347	GAAAA	2	10	1336	1345	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022347	AAAAT	2	10	6012	6021	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022347	TTTTA	2	10	9352	9361	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022347	TTTTA	2	10	24708	24717	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022347	GGTAA	2	10	36842	36851	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022347	TCGTG	2	10	37638	37647	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_022347	TCTTT	2	10	38577	38586	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_022347	TTAAA	2	10	38652	38661	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022347	CCGTA	2	10	40744	40753	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_022347	TAAAA	2	10	42159	42168	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022347	AAGAT	2	10	42211	42220	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022347	TTTAT	2	10	43232	43241	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022347	AAATT	2	10	66511	66520	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022347	TTAAA	2	10	66833	66842	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022347	TTTAT	2	10	70420	70429	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022347	AAAAT	2	10	91206	91215	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022347	TTTTA	2	10	92991	93000	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022347	AATTT	2	10	97117	97126	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022347	ATTAA	2	10	99190	99199	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022347	AAAAT	2	10	139365	139374	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022347	TAAAA	2	10	139580	139589	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022347	CGATT	2	10	139603	139612	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_022347	CAAAG	2	10	145171	145180	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_022347	TGATT	2	10	146101	146110	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022347	TTCAC	2	10	146987	146996	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
26	NC_022347	ATCAA	2	10	154180	154189	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_022347	TGTAT	2	10	156926	156935	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022347	TAAAA	2	10	184522	184531	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022347	TAGCA	2	10	187169	187178	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_022347	TTCTT	2	10	187778	187787	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_022347	CATTG	2	10	188257	188266	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_022347	TTAAA	2	10	189841	189850	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022347	ATTTT	2	10	201579	201588	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022347	TTTTG	2	10	217427	217436	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022347	AAGTG	2	10	217717	217726	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022347	ACCTA	2	10	217830	217839	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_022347	TAAAA	2	10	226470	226479	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022347	GCGTG	2	10	226892	226901	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
39	NC_022347	TAAAA	2	10	229855	229864	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022347	TTTTA	2	10	232002	232011	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022347	AAATT	2	10	234540	234549	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022347	AATTT	2	10	252093	252102	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022347	GTTTT	2	10	265279	265288	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022347	TTTTA	2	10	276502	276511	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022347	TTAAA	2	10	283216	283225	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022347	TATAA	2	10	289994	290003	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022347	TAATA	2	10	302030	302039	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022347	TTAAT	2	10	323857	323866	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022347	TTTTC	2	10	368759	368768	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_022347	TAAAT	2	10	384853	384862	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022347	ATTAT	2	10	387754	387763	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022347	TAAAA	2	10	387786	387795	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022347	ATTGT	2	10	389347	389356	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022347	TAAAA	2	10	389504	389513	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022347	TAAAA	2	10	395026	395035	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022347	AAAAT	2	10	421487	421496	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022347	ATTTT	2	10	421850	421859	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022347	AAAAT	2	10	426599	426608	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022347	TAAAA	2	10	426616	426625	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022347	TTTAA	2	10	426670	426679	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022347	ATTTT	2	10	444955	444964	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022347	TTAAT	2	10	454711	454720	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022347	TTTTA	2	10	462600	462609	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022347	AATAA	2	10	462642	462651	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022347	AAATT	2	10	463957	463966	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022347	GTTTT	2	10	465962	465971	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022347	TAATA	2	10	469577	469586	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022347	AAAAT	2	10	470613	470622	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022347	ATTTT	2	10	476040	476049	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022347	ATTGT	2	10	476401	476410	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022347	ATTTT	2	10	480151	480160	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022347	ATTTT	2	10	488926	488935	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022347	TTAAA	2	10	488947	488956	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022347	ATTTT	2	10	489076	489085	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022347	ATTTT	2	10	510998	511007	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022347	CAAAG	2	10	535356	535365	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_022347	AAGAG	2	10	538538	538547	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022347	TTTAG	2	10	548487	548496	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022347	ATTTT	2	10	550637	550646	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022347	CGTAT	2	10	554465	554474	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_022347	ATAAA	2	10	554926	554935	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022347	TTAAA	2	10	555043	555052	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022347	TAAAA	2	10	562310	562319	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022347	TAATT	2	10	581679	581688	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022347	ATAAA	2	10	589933	589942	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022347	TTTAT	2	10	603330	603339	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022347	CTTTG	2	10	620459	620468	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_022347	TATAG	2	10	698574	698583	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022347	GAATG	2	10	700264	700273	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022347	GCTTT	2	10	700448	700457	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_022347	AGCAA	2	10	700752	700761	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_022347	AAAAC	2	10	725034	725043	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_022347	ATTTT	2	10	733300	733309	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022347	AAACA	2	10	734527	734536	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_022347	GAAAT	2	10	736584	736593	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022347	TACAA	2	10	736707	736716	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_022347	TAAAT	2	10	758850	758859	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022347	ATAAA	2	10	767239	767248	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022347	TTTAA	2	10	777644	777653	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022347	AAGAG	2	10	787181	787190	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022347	GAAAT	2	10	787655	787664	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022347	TTTCT	2	10	787782	787791	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_022347	TTTAT	2	10	790769	790778	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022347	TTTTA	2	10	794750	794759	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022347	TGTAT	2	10	815303	815312	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022347	ATTTT	2	10	815597	815606	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022347	GAAAA	2	10	815924	815933	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022347	ATTTT	2	10	822040	822049	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022347	AACCA	2	10	835606	835615	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
110	NC_022347	TAACA	2	10	837041	837050	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_022347	ATTTT	2	10	841697	841706	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022347	ATAAA	2	10	842711	842720	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022347	CAAAA	2	10	850587	850596	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_022347	ATTTT	2	10	863553	863562	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022347	ATTTT	2	10	874112	874121	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022347	TAAAA	2	10	878881	878890	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022347	ATTTT	2	10	891102	891111	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022347	TTAAA	2	10	891645	891654	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022347	ATTTA	2	10	913625	913634	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022347	ATTTT	2	10	921316	921325	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022347	ATCAA	2	10	921340	921349	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_022347	GAATA	2	10	928402	928411	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022347	TAAAA	2	10	928758	928767	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022347	ATAAG	2	10	929244	929253	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022347	TTTGA	2	10	929443	929452	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022347	TCTCT	2	10	929956	929965	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
127	NC_022347	AGCAA	2	10	942859	942868	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_022347	ATTTT	2	10	946589	946598	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022347	GATTT	2	10	948126	948135	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022347	TTAAA	2	10	959404	959413	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022347	ATTTT	2	10	967360	967369	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022347	TTATT	2	10	969605	969614	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022347	AAATT	2	10	975942	975951	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022347	TTAAA	2	10	984622	984631	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022347	TCTTA	2	10	990573	990582	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_022347	AAAAT	2	10	1005906	1005915	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022347	CTAAT	2	10	1006034	1006043	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_022347	TTTAA	2	10	1015202	1015211	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022347	CTACC	2	10	1017983	1017992	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
140	NC_022347	ATTTT	2	10	1026752	1026761	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022347	CAAAT	2	10	1026796	1026805	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_022347	ATTGA	2	10	1031128	1031137	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022347	TAAAA	2	10	1031167	1031176	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022347	GCTTT	2	10	1035327	1035336	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
145	NC_022347	TAAAC	2	10	1036223	1036232	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_022347	CAACC	2	10	1036288	1036297	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
147	NC_022347	ATTAA	2	10	1036393	1036402	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_022347	ATCTT	2	10	1037040	1037049	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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158	NC_022347	TAAAA	2	10	1056356	1056365	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_022347	ATTTT	2	10	1212463	1212472	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_022347	TAAAA	2	10	1240210	1240219	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.