MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Vibrio campbellii ATCC BAA-1116 plasmid

Total Repeats: 156

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022271	GAAA	2	8	1140	1147	75 %	0 %	25 %	0 %	541872156
2	NC_022271	TGAC	2	8	2414	2421	25 %	25 %	25 %	25 %	541872145
3	NC_022271	GATG	2	8	2616	2623	25 %	25 %	50 %	0 %	541872145
4	NC_022271	TGAC	2	8	4580	4587	25 %	25 %	25 %	25 %	541872159
5	NC_022271	ATAG	2	8	5634	5641	50 %	25 %	25 %	0 %	541872161
6	NC_022271	TGAG	2	8	5799	5806	25 %	25 %	50 %	0 %	541872161
7	NC_022271	CTCG	2	8	5923	5930	0 %	25 %	25 %	50 %	541872161
8	NC_022271	TAAA	2	8	6492	6499	75 %	25 %	0 %	0 %	541872162
9	NC_022271	ACTA	2	8	7190	7197	50 %	25 %	0 %	25 %	541872163
10	NC_022271	AAAG	2	8	7540	7547	75 %	0 %	25 %	0 %	541872164
11	NC_022271	ATGA	2	8	7831	7838	50 %	25 %	25 %	0 %	541872164
12	NC_022271	CAAA	2	8	9143	9150	75 %	0 %	0 %	25 %	541872165
13	NC_022271	GAAG	2	8	10187	10194	50 %	0 %	50 %	0 %	541872165
14	NC_022271	AAAG	2	8	10712	10719	75 %	0 %	25 %	0 %	541872165
15	NC_022271	TTAA	2	8	11573	11580	50 %	50 %	0 %	0 %	541872166
16	NC_022271	AAAG	2	8	11732	11739	75 %	0 %	25 %	0 %	541872166
17	NC_022271	GATA	2	8	12538	12545	50 %	25 %	25 %	0 %	541872168
18	NC_022271	CCAT	2	8	14713	14720	25 %	25 %	0 %	50 %	541872171
19	NC_022271	ACTG	2	8	14774	14781	25 %	25 %	25 %	25 %	541872171
20	NC_022271	CCAT	2	8	16980	16987	25 %	25 %	0 %	50 %	541872175
21	NC_022271	ACTG	2	8	17041	17048	25 %	25 %	25 %	25 %	541872175
22	NC_022271	ATAG	2	8	19609	19616	50 %	25 %	25 %	0 %	541872178
23	NC_022271	TTTG	2	8	21113	21120	0 %	75 %	25 %	0 %	541872180
24	NC_022271	CGCT	2	8	21314	21321	0 %	25 %	25 %	50 %	541872180
25	NC_022271	GATT	2	8	21371	21378	25 %	50 %	25 %	0 %	541872180
26	NC_022271	TGGT	2	8	22346	22353	0 %	50 %	50 %	0 %	541872181
27	NC_022271	ACTT	2	8	22459	22466	25 %	50 %	0 %	25 %	541872181
28	NC_022271	AGTG	2	8	22682	22689	25 %	25 %	50 %	0 %	541872181
29	NC_022271	TGAT	2	8	23289	23296	25 %	50 %	25 %	0 %	541872181
30	NC_022271	AACC	2	8	24134	24141	50 %	0 %	0 %	50 %	541872182
31	NC_022271	AGTG	2	8	24541	24548	25 %	25 %	50 %	0 %	541872182
32	NC_022271	AATG	2	8	24879	24886	50 %	25 %	25 %	0 %	541872183
33	NC_022271	GAAA	2	8	24917	24924	75 %	0 %	25 %	0 %	541872183
34	NC_022271	TCTA	2	8	25476	25483	25 %	50 %	0 %	25 %	541872184
35	NC_022271	ATGA	2	8	25525	25532	50 %	25 %	25 %	0 %	541872184
36	NC_022271	ATCT	2	8	25601	25608	25 %	50 %	0 %	25 %	541872184
37	NC_022271	ACTT	2	8	25700	25707	25 %	50 %	0 %	25 %	541872184
38	NC_022271	TAGA	2	8	25880	25887	50 %	25 %	25 %	0 %	541872184
39	NC_022271	TGAT	2	8	27202	27209	25 %	50 %	25 %	0 %	541872146
40	NC_022271	CAAT	2	8	27753	27760	50 %	25 %	0 %	25 %	541872147
41	NC_022271	GTTT	2	8	27937	27944	0 %	75 %	25 %	0 %	541872147
42	NC_022271	AATC	2	8	28555	28562	50 %	25 %	0 %	25 %	541872147
43	NC_022271	CTTT	2	8	29117	29124	0 %	75 %	0 %	25 %	541872148
44	NC_022271	ACCA	2	8	29378	29385	50 %	0 %	0 %	50 %	541872148
45	NC_022271	GCTT	2	8	29551	29558	0 %	50 %	25 %	25 %	541872148
46	NC_022271	CTTG	2	8	29627	29634	0 %	50 %	25 %	25 %	541872148
47	NC_022271	AAAC	2	8	30090	30097	75 %	0 %	0 %	25 %	541872148
48	NC_022271	GGCT	2	8	30149	30156	0 %	25 %	50 %	25 %	541872148
49	NC_022271	GTGC	2	8	30479	30486	0 %	25 %	50 %	25 %	541872148
50	NC_022271	TGAA	2	8	30547	30554	50 %	25 %	25 %	0 %	541872148
51	NC_022271	TAGG	2	8	31124	31131	25 %	25 %	50 %	0 %	541872148
52	NC_022271	AGGG	2	8	31297	31304	25 %	0 %	75 %	0 %	541872148
53	NC_022271	AAAC	2	8	31667	31674	75 %	0 %	0 %	25 %	541872187
54	NC_022271	GACT	2	8	32147	32154	25 %	25 %	25 %	25 %	541872188
55	NC_022271	GCTG	2	8	32521	32528	0 %	25 %	50 %	25 %	541872188
56	NC_022271	GTCG	2	8	33342	33349	0 %	25 %	50 %	25 %	541872188
57	NC_022271	TGGC	2	8	33385	33392	0 %	25 %	50 %	25 %	541872188
58	NC_022271	TTTG	2	8	34217	34224	0 %	75 %	25 %	0 %	541872189
59	NC_022271	ATTG	2	8	34646	34653	25 %	50 %	25 %	0 %	541872189
60	NC_022271	AGGA	2	8	35247	35254	50 %	0 %	50 %	0 %	541872191
61	NC_022271	TTGC	2	8	35603	35610	0 %	50 %	25 %	25 %	541872191
62	NC_022271	TTGC	2	8	35857	35864	0 %	50 %	25 %	25 %	541872191
63	NC_022271	GCTT	2	8	35871	35878	0 %	50 %	25 %	25 %	541872191
64	NC_022271	CACG	2	8	36737	36744	25 %	0 %	25 %	50 %	541872192
65	NC_022271	GGTA	2	8	37107	37114	25 %	25 %	50 %	0 %	541872193
66	NC_022271	GCTT	2	8	37656	37663	0 %	50 %	25 %	25 %	541872193
67	NC_022271	GGTT	2	8	37676	37683	0 %	50 %	50 %	0 %	541872193
68	NC_022271	GAAA	2	8	38360	38367	75 %	0 %	25 %	0 %	541872195
69	NC_022271	CAAT	2	8	38468	38475	50 %	25 %	0 %	25 %	541872195
70	NC_022271	TTCG	2	8	39389	39396	0 %	50 %	25 %	25 %	541872197
71	NC_022271	TTGA	2	8	39657	39664	25 %	50 %	25 %	0 %	541872197
72	NC_022271	TGTT	2	8	40127	40134	0 %	75 %	25 %	0 %	541872198
73	NC_022271	TCAT	2	8	40203	40210	25 %	50 %	0 %	25 %	541872198
74	NC_022271	AACA	2	8	40338	40345	75 %	0 %	0 %	25 %	541872198
75	NC_022271	TTGC	2	8	40432	40439	0 %	50 %	25 %	25 %	541872198
76	NC_022271	CAAG	2	8	40473	40480	50 %	0 %	25 %	25 %	541872198
77	NC_022271	TATC	2	8	40594	40601	25 %	50 %	0 %	25 %	541872198
78	NC_022271	CCTT	2	8	40740	40747	0 %	50 %	0 %	50 %	541872198
79	NC_022271	CTAT	2	8	41214	41221	25 %	50 %	0 %	25 %	541872198
80	NC_022271	ATCA	2	8	41375	41382	50 %	25 %	0 %	25 %	541872198
81	NC_022271	GTTG	2	8	41439	41446	0 %	50 %	50 %	0 %	541872198
82	NC_022271	AAGA	2	8	41650	41657	75 %	0 %	25 %	0 %	541872198
83	NC_022271	AAGG	2	8	42000	42007	50 %	0 %	50 %	0 %	541872198
84	NC_022271	GTCA	2	8	42128	42135	25 %	25 %	25 %	25 %	541872198
85	NC_022271	TGAA	2	8	42203	42210	50 %	25 %	25 %	0 %	541872199
86	NC_022271	CAGT	2	8	42383	42390	25 %	25 %	25 %	25 %	541872199
87	NC_022271	ACAA	2	8	42740	42747	75 %	0 %	0 %	25 %	541872200
88	NC_022271	GCTT	2	8	42872	42879	0 %	50 %	25 %	25 %	541872201
89	NC_022271	GTTG	2	8	43866	43873	0 %	50 %	50 %	0 %	541872203
90	NC_022271	GTTC	2	8	44080	44087	0 %	50 %	25 %	25 %	541872204
91	NC_022271	TTGA	2	8	44135	44142	25 %	50 %	25 %	0 %	541872204
92	NC_022271	AGCG	2	8	45090	45097	25 %	0 %	50 %	25 %	541872205
93	NC_022271	AAGT	2	8	45152	45159	50 %	25 %	25 %	0 %	541872205
94	NC_022271	AACG	2	8	45435	45442	50 %	0 %	25 %	25 %	541872206
95	NC_022271	AAGT	2	8	45493	45500	50 %	25 %	25 %	0 %	541872206
96	NC_022271	CAAA	2	8	45563	45570	75 %	0 %	0 %	25 %	541872206
97	NC_022271	CAAA	2	8	45656	45663	75 %	0 %	0 %	25 %	541872206
98	NC_022271	TTGA	2	8	45722	45729	25 %	50 %	25 %	0 %	541872206
99	NC_022271	GTAA	2	8	46696	46703	50 %	25 %	25 %	0 %	541872207
100	NC_022271	GACT	2	8	46826	46833	25 %	25 %	25 %	25 %	541872207
101	NC_022271	CAGA	2	8	48359	48366	50 %	0 %	25 %	25 %	541872208
102	NC_022271	GGTA	2	8	50432	50439	25 %	25 %	50 %	0 %	541872210
103	NC_022271	GGGT	2	8	50622	50629	0 %	25 %	75 %	0 %	541872211
104	NC_022271	TGAT	2	8	50734	50741	25 %	50 %	25 %	0 %	541872211
105	NC_022271	TTTC	2	8	53025	53032	0 %	75 %	0 %	25 %	541872214
106	NC_022271	CCGT	2	8	53335	53342	0 %	25 %	25 %	50 %	541872215
107	NC_022271	CGAA	2	8	53565	53572	50 %	0 %	25 %	25 %	541872215
108	NC_022271	AGTG	2	8	54349	54356	25 %	25 %	50 %	0 %	541872216
109	NC_022271	TTTG	2	8	54496	54503	0 %	75 %	25 %	0 %	541872216
110	NC_022271	GATA	2	8	55125	55132	50 %	25 %	25 %	0 %	541872217
111	NC_022271	CAAC	2	8	55435	55442	50 %	0 %	0 %	50 %	541872217
112	NC_022271	CCAT	2	8	57446	57453	25 %	25 %	0 %	50 %	541872220
113	NC_022271	GGCT	2	8	57510	57517	0 %	25 %	50 %	25 %	541872220
114	NC_022271	CTTG	2	8	57855	57862	0 %	50 %	25 %	25 %	541872220
115	NC_022271	AAAC	2	8	59934	59941	75 %	0 %	0 %	25 %	541872222
116	NC_022271	TTTC	2	8	61839	61846	0 %	75 %	0 %	25 %	541872150
117	NC_022271	CAAT	2	8	62774	62781	50 %	25 %	0 %	25 %	541872225
118	NC_022271	TCTT	2	8	64661	64668	0 %	75 %	0 %	25 %	541872226
119	NC_022271	CTTT	2	8	65190	65197	0 %	75 %	0 %	25 %	541872226
120	NC_022271	CGGA	2	8	66889	66896	25 %	0 %	50 %	25 %	541872228
121	NC_022271	GAAC	2	8	67463	67470	50 %	0 %	25 %	25 %	541872229
122	NC_022271	TGGA	2	8	67751	67758	25 %	25 %	50 %	0 %	541872230
123	NC_022271	ATTT	2	8	67971	67978	25 %	75 %	0 %	0 %	541872230
124	NC_022271	GGCA	2	8	68101	68108	25 %	0 %	50 %	25 %	541872230
125	NC_022271	GATT	2	8	68160	68167	25 %	50 %	25 %	0 %	541872230
126	NC_022271	TGGC	2	8	68618	68625	0 %	25 %	50 %	25 %	541872231
127	NC_022271	ATTG	2	8	70161	70168	25 %	50 %	25 %	0 %	541872232
128	NC_022271	GAGT	2	8	70280	70287	25 %	25 %	50 %	0 %	541872232
129	NC_022271	CAAT	2	8	71785	71792	50 %	25 %	0 %	25 %	541872233
130	NC_022271	TGAA	2	8	71801	71808	50 %	25 %	25 %	0 %	541872234
131	NC_022271	GGTT	2	8	72479	72486	0 %	50 %	50 %	0 %	541872234
132	NC_022271	GGCT	2	8	72859	72866	0 %	25 %	50 %	25 %	541872235
133	NC_022271	ACGC	2	8	73198	73205	25 %	0 %	25 %	50 %	541872235
134	NC_022271	ACTT	2	8	73370	73377	25 %	50 %	0 %	25 %	541872235
135	NC_022271	CCTG	2	8	78546	78553	0 %	25 %	25 %	50 %	541872152
136	NC_022271	TGCT	2	8	79189	79196	0 %	50 %	25 %	25 %	541872237
137	NC_022271	ACTT	2	8	79281	79288	25 %	50 %	0 %	25 %	541872237
138	NC_022271	TGGT	2	8	79445	79452	0 %	50 %	50 %	0 %	541872237
139	NC_022271	TGCT	2	8	79825	79832	0 %	50 %	25 %	25 %	541872237
140	NC_022271	CCAT	2	8	79943	79950	25 %	25 %	0 %	50 %	541872237
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155	NC_022271	AAGC	2	8	87065	87072	50 %	0 %	25 %	25 %	541872243
156	NC_022271	AATG	2	8	87707	87714	50 %	25 %	25 %	0 %	541872243

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.