MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio campbellii ATCC BAA-1116 chromosome I

Total Repeats: 156

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022269	CTTTTG	2	12	36880	36891	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_022269	TTTGGG	2	12	91346	91357	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022269	ATAACA	4	24	99338	99361	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_022269	TTACCT	2	12	137159	137170	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_022269	GTTTTT	2	12	165521	165532	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022269	GTTATA	2	12	172559	172570	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022269	TGTATA	2	12	177583	177594	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022269	GTTTTT	2	12	243765	243776	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022269	ATTTCA	2	12	267376	267387	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_022269	TTATCA	2	12	273838	273849	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_022269	GAACAG	2	12	275958	275969	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_022269	GTATTT	2	12	282932	282943	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022269	CTTGAT	2	12	363868	363879	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_022269	CCAAAT	2	12	364605	364616	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_022269	GCTGAC	2	12	379761	379772	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_022269	GCTTAC	2	12	395687	395698	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_022269	CAAAGC	2	12	396112	396123	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_022269	TTTAAA	2	12	432475	432486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022269	AATAAA	2	12	439366	439377	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022269	GCAAAT	2	12	442655	442666	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_022269	CAACTC	2	12	496215	496226	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_022269	AGCGAT	2	12	511788	511799	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_022269	GTTATT	2	12	518881	518892	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022269	TGAGGT	2	12	533074	533085	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022269	ATTAAA	2	12	540037	540048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022269	TTAACG	2	12	565480	565491	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_022269	TTTTCA	2	12	605089	605100	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_022269	ACAAAG	2	12	612936	612947	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_022269	CAGATG	2	12	615387	615398	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_022269	TACTAT	2	12	616897	616908	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_022269	GATAAT	2	12	670873	670884	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022269	TTACCT	2	12	688412	688423	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_022269	AAAATC	2	12	696720	696731	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_022269	TTCGCA	2	12	707190	707201	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_022269	TTACCT	2	12	714153	714164	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_022269	GATACA	2	12	724001	724012	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_022269	TGAAAA	2	12	756345	756356	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022269	TTTACC	2	12	763418	763429	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_022269	AAGGTA	2	12	781850	781861	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022269	GATACC	2	12	804622	804633	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_022269	AAGGCA	2	12	822411	822422	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_022269	ATTTCA	2	12	859338	859349	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_022269	TCTACT	2	12	910793	910804	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_022269	AGCTCA	2	12	920793	920804	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_022269	CCTAAA	2	12	940665	940676	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_022269	CCTAAA	2	12	942277	942288	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_022269	TTTATT	2	12	968853	968864	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022269	CATTTC	2	12	1050673	1050684	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_022269	TTTAAT	2	12	1079292	1079303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022269	GATTTT	2	12	1093398	1093409	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022269	TACAAA	2	12	1124210	1124221	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_022269	TCTTTT	2	12	1164798	1164809	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_022269	CAGAAA	2	12	1200468	1200479	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_022269	TCACCC	2	12	1204583	1204594	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_022269	ACTTGT	2	12	1223367	1223378	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_022269	GAGCAA	2	12	1223715	1223726	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_022269	AAGGTA	2	12	1230562	1230573	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022269	CTCATA	2	12	1267616	1267627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_022269	ATGATT	2	12	1273484	1273495	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022269	ATAAAA	2	12	1286172	1286183	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022269	CAAAAA	2	12	1302407	1302418	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_022269	AATATC	2	12	1318804	1318815	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_022269	AGAAAA	2	12	1344971	1344982	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022269	AATCTT	2	12	1369636	1369647	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_022269	CATCTC	2	12	1434517	1434528	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_022269	AGAAAG	2	12	1442940	1442951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022269	TTACCT	2	12	1561745	1561756	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_022269	CTGAGG	2	12	1562269	1562280	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_022269	ATTTTT	2	12	1588698	1588709	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022269	CGCTTT	2	12	1590346	1590357	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_022269	CGAAGT	2	12	1591422	1591433	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_022269	TGTCAG	2	12	1653254	1653265	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_022269	AGAAGC	2	12	1664924	1664935	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_022269	TAAAGA	2	12	1665011	1665022	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022269	CTAATA	2	12	1677117	1677128	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_022269	ATTTCA	2	12	1703155	1703166	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_022269	ACTTGA	2	12	1707788	1707799	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_022269	TTGATG	2	12	1723661	1723672	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022269	AAAGGT	2	12	1775852	1775863	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022269	AACTAG	2	12	1777809	1777820	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_022269	ACGTCA	2	12	1842919	1842930	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_022269	AAATAA	2	12	1849168	1849179	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022269	CTTATT	2	12	1897943	1897954	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_022269	AACAAT	2	12	1991189	1991200	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_022269	GTTAGT	2	12	2052489	2052500	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022269	CTAGCA	2	12	2056728	2056739	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_022269	GATAAA	2	12	2085221	2085232	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022269	CAATAC	2	12	2090603	2090614	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_022269	GCTGAC	2	12	2090615	2090626	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_022269	ACGCCA	2	12	2091470	2091481	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
91	NC_022269	GTGGTT	2	12	2104326	2104337	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022269	AGCAAG	2	12	2105656	2105667	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_022269	CACTCA	2	12	2172126	2172137	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_022269	TAAAAA	2	12	2212694	2212705	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022269	TTAATT	2	12	2224354	2224365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022269	TGAATT	2	12	2268944	2268955	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022269	ATTTCA	2	12	2270209	2270220	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_022269	TTTTTG	2	12	2305217	2305228	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022269	TTAAAA	2	12	2335963	2335974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022269	TGAGTA	2	12	2352535	2352546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022269	TGAAAT	2	12	2362976	2362987	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022269	AATTCA	2	12	2364272	2364283	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_022269	TGAAAT	2	12	2409606	2409617	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022269	AGATCA	2	12	2451876	2451887	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_022269	TGAAAT	2	12	2476543	2476554	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022269	TGAAAT	2	12	2523413	2523424	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022269	TGAAAT	2	12	2529001	2529012	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022269	GATAAT	2	12	2556163	2556174	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022269	TTAATG	2	12	2567923	2567934	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022269	TCAAAA	2	12	2574972	2574983	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_022269	TGTGAG	2	12	2589993	2590004	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022269	TGAATA	2	12	2593565	2593576	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022269	CCTATG	2	12	2659481	2659492	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_022269	GAAAGA	2	12	2703955	2703966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022269	AGAAAA	2	12	2708962	2708973	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022269	TAAAAC	2	12	2711392	2711403	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_022269	TGAAAT	2	12	2721780	2721791	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022269	TTATCT	2	12	2723436	2723447	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_022269	TTTATT	2	12	2779268	2779279	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022269	GATGGT	2	12	2790692	2790703	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022269	ATTAAG	2	12	2819588	2819599	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022269	AATTCA	2	12	2821033	2821044	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_022269	TATAAA	2	12	2823785	2823796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022269	TGAAAT	2	12	2835255	2835266	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022269	AAGAGA	2	12	2846215	2846226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022269	TGAACT	2	12	2955381	2955392	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_022269	CGTATT	2	12	2956275	2956286	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_022269	TAAAAA	2	12	3022723	3022734	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022269	ATAACT	2	12	3057265	3057276	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_022269	TTATCT	14	84	3101080	3101163	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_022269	TTTAAC	2	12	3108754	3108765	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_022269	AAAAAG	2	12	3120026	3120037	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022269	AATGTA	2	12	3160415	3160426	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022269	CAGAAT	3	18	3172473	3172490	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_022269	CAGAAA	2	12	3172491	3172502	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_022269	AAAACT	2	12	3262856	3262867	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_022269	CAGACA	2	12	3266297	3266308	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_022269	TTTTTA	2	12	3313848	3313859	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022269	GCGAAA	2	12	3329554	3329565	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_022269	ACTACA	2	12	3329618	3329629	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_022269	TTGTGG	2	12	3342663	3342674	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022269	CGAAAG	2	12	3372521	3372532	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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144	NC_022269	TTAGGT	2	12	3403246	3403257	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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147	NC_022269	CTTTTT	2	12	3448006	3448017	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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149	NC_022269	CCTCAG	2	12	3472444	3472455	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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151	NC_022269	TTCTTA	2	12	3520210	3520221	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.