MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Vibrio campbellii ATCC BAA-1116 plasmid

Total Repeats: 747

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022271	CGC	2	6	435	440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	541872154
2	NC_022271	CAT	2	6	583	588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541872155
3	NC_022271	TGA	2	6	589	594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541872155
4	NC_022271	CGA	2	6	646	651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541872155
5	NC_022271	GTC	3	9	1117	1125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541872156
6	NC_022271	GAA	2	6	1190	1195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	541872156
7	NC_022271	AGG	2	6	1336	1341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	541872157
8	NC_022271	CAG	2	6	1395	1400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541872157
9	NC_022271	TGT	2	6	1409	1414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	541872157
10	NC_022271	TGA	2	6	1547	1552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541872157
11	NC_022271	GTA	2	6	2633	2638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541872145
12	NC_022271	ATG	2	6	2777	2782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541872145
13	NC_022271	AGC	2	6	2913	2918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541872145
14	NC_022271	GGT	2	6	2976	2981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	541872145
15	NC_022271	GAA	2	6	2982	2987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	541872145
16	NC_022271	TTC	2	6	3066	3071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	541872145
17	NC_022271	CGC	2	6	3099	3104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	541872145
18	NC_022271	CGT	2	6	3214	3219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541872145
19	NC_022271	TTC	2	6	3363	3368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	541872158
20	NC_022271	TCG	2	6	3372	3377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541872158
21	NC_022271	AGT	2	6	3465	3470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541872158
22	NC_022271	TGT	2	6	4800	4805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	541872159
23	NC_022271	TGA	2	6	5020	5025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541872160
24	NC_022271	GCT	2	6	5042	5047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541872160
25	NC_022271	ATT	2	6	5066	5071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	541872160
26	NC_022271	TGC	2	6	5074	5079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541872160
27	NC_022271	AGA	2	6	5126	5131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	541872160
28	NC_022271	ACG	2	6	5143	5148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541872160
29	NC_022271	TCA	2	6	5212	5217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541872160
30	NC_022271	ACA	2	6	5238	5243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	541872160
31	NC_022271	TTG	2	6	5247	5252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	541872160
32	NC_022271	CAA	2	6	5664	5669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	541872161
33	NC_022271	GAA	3	9	5695	5703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	541872161
34	NC_022271	CTT	2	6	5790	5795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	541872161
35	NC_022271	TTG	2	6	5818	5823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	541872161
36	NC_022271	GCT	2	6	5847	5852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541872161
37	NC_022271	AGG	2	6	5910	5915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	541872161
38	NC_022271	TTC	2	6	5977	5982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	541872161
39	NC_022271	CAA	2	6	5988	5993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	541872161
40	NC_022271	GTT	2	6	6000	6005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	541872161
41	NC_022271	AGA	2	6	6372	6377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	541872162
42	NC_022271	AGT	2	6	6391	6396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541872162
43	NC_022271	TGT	2	6	6463	6468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	541872162
44	NC_022271	GGA	2	6	6561	6566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	541872162
45	NC_022271	ATG	2	6	6784	6789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541872162
46	NC_022271	GTT	2	6	6816	6821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	541872163
47	NC_022271	GTT	2	6	6868	6873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	541872163
48	NC_022271	CTT	2	6	6895	6900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	541872163
49	NC_022271	CGA	2	6	6973	6978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541872163
50	NC_022271	GCC	2	6	7118	7123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	541872163
51	NC_022271	TGG	2	6	7676	7681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	541872164
52	NC_022271	AAG	2	6	7771	7776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	541872164
53	NC_022271	GTG	2	6	7801	7806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	541872164
54	NC_022271	TGG	2	6	7898	7903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	541872165
55	NC_022271	ATT	2	6	8019	8024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	541872165
56	NC_022271	ATT	2	6	8056	8061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	541872165
57	NC_022271	AGA	2	6	8099	8104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	541872165
58	NC_022271	TCT	2	6	8148	8153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	541872165
59	NC_022271	GAA	2	6	8163	8168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	541872165
60	NC_022271	AGT	2	6	8234	8239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541872165
61	NC_022271	GAT	2	6	8289	8294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541872165
62	NC_022271	CAC	2	6	8519	8524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	541872165
63	NC_022271	AGA	2	6	8540	8545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	541872165
64	NC_022271	GTT	2	6	8650	8655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	541872165
65	NC_022271	AGC	2	6	8777	8782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541872165
66	NC_022271	CAG	2	6	9073	9078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541872165
67	NC_022271	GTC	2	6	9094	9099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541872165
68	NC_022271	CGA	2	6	9192	9197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541872165
69	NC_022271	AGT	2	6	9200	9205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541872165
70	NC_022271	GAC	2	6	9563	9568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541872165
71	NC_022271	GCA	2	6	9584	9589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541872165
72	NC_022271	AGC	2	6	9619	9624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541872165
73	NC_022271	CAT	2	6	9854	9859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541872165
74	NC_022271	CTG	2	6	9874	9879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541872165
75	NC_022271	TGA	2	6	9980	9985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541872165
76	NC_022271	GCG	2	6	10038	10043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	541872165
77	NC_022271	GCC	2	6	10053	10058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	541872165
78	NC_022271	GTG	2	6	10071	10076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	541872165
79	NC_022271	AAG	2	6	10158	10163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	541872165
80	NC_022271	TCG	2	6	10181	10186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541872165
81	NC_022271	CAA	2	6	10240	10245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	541872165
82	NC_022271	ACC	2	6	10260	10265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	541872165
83	NC_022271	CTG	2	6	10339	10344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541872165
84	NC_022271	AGA	2	6	10362	10367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	541872165
85	NC_022271	GCA	2	6	10514	10519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541872165
86	NC_022271	GAA	2	6	10649	10654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	541872165
87	NC_022271	AGG	2	6	10684	10689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	541872165
88	NC_022271	ATG	2	6	10750	10755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541872165
89	NC_022271	TCC	2	6	11295	11300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	541872166
90	NC_022271	ACT	2	6	11322	11327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541872166
91	NC_022271	AGA	2	6	11350	11355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	541872166
92	NC_022271	ATG	2	6	11411	11416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541872166
93	NC_022271	GAT	2	6	11459	11464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541872166
94	NC_022271	AAT	2	6	11546	11551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	541872166
95	NC_022271	GAT	2	6	11638	11643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541872166
96	NC_022271	AAT	2	6	11663	11668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	541872166
97	NC_022271	TTA	2	6	11778	11783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	541872166
98	NC_022271	TAT	2	6	11855	11860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	541872166
99	NC_022271	TAA	2	6	11893	11898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	541872166
100	NC_022271	TCA	2	6	12145	12150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541872167
101	NC_022271	CTC	2	6	12183	12188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	541872167
102	NC_022271	GTG	2	6	12238	12243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	541872167
103	NC_022271	CCT	2	6	12260	12265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	541872167
104	NC_022271	GTT	2	6	12303	12308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	541872167
105	NC_022271	CGA	2	6	12423	12428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541872168
106	NC_022271	ATT	2	6	12529	12534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	541872168
107	NC_022271	TTA	2	6	12627	12632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	541872168
108	NC_022271	TTG	2	6	12634	12639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	541872168
109	NC_022271	CTT	2	6	12808	12813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	541872168
110	NC_022271	TGA	2	6	12866	12871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541872168
111	NC_022271	CAT	2	6	12876	12881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541872168
112	NC_022271	AAG	2	6	12926	12931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	541872168
113	NC_022271	TCT	2	6	13055	13060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	541872168
114	NC_022271	GCG	2	6	13074	13079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	541872168
115	NC_022271	ACC	2	6	13094	13099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	541872168
116	NC_022271	TTG	2	6	13102	13107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	541872168
117	NC_022271	GAT	2	6	13264	13269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541872168
118	NC_022271	GAT	2	6	13306	13311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541872168
119	NC_022271	TGT	2	6	13344	13349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	541872168
120	NC_022271	GAC	2	6	13368	13373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541872168
121	NC_022271	CTG	2	6	13413	13418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541872168
122	NC_022271	GCA	2	6	13474	13479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541872168
123	NC_022271	GTC	2	6	13498	13503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541872168
124	NC_022271	CTT	2	6	13564	13569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	541872168
125	NC_022271	GTC	2	6	13580	13585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541872168
126	NC_022271	CTT	2	6	13602	13607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	541872168
127	NC_022271	CGC	2	6	14182	14187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	541872169
128	NC_022271	CAT	2	6	14330	14335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541872170
129	NC_022271	TGA	2	6	14336	14341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541872170
130	NC_022271	CGA	2	6	14393	14398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541872170
131	NC_022271	GCC	2	6	14876	14881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	541872171
132	NC_022271	CTT	2	6	15415	15420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	541872172
133	NC_022271	AGC	2	6	15477	15482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541872172
134	NC_022271	AGC	2	6	15560	15565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541872172
135	NC_022271	CAT	2	6	15962	15967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541872173
136	NC_022271	CAG	2	6	15988	15993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541872173
137	NC_022271	TAA	2	6	16093	16098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	541872173
138	NC_022271	CAG	2	6	16190	16195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541872173
139	NC_022271	CCA	2	6	16267	16272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	541872174
140	NC_022271	CAT	2	6	16327	16332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541872174
141	NC_022271	GTC	2	6	16383	16388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541872174
142	NC_022271	TTA	2	6	16394	16399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	541872174
143	NC_022271	GAA	2	6	16520	16525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	541872174
144	NC_022271	ATT	2	6	16565	16570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	541872174
145	NC_022271	TCA	2	6	16800	16805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541872175
146	NC_022271	CTC	2	6	16838	16843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	541872175
147	NC_022271	GTG	2	6	16893	16898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	541872175
148	NC_022271	CCT	2	6	16915	16920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	541872175
149	NC_022271	GCC	2	6	17143	17148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	541872175
150	NC_022271	CTT	2	6	17682	17687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	541872176
151	NC_022271	AGC	2	6	17744	17749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541872176
152	NC_022271	AGC	2	6	17827	17832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541872176
153	NC_022271	GAT	2	6	18908	18913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541872177
154	NC_022271	ATG	2	6	18918	18923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541872177
155	NC_022271	GAT	2	6	18950	18955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541872177
156	NC_022271	TTC	2	6	18995	19000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	541872177
157	NC_022271	TGA	2	6	19386	19391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541872178
158	NC_022271	ATT	2	6	19495	19500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	541872178
159	NC_022271	CGA	2	6	19716	19721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541872178
160	NC_022271	AGC	2	6	19725	19730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541872178
161	NC_022271	CAC	2	6	19893	19898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	541872178
162	NC_022271	GTT	2	6	19969	19974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	541872178
163	NC_022271	TGT	2	6	20163	20168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	541872179
164	NC_022271	GTT	2	6	20169	20174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	541872179
165	NC_022271	CTT	2	6	20244	20249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	541872179
166	NC_022271	CTT	2	6	20369	20374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	541872179
167	NC_022271	GAA	2	6	20398	20403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	541872179
168	NC_022271	TCA	2	6	20902	20907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541872180
169	NC_022271	TTG	2	6	21094	21099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	541872180
170	NC_022271	TGC	2	6	21280	21285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541872180
171	NC_022271	TTC	2	6	21518	21523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	541872180
172	NC_022271	ACC	2	6	21642	21647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	541872180
173	NC_022271	TCT	2	6	21812	21817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	541872180
174	NC_022271	GTT	2	6	21906	21911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	541872180
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176	NC_022271	TCG	2	6	22433	22438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541872181
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179	NC_022271	GCA	2	6	22614	22619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541872181
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183	NC_022271	CAT	2	6	23143	23148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541872181
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187	NC_022271	GAT	2	6	23336	23341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541872181
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189	NC_022271	CCA	2	6	23668	23673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	541872182
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194	NC_022271	ATG	2	6	24194	24199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541872182
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239	NC_022271	GCT	2	6	29127	29132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541872148
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242	NC_022271	GCG	2	6	29241	29246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	541872148
243	NC_022271	TGC	2	6	29258	29263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541872148
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246	NC_022271	GGC	2	6	29607	29612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	541872148
247	NC_022271	TTC	2	6	29667	29672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	541872148
248	NC_022271	GCA	2	6	29698	29703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541872148
249	NC_022271	ATC	2	6	29802	29807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541872148
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251	NC_022271	GGT	2	6	29907	29912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	541872148
252	NC_022271	CAT	2	6	29948	29953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541872148
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255	NC_022271	GTT	2	6	30172	30177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	541872148
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285	NC_022271	ACC	2	6	32233	32238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	541872188
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376	NC_022271	CAT	2	6	39569	39574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541872197
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498	NC_022271	AGG	2	6	51280	51285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	541872212
499	NC_022271	GTC	2	6	51394	51399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541872212
500	NC_022271	GCC	2	6	51471	51476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	541872213

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