MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Vibrio campbellii ATCC BAA-1116 plasmid

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022271	GATTG	2	10	1302	1311	20 %	40 %	40 %	0 %	541872157
2	NC_022271	GAGCC	2	10	3196	3205	20 %	0 %	40 %	40 %	541872145
3	NC_022271	GAATT	2	10	3386	3395	40 %	40 %	20 %	0 %	541872158
4	NC_022271	GGGCA	2	10	5273	5282	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5	NC_022271	AGTAA	2	10	6833	6842	60 %	20 %	20 %	0 %	541872163
6	NC_022271	ACAAG	2	10	7292	7301	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_022271	ACAAA	2	10	8320	8329	80 %	0 %	0 %	20 %	541872165
8	NC_022271	CCAAC	2	10	8814	8823	40 %	0 %	0 %	60 %	541872165
9	NC_022271	TTCGA	2	10	10849	10858	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_022271	TGTCT	2	10	11272	11281	0 %	60 %	20 %	20 %	541872166
11	NC_022271	ATTAC	4	20	15804	15823	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_022271	TTTGG	2	10	19101	19110	0 %	60 %	40 %	0 %	541872177
13	NC_022271	AGAGC	2	10	24551	24560	40 %	0 %	40 %	20 %	541872182
14	NC_022271	CAATG	2	10	25440	25449	40 %	20 %	20 %	20 %	541872184
15	NC_022271	TTGCG	2	10	30018	30027	0 %	40 %	40 %	20 %	541872148
16	NC_022271	GCTTG	2	10	36704	36713	0 %	40 %	40 %	20 %	541872192
17	NC_022271	ATCAC	2	10	36859	36868	40 %	20 %	0 %	40 %	541872192
18	NC_022271	GAACA	2	10	38140	38149	60 %	0 %	20 %	20 %	541872195
19	NC_022271	TTTTC	2	10	39020	39029	0 %	80 %	0 %	20 %	541872196
20	NC_022271	CATTT	2	10	42259	42268	20 %	60 %	0 %	20 %	541872199
21	NC_022271	ACTCA	2	10	43420	43429	40 %	20 %	0 %	40 %	541872201
22	NC_022271	CATTT	2	10	44020	44029	20 %	60 %	0 %	20 %	541872203
23	NC_022271	TGAGT	2	10	44767	44776	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022271	TGCAT	2	10	47196	47205	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_022271	TTTAA	2	10	47447	47456	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022271	TCGCT	2	10	48766	48775	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_022271	TTGAT	2	10	49889	49898	20 %	60 %	20 %	0 %	541872210
28	NC_022271	AATGA	2	10	50960	50969	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022271	TAATG	2	10	52327	52336	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022271	TAAGG	2	10	52530	52539	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022271	CGAAA	2	10	53740	53749	60 %	0 %	20 %	20 %	541872215
32	NC_022271	CACTG	2	10	60378	60387	20 %	20 %	20 %	40 %	541872223
33	NC_022271	AGCGC	2	10	60899	60908	20 %	0 %	40 %	40 %	541872223
34	NC_022271	TCCAT	2	10	63389	63398	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
35	NC_022271	TCTTG	2	10	64386	64395	0 %	60 %	20 %	20 %	541872226
36	NC_022271	CCGCG	2	10	66017	66026	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
37	NC_022271	CGTTA	2	10	66248	66257	20 %	40 %	20 %	20 %	541872227
38	NC_022271	ACGAC	2	10	66786	66795	40 %	0 %	20 %	40 %	541872228
39	NC_022271	TGGTT	2	10	66804	66813	0 %	60 %	40 %	0 %	541872228
40	NC_022271	CTCTA	2	10	67275	67284	20 %	40 %	0 %	40 %	541872229
41	NC_022271	TTTGG	2	10	67849	67858	0 %	60 %	40 %	0 %	541872230
42	NC_022271	TTTGT	2	10	70234	70243	0 %	80 %	20 %	0 %	541872232
43	NC_022271	AAGGA	2	10	73064	73073	60 %	0 %	40 %	0 %	541872235
44	NC_022271	GTCCA	2	10	74730	74739	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
45	NC_022271	ATTCA	2	10	77721	77730	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_022271	AAGAA	2	10	81033	81042	80 %	0 %	20 %	0 %	541872238
47	NC_022271	AGAGG	2	10	82213	82222	40 %	0 %	60 %	0 %	541872239
48	NC_022271	TTGGC	2	10	82295	82304	0 %	40 %	40 %	20 %	541872239
49	NC_022271	TAAAA	2	10	84036	84045	80 %	20 %	0 %	0 %	541872240

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.