MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Vibrio campbellii ATCC BAA-1116 plasmid

Total Repeats: 115

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022271	T	6	6	686	691	0 %	100 %	0 %	0 %	541872155
2	NC_022271	T	6	6	3164	3169	0 %	100 %	0 %	0 %	541872145
3	NC_022271	T	7	7	3354	3360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022271	T	6	6	3470	3475	0 %	100 %	0 %	0 %	541872158
5	NC_022271	T	8	8	5516	5523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022271	T	6	6	5528	5533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022271	A	6	6	5597	5602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022271	T	6	6	5898	5903	0 %	100 %	0 %	0 %	541872161
9	NC_022271	T	6	6	6087	6092	0 %	100 %	0 %	0 %	541872162
10	NC_022271	T	6	6	7064	7069	0 %	100 %	0 %	0 %	541872163
11	NC_022271	A	6	6	7421	7426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022271	T	6	6	7438	7443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022271	A	6	6	7626	7631	100 %	0 %	0 %	0 %	541872164
14	NC_022271	T	6	6	10661	10666	0 %	100 %	0 %	0 %	541872165
15	NC_022271	A	6	6	11521	11526	100 %	0 %	0 %	0 %	541872166
16	NC_022271	A	6	6	11672	11677	100 %	0 %	0 %	0 %	541872166
17	NC_022271	T	6	6	12485	12490	0 %	100 %	0 %	0 %	541872168
18	NC_022271	T	6	6	14433	14438	0 %	100 %	0 %	0 %	541872170
19	NC_022271	T	6	6	15129	15134	0 %	100 %	0 %	0 %	541872171
20	NC_022271	A	6	6	15363	15368	100 %	0 %	0 %	0 %	541872172
21	NC_022271	T	6	6	15485	15490	0 %	100 %	0 %	0 %	541872172
22	NC_022271	T	7	7	15701	15707	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022271	A	6	6	15750	15755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022271	A	6	6	15773	15778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022271	A	6	6	15784	15789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022271	T	6	6	15941	15946	0 %	100 %	0 %	0 %	541872173
27	NC_022271	A	7	7	16180	16186	100 %	0 %	0 %	0 %	541872173
28	NC_022271	T	6	6	16558	16563	0 %	100 %	0 %	0 %	541872174
29	NC_022271	T	6	6	17396	17401	0 %	100 %	0 %	0 %	541872175
30	NC_022271	A	6	6	17630	17635	100 %	0 %	0 %	0 %	541872176
31	NC_022271	T	6	6	17752	17757	0 %	100 %	0 %	0 %	541872176
32	NC_022271	A	7	7	20649	20655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022271	T	6	6	21293	21298	0 %	100 %	0 %	0 %	541872180
34	NC_022271	C	6	6	22578	22583	0 %	0 %	0 %	100 %	541872181
35	NC_022271	T	6	6	23261	23266	0 %	100 %	0 %	0 %	541872181
36	NC_022271	T	6	6	23316	23321	0 %	100 %	0 %	0 %	541872181
37	NC_022271	T	6	6	24604	24609	0 %	100 %	0 %	0 %	541872182
38	NC_022271	C	6	6	25667	25672	0 %	0 %	0 %	100 %	541872184
39	NC_022271	A	6	6	26549	26554	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022271	T	6	6	27539	27544	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022271	A	6	6	28128	28133	100 %	0 %	0 %	0 %	541872147
42	NC_022271	T	7	7	30410	30416	0 %	100 %	0 %	0 %	541872148
43	NC_022271	A	6	6	31830	31835	100 %	0 %	0 %	0 %	541872187
44	NC_022271	T	6	6	32160	32165	0 %	100 %	0 %	0 %	541872188
45	NC_022271	T	6	6	32263	32268	0 %	100 %	0 %	0 %	541872188
46	NC_022271	A	8	8	33609	33616	100 %	0 %	0 %	0 %	541872188
47	NC_022271	T	6	6	33639	33644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022271	G	7	7	34383	34389	0 %	0 %	100 %	0 %	541872189
49	NC_022271	G	7	7	34783	34789	0 %	0 %	100 %	0 %	541872190
50	NC_022271	T	6	6	37682	37687	0 %	100 %	0 %	0 %	541872193
51	NC_022271	T	6	6	37897	37902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022271	A	7	7	37909	37915	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022271	C	6	6	38543	38548	0 %	0 %	0 %	100 %	541872195
54	NC_022271	T	6	6	38955	38960	0 %	100 %	0 %	0 %	541872196
55	NC_022271	A	6	6	40838	40843	100 %	0 %	0 %	0 %	541872198
56	NC_022271	T	6	6	41985	41990	0 %	100 %	0 %	0 %	541872198
57	NC_022271	C	6	6	42589	42594	0 %	0 %	0 %	100 %	541872200
58	NC_022271	T	7	7	42598	42604	0 %	100 %	0 %	0 %	541872200
59	NC_022271	T	6	6	43686	43691	0 %	100 %	0 %	0 %	541872202
60	NC_022271	T	7	7	43771	43777	0 %	100 %	0 %	0 %	541872202
61	NC_022271	A	8	8	43829	43836	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022271	A	6	6	44835	44840	100 %	0 %	0 %	0 %	541872205
63	NC_022271	T	6	6	45057	45062	0 %	100 %	0 %	0 %	541872205
64	NC_022271	T	6	6	45487	45492	0 %	100 %	0 %	0 %	541872206
65	NC_022271	T	6	6	45873	45878	0 %	100 %	0 %	0 %	541872149
66	NC_022271	T	6	6	46180	46185	0 %	100 %	0 %	0 %	541872149
67	NC_022271	T	7	7	46469	46475	0 %	100 %	0 %	0 %	541872149
68	NC_022271	A	6	6	46591	46596	100 %	0 %	0 %	0 %	541872207
69	NC_022271	T	6	6	47321	47326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022271	A	6	6	48760	48765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022271	T	7	7	50986	50992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022271	T	6	6	51668	51673	0 %	100 %	0 %	0 %	541872213
73	NC_022271	T	6	6	52071	52076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022271	T	6	6	53128	53133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022271	A	6	6	54787	54792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022271	T	6	6	55072	55077	0 %	100 %	0 %	0 %	541872217
77	NC_022271	T	7	7	56438	56444	0 %	100 %	0 %	0 %	541872217
78	NC_022271	T	6	6	57028	57033	0 %	100 %	0 %	0 %	541872219
79	NC_022271	A	6	6	58370	58375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022271	T	6	6	59010	59015	0 %	100 %	0 %	0 %	541872221
81	NC_022271	T	7	7	59801	59807	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022271	A	7	7	59850	59856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022271	T	7	7	59874	59880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022271	G	6	6	59887	59892	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022271	A	9	9	60073	60081	100 %	0 %	0 %	0 %	541872222
86	NC_022271	C	7	7	60153	60159	0 %	0 %	0 %	100 %	541872223
87	NC_022271	T	7	7	60854	60860	0 %	100 %	0 %	0 %	541872223
88	NC_022271	A	6	6	61104	61109	100 %	0 %	0 %	0 %	541872223
89	NC_022271	T	6	6	62119	62124	0 %	100 %	0 %	0 %	541872150
90	NC_022271	T	6	6	62249	62254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022271	A	6	6	62384	62389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022271	T	7	7	63138	63144	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022271	T	7	7	63892	63898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022271	T	6	6	64513	64518	0 %	100 %	0 %	0 %	541872226
95	NC_022271	T	7	7	64792	64798	0 %	100 %	0 %	0 %	541872226
96	NC_022271	T	6	6	65453	65458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022271	C	6	6	66049	66054	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
98	NC_022271	A	7	7	66418	66424	100 %	0 %	0 %	0 %	541872227
99	NC_022271	G	7	7	67933	67939	0 %	0 %	100 %	0 %	541872230
100	NC_022271	A	6	6	68222	68227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022271	A	6	6	72844	72849	100 %	0 %	0 %	0 %	541872235
102	NC_022271	T	6	6	73423	73428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022271	T	6	6	74249	74254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022271	A	7	7	76155	76161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022271	T	6	6	76231	76236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022271	A	6	6	77331	77336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022271	T	6	6	79175	79180	0 %	100 %	0 %	0 %	541872152
108	NC_022271	T	6	6	80465	80470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022271	A	6	6	80508	80513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022271	A	6	6	81684	81689	100 %	0 %	0 %	0 %	541872239
111	NC_022271	A	6	6	82711	82716	100 %	0 %	0 %	0 %	541872153
112	NC_022271	A	6	6	83615	83620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022271	T	6	6	84072	84077	0 %	100 %	0 %	0 %	541872240
114	NC_022271	T	6	6	86642	86647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022271	T	6	6	87777	87782	0 %	100 %	0 %	0 %	541872243

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.