MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio campbellii ATCC BAA-1116 plasmid

Total Repeats: 71

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022271	TTCT	2	8	990	997	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_022271	GTTC	2	8	2076	2083	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_022271	GTTG	2	8	3973	3980	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022271	GTTC	2	8	4242	4249	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_022271	GTAT	2	8	5403	5410	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022271	GGTA	2	8	5606	5613	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022271	AATT	2	8	11089	11096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022271	TTTA	2	8	11118	11125	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022271	ATCA	2	8	15659	15666	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_022271	ATCA	2	8	17926	17933	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_022271	TCAC	2	8	18613	18620	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_022271	AAGC	2	8	20756	20763	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_022271	TCAT	2	8	26478	26485	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_022271	CATT	2	8	26581	26588	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_022271	TAAC	2	8	26593	26600	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_022271	CTTT	2	8	26890	26897	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_022271	TAAG	2	8	28790	28797	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022271	TCAG	2	8	28958	28965	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_022271	ACCA	2	8	35015	35022	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_022271	ATAA	2	8	47075	47082	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022271	AAAT	2	8	47095	47102	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022271	TTTC	2	8	48555	48562	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_022271	AATA	2	8	48733	48740	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022271	AATA	2	8	48745	48752	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022271	CAGC	2	8	48851	48858	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_022271	GCTG	2	8	48897	48904	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_022271	GAAG	2	8	51788	51795	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022271	TTAG	2	8	52229	52236	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022271	AGTT	2	8	52343	52350	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022271	CAAC	2	8	52399	52406	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_022271	TTTG	2	8	53140	53147	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022271	TATG	3	12	53148	53159	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022271	GTTT	2	8	53163	53170	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022271	ACAA	2	8	53187	53194	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_022271	CGTT	2	8	54848	54855	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_022271	TAAG	2	8	58056	58063	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022271	TAAA	2	8	58229	58236	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022271	AACG	2	8	59439	59446	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_022271	TGGC	2	8	59543	59550	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_022271	TGAG	2	8	61541	61548	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022271	GCTA	2	8	61582	61589	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_022271	TTGC	2	8	63240	63247	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_022271	CATA	2	8	63304	63311	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_022271	AGAA	2	8	63670	63677	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022271	TAGG	2	8	63984	63991	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022271	GGGA	2	8	65547	65554	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022271	GCTT	2	8	65560	65567	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_022271	TGAT	2	8	65615	65622	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022271	CAAT	2	8	65640	65647	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_022271	CTGT	2	8	65671	65678	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_022271	GGTT	2	8	65681	65688	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022271	CTAA	2	8	65777	65784	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_022271	CACC	2	8	65942	65949	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
54	NC_022271	CGCA	2	8	66120	66127	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_022271	GATT	2	8	73752	73759	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022271	CATA	2	8	74144	74151	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_022271	AGTG	2	8	74211	74218	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022271	AAGT	2	8	74493	74500	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022271	ATTG	2	8	75166	75173	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022271	TAAG	2	8	75606	75613	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022271	GAAG	2	8	76090	76097	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022271	TCAC	2	8	76689	76696	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_022271	ACAG	2	8	76858	76865	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_022271	GTTC	2	8	76900	76907	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_022271	GAAT	2	8	77007	77014	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022271	AATT	2	8	77061	77068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022271	AGTT	2	8	77503	77510	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022271	TGAT	2	8	81144	81151	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022271	AGAA	2	8	83601	83608	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022271	GATA	2	8	86695	86702	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022271	CAAC	2	8	88104	88111	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.