MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio campbellii ATCC BAA-1116 chromosome I

Total Repeats: 510

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022269	AAGAG	2	10	22153	22162	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022269	CGGTG	2	10	27433	27442	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3	NC_022269	ATTTG	2	10	34059	34068	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022269	AGATG	2	10	34184	34193	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022269	TGGGC	2	10	38482	38491	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6	NC_022269	AAGAC	2	10	42490	42499	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_022269	CTGAA	2	10	58145	58154	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_022269	TAAGT	2	10	71818	71827	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022269	AAATA	2	10	79149	79158	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022269	AAACC	2	10	80300	80309	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
11	NC_022269	AGGGC	2	10	80809	80818	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
12	NC_022269	TGAAA	2	10	84164	84173	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022269	TGCCT	2	10	84748	84757	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_022269	AATCT	2	10	97819	97828	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_022269	GCATA	2	10	102166	102175	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_022269	TTGCA	2	10	103167	103176	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_022269	ATCGG	2	10	104174	104183	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_022269	TGCGT	2	10	115152	115161	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_022269	AAGCA	2	10	121015	121024	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_022269	ATTGA	2	10	122494	122503	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022269	CATCA	2	10	123047	123056	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
22	NC_022269	ATCTT	2	10	123070	123079	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_022269	TCACT	2	10	123150	123159	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
24	NC_022269	ACAGA	2	10	139006	139015	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_022269	TGTAT	2	10	139434	139443	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022269	ATCTT	2	10	142894	142903	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_022269	TGGGT	2	10	150049	150058	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022269	AAAAT	2	10	150690	150699	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022269	TGTCG	2	10	170416	170425	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_022269	ATTTT	2	10	172491	172500	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022269	GGTTC	2	10	183199	183208	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_022269	TTGGC	2	10	192419	192428	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_022269	TATTG	2	10	195467	195476	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022269	CGAAT	2	10	196973	196982	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_022269	AATTG	2	10	202724	202733	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022269	GAAAT	2	10	202777	202786	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022269	TTTGT	2	10	202945	202954	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022269	CTGAA	2	10	223688	223697	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_022269	TGATT	2	10	230538	230547	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022269	ACTTT	2	10	243811	243820	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_022269	CGTAA	2	10	254776	254785	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_022269	AATGC	2	10	260256	260265	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_022269	TGAAC	2	10	273917	273926	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_022269	GTTTT	2	10	286079	286088	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022269	CTTTT	2	10	290449	290458	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_022269	CTGAA	2	10	290842	290851	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_022269	TGAGT	2	10	338104	338113	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022269	CTGCG	2	10	360111	360120	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
49	NC_022269	GTTCA	2	10	360378	360387	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_022269	TCAAT	2	10	362075	362084	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_022269	CAAAA	2	10	363942	363951	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_022269	GAACA	2	10	364348	364357	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_022269	CCAAT	2	10	364792	364801	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
54	NC_022269	AAATC	2	10	379578	379587	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_022269	CCATA	2	10	381316	381325	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
56	NC_022269	CAAGC	2	10	396413	396422	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
57	NC_022269	GTGAT	2	10	400800	400809	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022269	CAGAG	2	10	408774	408783	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_022269	AGCAC	2	10	434220	434229	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
60	NC_022269	CCAAA	2	10	434231	434240	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_022269	CTTGG	2	10	435224	435233	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_022269	AAATC	2	10	439404	439413	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_022269	ATCCG	2	10	440075	440084	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_022269	GTTTG	2	10	444929	444938	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022269	TCTAC	2	10	446385	446394	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
66	NC_022269	TAAGT	2	10	449430	449439	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022269	GATCA	2	10	450060	450069	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_022269	CCTTA	2	10	455332	455341	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
69	NC_022269	ATTGA	2	10	459261	459270	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022269	GTTTT	2	10	462171	462180	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022269	GGAAA	2	10	469632	469641	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022269	CAAAA	2	10	474634	474643	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_022269	TTCTT	2	10	478683	478692	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_022269	TTTCC	2	10	480890	480899	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
75	NC_022269	GCTGT	2	10	490274	490283	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_022269	TCGAG	2	10	490619	490628	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_022269	CTCTA	2	10	490654	490663	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
78	NC_022269	ATCAG	2	10	492664	492673	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_022269	TCAAA	2	10	494130	494139	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_022269	AGAAA	2	10	515258	515267	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022269	TACTT	2	10	525984	525993	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_022269	AGTCT	2	10	533769	533778	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_022269	TTGAC	2	10	536917	536926	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_022269	ACCCA	2	10	538777	538786	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
85	NC_022269	TTAAT	2	10	540233	540242	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022269	GAATG	2	10	544627	544636	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022269	GATCA	2	10	547033	547042	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_022269	AAGTA	2	10	555393	555402	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022269	TTTTG	2	10	556101	556110	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022269	TCGAC	2	10	557370	557379	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
91	NC_022269	TTCAT	2	10	557546	557555	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_022269	GTGCA	2	10	562823	562832	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
93	NC_022269	GAAAA	2	10	574257	574266	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022269	AAAGT	2	10	575485	575494	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022269	TGCTT	2	10	610969	610978	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_022269	TATTC	2	10	613046	613055	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_022269	CTCGT	2	10	615376	615385	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
98	NC_022269	TTTTC	2	10	622748	622757	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_022269	AGGAG	2	10	645145	645154	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022269	AGTTA	2	10	645643	645652	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022269	TTTCC	2	10	646946	646955	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
102	NC_022269	CTAAA	2	10	649894	649903	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_022269	GTTTT	2	10	650746	650755	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022269	TTTCA	2	10	670960	670969	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_022269	CAATA	2	10	676075	676084	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_022269	CTTCA	2	10	680601	680610	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
107	NC_022269	AAAAT	2	10	680850	680859	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022269	AATGA	2	10	681919	681928	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022269	CCTTT	2	10	694680	694689	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
110	NC_022269	TAATT	2	10	696774	696783	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022269	ACCAA	2	10	711466	711475	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
112	NC_022269	GTGCA	2	10	718073	718082	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
113	NC_022269	AATCT	3	15	760802	760816	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_022269	TTTCC	2	10	763285	763294	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
115	NC_022269	GTTTT	2	10	764100	764109	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022269	GAACT	2	10	764318	764327	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_022269	ACCAT	2	10	765502	765511	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
118	NC_022269	CAGTT	2	10	765732	765741	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_022269	CATGA	2	10	776988	776997	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_022269	TAATC	2	10	778052	778061	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_022269	TCGCT	2	10	791740	791749	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
122	NC_022269	TGCTT	2	10	802203	802212	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_022269	GGCTT	2	10	802221	802230	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
124	NC_022269	CATGC	2	10	802434	802443	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
125	NC_022269	CCCCT	2	10	804410	804419	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
126	NC_022269	CTTCA	2	10	805132	805141	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
127	NC_022269	TTGAG	2	10	805425	805434	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022269	TTTCT	2	10	805671	805680	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_022269	CTCTC	2	10	810054	810063	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
130	NC_022269	TCACA	2	10	816172	816181	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
131	NC_022269	GTTGA	2	10	817309	817318	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022269	TCAAA	2	10	822601	822610	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_022269	ATTTT	2	10	831399	831408	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022269	TAAAT	2	10	885268	885277	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022269	AAATT	2	10	885477	885486	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022269	AAGCG	2	10	891721	891730	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_022269	CAACA	2	10	905246	905255	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
138	NC_022269	AGGTA	2	10	910329	910338	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022269	AAGTT	2	10	925708	925717	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022269	TTTGT	2	10	943979	943988	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022269	GAACT	2	10	944294	944303	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_022269	TTGGT	2	10	953964	953973	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022269	ATGCA	2	10	968911	968920	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_022269	TTCAA	2	10	979336	979345	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_022269	ACAAT	2	10	998721	998730	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_022269	GCTCA	2	10	1003777	1003786	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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191	NC_022269	TGGCA	2	10	1348168	1348177	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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285	NC_022269	CTTCA	2	10	2012828	2012837	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
286	NC_022269	CTCAA	2	10	2013001	2013010	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
287	NC_022269	CATTG	2	10	2014581	2014590	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
288	NC_022269	TAAAA	2	10	2020364	2020373	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_022269	TACCC	2	10	2022880	2022889	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
290	NC_022269	CAAAA	2	10	2023818	2023827	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
291	NC_022269	CAAAT	2	10	2035929	2035938	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
292	NC_022269	TTAAA	2	10	2046226	2046235	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_022269	TAATT	2	10	2047379	2047388	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_022269	CAGTG	2	10	2091426	2091435	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
295	NC_022269	AACTT	2	10	2096303	2096312	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
296	NC_022269	GATTC	2	10	2108702	2108711	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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298	NC_022269	TCTAT	2	10	2111075	2111084	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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301	NC_022269	CTCGC	2	10	2152147	2152156	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
302	NC_022269	CTGCA	2	10	2152874	2152883	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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304	NC_022269	AGTTA	2	10	2166475	2166484	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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323	NC_022269	ACTAC	2	10	2273602	2273611	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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332	NC_022269	GTAGT	2	10	2359224	2359233	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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