MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Vibrio campbellii ATCC BAA-1116 plasmid

Total Repeats: 227

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022271	TTCT	2	8	990	997	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_022271	GAAA	2	8	1140	1147	75 %	0 %	25 %	0 %	541872156
3	NC_022271	GTTC	2	8	2076	2083	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_022271	TGAC	2	8	2414	2421	25 %	25 %	25 %	25 %	541872145
5	NC_022271	GATG	2	8	2616	2623	25 %	25 %	50 %	0 %	541872145
6	NC_022271	GTTG	2	8	3973	3980	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022271	GTTC	2	8	4242	4249	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_022271	TGAC	2	8	4580	4587	25 %	25 %	25 %	25 %	541872159
9	NC_022271	GTAT	2	8	5403	5410	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022271	GGTA	2	8	5606	5613	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022271	ATAG	2	8	5634	5641	50 %	25 %	25 %	0 %	541872161
12	NC_022271	TGAG	2	8	5799	5806	25 %	25 %	50 %	0 %	541872161
13	NC_022271	CTCG	2	8	5923	5930	0 %	25 %	25 %	50 %	541872161
14	NC_022271	TAAA	2	8	6492	6499	75 %	25 %	0 %	0 %	541872162
15	NC_022271	ACTA	2	8	7190	7197	50 %	25 %	0 %	25 %	541872163
16	NC_022271	AAAG	2	8	7540	7547	75 %	0 %	25 %	0 %	541872164
17	NC_022271	ATGA	2	8	7831	7838	50 %	25 %	25 %	0 %	541872164
18	NC_022271	CAAA	2	8	9143	9150	75 %	0 %	0 %	25 %	541872165
19	NC_022271	GAAG	2	8	10187	10194	50 %	0 %	50 %	0 %	541872165
20	NC_022271	AAAG	2	8	10712	10719	75 %	0 %	25 %	0 %	541872165
21	NC_022271	AATT	2	8	11089	11096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022271	TTTA	2	8	11118	11125	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022271	TTAA	2	8	11573	11580	50 %	50 %	0 %	0 %	541872166
24	NC_022271	AAAG	2	8	11732	11739	75 %	0 %	25 %	0 %	541872166
25	NC_022271	GATA	2	8	12538	12545	50 %	25 %	25 %	0 %	541872168
26	NC_022271	CCAT	2	8	14713	14720	25 %	25 %	0 %	50 %	541872171
27	NC_022271	ACTG	2	8	14774	14781	25 %	25 %	25 %	25 %	541872171
28	NC_022271	ATCA	2	8	15659	15666	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_022271	CCAT	2	8	16980	16987	25 %	25 %	0 %	50 %	541872175
30	NC_022271	ACTG	2	8	17041	17048	25 %	25 %	25 %	25 %	541872175
31	NC_022271	ATCA	2	8	17926	17933	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_022271	TCAC	2	8	18613	18620	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_022271	ATAG	2	8	19609	19616	50 %	25 %	25 %	0 %	541872178
34	NC_022271	AAGC	2	8	20756	20763	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_022271	TTTG	2	8	21113	21120	0 %	75 %	25 %	0 %	541872180
36	NC_022271	CGCT	2	8	21314	21321	0 %	25 %	25 %	50 %	541872180
37	NC_022271	GATT	2	8	21371	21378	25 %	50 %	25 %	0 %	541872180
38	NC_022271	TGGT	2	8	22346	22353	0 %	50 %	50 %	0 %	541872181
39	NC_022271	ACTT	2	8	22459	22466	25 %	50 %	0 %	25 %	541872181
40	NC_022271	AGTG	2	8	22682	22689	25 %	25 %	50 %	0 %	541872181
41	NC_022271	TGAT	2	8	23289	23296	25 %	50 %	25 %	0 %	541872181
42	NC_022271	AACC	2	8	24134	24141	50 %	0 %	0 %	50 %	541872182
43	NC_022271	AGTG	2	8	24541	24548	25 %	25 %	50 %	0 %	541872182
44	NC_022271	AATG	2	8	24879	24886	50 %	25 %	25 %	0 %	541872183
45	NC_022271	GAAA	2	8	24917	24924	75 %	0 %	25 %	0 %	541872183
46	NC_022271	TCTA	2	8	25476	25483	25 %	50 %	0 %	25 %	541872184
47	NC_022271	ATGA	2	8	25525	25532	50 %	25 %	25 %	0 %	541872184
48	NC_022271	ATCT	2	8	25601	25608	25 %	50 %	0 %	25 %	541872184
49	NC_022271	ACTT	2	8	25700	25707	25 %	50 %	0 %	25 %	541872184
50	NC_022271	TAGA	2	8	25880	25887	50 %	25 %	25 %	0 %	541872184
51	NC_022271	TCAT	2	8	26478	26485	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_022271	CATT	2	8	26581	26588	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_022271	TAAC	2	8	26593	26600	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_022271	CTTT	2	8	26890	26897	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_022271	TGAT	2	8	27202	27209	25 %	50 %	25 %	0 %	541872146
56	NC_022271	CAAT	2	8	27753	27760	50 %	25 %	0 %	25 %	541872147
57	NC_022271	GTTT	2	8	27937	27944	0 %	75 %	25 %	0 %	541872147
58	NC_022271	AATC	2	8	28555	28562	50 %	25 %	0 %	25 %	541872147
59	NC_022271	TAAG	2	8	28790	28797	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022271	TCAG	2	8	28958	28965	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_022271	CTTT	2	8	29117	29124	0 %	75 %	0 %	25 %	541872148
62	NC_022271	ACCA	2	8	29378	29385	50 %	0 %	0 %	50 %	541872148
63	NC_022271	GCTT	2	8	29551	29558	0 %	50 %	25 %	25 %	541872148
64	NC_022271	CTTG	2	8	29627	29634	0 %	50 %	25 %	25 %	541872148
65	NC_022271	AAAC	2	8	30090	30097	75 %	0 %	0 %	25 %	541872148
66	NC_022271	GGCT	2	8	30149	30156	0 %	25 %	50 %	25 %	541872148
67	NC_022271	GTGC	2	8	30479	30486	0 %	25 %	50 %	25 %	541872148
68	NC_022271	TGAA	2	8	30547	30554	50 %	25 %	25 %	0 %	541872148
69	NC_022271	TAGG	2	8	31124	31131	25 %	25 %	50 %	0 %	541872148
70	NC_022271	AGGG	2	8	31297	31304	25 %	0 %	75 %	0 %	541872148
71	NC_022271	AAAC	2	8	31667	31674	75 %	0 %	0 %	25 %	541872187
72	NC_022271	GACT	2	8	32147	32154	25 %	25 %	25 %	25 %	541872188
73	NC_022271	GCTG	2	8	32521	32528	0 %	25 %	50 %	25 %	541872188
74	NC_022271	GTCG	2	8	33342	33349	0 %	25 %	50 %	25 %	541872188
75	NC_022271	TGGC	2	8	33385	33392	0 %	25 %	50 %	25 %	541872188
76	NC_022271	TTTG	2	8	34217	34224	0 %	75 %	25 %	0 %	541872189
77	NC_022271	ATTG	2	8	34646	34653	25 %	50 %	25 %	0 %	541872189
78	NC_022271	ACCA	2	8	35015	35022	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_022271	AGGA	2	8	35247	35254	50 %	0 %	50 %	0 %	541872191
80	NC_022271	TTGC	2	8	35603	35610	0 %	50 %	25 %	25 %	541872191
81	NC_022271	TTGC	2	8	35857	35864	0 %	50 %	25 %	25 %	541872191
82	NC_022271	GCTT	2	8	35871	35878	0 %	50 %	25 %	25 %	541872191
83	NC_022271	CACG	2	8	36737	36744	25 %	0 %	25 %	50 %	541872192
84	NC_022271	GGTA	2	8	37107	37114	25 %	25 %	50 %	0 %	541872193
85	NC_022271	GCTT	2	8	37656	37663	0 %	50 %	25 %	25 %	541872193
86	NC_022271	GGTT	2	8	37676	37683	0 %	50 %	50 %	0 %	541872193
87	NC_022271	GAAA	2	8	38360	38367	75 %	0 %	25 %	0 %	541872195
88	NC_022271	CAAT	2	8	38468	38475	50 %	25 %	0 %	25 %	541872195
89	NC_022271	TTCG	2	8	39389	39396	0 %	50 %	25 %	25 %	541872197
90	NC_022271	TTGA	2	8	39657	39664	25 %	50 %	25 %	0 %	541872197
91	NC_022271	TGTT	2	8	40127	40134	0 %	75 %	25 %	0 %	541872198
92	NC_022271	TCAT	2	8	40203	40210	25 %	50 %	0 %	25 %	541872198
93	NC_022271	AACA	2	8	40338	40345	75 %	0 %	0 %	25 %	541872198
94	NC_022271	TTGC	2	8	40432	40439	0 %	50 %	25 %	25 %	541872198
95	NC_022271	CAAG	2	8	40473	40480	50 %	0 %	25 %	25 %	541872198
96	NC_022271	TATC	2	8	40594	40601	25 %	50 %	0 %	25 %	541872198
97	NC_022271	CCTT	2	8	40740	40747	0 %	50 %	0 %	50 %	541872198
98	NC_022271	CTAT	2	8	41214	41221	25 %	50 %	0 %	25 %	541872198
99	NC_022271	ATCA	2	8	41375	41382	50 %	25 %	0 %	25 %	541872198
100	NC_022271	GTTG	2	8	41439	41446	0 %	50 %	50 %	0 %	541872198
101	NC_022271	AAGA	2	8	41650	41657	75 %	0 %	25 %	0 %	541872198
102	NC_022271	AAGG	2	8	42000	42007	50 %	0 %	50 %	0 %	541872198
103	NC_022271	GTCA	2	8	42128	42135	25 %	25 %	25 %	25 %	541872198
104	NC_022271	TGAA	2	8	42203	42210	50 %	25 %	25 %	0 %	541872199
105	NC_022271	CAGT	2	8	42383	42390	25 %	25 %	25 %	25 %	541872199
106	NC_022271	ACAA	2	8	42740	42747	75 %	0 %	0 %	25 %	541872200
107	NC_022271	GCTT	2	8	42872	42879	0 %	50 %	25 %	25 %	541872201
108	NC_022271	GTTG	2	8	43866	43873	0 %	50 %	50 %	0 %	541872203
109	NC_022271	GTTC	2	8	44080	44087	0 %	50 %	25 %	25 %	541872204
110	NC_022271	TTGA	2	8	44135	44142	25 %	50 %	25 %	0 %	541872204
111	NC_022271	AGCG	2	8	45090	45097	25 %	0 %	50 %	25 %	541872205
112	NC_022271	AAGT	2	8	45152	45159	50 %	25 %	25 %	0 %	541872205
113	NC_022271	AACG	2	8	45435	45442	50 %	0 %	25 %	25 %	541872206
114	NC_022271	AAGT	2	8	45493	45500	50 %	25 %	25 %	0 %	541872206
115	NC_022271	CAAA	2	8	45563	45570	75 %	0 %	0 %	25 %	541872206
116	NC_022271	CAAA	2	8	45656	45663	75 %	0 %	0 %	25 %	541872206
117	NC_022271	TTGA	2	8	45722	45729	25 %	50 %	25 %	0 %	541872206
118	NC_022271	GTAA	2	8	46696	46703	50 %	25 %	25 %	0 %	541872207
119	NC_022271	GACT	2	8	46826	46833	25 %	25 %	25 %	25 %	541872207
120	NC_022271	ATAA	2	8	47075	47082	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022271	AAAT	2	8	47095	47102	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022271	CAGA	2	8	48359	48366	50 %	0 %	25 %	25 %	541872208
123	NC_022271	TTTC	2	8	48555	48562	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_022271	AATA	2	8	48733	48740	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022271	AATA	2	8	48745	48752	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022271	CAGC	2	8	48851	48858	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_022271	GCTG	2	8	48897	48904	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_022271	GGTA	2	8	50432	50439	25 %	25 %	50 %	0 %	541872210
129	NC_022271	GGGT	2	8	50622	50629	0 %	25 %	75 %	0 %	541872211
130	NC_022271	TGAT	2	8	50734	50741	25 %	50 %	25 %	0 %	541872211
131	NC_022271	GAAG	2	8	51788	51795	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022271	TTAG	2	8	52229	52236	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022271	AGTT	2	8	52343	52350	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022271	CAAC	2	8	52399	52406	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_022271	TTTC	2	8	53025	53032	0 %	75 %	0 %	25 %	541872214
136	NC_022271	TTTG	2	8	53140	53147	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022271	TATG	3	12	53148	53159	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022271	GTTT	2	8	53163	53170	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022271	ACAA	2	8	53187	53194	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_022271	CCGT	2	8	53335	53342	0 %	25 %	25 %	50 %	541872215
141	NC_022271	CGAA	2	8	53565	53572	50 %	0 %	25 %	25 %	541872215
142	NC_022271	AGTG	2	8	54349	54356	25 %	25 %	50 %	0 %	541872216
143	NC_022271	TTTG	2	8	54496	54503	0 %	75 %	25 %	0 %	541872216
144	NC_022271	CGTT	2	8	54848	54855	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_022271	GATA	2	8	55125	55132	50 %	25 %	25 %	0 %	541872217
146	NC_022271	CAAC	2	8	55435	55442	50 %	0 %	0 %	50 %	541872217
147	NC_022271	CCAT	2	8	57446	57453	25 %	25 %	0 %	50 %	541872220
148	NC_022271	GGCT	2	8	57510	57517	0 %	25 %	50 %	25 %	541872220
149	NC_022271	CTTG	2	8	57855	57862	0 %	50 %	25 %	25 %	541872220
150	NC_022271	TAAG	2	8	58056	58063	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_022271	TAAA	2	8	58229	58236	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_022271	AACG	2	8	59439	59446	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
153	NC_022271	TGGC	2	8	59543	59550	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
154	NC_022271	AAAC	2	8	59934	59941	75 %	0 %	0 %	25 %	541872222
155	NC_022271	TGAG	2	8	61541	61548	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
156	NC_022271	GCTA	2	8	61582	61589	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
157	NC_022271	TTTC	2	8	61839	61846	0 %	75 %	0 %	25 %	541872150
158	NC_022271	CAAT	2	8	62774	62781	50 %	25 %	0 %	25 %	541872225
159	NC_022271	TTGC	2	8	63240	63247	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
160	NC_022271	CATA	2	8	63304	63311	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
161	NC_022271	AGAA	2	8	63670	63677	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
162	NC_022271	TAGG	2	8	63984	63991	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
163	NC_022271	TCTT	2	8	64661	64668	0 %	75 %	0 %	25 %	541872226
164	NC_022271	CTTT	2	8	65190	65197	0 %	75 %	0 %	25 %	541872226
165	NC_022271	GGGA	2	8	65547	65554	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
166	NC_022271	GCTT	2	8	65560	65567	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
167	NC_022271	TGAT	2	8	65615	65622	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
168	NC_022271	CAAT	2	8	65640	65647	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
169	NC_022271	CTGT	2	8	65671	65678	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
170	NC_022271	GGTT	2	8	65681	65688	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
171	NC_022271	CTAA	2	8	65777	65784	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
172	NC_022271	CACC	2	8	65942	65949	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
173	NC_022271	CGCA	2	8	66120	66127	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
174	NC_022271	CGGA	2	8	66889	66896	25 %	0 %	50 %	25 %	541872228
175	NC_022271	GAAC	2	8	67463	67470	50 %	0 %	25 %	25 %	541872229
176	NC_022271	TGGA	2	8	67751	67758	25 %	25 %	50 %	0 %	541872230
177	NC_022271	ATTT	2	8	67971	67978	25 %	75 %	0 %	0 %	541872230
178	NC_022271	GGCA	2	8	68101	68108	25 %	0 %	50 %	25 %	541872230
179	NC_022271	GATT	2	8	68160	68167	25 %	50 %	25 %	0 %	541872230
180	NC_022271	TGGC	2	8	68618	68625	0 %	25 %	50 %	25 %	541872231
181	NC_022271	ATTG	2	8	70161	70168	25 %	50 %	25 %	0 %	541872232
182	NC_022271	GAGT	2	8	70280	70287	25 %	25 %	50 %	0 %	541872232
183	NC_022271	CAAT	2	8	71785	71792	50 %	25 %	0 %	25 %	541872233
184	NC_022271	TGAA	2	8	71801	71808	50 %	25 %	25 %	0 %	541872234
185	NC_022271	GGTT	2	8	72479	72486	0 %	50 %	50 %	0 %	541872234
186	NC_022271	GGCT	2	8	72859	72866	0 %	25 %	50 %	25 %	541872235
187	NC_022271	ACGC	2	8	73198	73205	25 %	0 %	25 %	50 %	541872235
188	NC_022271	ACTT	2	8	73370	73377	25 %	50 %	0 %	25 %	541872235
189	NC_022271	GATT	2	8	73752	73759	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
190	NC_022271	CATA	2	8	74144	74151	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
191	NC_022271	AGTG	2	8	74211	74218	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
192	NC_022271	AAGT	2	8	74493	74500	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
193	NC_022271	ATTG	2	8	75166	75173	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
194	NC_022271	TAAG	2	8	75606	75613	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
195	NC_022271	GAAG	2	8	76090	76097	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
196	NC_022271	TCAC	2	8	76689	76696	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
197	NC_022271	ACAG	2	8	76858	76865	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
198	NC_022271	GTTC	2	8	76900	76907	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
199	NC_022271	GAAT	2	8	77007	77014	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
200	NC_022271	AATT	2	8	77061	77068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
201	NC_022271	AGTT	2	8	77503	77510	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
202	NC_022271	CCTG	2	8	78546	78553	0 %	25 %	25 %	50 %	541872152
203	NC_022271	TGCT	2	8	79189	79196	0 %	50 %	25 %	25 %	541872237
204	NC_022271	ACTT	2	8	79281	79288	25 %	50 %	0 %	25 %	541872237
205	NC_022271	TGGT	2	8	79445	79452	0 %	50 %	50 %	0 %	541872237
206	NC_022271	TGCT	2	8	79825	79832	0 %	50 %	25 %	25 %	541872237
207	NC_022271	CCAT	2	8	79943	79950	25 %	25 %	0 %	50 %	541872237
208	NC_022271	TAAG	2	8	80242	80249	50 %	25 %	25 %	0 %	541872237
209	NC_022271	GTTA	2	8	80688	80695	25 %	50 %	25 %	0 %	541872238
210	NC_022271	AGCT	2	8	80858	80865	25 %	25 %	25 %	25 %	541872238
211	NC_022271	CTTT	2	8	80965	80972	0 %	75 %	0 %	25 %	541872238
212	NC_022271	TGAT	2	8	81144	81151	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
213	NC_022271	TAAA	2	8	81351	81358	75 %	25 %	0 %	0 %	541872239
214	NC_022271	TCAC	2	8	81881	81888	25 %	25 %	0 %	50 %	541872239
215	NC_022271	GCAC	2	8	81933	81940	25 %	0 %	25 %	50 %	541872239
216	NC_022271	ATCA	2	8	82569	82576	50 %	25 %	0 %	25 %	541872153
217	NC_022271	CGAG	2	8	82754	82761	25 %	0 %	50 %	25 %	541872153
218	NC_022271	AGAA	2	8	83601	83608	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
219	NC_022271	TCAT	2	8	83932	83939	25 %	50 %	0 %	25 %	541872240
220	NC_022271	ACTC	2	8	84909	84916	25 %	25 %	0 %	50 %	541872241
221	NC_022271	TCAA	2	8	85027	85034	50 %	25 %	0 %	25 %	541872241
222	NC_022271	CCAA	2	8	85956	85963	50 %	0 %	0 %	50 %	541872241
223	NC_022271	GATA	2	8	86695	86702	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
224	NC_022271	TTCT	2	8	87025	87032	0 %	75 %	0 %	25 %	541872243
225	NC_022271	AAGC	2	8	87065	87072	50 %	0 %	25 %	25 %	541872243
226	NC_022271	AATG	2	8	87707	87714	50 %	25 %	25 %	0 %	541872243
227	NC_022271	CAAC	2	8	88104	88111	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.