MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Vibrio campbellii ATCC BAA-1116 chromosome II

Total Repeats: 1168

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022270	CAAAT	2	10	7254	7263	60 %	20 %	0 %	20 %	541871276
2	NC_022270	TAAGT	2	10	7460	7469	40 %	40 %	20 %	0 %	541871276
3	NC_022270	TGCTC	2	10	7608	7617	0 %	40 %	20 %	40 %	541871276
4	NC_022270	AAACT	2	10	11557	11566	60 %	20 %	0 %	20 %	541871282
5	NC_022270	TTACG	2	10	12727	12736	20 %	40 %	20 %	20 %	541871283
6	NC_022270	GTTGT	2	10	17800	17809	0 %	60 %	40 %	0 %	541871292
7	NC_022270	AATGC	2	10	18169	18178	40 %	20 %	20 %	20 %	541871292
8	NC_022270	CAAGC	2	10	23647	23656	40 %	0 %	20 %	40 %	541871297
9	NC_022270	GTTTG	2	10	26770	26779	0 %	60 %	40 %	0 %	541871299
10	NC_022270	AGTTG	2	10	29605	29614	20 %	40 %	40 %	0 %	541870148
11	NC_022270	CCACT	2	10	31259	31268	20 %	20 %	0 %	60 %	541870148
12	NC_022270	AAAGG	2	10	32110	32119	60 %	0 %	40 %	0 %	541870149
13	NC_022270	AATCA	2	10	33465	33474	60 %	20 %	0 %	20 %	541871300
14	NC_022270	AAACC	2	10	33850	33859	60 %	0 %	0 %	40 %	541871300
15	NC_022270	TACGA	2	10	35008	35017	40 %	20 %	20 %	20 %	541870152
16	NC_022270	CAGTG	2	10	35242	35251	20 %	20 %	40 %	20 %	541870152
17	NC_022270	ACAAA	2	10	35432	35441	80 %	0 %	0 %	20 %	541870152
18	NC_022270	CGCTT	2	10	37508	37517	0 %	40 %	20 %	40 %	541870153
19	NC_022270	TCCAC	2	10	38506	38515	20 %	20 %	0 %	60 %	541870153
20	NC_022270	TAAGT	2	10	39667	39676	40 %	40 %	20 %	0 %	541871302
21	NC_022270	GAAAA	2	10	40453	40462	80 %	0 %	20 %	0 %	541871303
22	NC_022270	GTGAT	2	10	41887	41896	20 %	40 %	40 %	0 %	541871304
23	NC_022270	TCTGC	2	10	45379	45388	0 %	40 %	20 %	40 %	541870157
24	NC_022270	GTTGT	2	10	45757	45766	0 %	60 %	40 %	0 %	541870157
25	NC_022270	CATTG	2	10	45942	45951	20 %	40 %	20 %	20 %	541870157
26	NC_022270	CTACG	2	10	46338	46347	20 %	20 %	20 %	40 %	541870158
27	NC_022270	GCGTG	2	10	46711	46720	0 %	20 %	60 %	20 %	541870158
28	NC_022270	TTGGC	2	10	48716	48725	0 %	40 %	40 %	20 %	541870160
29	NC_022270	GTTTG	2	10	49222	49231	0 %	60 %	40 %	0 %	541870160
30	NC_022270	CGGAA	2	10	51174	51183	40 %	0 %	40 %	20 %	541870161
31	NC_022270	CGCTT	2	10	53979	53988	0 %	40 %	20 %	40 %	541870164
32	NC_022270	AAATA	2	10	54553	54562	80 %	20 %	0 %	0 %	541870164
33	NC_022270	AGAGG	2	10	56246	56255	40 %	0 %	60 %	0 %	541871306
34	NC_022270	CATTG	2	10	56814	56823	20 %	40 %	20 %	20 %	541870167
35	NC_022270	TGGCT	2	10	57325	57334	0 %	40 %	40 %	20 %	541870167
36	NC_022270	AGTCG	2	10	59607	59616	20 %	20 %	40 %	20 %	541870169
37	NC_022270	ATCGC	2	10	59793	59802	20 %	20 %	20 %	40 %	541870169
38	NC_022270	GTGAA	2	10	60024	60033	40 %	20 %	40 %	0 %	541871307
39	NC_022270	AGCCG	2	10	61019	61028	20 %	0 %	40 %	40 %	541870171
40	NC_022270	CTGAG	2	10	61303	61312	20 %	20 %	40 %	20 %	541870171
41	NC_022270	CACAC	2	10	61864	61873	40 %	0 %	0 %	60 %	541871308
42	NC_022270	TGGAA	2	10	67020	67029	40 %	20 %	40 %	0 %	541870172
43	NC_022270	TGCCA	2	10	68917	68926	20 %	20 %	20 %	40 %	541871313
44	NC_022270	CTTTC	2	10	71657	71666	0 %	60 %	0 %	40 %	541870174
45	NC_022270	GTGCA	2	10	73604	73613	20 %	20 %	40 %	20 %	541871317
46	NC_022270	TCTGA	2	10	76196	76205	20 %	40 %	20 %	20 %	541870177
47	NC_022270	CCAAA	2	10	78296	78305	60 %	0 %	0 %	40 %	541870179
48	NC_022270	TCACT	2	10	79304	79313	20 %	40 %	0 %	40 %	541870180
49	NC_022270	GAAGT	2	10	85367	85376	40 %	20 %	40 %	0 %	541870182
50	NC_022270	GTGCA	2	10	85989	85998	20 %	20 %	40 %	20 %	541870182
51	NC_022270	CTTGG	2	10	87923	87932	0 %	40 %	40 %	20 %	541870185
52	NC_022270	GCATC	2	10	88073	88082	20 %	20 %	20 %	40 %	541870185
53	NC_022270	TTTCA	2	10	93255	93264	20 %	60 %	0 %	20 %	541870188
54	NC_022270	TGCAT	2	10	98002	98011	20 %	40 %	20 %	20 %	541870189
55	NC_022270	TTAAG	2	10	98402	98411	40 %	40 %	20 %	0 %	541870189
56	NC_022270	AATTC	2	10	98431	98440	40 %	40 %	0 %	20 %	541870189
57	NC_022270	GCGCT	2	10	99206	99215	0 %	20 %	40 %	40 %	541870190
58	NC_022270	TTTGT	2	10	103531	103540	0 %	80 %	20 %	0 %	541871324
59	NC_022270	AGTGA	2	10	106351	106360	40 %	20 %	40 %	0 %	541870195
60	NC_022270	AATGA	2	10	106575	106584	60 %	20 %	20 %	0 %	541870196
61	NC_022270	ATGTG	2	10	107153	107162	20 %	40 %	40 %	0 %	541870196
62	NC_022270	TTATC	2	10	108203	108212	20 %	60 %	0 %	20 %	541871325
63	NC_022270	CATTG	2	10	108966	108975	20 %	40 %	20 %	20 %	541871325
64	NC_022270	GCAAA	2	10	109168	109177	60 %	0 %	20 %	20 %	541871326
65	NC_022270	GTTGG	2	10	111728	111737	0 %	40 %	60 %	0 %	541870197
66	NC_022270	TGTCT	2	10	114240	114249	0 %	60 %	20 %	20 %	541870199
67	NC_022270	CAGAA	2	10	115703	115712	60 %	0 %	20 %	20 %	541871329
68	NC_022270	ACGTT	2	10	115957	115966	20 %	40 %	20 %	20 %	541871329
69	NC_022270	ATTTG	2	10	117016	117025	20 %	60 %	20 %	0 %	541870203
70	NC_022270	GCAAA	2	10	117214	117223	60 %	0 %	20 %	20 %	541870203
71	NC_022270	AATGG	2	10	122420	122429	40 %	20 %	40 %	0 %	541871330
72	NC_022270	ACGCC	2	10	123371	123380	20 %	0 %	20 %	60 %	541870208
73	NC_022270	TGGCT	2	10	123745	123754	0 %	40 %	40 %	20 %	541870208
74	NC_022270	AGCCA	2	10	124220	124229	40 %	0 %	20 %	40 %	541870209
75	NC_022270	CTTTG	2	10	125202	125211	0 %	60 %	20 %	20 %	541870210
76	NC_022270	GAAAA	2	10	126160	126169	80 %	0 %	20 %	0 %	541870211
77	NC_022270	GCCAA	2	10	127897	127906	40 %	0 %	20 %	40 %	541870213
78	NC_022270	GAAGC	2	10	131781	131790	40 %	0 %	40 %	20 %	541870216
79	NC_022270	TGATT	2	10	132548	132557	20 %	60 %	20 %	0 %	541870216
80	NC_022270	GATTC	2	10	140693	140702	20 %	40 %	20 %	20 %	541871332
81	NC_022270	GATTG	2	10	145300	145309	20 %	40 %	40 %	0 %	541870218
82	NC_022270	AAGCA	2	10	145579	145588	60 %	0 %	20 %	20 %	541871335
83	NC_022270	GAGCT	2	10	145960	145969	20 %	20 %	40 %	20 %	541871335
84	NC_022270	GAAGT	2	10	148198	148207	40 %	20 %	40 %	0 %	541870220
85	NC_022270	CCATT	2	10	150236	150245	20 %	40 %	0 %	40 %	541871340
86	NC_022270	AGCGA	2	10	150404	150413	40 %	0 %	40 %	20 %	541871340
87	NC_022270	CATCT	2	10	152314	152323	20 %	40 %	0 %	40 %	541871342
88	NC_022270	GACTC	2	10	152690	152699	20 %	20 %	20 %	40 %	541871343
89	NC_022270	CCAAC	2	10	153785	153794	40 %	0 %	0 %	60 %	541871344
90	NC_022270	TAAAA	2	10	156432	156441	80 %	20 %	0 %	0 %	541871345
91	NC_022270	CGAGC	2	10	158448	158457	20 %	0 %	40 %	40 %	541870221
92	NC_022270	CTGCA	2	10	171624	171633	20 %	20 %	20 %	40 %	541871360
93	NC_022270	TAAGT	2	10	178277	178286	40 %	40 %	20 %	0 %	541871366
94	NC_022270	ATTTG	2	10	181402	181411	20 %	60 %	20 %	0 %	541871369
95	NC_022270	TTCTA	2	10	185168	185177	20 %	60 %	0 %	20 %	541870226
96	NC_022270	CGGTG	2	10	186310	186319	0 %	20 %	60 %	20 %	541870227
97	NC_022270	ACAGC	2	10	186408	186417	40 %	0 %	20 %	40 %	541870227
98	NC_022270	GATGT	2	10	187880	187889	20 %	40 %	40 %	0 %	541870227
99	NC_022270	GGAAC	2	10	189083	189092	40 %	0 %	40 %	20 %	541870228
100	NC_022270	TGATG	2	10	190929	190938	20 %	40 %	40 %	0 %	541870230
101	NC_022270	AGATG	2	10	192639	192648	40 %	20 %	40 %	0 %	541870233
102	NC_022270	GCAAA	2	10	193277	193286	60 %	0 %	20 %	20 %	541870233
103	NC_022270	GGCGT	2	10	193649	193658	0 %	20 %	60 %	20 %	541870234
104	NC_022270	TTTCA	2	10	194225	194234	20 %	60 %	0 %	20 %	541870234
105	NC_022270	TTTGT	2	10	196004	196013	0 %	80 %	20 %	0 %	541871371
106	NC_022270	AGCTA	2	10	198271	198280	40 %	20 %	20 %	20 %	541870236
107	NC_022270	GTATG	2	10	204010	204019	20 %	40 %	40 %	0 %	541870243
108	NC_022270	GAACG	2	10	205087	205096	40 %	0 %	40 %	20 %	541870244
109	NC_022270	GATTG	2	10	205140	205149	20 %	40 %	40 %	0 %	541870244
110	NC_022270	CAAGC	2	10	207364	207373	40 %	0 %	20 %	40 %	541870245
111	NC_022270	GATTT	2	10	211782	211791	20 %	60 %	20 %	0 %	541870248
112	NC_022270	TGGTT	2	10	216174	216183	0 %	60 %	40 %	0 %	541870251
113	NC_022270	AGCCA	2	10	217554	217563	40 %	0 %	20 %	40 %	541870252
114	NC_022270	CGACG	2	10	218065	218074	20 %	0 %	40 %	40 %	541870253
115	NC_022270	AGCTG	2	10	219865	219874	20 %	20 %	40 %	20 %	541870253
116	NC_022270	TCAAC	2	10	220360	220369	40 %	20 %	0 %	40 %	541870254
117	NC_022270	AGCCC	2	10	221815	221824	20 %	0 %	20 %	60 %	541870255
118	NC_022270	CATCT	2	10	221879	221888	20 %	40 %	0 %	40 %	541870255
119	NC_022270	GAACA	2	10	222554	222563	60 %	0 %	20 %	20 %	541870255
120	NC_022270	CTTGC	2	10	225396	225405	0 %	40 %	20 %	40 %	541870257
121	NC_022270	ACTTT	2	10	229112	229121	20 %	60 %	0 %	20 %	541870259
122	NC_022270	TTGGT	2	10	229866	229875	0 %	60 %	40 %	0 %	541870259
123	NC_022270	ACTTA	2	10	239544	239553	40 %	40 %	0 %	20 %	541871380
124	NC_022270	GAAAT	2	10	242980	242989	60 %	20 %	20 %	0 %	541870266
125	NC_022270	GCTCC	2	10	244790	244799	0 %	20 %	20 %	60 %	541870268
126	NC_022270	CTTCT	2	10	245231	245240	0 %	60 %	0 %	40 %	541870268
127	NC_022270	CACGC	2	10	247071	247080	20 %	0 %	20 %	60 %	541870269
128	NC_022270	CCATT	2	10	247605	247614	20 %	40 %	0 %	40 %	541870269
129	NC_022270	AACGC	2	10	247801	247810	40 %	0 %	20 %	40 %	541870269
130	NC_022270	CTTGC	2	10	250625	250634	0 %	40 %	20 %	40 %	541870272
131	NC_022270	GACAT	2	10	252068	252077	40 %	20 %	20 %	20 %	541870273
132	NC_022270	ACAGT	2	10	255023	255032	40 %	20 %	20 %	20 %	541870275
133	NC_022270	GTGGA	2	10	256512	256521	20 %	20 %	60 %	0 %	541870277
134	NC_022270	TTTGT	2	10	256829	256838	0 %	80 %	20 %	0 %	541870278
135	NC_022270	ATCAA	2	10	258168	258177	60 %	20 %	0 %	20 %	541871384
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137	NC_022270	TTGGT	2	10	259587	259596	0 %	60 %	40 %	0 %	541870279
138	NC_022270	AAGCA	2	10	262154	262163	60 %	0 %	20 %	20 %	541871385
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141	NC_022270	TGCGC	2	10	265206	265215	0 %	20 %	40 %	40 %	541870281
142	NC_022270	CCAGC	2	10	266192	266201	20 %	0 %	20 %	60 %	541870282
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146	NC_022270	GCATC	2	10	271067	271076	20 %	20 %	20 %	40 %	541871387
147	NC_022270	GCTAA	2	10	272314	272323	40 %	20 %	20 %	20 %	541871387
148	NC_022270	ATTTT	2	10	273751	273760	20 %	80 %	0 %	0 %	541871388
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151	NC_022270	TGTTT	2	10	284891	284900	0 %	80 %	20 %	0 %	541870292
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173	NC_022270	GTGAT	2	10	317899	317908	20 %	40 %	40 %	0 %	541871407
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203	NC_022270	TAGCT	2	10	370077	370086	20 %	40 %	20 %	20 %	541870340
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244	NC_022270	GGTCA	2	10	469977	469986	20 %	20 %	40 %	20 %	541871461
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247	NC_022270	CTCGA	2	10	471483	471492	20 %	20 %	20 %	40 %	541871464
248	NC_022270	GCATT	2	10	473794	473803	20 %	40 %	20 %	20 %	541871465
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250	NC_022270	AAAGA	2	10	475737	475746	80 %	0 %	20 %	0 %	541870387
251	NC_022270	TTAAG	2	10	477069	477078	40 %	40 %	20 %	0 %	541870387
252	NC_022270	GCTGA	2	10	483385	483394	20 %	20 %	40 %	20 %	541870388
253	NC_022270	GAAAA	2	10	484968	484977	80 %	0 %	20 %	0 %	541871472
254	NC_022270	ACCAA	2	10	488673	488682	60 %	0 %	0 %	40 %	541870389
255	NC_022270	GAGAA	2	10	488955	488964	60 %	0 %	40 %	0 %	541870389
256	NC_022270	TACCA	2	10	492652	492661	40 %	20 %	0 %	40 %	541870393
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258	NC_022270	TCTTT	2	10	495065	495074	0 %	80 %	0 %	20 %	541871478
259	NC_022270	TTGTC	2	10	497445	497454	0 %	60 %	20 %	20 %	541870398
260	NC_022270	TTTGA	2	10	500465	500474	20 %	60 %	20 %	0 %	541870400
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262	NC_022270	GAAGC	2	10	500856	500865	40 %	0 %	40 %	20 %	541870401
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264	NC_022270	TGCGT	2	10	502849	502858	0 %	40 %	40 %	20 %	541870403
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389	NC_022270	TATTG	2	10	704997	705006	20 %	60 %	20 %	0 %	541871561
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